237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3985 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_3985  hypothetical protein  100 
 
 
143 aa  295  2e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.889068  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1406  protein of unknown function UPF0102  36.11 
 
 
114 aa  80.1  0.000000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5877  protein of unknown function UPF0102  35.04 
 
 
117 aa  75.9  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.662779 
 
 
-
 
NC_002936  DET0781  hypothetical protein  35.09 
 
 
121 aa  73.6  0.000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1874  hypothetical protein  41.18 
 
 
135 aa  73.6  0.000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0666  hypothetical protein  41.41 
 
 
116 aa  72.8  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0397911  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_687  endonuclease  36.84 
 
 
121 aa  73.2  0.000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02085  hypothetical protein  32.2 
 
 
119 aa  72.8  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.997348  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0720  hypothetical protein  35.96 
 
 
126 aa  72.4  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0341617  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2035  hypothetical protein  36.21 
 
 
122 aa  72  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.848509  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2019  protein of unknown function UPF0102  39.5 
 
 
134 aa  71.2  0.000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.573307  normal  0.167847 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1093  endonuclease-like  38.46 
 
 
202 aa  70.9  0.000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0707  hypothetical protein  35.09 
 
 
121 aa  70.5  0.000000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1992  hypothetical protein  36.84 
 
 
129 aa  69.7  0.00000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4433  hypothetical protein  34.21 
 
 
129 aa  68.9  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.875795  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0553  protein of unknown function UPF0102  41.28 
 
 
118 aa  68.9  0.00000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.156898 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07020  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  36.84 
 
 
186 aa  69.3  0.00000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00114408  normal  0.507303 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2298  hypothetical protein  38.61 
 
 
123 aa  68.9  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0017  hypothetical protein  38.54 
 
 
128 aa  68.2  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000457371  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0701  hypothetical protein  36.08 
 
 
122 aa  68.6  0.00000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3756  hypothetical protein  33.87 
 
 
127 aa  68.2  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00341379  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1406  protein of unknown function UPF0102  39.05 
 
 
173 aa  68.2  0.00000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000418677  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0037  hypothetical protein  33.65 
 
 
127 aa  68.2  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1959  hypothetical protein  35.09 
 
 
122 aa  67.8  0.00000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.142549  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2864  hypothetical protein  33.04 
 
 
122 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00415914  hitchhiker  0.000000500394 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1062  hypothetical protein  34.35 
 
 
138 aa  67.4  0.00000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.340253 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0016  hypothetical protein  38.38 
 
 
129 aa  67  0.00000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.197298  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1447  protein of unknown function UPF0102  37.19 
 
 
127 aa  66.6  0.00000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3740  protein of unknown function UPF0102  40.21 
 
 
121 aa  66.2  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000086697  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2488  protein of unknown function UPF0102  34.38 
 
 
123 aa  66.6  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0776001  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09830  conserved hypothetical protein TIGR00252  36.21 
 
 
125 aa  66.2  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.351272  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2213  protein of unknown function UPF0102  35.35 
 
 
118 aa  66.6  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.19652 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1272  protein of unknown function UPF0102  37.25 
 
 
125 aa  65.9  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1677  hypothetical protein  34.21 
 
 
122 aa  65.5  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.238653  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2202  hypothetical protein  40.54 
 
 
121 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.474644  normal  0.174288 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07400  hypothetical protein  33.04 
 
 
116 aa  65.5  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1475  endonuclease  36.61 
 
 
115 aa  65.1  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.733308  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1186  hypothetical protein  36.29 
 
 
140 aa  65.1  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00400032  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0758  hypothetical protein  33.9 
 
 
130 aa  65.1  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3709  protein of unknown function UPF0102  39.18 
 
 
119 aa  64.7  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2398  hypothetical protein  36.89 
 
 
118 aa  64.3  0.0000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.430013  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0977  hypothetical protein  33.33 
 
 
119 aa  63.9  0.0000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.320606  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3311  protein of unknown function UPF0102  39.22 
 
 
134 aa  63.5  0.0000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2881  hypothetical protein  42.57 
 
 
146 aa  63.2  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.696458 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2025  hypothetical protein  31.3 
 
 
119 aa  63.2  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1530  hypothetical protein  32.71 
 
 
118 aa  62.8  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0048655  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1703  hypothetical protein  35 
 
 
123 aa  63.2  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10070  conserved hypothetical protein TIGR00252  40.59 
 
 
153 aa  63.2  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0294595  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3766  hypothetical protein  35.04 
 
