232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0160 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0160  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  100 
 
 		 404 aa  812    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.319111  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0891  C-5 cytosine-specific DNA methylase  51.03 
 
 		 397 aa  424  1e-117  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.128685  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4269  DNA-cytosine methyltransferase  49.72 
 
 		 359 aa  312  5.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.88782 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_257  DNA-cytosine methyltransferase  34.22 
 
 		 365 aa  172  1e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1453  DNA-cytosine methyltransferase  33.6 
 
 		 342 aa  157  3e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0528  DNA-cytosine methyltransferase  32 
 
 		 354 aa  155  8e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.555926  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2196  DNA-cytosine methyltransferase  32.69 
 
 		 366 aa  155  1e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.227819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3681  modification methylase HgiDII  32.17 
 
 		 344 aa  155  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1175  DNA-cytosine methyltransferase  32.68 
 
 		 349 aa  154  2.9999999999999998e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.164827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1628  C-5 cytosine-specific DNA methylase  29.36 
 
 		 359 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0606  DNA-cytosine methyltransferase  32.81 
 
 		 355 aa  142  7e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0503  putative C-5 cytosine-specific DNA methylase  28.97 
 
 		 387 aa  143  7e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.181875  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4309  DNA-cytosine methyltransferase  32.6 
 
 		 374 aa  142  8e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0990622  normal  0.0453977 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2193  DNA-cytosine methyltransferase  30.25 
 
 		 358 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.877984  normal  0.072963 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04735  DNA (cytosine-5)-methyltransferase PliMCI  32.06 
 
 		 395 aa  137  2e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.584322  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2314  DNA-cytosine methyltransferase  29.68 
 
 		 340 aa  133  5e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.704291 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1183  hypothetical protein  31.2 
 
 		 352 aa  133  6e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.401368  normal  0.0474441 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1377  DNA-cytosine methyltransferase  30.47 
 
 		 362 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2889  DNA-cytosine methyltransferase  30.77 
 
 		 373 aa  132  1.0000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000172243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8539  DNA-cytosine methyltransferase  29.5 
 
 		 389 aa  131  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000203506  hitchhiker  0.000040976 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4973  DNA-cytosine methyltransferase  30.64 
 
 		 373 aa  130  6e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4678  DNA-cytosine methyltransferase  29.13 
 
 		 345 aa  129  7.000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.201023  normal  0.324334 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3845  DNA-cytosine methyltransferase  31.16 
 
 		 371 aa  129  1.0000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.305468 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0080  DNA-cytosine methyltransferase  31.55 
 
 		 371 aa  126  8.000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.35686  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2797  DNA-cytosine methyltransferase  30.24 
 
 		 399 aa  124  3e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0617861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1050  DNA-cytosine methyltransferase  32.74 
 
 		 361 aa  123  6e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00805794  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0680  C-5 cytosine-specific DNA methylase  29.36 
 
 		 350 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000225645 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0535  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  27.75 
 
 		 357 aa  121  1.9999999999999998e-26  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373164 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0302  DNA-cytosine methyltransferase  26.85 
 
 		 375 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0568  DNA-cytosine methyltransferase  30.73 
 
 		 652 aa  116  6.9999999999999995e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.905473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3948  DNA-cytosine methyltransferase  30.62 
 
 		 657 aa  116  8.999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1675  DNA-cytosine methyltransferase  27.81 
 
 		 319 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0148653 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0531  DNA-cytosine methyltransferase  27.05 
 
 		 421 aa  114  4.0000000000000004e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0676  DNA-cytosine methyltransferase  28.82 
 
 		 434 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2522  transcriptional regulator, XRE family  28.53 
 
 		 468 aa  110  5e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0082  DNA-cytosine methyltransferase  28.3 
 
 		 423 aa  110  6e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0101  C-5 cytosine-specific DNA methylase  26.43 
 
 		 431 aa  110  6e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.999272  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4262  DNA-cytosine methyltransferase  27.98 
 
 		 415 aa  109  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0084  DNA-cytosine methyltransferase  27.76 
 
 		 423 aa  109  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0206  DNA-cytosine methyltransferase  30.05 
 
 		 398 aa  109  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.711166  hitchhiker  0.00000436024 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0372  DNA-cytosine methyltransferase  25 
 
 		 385 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.497071  normal  0.790678 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0526  DNA-cytosine methyltransferase  30.15 
 
 		 377 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000243641  normal  0.870196 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04441  DNA-cytosine methyltransferase  25.18 
 
 		 689 aa  107  5e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.355889  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1839  DNA-cytosine methyltransferase  29.24 
 
 		 318 aa  106  7e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.414211  normal  0.341933 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0576  DNA-cytosine methyltransferase  28.75 
 
 		 313 aa  105  1e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1159  putative 5-methylcytosine methyltransferase  28.37 
 
 		 381 aa  104  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.105767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0378  DNA-cytosine methyltransferase  24.63 
 
 		 686 aa  101  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.853393  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04331  DNA-cytosine methyltransferase  23.9 
 
 		 698 aa  102  2e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0756  DNA-cytosine methyltransferase  29.2 
 
 		 671 aa  99.8  8e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.967927  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0989  DNA-cytosine methyltransferase  25.63 
 
 		 418 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4984  DNA-cytosine methyltransferase  29.77 
 
