More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1488 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_1488  ABC transporter related protein  100 
 
 
259 aa  518  1e-146  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0824  ABC transporter related  43.6 
 
 
247 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0598  ABC transporter related  43.15 
 
 
253 aa  211  1e-53  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1184  branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  40.96 
 
 
293 aa  205  7e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00283179  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1502  ABC transporter related  43.78 
 
 
247 aa  204  1e-51  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.202973  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3968  ABC transporter related protein  41.56 
 
 
263 aa  202  3e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1039  ABC transporter related  39.6 
 
 
270 aa  202  4e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.418168 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0659  ABC transporter related protein  40.87 
 
 
266 aa  201  7e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0315  ABC transporter related  43.15 
 
 
246 aa  201  9.999999999999999e-51  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2707  ABC transporter related  38.8 
 
 
258 aa  199  5e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3409  ABC transporter related  38.8 
 
 
258 aa  199  5e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4896  ABC transporter related protein  42.86 
 
 
265 aa  196  4.0000000000000005e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.408295  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2096  ABC transporter related  39.29 
 
 
297 aa  196  4.0000000000000005e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.185907  normal  0.0132496 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3015  ABC transporter related  36.95 
 
 
327 aa  195  6e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1981  putative branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  42.4 
 
 
257 aa  194  1e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.547444 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1273  ABC transporter related  38.15 
 
 
263 aa  194  1e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.459215 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1763  ABC transporter related  38.28 
 
 
254 aa  193  3e-48  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0241378  hitchhiker  0.00146428 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0593  ABC transporter related  39.06 
 
 
255 aa  193  3e-48  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.137046  hitchhiker  0.0000276007 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2164  ABC transporter related  38.15 
 
 
263 aa  191  9e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1806  ABC transporter related  42.28 
 
 
246 aa  191  1e-47  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.944964  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3961  ABC transporter related  40 
 
 
252 aa  190  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.721772  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1146  ABC transporter related  39.76 
 
 
262 aa  190  2e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1579  ABC transporter related  41.18 
 
 
261 aa  190  2e-47  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0133933  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3704  ABC transporter-like  37.6 
 
 
260 aa  189  2.9999999999999997e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2774  ABC transporter-like protein protein  39.6 
 
 
261 aa  190  2.9999999999999997e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0447  ABC transporter related  39.13 
 
 
254 aa  189  4e-47  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1422  ABC transporter related  34.38 
 
 
272 aa  189  5.999999999999999e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3205  ABC transporter related protein  38.31 
 
 
351 aa  188  7e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.931836  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1584  ABC transporter related  37.89 
 
 
255 aa  187  1e-46  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3842  ABC transporter related  39.6 
 
 
252 aa  187  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1545  ABC transporter related  42.21 
 
 
252 aa  186  4e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3088  ABC transporter related protein  40.4 
 
 
297 aa  185  5e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3414  ABC transporter component  41.5 
 
 
255 aa  185  7e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.554453  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0106  ABC transporter related protein  39.84 
 
 
302 aa  184  1.0000000000000001e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.732505  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1521  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  37.35 
 
 
260 aa  182  3e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.240271 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4884  ABC transporter related  37.6 
 
 
260 aa  182  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3931  ABC transporter related  38.15 
 
 
301 aa  182  5.0000000000000004e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2924  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  37.97 
 
 
260 aa  181  7e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.454233  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1569  ABC transporter related  37.97 
 
 
260 aa  181  7e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.51859  normal  0.809659 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2502  ABC transporter related protein  37.85 
 
 
254 aa  181  1e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0925  ABC transporter related  37.55 
 
 
260 aa  181  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0463719  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2205  ABC transporter related  36.14 
 
 
310 aa  180  2e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0505  ABC transporter related  35.91 
 
 
265 aa  180  2e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3102  ABC transporter related protein  36.4 
 
 
256 aa  179  4e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1156  ABC transporter related  34.54 
 
 
349 aa  179  4e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.113513  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1229  ABC transporter related  35.74 
 
 
367 aa  179  4.999999999999999e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000210796 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1893  ATPase  36.55 
 
 
258 aa  178  8e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0578772  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1723  ABC transporter related  34.8 
 
