More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3339 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3339  NmrA family protein  100 
 
 		 279 aa  542  1e-153  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4673  NmrA family protein  70.97 
 
 		 279 aa  403  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.909291  normal  0.648206 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7958  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  56.99 
 
 		 271 aa  284  1.0000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0272  NmrA family protein  55 
 
 		 274 aa  270  2e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2046  NmrA family protein  49.47 
 
 		 274 aa  204  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.146802 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5449  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  39.93 
 
 		 274 aa  155  6e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0124495  normal  0.101659 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4590  NmrA family protein  35.64 
 
 		 283 aa  154  1e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5261  NmrA family protein  35.46 
 
 		 271 aa  150  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4166  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  39.58 
 
 		 281 aa  148  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.013923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5325  NmrA family protein  37.75 
 
 		 286 aa  143  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.260355  normal  0.558765 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1213  NmrA family protein  37.1 
 
 		 273 aa  144  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.423436  normal  0.352226 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1339  NmrA family protein  33.8 
 
 		 274 aa  137  3.0000000000000003e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3559  NmrA family protein  36.59 
 
 		 283 aa  135  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6522  NmrA family protein  39.36 
 
 		 295 aa  134  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.114988  normal  0.107947 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0344  NmrA family protein  37.63 
 
 		 281 aa  133  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1235  hypothetical protein  35.82 
 
 		 272 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4686  NmrA family protein  37.28 
 
 		 274 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.742277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5809  NmrA family protein  35.82 
 
 		 279 aa  130  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.839032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5627  NmrA family protein  32.27 
 
 		 273 aa  129  5.0000000000000004e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00676313 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5185  NADPH:quinone reductase and related Zn-dependent oxidoreductase-like protein  34.27 
 
 		 584 aa  127  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0220056 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1958  NmrA family protein  35.64 
 
 		 284 aa  124  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.190624  normal  0.373159 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0324  NmrA family protein  36.84 
 
 		 280 aa  125  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7197  NmrA family protein  39.01 
 
 		 285 aa  124  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4894  NmrA family protein  40.56 
 
 		 280 aa  123  4e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2660  NmrA family protein  36.4 
 
 		 280 aa  122  5e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4300  NmrA family protein  32.62 
 
 		 268 aa  121  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.620911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0634  NmrA family protein  37.1 
 
 		 279 aa  119  6e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.196658 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5612  NmrA family protein  34.24 
 
 		 287 aa  115  6.9999999999999995e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.940246  normal  0.705439 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6339  NmrA family protein  36.42 
 
 		 302 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193526 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8682  NmrA family protein  34.04 
 
 		 276 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0037  NmrA family protein  35.11 
 
 		 280 aa  112  6e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0712158  normal  0.162843 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0312  NmrA family protein  35.23 
 
 		 299 aa  112  9e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.212335  normal  0.352411 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6001  NmrA family protein  33.45 
 
 		 281 aa  112  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0281153 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4150  NmrA family protein  34.97 
 
 		 280 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0515383  normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0660  NmrA family protein  36.63 
 
 		 240 aa  107  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3651  NmrA family protein  32.76 
 
 		 276 aa  105  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1360  NmrA family protein  33.94 
 
 		 288 aa  103  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6609  NmrA family protein  34.95 
 
 		 310 aa  103  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6618  NmrA family protein  33.45 
 
 		 282 aa  103  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1449  NmrA family protein  35.34 
 
 		 275 aa  103  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0204448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6187  NmrA family protein  31.69 
 
 		 277 aa  102  6e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2763  NmrA family protein  32.65 
 
 		 291 aa  100  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0403  NmrA family protein  32.98 
 
 		 287 aa  99.4  6e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3166  NmrA family protein  28.41 
 
 		 273 aa  99  8e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6349  NmrA family protein  29.76 
 
 		 277 aa  98.6  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2210  NmrA family protein  32.87 
 
 		 281 aa  96.7  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.56784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22520  hypothetical protein  30.6 
 
 		 351 aa  95.5  8e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000139034  hitchhiker  0.0000222268 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2493  NmrA family protein  31.72 
 
 		 288 aa  95.1  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6198  NmrA family protein  36.13 
 
 		 250 aa  94.4  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.823191  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3935  NmrA family protein  31.7 
 