 		 361 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1018  DNA-cytosine methyltransferase  25.63 
 
 		 418 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.928901 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5355  modification methylase HaeIII  24.73 
 
 		 313 aa  98.2  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000134666  hitchhiker  1.11891e-16 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0700  DNA-cytosine methyltransferase  28.33 
 
 		 320 aa  97.1  5e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3920  DNA-cytosine methyltransferase  30.37 
 
 		 358 aa  97.1  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0819  modification methylase HaeIII (cytosine-specificmethyltransferase HaeIII; M.HaeIII)  23.06 
 
 		 388 aa  97.1  5e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.230352  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1473  DNA-cytosine methyltransferase  24.26 
 
 		 360 aa  95.5  1e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0824  DNA-cytosine methyltransferase  30.08 
 
 		 349 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0271  DNA-cytosine methyltransferase  28.85 
 
 		 310 aa  94  5e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7048  DNA-cytosine methyltransferase  29.85 
 
 		 358 aa  93.6  6e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5354  modification methylase HaeIII  25.54 
 
 		 313 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000130575  hitchhiker  4.94055e-16 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1616  C-5 cytosine-specific DNA methylase family protein  27.13 
 
 		 345 aa  90.9  3e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3736  DNA-cytosine methyltransferase  24.3 
 
 		 434 aa  91.3  3e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.730052  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2163  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  27.65 
 
 		 375 aa  90.5  4e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.41914  normal  0.896778 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1847  DNA-cytosine methyltransferase  35.42 
 
 		 446 aa  90.5  4e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0232  C-5 cytosine-specific DNA methylase  27.91 
 
 		 415 aa  89.4  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.547554  decreased coverage  0.000406028 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4605  DNA-cytosine methyltransferase family protein  23.45 
 
 		 362 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000208195  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3758  cytosine-specific DNA methylase  27.08 
 
 		 443 aa  88.2  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.00145147  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4525  DNA-cytosine methyltransferase  24.25 
 
 		 337 aa  87.4  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.301699 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26030  DNA-methyltransferase Dcm  26.25 
 
 		 431 aa  87  5e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4036  DNA-cytosine methyltransferase  28.02 
 
 		 365 aa  86.3  9e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4938  DNA-cytosine methyltransferase  28.16 
 
 		 355 aa  85.9  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3989  DNA-cytosine methyltransferase  26.32 
 
 		 348 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.519304  normal  0.0147961 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1333  DNA-cytosine methyltransferase  24.93 
 
 		 415 aa  84.7  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.235826  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2257  DNA-cytosine methyltransferase  26.61 
 
 		 323 aa  84.3  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120501 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0731  site-specific DNA methylase  28.32 
 
 		 406 aa  84  0.000000000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00265008  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1510  DNA-cytosine methyltransferase  25.46 
 
 		 414 aa  84.3  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3399  DNA-cytosine methyltransferase  25 
 
 		 356 aa  82.8  0.000000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273087  hitchhiker  0.000000104958 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2793  DNA-cytosine methyltransferase  24.37 
 
 		 727 aa  82.8  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0766  DNA-cytosine methyltransferase  28.18 
 
 		 488 aa  82  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0644  DNA-cytosine methyltransferase  25.26 
 
 		 390 aa  80.9  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000274432  normal  0.895055 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4810  DNA-cytosine methyltransferase  27.73 
 
 		 379 aa  81.3  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3307  DNA-cytosine methyltransferase  24.22 
 
 		 331 aa  80.5  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.594869 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0139  DNA-cytosine methyltransferase  22.99 
 
 		 361 aa  79.7  0.00000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00921515  n/a   
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4233  DNA-cytosine methyltransferase  30.98 
 
 		 283 aa  79.3  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3438  DNA modification cytosine-specific methyltransferase protein  25.68 
 
 		 364 aa  78.6  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0272  DNA-cytosine methyltransferase  26.23 
 
 		 308 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.861301  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0102  DNA-cytosine methyltransferase  22.34 
 
 		 438 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.557518  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5064  DNA-cytosine methyltransferase  27.09 
 
 		 424 aa  77  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3950  DNA-cytosine methyltransferase  26.69 
 
 		 508 aa  75.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2462  DNA-cytosine methyltransferase  27.41 
 
 		 412 aa  75.5  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.017331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3325  DNA-cytosine methyltransferase  26.01 
 
 		 438 aa  75.1  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2442  DNA-cytosine methyltransferase  21.99 
 
 		 464 aa  75.1  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.767774  unclonable  0.00000000055978 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0419  C-5 cytosine-specific DNA methylase  23.02 
 
 		 405 aa  74.3  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000336169  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0598  DNA-cytosine methyltransferase  25.17 
 
 		 440 aa  74.3  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0631504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0394  DNA-cytosine methyltransferase  25.17 
 
 		 440 aa  74.3  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0349953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1270  DNA-cytosine methyltransferase  25 
 
 		 406 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1243  DNA-cytosine methyltransferase  25.77 
 
 		 325 aa  73.6  0.000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0820  putative two-component sensor  26.6 
 
 		 489 aa  73.2  0.000000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0815134  n/a   
 
 
-
 
NC_012790  GWCH70_3472  DNA-cytosine methyltransferase  22.62 
 
 		 370 aa  73.2  0.000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000168758  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>