More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1604 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_1604  phage integrase family protein  100 
 
 		 459 aa  951    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0580  putative phage integrase  51.65 
 
 		 438 aa  411  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0922  Phage integrase  51.54 
 
 		 403 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.12188  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0409  putative phage integrase  52.17 
 
 		 411 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1997  integrase family protein  51.69 
 
 		 400 aa  404  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.726133 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1675  Phage integrase  51.25 
 
 		 419 aa  405  1e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0410  putative phage integrase  50.76 
 
 		 397 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.980223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0341  integrase family protein  51.72 
 
 		 436 aa  400  9.999999999999999e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2924  integrase family protein  50.13 
 
 		 390 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1896  putative integrase prophage protein  51.02 
 
 		 411 aa  392  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.240804  normal  0.815259 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4142  integrase family protein  50.13 
 
 		 401 aa  364  2e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2283  integrase family protein  46.94 
 
 		 417 aa  354  1e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.468069  normal  0.768394 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3334  phage integrase family protein  48.46 
 
 		 398 aa  355  1e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1142  integrase family protein  46.72 
 
 		 399 aa  354  2e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.441894  hitchhiker  0.0000269765 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0275  phage integrase family protein  49.11 
 
 		 407 aa  352  1e-95  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2013  integrase  50.13 
 
 		 409 aa  351  2e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0417759  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0966  phage integrase  48.47 
 
 		 410 aa  347  3e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0357996 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2309  phage integrase family protein  45.15 
 
 		 410 aa  344  2e-93  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.733964  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2389  integrase  46.06 
 
 		 415 aa  335  1e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.557961  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0970  phage integrase family protein  45.2 
 
 		 406 aa  329  8e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2480  integrase family protein  47.57 
 
 		 397 aa  327  2.0000000000000001e-88  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0151  phage integrase  43.13 
 
 		 429 aa  325  1e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4522  phage integrase  43.13 
 
 		 429 aa  322  6e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.292224 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3983  integrase family protein  49.36 
 
 		 391 aa  322  8e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1500  phage integrase family protein  42.66 
 
 		 432 aa  320  3e-86  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00572573  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2203  integrase family protein  43.78 
 
 		 404 aa  319  5e-86  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0637  phage integrase family protein  44.27 
 
 		 411 aa  316  5e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102856 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6554  integrase family protein  44.13 
 
 		 411 aa  315  7e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000624371  hitchhiker  0.00796568 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1348  phage integrase family protein  44.81 
 
 		 391 aa  315  8e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0253  integrase family protein  45.01 
 
 		 412 aa  305  8.000000000000001e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0244  integrase family protein  44.13 
 
 		 408 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1116  phage integrase family protein  41.18 
 
 		 434 aa  302  1e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0425544  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1063  integrase family protein  48.59 
 
 		 359 aa  299  7e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1070  integrase family protein  49 
 
 		 365 aa  298  2e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1496  phage integrase  46.47 
 
 		 343 aa  288  1e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.864475  normal  0.0288639 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3606  integrase family protein  44.08 
 
 		 420 aa  288  1e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5109  integrase family protein  44.42 
 
 		 420 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5749  integrase family protein  44.22 
 
 		 407 aa  277  3e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.857054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5029  phage integrase family protein  41.01 
 
 		 450 aa  272  9e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.440555  normal  0.789511 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2749  P4 family integrase  41.39 
 
 		 439 aa  260  5.0000000000000005e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1022  putative phage integrase  45.96 
 
 		 279 aa  247  3e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.599421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0847  phage integrase  35.75 
 
 		 403 aa  223  7e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.237314  normal  0.433067 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1298  integrase  37.81 
 
 		 400 aa  214  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.64566  normal  0.14409 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2277  phage integrase family site specific recombinase  37.43 
 
 		 402 aa  213  7e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0249375  normal  0.0747113 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4951  putative prophage integrase  33.51 
 
 		 408 aa  197  5.000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0229116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02454  integrase  44.64 
 
 		 228 aa  192  1e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1229  integrase family protein  32.44 
 
 		 402 aa  168  2e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.308607  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1546  phage integrase  32.75 
 
 		 387 aa  167  2.9999999999999998e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.226246  normal  0.34056 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0229  phage integrase  31.14 
 
 		 401 aa  160  3e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2541  putative CP4-like integrase  29.95 
 
