More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0104 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_0104  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 524 aa  1062    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.256556 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0121  AMP-dependent synthetase and ligase  90.27 
 
 		 522 aa  900    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0696  AMP-dependent synthetase and ligase  66.03 
 
 		 521 aa  656    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5158  putative o-succinylbenzoate-CoA ligase  53.7 
 
 		 527 aa  558  1e-157  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.20469 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  48.22 
 
 		 513 aa  463  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1681  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  46.41 
 
 		 514 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3161  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  47.56 
 
 		 516 aa  454  1.0000000000000001e-126  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1902  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  45.9 
 
 		 518 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.889055  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7124  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  45.38 
 
 		 512 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.100628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0848  AMP-dependent synthetase and ligase  45.87 
 
 		 517 aa  442  1e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3612  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  45.31 
 
 		 514 aa  442  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1905  AMP-dependent synthetase and ligase  47.66 
 
 		 512 aa  443  1e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.97218  normal  0.26016 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0449  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  45.72 
 
 		 516 aa  426  1e-118  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.93416 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0166  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  45.72 
 
 		 506 aa  422  1e-117  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1347  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  45.7 
 
 		 512 aa  420  1e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0177  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  45.53 
 
 		 506 aa  420  1e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.761031  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2397  AMP-dependent synthetase and ligase  43.82 
 
 		 516 aa  419  1e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.264456  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0186  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  45.53 
 
 		 506 aa  420  1e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0230763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0221  AMP-dependent synthetase and ligase  44.12 
 
 		 510 aa  418  9.999999999999999e-116  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0218  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  45.42 
 
 		 516 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0925378 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1124  AMP-dependent synthetase and ligase  45.28 
 
 		 509 aa  414  1e-114  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.719867  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3266  AMP-dependent synthetase and ligase  46.09 
 
 		 511 aa  408  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0015  acyl-CoA synthetase  45.11 
 
 		 511 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.323665 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3605  acyl-CoA synthetase  43.46 
 
 		 514 aa  405  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.133038  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2936  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  45.45 
 
 		 536 aa  404  1e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.098527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3399  AMP-dependent synthetase and ligase  45.63 
 
 		 522 aa  400  9.999999999999999e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10216  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  43.51 
 
 		 537 aa  402  9.999999999999999e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2714  AMP-dependent synthetase and ligase  44.66 
 
 		 546 aa  397  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1763  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  43.39 
 
 		 512 aa  395  1e-109  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2738  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  45.91 
 
 		 522 aa  395  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0912  AMP-dependent synthetase and ligase  44.96 
 
 		 515 aa  398  1e-109  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.881726 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4161  acyl-CoA synthetase  43.57 
 
 		 517 aa  394  1e-108  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4649  acyl-CoA synthetase  45.35 
 
 		 501 aa  393  1e-108  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5032  acyl-CoA synthetase  45.35 
 
 		 501 aa  394  1e-108  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.672582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4737  acyl-CoA synthetase  45.35 
 
 		 501 aa  393  1e-108  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.987006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2695  AMP-dependent synthetase and ligase  43.65 
 
 		 516 aa  389  1e-107  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4410  acyl-CoA synthetase  41.34 
 
 		 516 aa  383  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.648302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1502  acyl-CoA synthetase  42.94 
 
 		 515 aa  384  1e-105  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1525  acyl-CoA synthetase  42.94 
 
 		 515 aa  384  1e-105  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1502  acyl-CoA synthetase  42.94 
 
 		 515 aa  383  1e-105  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6056  AMP-dependent synthetase and ligase  41.42 
 
 		 515 aa  379  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5310  acyl-CoA synthetase  42.27 
 
 		 516 aa  381  1e-104  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4700  acyl-CoA synthetase  41.98 
 
 		 516 aa  376  1e-103  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0681  acyl-CoA synthetase  42.06 
 
 		 520 aa  374  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.457647 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2641  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.72 
 
 		 516 aa  347  3e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.517138  normal  0.152736 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1465  acyl-CoA synthetase  41.12 
 
 		 487 aa  343  4e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.845905  normal  0.967698 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3984  AMP-dependent synthetase and ligase  38.83 
 
 		 521 aa  335  1e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.446284  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2838  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.31 
 
 		 515 aa  334  3e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.153198 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6823  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase I  40.27 
 
 		 492 aa  331  2e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3597  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.94 
 
 		 543 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2927  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.55 
 
 		 509 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.686689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3839  AMP-dependent synthetase and ligase  38.45 
 
 		 508 aa  321  1.9999999999999998e-86  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3089  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.08 
 