 
256 aa  177  1e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1738  ABC transporter related protein  40 
 
 
277 aa  177  1e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1974  ABC transporter related protein  36.14 
 
 
315 aa  176  4e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0931609  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2890  ABC transporter related protein  34.94 
 
 
353 aa  175  8e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0599  ABC transporter related  37.05 
 
 
279 aa  174  9.999999999999999e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1128  ABC transporter related  35.6 
 
 
256 aa  174  9.999999999999999e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.79034  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3338  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  34.92 
 
 
251 aa  174  1.9999999999999998e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3392  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  36.61 
 
 
256 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1245  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  34.52 
 
 
255 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.592579 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4306  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  34.26 
 
 
255 aa  171  7.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1172  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  34.92 
 
 
255 aa  171  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.333486  normal  0.875323 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0909  ABC transporter related  40 
 
 
241 aa  171  9e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1114  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  34.4 
 
 
256 aa  171  1e-41  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1138  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  34.52 
 
 
255 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.523299  normal  0.117665 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4111  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  34.85 
 
 
255 aa  170  2e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.277717  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2932  ABC transporter related  33.2 
 
 
263 aa  171  2e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4279  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  34.92 
 
 
255 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.667482  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2553  ABC transporter related  33.73 
 
 
255 aa  170  2e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50550  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  33.86 
 
 
255 aa  170  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.013767 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0478  ABC transporter related protein  33.2 
 
 
255 aa  169  3e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000496209  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1155  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  34.52 
 
 
255 aa  169  3e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0154079 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3200  ABC transporter-related protein  32.62 
 
 
291 aa  169  4e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2477  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  34.13 
 
 
255 aa  169  4e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0920701 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1406  ABC transporter related  36.55 
 
 
254 aa  169  5e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.260319  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2849  ABC transporter related protein  38.34 
 
 
247 aa  169  5e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.485647  normal  0.511604 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1384  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  33.07 
 
 
255 aa  168  8e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0818364  normal  0.420206 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2270  ABC transporter related  36.36 
 
 
257 aa  168  8e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.881925 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3848  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  34.44 
 
 
255 aa  167  1e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0319236  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2425  ABC transporter-related protein  38.15 
 
 
608 aa  168  1e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.630273  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1426  ABC transporter related protein  35.55 
 
 
253 aa  167  1e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.259365  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1820  ABC transporter-related protein  34.92 
 
 
250 aa  167  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0671  ABC transporter related  35.06 
 
 
252 aa  167  2e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1389  ABC transporter related  36.25 
 
 
256 aa  167  2e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1945  ABC transporter related protein  35.97 
 
 
257 aa  167  2e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1093  ABC transporter related  38.55 
 
 
555 aa  166  4e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.403079  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2316  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  34.92 
 
 
261 aa  166  4e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0614  ABC transporter related  32.4 
 
 
259 aa  166  4e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.417292  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1385  ABC transporter related  33.6 
 
 
256 aa  165  5e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0622  ABC transporter related  34.65 
 
 
269 aa  165  5.9999999999999996e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.105631  normal  0.0623344 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3054  ABC transporter related protein  32.4 
 
 
259 aa  165  5.9999999999999996e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0519  ABC transporter related  32.14 
 
 
255 aa  165  6.9999999999999995e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.295822  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1521  ABC transporter related  39.77 
 
 
242 aa  165  8e-40  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.0000012745  normal  0.429613 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1864  ABC transporter related  36.8 
 
 
599 aa  164  9e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2423  ABC transporter related  34.55 
 
 
269 aa  164  9e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0261  ATPase  35.32 
 
 
255 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19620  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  34.26 
 
 
255 aa  164  1.0000000000000001e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00232655  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1895  ABC transporter related  34.52 
 
 
264 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.045423 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2364  ABC transporter related  36.36 
 
 
245 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.106174  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0401  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  33.47 
 
 
254 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2041  ABC transporter related  34.4 
 
 
250 aa  163  3e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000871582 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0609  ATPase  33.07 
 
 
261 aa  163  3e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1034  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  32 
 
 
256 aa  163  3e-39  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.634603  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5130  ABC transporter related  38 
 
 
250 aa  163  3e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0104997 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>