81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1898 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_3934  hypothetical protein  44.93 
 
 
1117 aa  837    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.515383 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1898  glycosyl hydrolase  100 
 
 
1083 aa  2158    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000419875  unclonable  0.0000213557 
 
 
 
NC_008009  Acid345_0385  integrin like protein  56.36 
 
 
974 aa  291  3e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.459486 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3583  hypothetical protein  57.45 
 
 
1189 aa  284  5.000000000000001e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.970923  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0416  hypothetical protein  55.84 
 
 
673 aa  282  3e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0810829 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1908  fibronectin, type III  56 
 
 
968 aa  281  5e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0431753 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2670  Ig-like, group 2  52.14 
 
 
924 aa  262  2e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2980  integrin-like protein  50.18 
 
 
1126 aa  249  1e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16679  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2079  hypothetical protein  50 
 
 
709 aa  244  7e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000832848 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2775  hypothetical protein  51.08 
 
 
1182 aa  238  7e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.465678  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2149  hypothetical protein  48.35 
 
 
847 aa  220  1e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2318  hypothetical protein  30.02 
 
 
1321 aa  205  3e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0185432  normal  0.0231077 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2659  hypothetical protein  27.06 
 
 
1220 aa  187  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00921  BNR/Asp-box repeat protein  25.19 
 
 
1084 aa  182  2.9999999999999997e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2533  hypothetical protein  24.87 
 
 
1043 aa  164  6e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1624  hypothetical protein  24.4 
 
 
1054 aa  162  3e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.6016 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2554  hypothetical protein  27.01 
 
 
931 aa  161  7e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.521814  decreased coverage  0.00000671119 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1665  hypothetical protein  24.3 
 
 
1090 aa  159  2e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.193209  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1574  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  24.51 
 
 
999 aa  157  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0267092 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3595  kelch domain-containing protein  48.33 
 
 
833 aa  154  7e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.066444 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1572  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  23.97 
 
 
1078 aa  154  7e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0452612 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3494  hypothetical protein  28.45 
 
 
681 aa  153  2e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.459183  normal  0.270651 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12688  hypothetical protein  24.54 
 
 
1075 aa  152  4e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2353  hypothetical protein  23.31 
 
 
1048 aa  150  1.0000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3021  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  24.77 
 
 
1041 aa  149  3e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.195512 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2405  hypothetical protein  24.86 
 
 
931 aa  146  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3156  hypothetical protein  23.8 
 
 
1060 aa  145  5e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04705  hypothetical protein  24.31 
 
 
952 aa  138  7.000000000000001e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0367565  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0515  hypothetical protein  23.38 
 
 
1147 aa  137  8e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0910  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  22.3 
 
 
983 aa  137  1.9999999999999998e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1563  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  23.5 
 
 
1082 aa  133  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01526  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  22.59 
 
 
931 aa  130  2.0000000000000002e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2423  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  23.12 
 
 
1044 aa  125  4e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1570  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  22.42 
 
 
1021 aa  118  5e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.371729 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4900  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  22.89 
 
 
1060 aa  115  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0367  BNR repeat-containing protein  26.51 
 
 
787 aa  105  5e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.159044  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1547  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.07 
 
 
630 aa  103  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1569  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  27.67 
 
 
1063 aa  102  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.870361 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03670  hypothetical protein  21.38 
 
 
1032 aa  101  7e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1546  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  24.89 
 
 
652 aa  101  9e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.860471  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4967  hypothetical protein  28.98 
 
 
876 aa  93.6  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.41505  normal  0.327151 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4181  conserved repeat domain protein  27.87 
 
 
1750 aa  91.7  6e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.46583  normal  0.246387 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0386  hypothetical protein  59.02 
 
 
164 aa  74.7  0.000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.326628 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2465  hypothetical protein  26.86 
 
 
608 aa  73.2  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0626  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.62 
 
 
707 aa  67.4  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1806  hypothetical protein  24.79 
 
 
912 aa  67.8  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0933525  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1688  two component regulator propeller domain-containing protein  22.84 
 
 
597 aa  66.6  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.216388  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2203  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  27.39 
 
 
757 aa  65.9  0.000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6491  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.17 
 
 
345 aa  61.6  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6726  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.17 
 
 
345 aa  61.6  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1460  hypothetical protein  27.06 
 
 
361 aa  60.8  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2327  Galactose oxidase  39.62 
 
 
638 aa  59.7  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0021  hypothetical protein  24.82 
 
 
371 aa  58.9  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0859  PKD domain containing protein  26.7 
 
 
488 aa  57.8  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3988  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.5 
 
 
359 aa  56.6  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.757519 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1158  hypothetical protein  25.32 
 
 
362 aa  55.5  0.000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.946147  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2138  cellulose-binding family II protein  29.19 
 
 
942 aa  54.3  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.368421  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2042  hypothetical protein  23.33 
 
 
373 aa  53.9  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3424  hypothetical protein  27.17 
 
 
362 aa  53.9  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.189338  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5562  cellulose-binding family II  30.27 
 
 
906 aa  52.4  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.655446 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2681  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  25.95 
 
 
371 aa  52.4  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.155468  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1115  hypothetical protein  32.26 
 
 
557 aa  51.6  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3271  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  21.65 
 
 
694 aa  51.2  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00240388  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1398  cellulosome enzyme, dockerin type I  25.66 
 
 
842 aa  50.1  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.461235  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0669  hypothetical protein  25 
 
 
780 aa  50.1  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1219  cellulose-binding family II  32.21 
 
 
911 aa  50.1  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0349548 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1612  cellulose-binding family II protein  27.49 
 
 
925 aa  50.1  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3051  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  23.57 
 
 
909 aa  50.4  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.640117  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6682  cellulose-binding family II  27.78 
 
 
935 aa  50.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.224663  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0618  cellulose-binding family II protein  25.55 
 
 
1298 aa  50.4  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0939482  hitchhiker  0.00792989 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1860  glycoside hydrolase family 48  25.38 
 
 
1904 aa  48.9  0.0006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.738055  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0852  hypothetical protein  30.53 
 
 
279 aa  47.8  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1791  cellulose-binding family II  32.95 
 
 
913 aa  47.4  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.381117  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4987  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.93 
 
 
393 aa  46.6  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1444  PKD domain containing protein  30.65 
 
 
479 aa  47  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2492  endo-1,4-beta-glucanase/xyloglucanase, putative, gly74A  27.27 
 
 
978 aa  47.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0351052  normal  0.027518 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05061  xyloglucanase (Eurofung)  27.47 
 
 
836 aa  46.2  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.341133  hitchhiker  0.000000000000191913 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1114  hypothetical protein  32.98 
 
 
323 aa  46.2  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1580  glycosyl hydrolase  26.44 
 
 
357 aa  46.2  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.716896  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0731  cellulose-binding family II  27.12 
 
 
934 aa  45.8  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4876  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  25.47 
 
 
367 aa  45.1  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.892609 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>