 
122 aa  63.2  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.969308  normal  0.0430921 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0650  hypothetical protein  33.33 
 
 
128 aa  62.4  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3485  hypothetical protein  32 
 
 
125 aa  62  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000340579 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2217  hypothetical protein  35.25 
 
 
123 aa  62.8  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089571  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0272  hypothetical protein  34.69 
 
 
108 aa  62.4  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000600044  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0017  hypothetical protein  38.54 
 
 
126 aa  62  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00052241  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2007  hypothetical protein  34.78 
 
 
124 aa  62.4  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.63182  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3355  hypothetical protein  33.33 
 
 
108 aa  62  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0629  hypothetical protein  39.62 
 
 
122 aa  62  0.000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0226  hypothetical protein  34.65 
 
 
114 aa  62  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.113401  normal  0.113585 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0993  protein of unknown function UPF0102  38.14 
 
 
129 aa  61.2  0.000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00109853  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0676  hypothetical protein  33.04 
 
 
167 aa  61.6  0.000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0552943  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0391  hypothetical protein  33.9 
 
 
149 aa  61.2  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0487377 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0669  hypothetical protein  37.11 
 
 
124 aa  60.8  0.000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3424  hypothetical protein  32 
 
 
125 aa  60.8  0.000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3881  hypothetical protein  32.65 
 
 
108 aa  60.8  0.000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.114446 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0231  protein of unknown function UPF0102  39.39 
 
 
121 aa  60.8  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.819406  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4252  hypothetical protein  30.89 
 
 
117 aa  60.5  0.000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000137469 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1291  protein of unknown function UPF0102  33.91 
 
 
115 aa  60.5  0.000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000677509  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1792  hypothetical protein  37 
 
 
160 aa  60.1  0.000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1376  protein of unknown function UPF0102  34.21 
 
 
119 aa  59.7  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000032081  normal  0.333882 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3065  hypothetical protein  29.2 
 
 
118 aa  59.7  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0930  hypothetical protein  38.38 
 
 
123 aa  60.1  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.930588  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4685  hypothetical protein  29.51 
 
 
120 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0484178 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23670  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  36.21 
 
 
127 aa  59.7  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.183487  normal  0.0867152 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0277  protein of unknown function UPF0102  31.93 
 
 
120 aa  59.7  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.107261  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0388  hypothetical protein  30.7 
 
 
108 aa  60.1  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.597532  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0299  hypothetical protein  30.61 
 
 
108 aa  59.3  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10390  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  35.92 
 
 
167 aa  58.9  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000139118  unclonable  0.000000000910029 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0756  hypothetical protein  31.58 
 
 
118 aa  59.3  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.477778  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0675  protein of unknown function UPF0102  30 
 
 
165 aa  58.9  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0465  hypothetical protein  33 
 
 
113 aa  58.9  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3685  hypothetical protein  32.65 
 
 
108 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1723  hypothetical protein  32.67 
 
 
123 aa  58.9  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0630  hypothetical protein  33.63 
 
 
144 aa  59.3  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1218  protein of unknown function UPF0102  32.32 
 
 
119 aa  59.3  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.648075  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0260  hypothetical protein  31.63 
 
 
108 aa  58.9  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1320  hypothetical protein  39.29 
 
 
121 aa  58.9  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1228  hypothetical protein  37.17 
 
 
119 aa  58.5  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.74821  normal  0.260342 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1934  hypothetical protein  34.21 
 
 
120 aa  58.2  0.00000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.547856  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0259  hypothetical protein  34.21 
 
 
120 aa  58.2  0.00000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0460  protein of unknown function UPF0102  31.9 
 
 
153 aa  57.8  0.00000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57490  hypothetical protein  31.71 
 
 
125 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3298  hypothetical protein  32.76 
 
 
124 aa  57.8  0.00000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.861672  normal  0.570212 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2103  hypothetical protein  33.33 
 
 
121 aa  57.8  0.00000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.374615  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2095  protein of unknown function UPF0102  32.69 
 
 
137 aa  57.4  0.00000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0195  hypothetical protein  32.43 
 
 
119 aa  57.4  0.00000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.227376  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1212  protein of unknown function UPF0102  28.95 
 
 
121 aa  57.4  0.00000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1175  protein of unknown function UPF0102  37.5 
 
 
122 aa  57  0.00000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1217  hypothetical protein  31.4 
 
 
123 aa  57  0.00000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266389  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2193  hypothetical protein  36.46 
 
 
207 aa  56.2  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1725  normal  0.994481 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0695  hypothetical protein  37 
 
 
108 aa  56.6  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000229548  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>