More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3835 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_3835  amino acid transporter  100 
 
 		 439 aa  865    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.507141 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2701  amino acid transporter  40 
 
 		 489 aa  304  2.0000000000000002e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3351  amino acid transporter  39.13 
 
 		 485 aa  299  5e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1932  amino acid permease-associated region  35.92 
 
 		 461 aa  275  1.0000000000000001e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1474  amino acid transporter  37.02 
 
 		 445 aa  273  4.0000000000000004e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.221068  normal  0.529495 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3285  amino acid transporter  33.13 
 
 		 522 aa  270  5e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1002  amino acid permease-associated region  35.1 
 
 		 499 aa  265  1e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1961  amino acid permease-associated region  35.01 
 
 		 469 aa  263  4e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0292842  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1714  amino acid permease-associated region  36.32 
 
 		 473 aa  253  5.000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3914  amino acid permease-associated region  39.82 
 
 		 495 aa  248  2e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6226  amino acid permease-associated region  34.26 
 
 		 490 aa  244  3e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0718  amino acid permease family protein  38.29 
 
 		 473 aa  239  1e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.902571  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0190  putative amino acid/amine transport protein  34.24 
 
 		 452 aa  236  7e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4660  amino acid permease-associated region  35.47 
 
 		 467 aa  230  3e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.87278  normal  0.151026 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1252  amino acid permease-associated region  33.04 
 
 		 484 aa  225  1e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1679  amino acid transporter  36.67 
 
 		 440 aa  225  2e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5584  amino acid permease-associated region  33.69 
 
 		 472 aa  223  4.9999999999999996e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.626163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3911  amino acid permease-associated region  34.78 
 
 		 452 aa  219  7e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4886  amino acid permease family protein  32.71 
 
 		 438 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000145673  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4845  amino acid permease-associated region  33.1 
 
 		 437 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.976414  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5261  amino acid permease family protein  32.71 
 
 		 438 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00026519  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5157  amino acid permease family protein  32.47 
 
 		 438 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5163  amino acid permease family protein  32.86 
 
 		 437 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5170  amino acid permease family protein  33.02 
 
 		 437 aa  214  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4275  amino acid permease-associated region  31.72 
 
 		 474 aa  213  4.9999999999999996e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4728  amino acid permease  32.47 
 
 		 438 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000742695  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5129  amino acid permease family protein  32.47 
 
 		 438 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4743  amino acid permease  32.47 
 
 		 438 aa  212  1e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000004453  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3544  amino acid permease-associated region  33.5 
 
 		 448 aa  209  6e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.121103 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1394  amino acid permease-associated region  31.55 
 
 		 443 aa  208  2e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0385  amino acid permease-associated region  32.29 
 
 		 453 aa  205  1e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000859435  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1917  amino acid permease-associated region  33.26 
 
 		 463 aa  202  8e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.797134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1526  amino acid permease-associated region  31.62 
 
 		 440 aa  202  9e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0740999  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1497  amino acid permease-associated region  31.62 
 
 		 440 aa  202  9e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.649602  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1855  amino acid transporter  30.56 
 
 		 443 aa  200  3e-50  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.599049  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3609  amino acid permease-associated region  31.37 
 
 		 435 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3770  amino acid permease-associated region  29.51 
 
 		 444 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3386  amino acid permease-associated region  32.88 
 
 		 482 aa  186  1.0000000000000001e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.944667  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04430  L-methionine porter, putative  30.49 
 
 		 580 aa  182  1e-44  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.612306  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5443  amino acid permease-associated region  31.19 
 
 		 463 aa  176  5e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0993936  normal  0.863947 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0176  amino acid permease-associated region  28.7 
 
 		 447 aa  176  6e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0084  threonine transporter  30.89 
 
 		 387 aa  176  8e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0567  amino acid transporter  29.68 
 
 		 452 aa  171  2e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0228349 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10825  amino acid transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04990)  29.08 
 
 		 609 aa  168  2e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2909  amino acid permease-associated region  31.44 
 
 		 452 aa  163  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.13469 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2343  amino acid permease-associated region  29.81 
 
 		 454 aa  157  4e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.342965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5190  putative amino acid transporter  28.23 
 
 		 458 aa  155  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.251586 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0069  amino acid permease-associated region  29.15 
 
