294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2440 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_2440  phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 282 aa  547  1e-155  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000223825 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2709  phosphoribosyltransferase  54.23 
 
 		 308 aa  257  2e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14720  predicted amidophosphoribosyltransferase  38.89 
 
 		 265 aa  102  5e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.43829  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1852  phosphoribosyltransferase  35.81 
 
 		 244 aa  88.6  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.891548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0911  hypothetical protein  23.93 
 
 		 255 aa  78.6  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.466894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1824  amidophosphoribosyltransferase-like protein  32.24 
 
 		 255 aa  77  0.0000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0970  hypothetical protein  34.63 
 
 		 234 aa  74.7  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.288452  normal  0.841121 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09370  predicted amidophosphoribosyltransferase  31.75 
 
 		 299 aa  72.4  0.000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0026  phosphoribosyltransferase  30.77 
 
 		 254 aa  70.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0307  competence protein F  31.17 
 
 		 255 aa  70.1  0.00000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.387643 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0188  phosphoribosyltransferase  30.91 
 
 		 239 aa  69.3  0.00000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.138467  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2573  amidophosphoribosyltransferase  30.66 
 
 		 247 aa  68.9  0.00000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3081  phosphoribosyltransferase  31.08 
 
 		 237 aa  68.9  0.00000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000295242  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1762  amidophosphoribosyltransferases-like  33.52 
 
 		 202 aa  68.2  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3630  phosphoribosyltransferase  34.55 
 
 		 227 aa  67.4  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0248  amidophosphoribosyltransferase  24.79 
 
 		 245 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.067407  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0107  phosphoribosyltransferase  32.78 
 
 		 272 aa  67.8  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0383  competence protein F  32.17 
 
 		 255 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366991  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1875  amidophosphoribosyltransferase-like protein  33.06 
 
 		 215 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0109  phosphoribosyltransferase  27.98 
 
 		 245 aa  67  0.0000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0864582 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2936  competence protein F, putative  34 
 
 		 243 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0346269  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4814  phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 		 279 aa  67  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.727604  decreased coverage  0.0000849043 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2493  hypothetical protein  38.24 
 
 		 284 aa  66.6  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.213195  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0976  hypothetical protein  24.89 
 
 		 229 aa  66.6  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0430992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20620  predicted amidophosphoribosyltransferase  36.11 
 
 		 253 aa  66.6  0.0000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.235414  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0773  phosphoribosyltransferase  33.04 
 
 		 238 aa  65.9  0.0000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.413809 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0351  competence protein F  32.03 
 
 		 255 aa  65.9  0.0000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.733482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2248  phosphoribosyltransferase  23.48 
 
 		 220 aa  65.5  0.0000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000079712  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1140  phosphoribosyltransferase  30.89 
 
 		 264 aa  65.1  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0794906  normal  0.739937 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0784  ComF family protein  34.12 
 
 		 251 aa  65.1  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0887705  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0601  phosphoribosyltransferase  29.11 
 
 		 271 aa  64.7  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3741  phosphoribosyltransferase  36.24 
 
 		 342 aa  65.5  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2437  competence protein F  30.63 
 
 		 262 aa  65.5  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104634 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4202  phosphoribosyltransferase  31.08 
 
 		 213 aa  63.9  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0030984 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1679  phosphoribosyltransferase  22.75 
 
 		 231 aa  63.5  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1436  hypothetical protein  38.46 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1907  phosphoribosyltransferase  30.64 
 
 		 279 aa  63.2  0.000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000754112  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1028  competence protein F, putative  25.98 
 
 		 262 aa  62.8  0.000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0447  phosphoribosyltransferase  30.99 
 
 		 229 aa  62.4  0.000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.300519  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0090  phosphoribosyltransferase  25.73 
 
 		 220 aa  62.4  0.000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1977  hypothetical protein  27.83 
 
 		 231 aa  62  0.00000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0186  comFC protein, putative  23.65 
 
 		 226 aa  61.6  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0559  phosphoribosyltransferase  30.3 
 
 		 248 aa  61.6  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.230828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0548  amidophosphoribosyltransferase  21.33 
 
 		 217 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0737  phosphoribosyltransferase  32.64 
 
 		 246 aa  61.2  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.113594  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0531  hypothetical protein  21.33 
 
 		 217 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0907  hypothetical protein  31.8 
 
 		 220 aa  61.2  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.228369 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0234  putative competence protein F-related protein  33.54 
 
 		 240 aa  60.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0348529 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0385  phosphoribosyltransferase  28.74 
 
 		 271 aa  60.8  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.543655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0363  amidophosphoribosyltransferase-like protein  27.95 
 
