270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_1434 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_2513  Patatin  95 
 
 		 400 aa  720    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.220838  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1434  patatin  100 
 
 		 400 aa  777    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2426  Patatin  95.25 
 
 		 400 aa  722    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.371525  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2395  patatin  74.87 
 
 		 391 aa  597  1e-169  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0853  patatin  41.91 
 
 		 382 aa  292  6e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000107118  unclonable  0.000000108981 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2472  patatin  40.85 
 
 		 408 aa  290  2e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.797753  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1094  Patatin  44.06 
 
 		 381 aa  280  2e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.982413  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1237  patatin  43.83 
 
 		 393 aa  279  6e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.880366  normal  0.614167 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1884  hypothetical protein  43.39 
 
 		 389 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.93068  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22060  hypothetical protein  42.86 
 
 		 389 aa  269  5e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0545767  hitchhiker  7.20357e-19 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1392  patatin  40.21 
 
 		 379 aa  265  1e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0427105  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2859  patatin  38.68 
 
 		 374 aa  262  6.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000023249  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1888  hypothetical protein  38.16 
 
 		 380 aa  262  8e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3005  patatin  38.68 
 
 		 383 aa  261  1e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000873649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1160  hypothetical protein  39.15 
 
 		 374 aa  261  1e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1500  Patatin  38.68 
 
 		 374 aa  261  2e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000109081  normal  0.428917 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2876  patatin  38.68 
 
 		 374 aa  261  2e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000103139  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1397  patatin  39.43 
 
 		 374 aa  261  2e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0173142  normal  0.188155 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2519  patatin  39.53 
 
 		 374 aa  261  2e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.256378  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1409  patatin  39.16 
 
 		 374 aa  260  3e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0748735 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1344  patatin  39.16 
 
 		 374 aa  260  4e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0143871 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3260  patatin  37.63 
 
 		 375 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3155  hypothetical protein  39.74 
 
 		 374 aa  259  6e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1615  patatin  40.74 
 
 		 394 aa  258  2e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.793061  normal  0.584211 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2547  patatin  37.4 
 
 		 375 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3870  patatin family protein  40.48 
 
 		 393 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.838023  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2615  patatin  38.22 
 
 		 374 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1697  patatin  40.68 
 
 		 390 aa  252  8.000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.741172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2805  Patatin  40.75 
 
 		 410 aa  251  1e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0078  patatin  38.97 
 
 		 418 aa  251  1e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.767923 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1761  patatin  40.47 
 
 		 376 aa  251  1e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2756  patatin  36.94 
 
 		 377 aa  251  1e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2865  patatin  37.14 
 
 		 374 aa  251  2e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.906951  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3141  patatin  36.05 
 
 		 375 aa  250  3e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.133686  normal  0.0844879 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1286  patatin  41.11 
 
 		 382 aa  248  9e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1328  patatin  41.38 
 
 		 382 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4479  patatin  41.6 
 
 		 425 aa  248  1e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.493587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0108  patatin  40.34 
 
 		 422 aa  248  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3983  patatin  41.38 
 
 		 382 aa  247  3e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.251538  normal  0.787377 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1736  patatin  41.11 
 
 		 382 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1182  Patatin  40.51 
 
 		 416 aa  245  8e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.41454  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3832  patatin  43.22 
 
 		 418 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2157  patatin  35.88 
 
 		 392 aa  244  3e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.128779  normal  0.260963 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4076  Patatin  42.09 
 
 		 397 aa  242  7e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0978  patatin  41.22 
 
 		 422 aa  241  1e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0306  hypothetical protein  39.44 
 
 		 391 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1274  patatin  37.17 
 
 		 376 aa  240  4e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.534062  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0168  Patatin  39.06 
 
 		 394 aa  239  6.999999999999999e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1594  patatin-like phospholipase family protein  36.24 
 
 		 383 aa  239  9e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.845479  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2250  hypothetical protein  40.91 
 
 		 394 aa  238  2e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1844  patatin  40.82 
 
 		 412 aa  235  9e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.237436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0161  Patatin  38.95 
 
 		 385 aa  234  3e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.957782 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1160  alpha-beta hydrolase family esterase  42.24 
 
 		 400 aa  231  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2924  patatin  37.73 
 
 		 408 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.761866 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2295  patatin  37.73 
 
 		 408 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0597208  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2909  patatin  37.73 
 
 		 408 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.255249  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2722  hypothetical protein  33.51 
 
 		 370 aa  226  4e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3101  patatin  33.85 
 
 		 378 aa  227  4e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.480347  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0395  patatin  37.69 
 
 		 463 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00554522 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2853  hypothetical protein  33.51 
 
 		 370 aa  225  1e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3273  patatin  37.47 
 
 		 427 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2821  patatin  37.24 
 
 		 408 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.438344 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2958  patatin  37.18 
 
 		 408 aa  211  1e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6252  patatin  36.87 
 
 		 408 aa  210  4e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.478627 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0605  patatin  35.92 
 
 		 414 aa  206  7e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0422  patatin family phospholipase  35.92 
 
 		 415 aa  206  7e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.272938  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0365  patatin  35.68 
 
 		 410 aa  204  2e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0673192  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0441  patatin family phospholipase  36.04 
 
 		 414 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.12986  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4614  patatin  34.01 
 
 		 408 aa  171  1e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.758512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1352  patatin family phospholipase  38.01 
 
 		 300 aa  169  6e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.620499  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0242  patatin  38.01 
 
 		 300 aa  169  6e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.314598  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5960  Patatin  32.22 
 
 		 421 aa  163  6e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1777  patatin  34.96 
 
 		 419 aa  153  4e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.152361  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2155  Patatin  34.07 
 
 		 419 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2063  Patatin  33.82 
 
 		 419 aa  146  5e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.719595  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4934  Patatin  33.68 
 
 		 429 aa  94.4  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.791288  normal  0.414026 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2521  Patatin  33.25 
 
 		 420 aa  88.2  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0335  patatin  29.07 
 
 		 377 aa  82.4  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0172701 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1914  hypothetical protein  26.3 
 
 		 334 aa  75.1  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0848  patatin  27.16 
 
 		 377 aa  73.6  0.000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785224 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1925  hypothetical protein  26.62 
 
 		 339 aa  72.8  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22400  Patatin  26.67 
 
 		 343 aa  70.1  0.00000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1281  patatin  30.17 
 
 		 406 aa  69.3  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000145199  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2133  patatin  30.43 
 
 		 410 aa  69.3  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3930  patatin  29.79 
 
 		 375 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.664139 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1865  patatin  28.76 
 
 		 387 aa  67.4  0.0000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0221  hypothetical protein  31.33 
 
 		 303 aa  65.9  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4898  putative patatin-like phospholipase  32.19 
 
 		 313 aa  66.2  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0432192 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4981  patatin  29.36 
 
 		 405 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2551  hypothetical protein  30.91 
 
 		 349 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.712482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3124  patatin  29.36 
 
 		 405 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0073  Patatin  32.61 
 
 		 306 aa  65.5  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.568339 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0065  Patatin  32.61 
 
 		 306 aa  65.5  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4457  patatin  33.05 
 
 		 312 aa  64.7  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0020  patatin family phospholipase  29.96 
 
 		 412 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0020  patatin family phospholipase  29.96 
 
 		 412 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0022  patatin family phospholipase  29.96 
 
 		 412 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5355  Patatin  30.4 
 
 		 382 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.137697  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0420  patatin  24.89 
 
 		 397 aa  64.3  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0379208  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1166  patatin family phospholipase  29.96 
 
 		 412 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>