More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_0289 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU3423  transketolase  57.19 
 
 
668 aa  682    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0300  transketolase  96.99 
 
 
665 aa  1285    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0487  transketolase  51.81 
 
 
667 aa  644    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.33279  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0178  transketolase  56.22 
 
 
668 aa  660    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0311  transketolase  96.99 
 
 
665 aa  1288    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.554758  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0289  transketolase  100 
 
 
665 aa  1340    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0730452  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2804  transketolase  52.74 
 
 
665 aa  664    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0841  transketolase  54.96 
 
 
679 aa  690    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2601  transketolase  55.42 
 
 
668 aa  661    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000100411  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0315  transketolase  79.22 
 
 
665 aa  1086    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0472  transketolase  52.92 
 
 
682 aa  633  1e-180  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2122  transketolase  51.5 
 
 
668 aa  628  1e-178  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0416  transketolase  52.69 
 
 
678 aa  624  1e-177  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.985586  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3879  transketolase  52.47 
 
 
675 aa  622  1e-177  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.657918 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4614  transketolase  52.62 
 
 
674 aa  621  1e-176  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.566503 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14410  transketolase  48.11 
 
 
660 aa  615  1e-175  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1241  transketolase  49.17 
 
 
668 aa  615  1e-175  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000546415  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1883  transketolase  50.23 
 
 
672 aa  609  1e-173  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.768149  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03290  transketolase  47.58 
 
 
661 aa  609  1e-173  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0946  transketolase  50.84 
 
 
665 aa  611  1e-173  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0644  transketolase  47.6 
 
 
666 aa  608  9.999999999999999e-173  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0678  transketolase  47.6 
 
 
666 aa  608  9.999999999999999e-173  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_584  transketolase  47.73 
 
 
666 aa  606  9.999999999999999e-173  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0616  transketolase  47.01 
 
 
666 aa  605  9.999999999999999e-173  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3125  transketolase  50.15 
 
 
664 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5284  transketolase  50.96 
 
 
691 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5573  transketolase  50.96 
 
 
691 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1379  transketolase  49.93 
 
 
711 aa  600  1e-170  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356531  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2903  transketolase  49.49 
 
 
711 aa  600  1e-170  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000161618 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1904  transketolase  46.4 
 
 
668 aa  598  1e-170  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2594  transketolase  48.3 
 
 
681 aa  596  1e-169  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.123442 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3718  transketolase  48.48 
 
 
666 aa  593  1e-168  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000892016  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3470  transketolase  48.48 
 
 
666 aa  592  1e-168  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000202879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3436  transketolase  48.64 
 
 
666 aa  592  1e-168  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000116203  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3388  transketolase  48.64 
 
 
666 aa  593  1e-168  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000543798  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3744  transketolase  48.48 
 
 
666 aa  592  1e-168  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000152991  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3699  transketolase  48.21 
 
 
680 aa  593  1e-168  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000172901 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1828  transketolase  49.24 
 
 
653 aa  593  1e-168  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.208586  normal  0.379943 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1524  transketolase  48.06 
 
 
680 aa  594  1e-168  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000346626  normal  0.0243149 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3742  transketolase  48.64 
 
 
666 aa  593  1e-168  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000620958  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2841  transketolase  50.61 
 
 
665 aa  592  1e-168  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0554  transketolase  48.64 
 
 
665 aa  593  1e-168  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3369  transketolase  48.64 
 
 
666 aa  590  1e-167  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00015872  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0103  transketolase  51.22 
 
 
662 aa  590  1e-167  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4499  transketolase  48.98 
 
 
688 aa  591  1e-167  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2336  transketolase  47.58 
 
 
666 aa  589  1e-167  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000657537  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2261  transketolase  50.46 
 
 
666 aa  590  1e-167  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3413  transketolase  48.54 
 
 
664 aa  588  1e-166  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3411  transketolase  48.38 
 
 
664 aa  585  1e-166  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.856564  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0565  transketolase  47.53 
 
 
680 aa  585  1e-166  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3165  transketolase  48.38 
 
 
664 aa  587  1e-166  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3082  transketolase  48.23 
 