 		 226 aa  60.5  0.00000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1259  amidophosphoribosyltransferase-like protein  27.35 
 
 		 233 aa  60.8  0.00000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00000170778  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0124  competence protein F, putative  27.43 
 
 		 238 aa  60.1  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4040  phosphoribosyltransferase  33.86 
 
 		 244 aa  60.1  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.522362  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2675  competence protein F  30.57 
 
 		 253 aa  60.1  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2240  phosphoribosyltransferase  25.99 
 
 		 230 aa  60.1  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4090  amidophosphoribosyltransferase-like protein  29.75 
 
 		 246 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0520  phosphoribosyltransferase  30.04 
 
 		 269 aa  60.1  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.251587 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0226  competence protein  29.03 
 
 		 236 aa  59.7  0.00000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1079  hypothetical protein  34.04 
 
 		 222 aa  59.7  0.00000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0232  competence protein F  27.51 
 
 		 280 aa  59.3  0.00000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2102  competence protein F  27.97 
 
 		 246 aa  59.3  0.00000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0242  competence protein  29.23 
 
 		 263 aa  59.3  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1808  putative competence protein F  25.57 
 
 		 262 aa  59.3  0.00000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.640197  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0165  phosphoribosyltransferase  32.31 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000298653  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1458  comF family protein, putative  27.97 
 
 		 233 aa  58.9  0.00000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000115929  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0493  competence protein ComF, putative  29.07 
 
 		 244 aa  58.9  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1381  phosphoribosyltransferase protein-like protein  24.31 
 
 		 229 aa  58.9  0.00000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.431166  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0480  phosphoribosyltransferase  28.12 
 
 		 270 aa  58.5  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1490  competence protein  23.53 
 
 		 232 aa  58.5  0.0000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.923217  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3894  phosphoribosyltransferase  30.13 
 
 		 259 aa  58.5  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.148595 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0418  competence protein F  29.15 
 
 		 237 aa  58.9  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113575 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0126  putative phosphoribosyltransferase  31.3 
 
 		 260 aa  58.5  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0837099  normal  0.0454325 
 
 
-
 
NC_002950  PG0158  competence protein F-related protein  25.21 
 
 		 246 aa  58.2  0.0000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0225  phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 		 222 aa  57.8  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000513263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0024  phosphoribosyltransferase  23.46 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.118488  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0248  amidophosphoribosyltransferase  27.33 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0337  competence protein F, putative  24.84 
 
 		 221 aa  57  0.0000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1733  ComF family protein  35.5 
 
 		 299 aa  57  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00110223  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3746  hypothetical protein  22.27 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.345034 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5516  phosphoribosyltransferase  27.39 
 
 		 239 aa  57  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3090  phosphoribosyltransferase  29.67 
 
 		 255 aa  56.2  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.318018  normal  0.255488 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1322  amidophosphoribosyltransferase  22.98 
 
 		 226 aa  56.2  0.0000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.575173  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00615  amidophosphoribosyltransferase  27.75 
 
 		 185 aa  56.2  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3978  amidophosphoribosyltransferase  26.79 
 
 		 247 aa  56.2  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000228235  hitchhiker  0.000000230998 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2971  phosphoribosyltransferase  27.93 
 
 		 268 aa  55.5  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.566762 
 
 
-
 
NC_004310  BR1878  competence protein F, putative  25.95 
 
 		 262 aa  55.5  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15330  predicted amidophosphoribosyltransferase  28.21 
 
 		 230 aa  55.5  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0698628  normal  0.0235577 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0763  amidophosphoribosyltransferases-like  33.2 
 
 		 278 aa  55.1  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.040475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1537  putative competence protein F  28.57 
 
 		 228 aa  55.1  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0877  phosphoribosyltransferase  24.77 
 
 		 232 aa  54.7  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2863  phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 		 242 aa  54.3  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0215  putative competence protein F-related protein  32.92 
 
 		 240 aa  54.3  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.162002 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3540  ComF family protein  33.33 
 
 		 242 aa  54.7  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0617  phosphoribosyltransferase  26.43 
 
 		 247 aa  53.9  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1236  ComF  26.61 
 
 		 233 aa  53.9  0.000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.105721  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1385  hypothetical protein  30.09 
 
 		 204 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.653561  normal  0.716012 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1208  phosphoribosyltransferase  23.25 
 
 		 202 aa  53.1  0.000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000195663  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3333  phosphoribosyltransferase  34.53 
 
 		 242 aa  53.5  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1247  phosphoribosyltransferase  23.25 
 
 		 202 aa  53.1  0.000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1369  hypothetical protein  29.2 
 
 		 204 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>