69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2304 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_2304  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
452 aa  829    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000298214 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2572  major facilitator transporter  65.86 
 
 
482 aa  397  1e-109  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12350  Major Facilitator Superfamily transporter  41.98 
 
 
472 aa  237  3e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.485954 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2992  major facilitator superfamily MFS_1  41.89 
 
 
413 aa  204  2e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28500  Major Facilitator Superfamily transporter  38.18 
 
 
437 aa  196  8.000000000000001e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3629  major facilitator superfamily MFS_1  40.93 
 
 
424 aa  194  3e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13000  arabinose efflux permease family protein  42.31 
 
 
453 aa  187  3e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0745  major facilitator superfamily MFS_1  40.37 
 
 
400 aa  169  1e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0780  major facilitator superfamily MFS_1  36.81 
 
 
420 aa  167  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.347678  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2303  major facilitator superfamily protein  33 
 
 
409 aa  136  6.0000000000000005e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.569789  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0371  major facilitator superfamily MFS_1  29.03 
 
 
414 aa  118  1.9999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7368  major facilitator superfamily MFS_1  31 
 
 
399 aa  117  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3466  major facilitator superfamily MFS_1  31.15 
 
 
409 aa  113  6e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.488315  normal  0.151148 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3195  major facilitator superfamily MFS_1  29.02 
 
 
446 aa  113  7.000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000039587 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5100  major facilitator superfamily MFS_1  32.19 
 
 
417 aa  112  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.404001  normal  0.353068 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6779  hypothetical protein  30.39 
 
 
396 aa  110  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.474799  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0686  major facilitator superfamily MFS_1  30.1 
 
 
417 aa  110  6e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3030  major facilitator transporter  28.89 
 
 
408 aa  108  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.54277  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2483  major facilitator superfamily MFS_1  30.75 
 
 
402 aa  107  5e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0234  transmembrane efflux protein  27.15 
 
 
407 aa  106  7e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0247796  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3782  major facilitator transporter  28.61 
 
 
405 aa  106  7e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.22509 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3637  major facilitator transporter  29.57 
 
 
403 aa  106  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.288543 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01430  arabinose efflux permease family protein  27.29 
 
 
420 aa  104  3e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1689  major facilitator superfamily MFS_1  32.19 
 
 
402 aa  104  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00788722  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2789  major facilitator superfamily MFS_1  30.65 
 
 
402 aa  100  4e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2972  hypothetical protein  31.76 
 
 
401 aa  99  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.355188  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4978  putative ABC transporter, permease protein  33.42 
 
 
403 aa  97.8  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.80843 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0256  major facilitator superfamily MFS_1  27.44 
 
 
448 aa  96.3  9e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0048883  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4653  major facilitator superfamily MFS_1  26.72 
 
 
408 aa  95.9  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.523264  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2846  major facilitator transporter  26.33 
 
 
410 aa  95.9  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0835154  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35230  hypothetical protein  31.51 
 
 
401 aa  96.3  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.578304 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36140  arabinose efflux permease family protein  32.23 
 
 
419 aa  92.4  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1671  major facilitator superfamily MFS_1  29.51 
 
 
414 aa  92  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4875  major facilitator superfamily MFS_1  29.57 
 
 
404 aa  89.7  9e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.615718  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4039  major facilitator superfamily MFS_1  28.07 
 
 
409 aa  85.1  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0402571 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2693  major facilitator transporter  29.19 
 
 
398 aa  84  0.000000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0742009  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2914  major facilitator transporter  29.02 
 
 
396 aa  83.6  0.000000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00730605  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0426  major facilitator superfamily MFS_1  31.61 
 
 
404 aa  83.2  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.258686  normal  0.0618447 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0252  major facilitator superfamily MFS_1  34.9 
 
 
432 aa  79.3  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1842  major facilitator transporter  29.02 
 
 
390 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.570111  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3286  major facilitator transporter  30.54 
 
 
430 aa  77  0.0000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.92018 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3577  major facilitator transporter  28.9 
 
 
406 aa  73.9  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.194075  normal  0.0346233 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3961  major facilitator transporter  29.89 
 
 
402 aa  73.2  0.000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.357684 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1865  major facilitator transporter  29.89 
 
 
402 aa  73.2  0.000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0835238 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5238  major facilitator superfamily MFS_1  31.52 
 
 
399 aa  71.2  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0376392  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0163  major facilitator superfamily MFS_1  36.54 
 
 
454 aa  70.9  0.00000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1898  hypothetical protein  33.86 
 
 
405 aa  70.5  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.577785  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1151  transporter, major facilitator family protein  28.93 
 
 
464 aa  67.8  0.0000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.469234 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2605  major facilitator superfamily MFS_1  35.2 
 
 
413 aa  67.4  0.0000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1712  major facilitator superfamily MFS_1  30.85 
 
 
396 aa  64.3  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.190703  normal  0.202601 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6310  major facilitator superfamily MFS_1  24.86 
 
 
430 aa  63.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3536  major facilitator superfamily MFS_1  26.18 
 
 
412 aa  63.2  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0953  hypothetical protein  25.62 
 
 
439 aa  60.8  0.00000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4443  transporter, putative  31.52 
 
 
407 aa  60.5  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.145391  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0452  major facilitator superfamily MFS_1  31.99 
 
 
417 aa  60.1  0.00000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4959  major facilitator superfamily MFS_1  29.92 
 
 
407 aa  59.7  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.6026  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1095  major facilitator transporter  41.03 
 
 
413 aa  54.7  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.522817  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2206  putative transporter  27.07 
 
 
417 aa  50.4  0.00006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3935  major facilitator superfamily MFS_1  32.58 
 
 
405 aa  50.4  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.253599  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1188  major facilitator superfamily MFS_1  42.03 
 
 
449 aa  49.3  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0984  major facilitator transporter  38.96 
 
 
404 aa  49.7  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.973774  hitchhiker  0.00222704 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1175  major facilitator transporter  31.72 
 
 
469 aa  48.9  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.62148  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12160  arabinose efflux permease family protein  26.51 
 
 
395 aa  48.1  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.541779  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0458  major facilitator transporter  28.07 
 
 
397 aa  47.4  0.0006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0221  major facilitator superfamily MFS_1  33.11 
 
 
392 aa  45.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3415  major facilitator superfamily MFS_1  29.31 
 
 
439 aa  44.7  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.532802  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4650  hypothetical protein  33.77 
 
 
408 aa  43.9  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.04012  normal  0.232037 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2591  major facilitator transporter  32.94 
 
 
397 aa  43.9  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.101194 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1250  major facilitator superfamily protein  28.39 
 
 
410 aa  43.9  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0951104 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>