 		 412 aa  160  6e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.016489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1237  integrase family protein  30.83 
 
 		 401 aa  158  1e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.184026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0239  phage integrase  31.59 
 
 		 384 aa  158  2e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2828  integrase family protein  33.92 
 
 		 396 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1357  phage family integrase  31.05 
 
 		 411 aa  152  8.999999999999999e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.183355  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1631  integrase family protein  32.98 
 
 		 409 aa  152  1e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1791  phage integrase family protein  30.56 
 
 		 411 aa  150  4e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.275952  normal  0.224939 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2977  integrase family protein  30.5 
 
 		 429 aa  149  9e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1254  integrase family protein  31.23 
 
 		 406 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1761  phage integrase family protein  30.56 
 
 		 411 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0148676  normal  0.285781 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1686  phage integrase family protein  30.3 
 
 		 411 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.034435  normal  0.0441759 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3253  integrase family protein  33.67 
 
 		 406 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.274925  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0928  phage integrase family site specific recombinase  32.17 
 
 		 438 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0249275  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3537  integrase family protein  29.6 
 
 		 419 aa  145  1e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2463  phage integrase family protein  30.47 
 
 		 414 aa  145  1e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.384114  normal  0.0605266 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3034  integrase family protein  28.86 
 
 		 419 aa  144  2e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1823  prophage P4 integrase  31.22 
 
 		 421 aa  145  2e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0003918  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01122  integrase  28.5 
 
 		 410 aa  144  2e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2777  phage integrase family protein  29.84 
 
 		 414 aa  145  2e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.179227 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0747  Phage integrase  30.71 
 
 		 418 aa  144  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.236649  normal  0.444279 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0997  integrase family protein  30.99 
 
 		 410 aa  144  3e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1721  phage integrase  29.75 
 
 		 413 aa  144  5e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.749059  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2233  integrase family protein  31.62 
 
 		 397 aa  142  9.999999999999999e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0126025 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2855  phage integrase family protein  27.85 
 
 		 412 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.866183 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3412  integrase family protein  28.78 
 
 		 424 aa  142  9.999999999999999e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.357921  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2362  integrase family protein  28.32 
 
 		 416 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.965631  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0501  integrase family protein  28.36 
 
 		 419 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0858  integrase family protein  28.86 
 
 		 419 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1281  integrase family protein  30.49 
 
 		 410 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.250481  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2892  phage integrase family protein  30.96 
 
 		 423 aa  141  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.196545 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1063  integrase family protein  30.61 
 
 		 398 aa  140  3e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1143  phage integrase family protein  30.71 
 
 		 412 aa  140  3e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3419  integrase family protein  28.11 
 
 		 419 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.837092  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40500  Phage integrase  30.73 
 
 		 401 aa  140  6e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2952  phage integrase family protein  30.61 
 
 		 397 aa  139  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.20289e-17 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3554  integrase family protein  29.1 
 
 		 419 aa  139  7.999999999999999e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4836  integrase  28.92 
 
 		 421 aa  139  8.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.466297  normal  0.712135 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2480  integrase, phage family  28.93 
 
 		 413 aa  139  1e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00704938  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3717  integrase family protein  29.1 
 
 		 419 aa  139  1e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2073  putative integrase prophage protein  30.54 
 
 		 445 aa  138  2e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.343069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1442  phage integrase  29.56 
 
 		 404 aa  138  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2365  Phage integrase  31.45 
 
 		 404 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004301  phage integrase  29.41 
 
 		 415 aa  137  3.0000000000000003e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3996  phage integrase family protein  29.77 
 
 		 389 aa  137  4e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.243095  normal  0.464149 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2483  integrase family protein  31.46 
 
 		 404 aa  137  4e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2496  phage integrase family protein  31.33 
 
 		 408 aa  137  4e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0214559 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0657  phage integrase family protein  31.66 
 
 		 412 aa  137  4e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.907789  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5344  site-specific recombinase, phage integrase family  29.31 
 
 		 402 aa  136  8e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.803856  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3122  integrase family protein  30.83 
 
 		 404 aa  136  8e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1601  phage integrase family protein  29.89 
 
 		 416 aa  136  8e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.634793  normal  0.83663 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2751  integrase family protein  28.2 
 
 		 415 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.606598  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>