 		 522 aa  317  5e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.196285  normal  0.363977 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0282  AMP-dependent synthetase and ligase  40.16 
 
 		 492 aa  315  9.999999999999999e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.376129  normal  0.234171 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2707  AMP-dependent synthetase and ligase  39.49 
 
 		 519 aa  315  1.9999999999999998e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0621527  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0804  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.83 
 
 		 516 aa  313  6.999999999999999e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.48042 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1871  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.12 
 
 		 524 aa  309  5.9999999999999995e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.394568  normal  0.852293 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1967  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.6 
 
 		 514 aa  307  3e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.595404  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1481  AMP-dependent synthetase and ligase  38.55 
 
 		 525 aa  306  9.000000000000001e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3874  AMP-dependent synthetase and ligase  39.02 
 
 		 510 aa  303  7.000000000000001e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0918503 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0423  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.6 
 
 		 509 aa  290  4e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0570  AMP-dependent synthetase and ligase  36.86 
 
 		 525 aa  289  8e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.356446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5528  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.05 
 
 		 509 aa  288  1e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3215  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.77 
 
 		 500 aa  286  7e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2787  AMP-dependent synthetase and ligase  36.36 
 
 		 518 aa  283  8.000000000000001e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.296837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6480  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.53 
 
 		 513 aa  280  3e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3247  AMP-dependent synthetase and ligase  38.56 
 
 		 497 aa  280  5e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.640388 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3166  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.52 
 
 		 501 aa  279  1e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.130976  hitchhiker  0.0000354644 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3057  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.63 
 
 		 499 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.847241  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4093  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.14 
 
 		 497 aa  270  4e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0327517  normal  0.151728 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3980  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.14 
 
 		 497 aa  270  4e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.310048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1368  AMP-dependent synthetase and ligase  33.53 
 
 		 515 aa  265  2e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.663143  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01193  acyl-CoA synthase  33.53 
 
 		 544 aa  252  1e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0176178  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1034  AMP-dependent synthetase and ligase  34.98 
 
 		 495 aa  249  1e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4604  AMP-dependent synthetase and ligase  34.71 
 
 		 492 aa  236  9e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.37521 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1599  AMP-dependent synthetase and ligase  34.84 
 
 		 484 aa  236  1.0000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1025  AMP-dependent synthetase and ligase  34.7 
 
 		 498 aa  235  1.0000000000000001e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1029  AMP-dependent synthetase and ligase  33.87 
 
 		 499 aa  234  3e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1913  AMP-dependent synthetase and ligase  33.02 
 
 		 515 aa  230  5e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6878  AMP-dependent synthetase and ligase  32.56 
 
 		 509 aa  230  6e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.615245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6739  AMP-dependent synthetase and ligase  33.79 
 
 		 532 aa  229  1e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0799452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0351  AMP-dependent synthetase and ligase  34.04 
 
 		 507 aa  229  1e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1112  putative acyl-CoA ligase  34.17 
 
 		 504 aa  229  1e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.29648 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0098  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 		 522 aa  228  2e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.690806  normal  0.913632 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  34.17 
 
 		 525 aa  228  3e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4908  AMP-dependent synthetase and ligase  31.05 
 
 		 512 aa  225  2e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.96823  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  32.76 
 
 		 520 aa  223  4.9999999999999996e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0814  AMP-dependent synthetase and ligase  33.52 
 
 		 517 aa  222  9.999999999999999e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1600  AMP-dependent synthetase and ligase  31.8 
 
 		 496 aa  221  3e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0115  AMP-dependent synthetase and ligase  33.68 
 
 		 526 aa  220  5e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4472  AMP-dependent synthetase and ligase  32.67 
 
 		 517 aa  219  1e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3855  AMP-dependent synthetase and ligase  33.2 
 
 		 523 aa  218  2.9999999999999998e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.713722 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3975  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.15 
 
 		 530 aa  217  4e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.251646  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  31.65 
 
 		 520 aa  217  4e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.504179  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1225  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.54 
 
 		 519 aa  215  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.399435  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4160  AMP-dependent synthetase and ligase  33.83 
 
 		 499 aa  215  1.9999999999999998e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.365856  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  30.69 
 
 		 499 aa  214  2.9999999999999995e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4081  AMP-dependent synthetase and ligase  31.26 
 
 		 512 aa  214  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  30.66 
 
 		 521 aa  213  4.9999999999999996e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13106  fatty-acid-CoA ligase fadD13  32.23 
 
 		 503 aa  212  1e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>