More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1391 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_1391  twitching motility protein  100 
 
 
375 aa  772    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.899661  normal  0.0234159 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2594  twitching motility protein  65.44 
 
 
366 aa  514  1.0000000000000001e-145  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0657  twitching motility protein  66.57 
 
 
366 aa  515  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1632  twitching motility protein  65.72 
 
 
366 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0623  twitching motility protein  66.29 
 
 
366 aa  513  1e-144  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0657  twitching motility protein  66.29 
 
 
366 aa  514  1e-144  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0668  twitching motility protein  63.78 
 
 
365 aa  509  1e-143  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.157686  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2681  twitching motility protein  64.67 
 
 
368 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1492  twitching motility protein PilT  63.87 
 
 
365 aa  502  1e-141  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144768  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2513  twitching motility protein  64.79 
 
 
365 aa  501  1e-141  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1394  pilus retraction protein PilT  64.1 
 
 
365 aa  499  1e-140  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1654  twitching motility protein  66.67 
 
 
363 aa  499  1e-140  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2148  Tfp pilus assembly protein, pilus retraction ATPase PilT  62.18 
 
 
374 aa  483  1e-135  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4827  twitching motility protein  59.72 
 
 
366 aa  458  9.999999999999999e-129  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.465197  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1165  pilus retraction ATPase PilT  57.64 
 
 
367 aa  404  1e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.591926  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1744  twitching motility protein  54.57 
 
 
362 aa  402  1e-111  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5045  twitching motility protein  55.81 
 
 
344 aa  389  1e-107  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.597487  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0478  pilus retraction protein PilT  55.52 
 
 
344 aa  385  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1724  twitching motility protein  53.07 
 
 
360 aa  382  1e-105  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1823  twitching motility protein  52.99 
 
 
378 aa  380  1e-104  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.227924  normal  0.842745 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0375  pilus retraction protein PilT  51.54 
 
 
372 aa  381  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2215  twitching motility protein  52.82 
 
 
368 aa  380  1e-104  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0874  twitching motility protein  54.18 
 
 
360 aa  379  1e-104  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1637  twitching motility protein  51.26 
 
 
372 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.601857  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3027  twitching motility protein  50.14 
 
 
382 aa  380  1e-104  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17750  pilus retraction protein PilT  51.27 
 
 
397 aa  379  1e-104  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.643822 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1611  twitching motility protein  51.26 
 
 
372 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1995  hypothetical protein  54.49 
 
 
344 aa  375  1e-103  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4696  twitching motility protein  50.98 
 
 
374 aa  377  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.787911 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2476  twitching motility protein  53.39 
 
 
345 aa  372  1e-102  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3662  twitching motility protein PilT  53.55 
 
 
347 aa  371  1e-102  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.69581  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1990  hypothetical protein  54.49 
 
 
344 aa  374  1e-102  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4183  twitching motility protein  51.56 
 
 
372 aa  373  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.212541 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3640  twitching motility protein PilT  51.45 
 
 
344 aa  372  1e-102  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0495  twitching motility protein PilT  51.45 
 
 
344 aa  372  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2859  twitching motility protein  53.39 
 
 
345 aa  375  1e-102  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00311104  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05180  twitching motility protein PilT  51.45 
 
 
344 aa  372  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4149  twitching motility protein  51.45 
 
 
344 aa  374  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.84862 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1321  twitching motility protein  52.96 
 
 
362 aa  374  1e-102  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0136212 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1126  twitching motility protein  50.57 
 
 
430 aa  369  1e-101  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3039  type II secretion system protein (twitching motility protein) (PilT)  52.92 
 
 
344 aa  369  1e-101  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.37999  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0969  twitching motility protein  50.14 
 
 
365 aa  369  1e-101  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1128  twitching motility protein  53.39 
 
 
345 aa  370  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0169735  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2070  twitching motility protein  49.58 
 
 
362 aa  370  1e-101  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0593  twitching motility protein  52.74 
 
 
370 aa  370  1e-101  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.499274  normal  0.0167916 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0537  twitching motility protein  51.74 
 
 
344 aa  370  1e-101  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2681  twitching motility protein  52.17 
 
 
349 aa  370  1e-101  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.172502  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0951  twitching motility protein  50.71 
 
 
372 aa  370  1e-101  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0342  twitching motility protein  53.94 
 
 
345 aa  370  1e-101  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1333  twitching motility protein  53.1 
 
 
345 aa  369  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0112575 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01993  twitching motility protein  53.64 
 
 
345 aa  365  1e-100  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.913118  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3039  twitching motility protein  52.51 
 
 
345 aa  365  1e-100  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00110048  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1537  twitching motility protein PilT  52.62 
 