 		 288 aa  94.4  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00694182 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4454  NmrA family protein  32.17 
 
 		 281 aa  93.6  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2575  NmrA family protein  32.75 
 
 		 295 aa  94  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6424  NmrA family protein  34.51 
 
 		 288 aa  92.4  6e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0421273  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3071  NmrA family protein  32.39 
 
 		 298 aa  90.9  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.16451  normal  0.48067 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9342  hypothetical protein  33.57 
 
 		 278 aa  90.1  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.894169  normal  0.787552 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4824  NmrA family protein  25 
 
 		 276 aa  89.4  6e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0799506  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0576  hypothetical protein  30.33 
 
 		 434 aa  89  8e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5083  NmrA family protein  28.57 
 
 		 292 aa  87.8  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.624172  normal  0.697102 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0911  NmrA family protein  30.74 
 
 		 269 aa  86.7  4e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8402  NmrA family protein  32.76 
 
 		 291 aa  86.3  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1963  NmrA family protein  30.82 
 
 		 296 aa  85.9  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.145776 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1515  NmrA family protein  32.97 
 
 		 278 aa  85.5  8e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.276562  normal  0.199707 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2997  NmrA family protein  31.21 
 
 		 279 aa  84.7  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2380  NmrA family protein  32.26 
 
 		 294 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5084  NmrA family protein  31.36 
 
 		 294 aa  83.6  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.195727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4112  NmrA family protein  28.87 
 
 		 293 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0977  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.95 
 
 		 294 aa  82.8  0.000000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152042  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6067  NAD-dependent epimerase/dehydratase:NmrA-like  31.23 
 
 		 295 aa  82.8  0.000000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.551699  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1525  NmrA family protein  30.22 
 
 		 279 aa  82.4  0.000000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000360309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3216  NmrA family protein  30.5 
 
 		 279 aa  82  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0902  NmrA family protein  30.63 
 
 		 294 aa  81.6  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2684  NmrA family protein  32.71 
 
 		 267 aa  80.9  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.66579 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5875  NmrA family protein  34.47 
 
 		 288 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3759  NmrA family protein  26.12 
 
 		 292 aa  80.9  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.791935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6413  NmrA family protein  36.17 
 
 		 288 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.958881  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3020  hypothetical protein  29.96 
 
 		 289 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.375622  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3022  NmrA family protein  30.47 
 
 		 280 aa  79  0.00000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.589818  normal  0.26374 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2993  NmrA family protein  32.73 
 
 		 306 aa  78.6  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0106693  normal  0.0973127 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1700  NmrA family protein  28.03 
 
 		 281 aa  77.4  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560345  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5542  NmrA-like  33.33 
 
 		 288 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0956662  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5907  NmrA family protein  33.33 
 
 		 288 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3405  NmrA family protein  34.02 
 
 		 288 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.455862 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1674  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  30.28 
 
 		 279 aa  77.8  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.117563  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2341  NmrA-like  32.91 
 
 		 274 aa  77  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.386824 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3363  hypothetical protein  33.06 
 
 		 287 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0680554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1075  hypothetical protein  28.46 
 
 		 319 aa  75.9  0.0000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4018  NmrA family protein  28.38 
 
 		 299 aa  75.9  0.0000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.723886  hitchhiker  0.00143621 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4267  NmrA family protein  29.47 
 
 		 292 aa  75.9  0.0000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.355759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0483  NmrA family protein  31.31 
 
 		 295 aa  75.9  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2699  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  33.62 
 
 		 286 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.534196 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3545  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.85 
 
 		 276 aa  75.5  0.0000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.789815 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6112  NmrA family protein  33.19 
 
 		 288 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.837371  normal  0.169159 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1673  NmrA family protein  28.29 
 
 		 290 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.491569  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1891  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.74 
 
 		 298 aa  74.7  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0168492  normal  0.486121 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1893  NmrA family protein  29.93 
 
 		 285 aa  73.9  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.730888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4022  NmrA family protein  30.47 
 
 		 297 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.144571  normal  0.731843 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6266  NmrA family protein  32.89 
 
 		 287 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0469029 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1481  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.83 
 
 		 309 aa  73.6  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0783672  hitchhiker  0.0000370596 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6433  NmrA-like  31.11 
 
 		 287 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6668  NmrA family protein  31.11 
 
 		 287 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0183081  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>