 		 447 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.480186 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3314  amino acid permease-associated region  26.81 
 
 		 442 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00103412  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03221  predicted fructoselysine transporter  27.87 
 
 		 445 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0342  amino acid permease-associated region  27.87 
 
 		 445 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03173  hypothetical protein  27.87 
 
 		 445 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3840  putative fructoselysine transporter  27.87 
 
 		 462 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3566  putative fructoselysine transporter  27.87 
 
 		 462 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3748  putative fructoselysine transporter  27.42 
 
 		 462 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.211488  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0342  putative fructoselysine transporter  27.64 
 
 		 445 aa  147  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.473347 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4682  putative fructoselysine transporter  29.02 
 
 		 445 aa  147  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1826  amino acid permease-associated region  30.38 
 
 		 436 aa  137  5e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4173  amino acid permease-associated region  31.26 
 
 		 429 aa  135  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.235964  normal  0.356034 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2279  amino acid permease-associated region  24 
 
 		 382 aa  135  9.999999999999999e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.665264  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0079  putative amino acid permease  30.75 
 
 		 440 aa  134  3e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  27.46 
 
 		 439 aa  133  5e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5065  amino acid permease-associated region  28.29 
 
 		 457 aa  132  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0442814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1840  amino acid transporter  27.31 
 
 		 466 aa  128  2.0000000000000002e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2719  amino acid permease-associated region  26.54 
 
 		 427 aa  127  3e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0307129  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0678  amino acid transporter  30.33 
 
 		 421 aa  126  8.000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.633232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0900  amino acid permease-associated region  29.29 
 
 		 500 aa  125  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2084  amino acid permease-associated region  28.38 
 
 		 770 aa  124  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3114  amino acid transporter  31.83 
 
 		 446 aa  122  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.988661  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2114  amino acid permease-associated region  29.79 
 
 		 485 aa  120  3e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.590902  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1266  amino acid permease-associated region  29.72 
 
 		 474 aa  121  3e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0445  amino acid permease  27.46 
 
 		 426 aa  120  4.9999999999999996e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000397922  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2693  amino acid permease-associated region  29.35 
 
 		 786 aa  120  4.9999999999999996e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0195  amino acid permease-associated region  30.69 
 
 		 745 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3333  amino acid transporter  25.7 
 
 		 480 aa  118  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.326771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1073  amino acid permease-associated region  29.77 
 
 		 475 aa  117  3.9999999999999997e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.00231031  normal  0.0754239 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1408  cationic amino acid transporter  26.42 
 
 		 483 aa  117  3.9999999999999997e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0734654  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2442  amino acid permease-associated region  25.51 
 
 		 441 aa  116  6.9999999999999995e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0536  amino acid permease-associated region  31.31 
 
 		 435 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.555012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1341  amino acid permease-associated region  26.42 
 
 		 496 aa  115  2.0000000000000002e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0976  amino acid transporter  30.86 
 
 		 470 aa  115  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046598 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21440  amino acid transporter  28.07 
 
 		 512 aa  114  3e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.250254 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1685  amino acid permease-associated region  25.17 
 
 		 451 aa  114  5e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3641  amino acid permease-associated region  29.48 
 
 		 513 aa  113  9e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3228  amino acid permease-associated region  29.06 
 
 		 473 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  26.03 
 
 		 467 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2785  amino acid permease-associated region  26.32 
 
 		 520 aa  112  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0177971 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  26.03 
 
 		 467 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  25.97 
 
 		 467 aa  111  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0948  amino acid permease-associated region  29.73 
 
 		 546 aa  111  3e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0158045  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  26.41 
 
 		 467 aa  111  3e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  26.41 
 
 		 467 aa  110  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1577  amino acid permease-associated region  28.54 
 
 		 479 aa  110  5e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1907  amino acid permease-associated region  29.5 
 
 		 486 aa  110  5e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  26.62 
 
 		 467 aa  110  6e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0566  amino acid permease-associated region  27 
 
 		 764 aa  108  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3620  amino acid permease-associated region  25.86 
 
 		 494 aa  109  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2830  amino acid permease family protein  28.16 
 
 		 430 aa  108  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  27 
 
 		 467 aa  108  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0277  amino acid transporter, cationic amino acid transporter (CAT) family  25.48 
 
 		 471 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>