 
664 aa  586  1e-166  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3388  transketolase  48.38 
 
 
664 aa  588  1e-166  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.170816  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0309  transketolase  47.53 
 
 
684 aa  587  1e-166  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000137507 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2102  transketolase  46.68 
 
 
668 aa  587  1e-166  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000131444  normal  0.204144 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0510  transketolase  47.6 
 
 
664 aa  584  1.0000000000000001e-165  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1187  transketolase  47.18 
 
 
670 aa  583  1.0000000000000001e-165  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0904971  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1698  transketolase  50.74 
 
 
691 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3790  transketolase  48.48 
 
 
666 aa  584  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00258353  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20621  transketolase  47.02 
 
 
670 aa  582  1.0000000000000001e-165  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2893  transketolase  47.33 
 
 
665 aa  582  1.0000000000000001e-165  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0224  transketolase  46.95 
 
 
673 aa  583  1.0000000000000001e-165  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0552  transketolase  47.16 
 
 
664 aa  583  1.0000000000000001e-165  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2283  transketolase  49.55 
 
 
667 aa  583  1.0000000000000001e-165  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0932399  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3401  transketolase  48.38 
 
 
664 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0026  transketolase  47.53 
 
 
694 aa  583  1.0000000000000001e-165  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0910343  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1844  transketolase  48.07 
 
 
664 aa  582  1e-164  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.862582 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1981  transketolase  47.25 
 
 
664 aa  581  1e-164  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1547  transketolase  46.74 
 
 
659 aa  582  1e-164  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.45317  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1635  transketolase  47.09 
 
 
670 aa  579  1e-164  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0651  transketolase  48.72 
 
 
723 aa  579  1e-164  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02765  transketolase 1, thiamin-binding  45.98 
 
 
663 aa  577  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0759  transketolase  45.98 
 
 
663 aa  577  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02728  hypothetical protein  45.98 
 
 
663 aa  577  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0847  transketolase  47.31 
 
 
664 aa  576  1.0000000000000001e-163  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2390  transketolase  47.66 
 
 
666 aa  578  1.0000000000000001e-163  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0781466 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3181  transketolase  47.66 
 
 
674 aa  576  1.0000000000000001e-163  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0776  transketolase  45.98 
 
 
663 aa  577  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0260346 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0850  transketolase  47.31 
 
 
664 aa  576  1.0000000000000001e-163  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.889577  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1617  transketolase  46.81 
 
 
665 aa  575  1.0000000000000001e-163  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.804069 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3093  transketolase  45.98 
 
 
663 aa  577  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3352  transketolase  47.31 
 
 
664 aa  575  1.0000000000000001e-163  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3432  transketolase  47.66 
 
 
674 aa  576  1.0000000000000001e-163  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4237  transketolase  45.98 
 
 
663 aa  577  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3077  transketolase  46.18 
 
 
663 aa  576  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00342437 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5124  transketolase  50.62 
 
 
671 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3765  transketolase  46.59 
 
 
659 aa  578  1.0000000000000001e-163  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1538  transketolase  47.18 
 
 
666 aa  578  1.0000000000000001e-163  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0168278  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3269  transketolase  45.98 
 
 
663 aa  577  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0409  transketolase  48.01 
 
 
662 aa  575  1.0000000000000001e-163  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.148616  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3367  transketolase  45.83 
 
 
663 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07130  transketolase  48.5 
 
 
665 aa  578  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1127  transketolase  50 
 
 
692 aa  578  1.0000000000000001e-163  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0296008 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15980  transketolase  48.15 
 
 
699 aa  575  1.0000000000000001e-162  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0310968  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4792  transketolase  48.2 
 
 
665 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00646987 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0124  transketolase  47.45 
 
 
669 aa  575  1.0000000000000001e-162  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0136213 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3313  transketolase  46.18 
 
 
663 aa  573  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.333465  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0538  transketolase  47.31 
 
 
668 aa  574  1.0000000000000001e-162  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3256  transketolase  46.18 
 
 
663 aa  573  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3238  transketolase  46.03 
 
 
663 aa  572  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>