 
344 aa  367  1e-100  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1339  twitching motility protein  52.51 
 
 
345 aa  365  1e-100  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0176269  hitchhiker  0.0000000675214 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3351  twitching motility protein PilT  52.8 
 
 
345 aa  366  1e-100  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1233  twitching motility protein PilT  53.69 
 
 
344 aa  367  1e-100  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000670856  normal  0.482312 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1138  twitching motility protein  52.8 
 
 
345 aa  366  1e-100  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3182  twitching motility protein  52.51 
 
 
345 aa  365  1e-100  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000300358  normal  0.0171368 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1194  pilus retraction ATPase PilT  53.1 
 
 
345 aa  367  1e-100  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0809497  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1265  pilus retraction ATPase PilT  53.1 
 
 
345 aa  367  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00395146  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1195  pilus retraction ATPase PilT  53.1 
 
 
345 aa  368  1e-100  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.035221  normal  0.726938 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1969  twitching motility protein  49.3 
 
 
374 aa  367  1e-100  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2686  twitching motility protein  52.51 
 
 
345 aa  364  1e-99  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03090  Pilus retraction protein  50.87 
 
 
344 aa  364  1e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.166876  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1221  twitching motility protein  54.19 
 
 
344 aa  364  1e-99  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.475571  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1106  twitching motility protein  52.72 
 
 
351 aa  364  1e-99  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.321082  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1253  twitching motility protein  54.19 
 
 
344 aa  364  1e-99  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3004  pilus retraction protein PilT  51.3 
 
 
345 aa  363  2e-99  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5318  pilus retraction protein PilT  51.16 
 
 
344 aa  364  2e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3024  twitching motility protein  52.21 
 
 
345 aa  363  3e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00035663  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3703  twitching motility protein  51.21 
 
 
347 aa  362  4e-99  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0806  twitching motility protein  49.86 
 
 
360 aa  361  1e-98  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0922  twitching mobility protein  49.72 
 
 
363 aa  360  2e-98  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.987668  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1841  twitching motility protein  51.78 
 
 
349 aa  360  2e-98  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.616267  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_793  twitching mobility protein  49.16 
 
 
360 aa  360  2e-98  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3053  twitching motility protein  53.7 
 
 
346 aa  360  2e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.39006  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0264  twitching motility protein  50.68 
 
 
403 aa  360  2e-98  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.723918 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0931  twitching motility protein  52.73 
 
 
345 aa  360  2e-98  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.413956  normal  0.826545 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1346  twitching motility protein  48.06 
 
 
566 aa  358  6e-98  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1631  twitching motility protein  50.87 
 
 
347 aa  358  6e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0179805 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3527  twitching motility protein  52.38 
 
 
344 aa  358  8e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.318184  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1188  twitching motility protein  52.01 
 
 
358 aa  358  9.999999999999999e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.231991  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0544  twitching mobility protein PilT, type II/IV secretion system protein  53.37 
 
 
345 aa  357  1.9999999999999998e-97  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0267  pilus retraction protein PilT  52.05 
 
 
350 aa  356  2.9999999999999997e-97  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03297  twitching motility protein PilT  51.75 
 
 
349 aa  356  2.9999999999999997e-97  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.987753  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1553  twitching motility protein  55.31 
 
 
339 aa  357  2.9999999999999997e-97  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0974985 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3760  Pili biogenesis ATPase  50.58 
 
 
347 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.112866  normal  0.149271 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2419  pilus retraction ATPase PilT  49.7 
 
 
347 aa  356  3.9999999999999996e-97  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0704  twitching motility protein  49.86 
 
 
383 aa  355  5e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0316  twitching motility protein  50.72 
 
 
345 aa  355  6.999999999999999e-97  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.436596  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0245  twitching motility protein  50.42 
 
 
359 aa  355  7.999999999999999e-97  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.292052  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0293  twitching motility protein  51.74 
 
 
350 aa  355  8.999999999999999e-97  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2413  twitching motility protein  49.13 
 
 
351 aa  353  2.9999999999999997e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2406  twitching motility protein, PilT-like  49.86 
 
 
388 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.776095  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2918  twitching motility protein PilT  49.71 
 
 
344 aa  352  4e-96  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.683879  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2107  twitching motility protein  51.66 
 
 
347 aa  352  4e-96  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3717  twitching motility protein  52.37 
 
 
347 aa  352  4e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00181  PilT1-like protein  48.47 
 
 
358 aa  352  5e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0278  twitching motility protein  49.42 
 
 
347 aa  352  7e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06901  twitching motility protein  50.57 
 
 
357 aa  350  3e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.595138  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>