186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0994 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_0994  hypothetical protein  100 
 
 		 527 aa  1018    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3467  DNA-repair protein  43.97 
 
 		 528 aa  322  7e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.177585  normal  0.0126488 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0923  hypothetical protein  40.93 
 
 		 527 aa  304  3.0000000000000004e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3156  UMUC domain protein DNA-repair protein  41.42 
 
 		 510 aa  301  3e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000974062  hitchhiker  0.000679979 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3240  hypothetical protein  44.94 
 
 		 524 aa  299  8e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.488053  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1747  hypothetical protein  39.67 
 
 		 536 aa  294  2e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13428  hypothetical protein  39.78 
 
 		 527 aa  291  2e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000191065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2945  Nucleotidyltransferase/DNA polymerase involved in DNA repair-like protein  37.76 
 
 		 505 aa  284  3.0000000000000004e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  unclonable  0.000000598538  decreased coverage  0.00000434939 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21280  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  41.27 
 
 		 553 aa  277  4e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00165363  normal  0.165468 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1175  hypothetical protein  41.04 
 
 		 532 aa  273  6e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.24995  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5241  hypothetical protein  40.7 
 
 		 535 aa  272  1e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0112063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1192  hypothetical protein  41.04 
 
 		 529 aa  272  1e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1202  hypothetical protein  41.04 
 
 		 529 aa  272  1e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.344019  normal  0.0467691 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1523  hypothetical protein  39.63 
 
 		 522 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2288  DNA-repair protein  40.54 
 
 		 562 aa  264  3e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4898  hypothetical protein  40.48 
 
 		 531 aa  251  2e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.834206  normal  0.0834013 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1440  hypothetical protein  42.11 
 
 		 549 aa  249  1e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15750  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  36.61 
 
 		 589 aa  241  2.9999999999999997e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0334276  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1896  putative DNA-directed DNA polymerase  37.59 
 
 		 520 aa  239  6.999999999999999e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.582074  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2039  hypothetical protein  44.3 
 
 		 581 aa  191  2e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.566112  normal  0.522751 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1186  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  32.18 
 
 		 549 aa  181  4e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00000707508  normal  0.0119021 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0809  hypothetical protein  26.29 
 
 		 507 aa  79.7  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2986  putative DNA-directed DNA polymerase  29.49 
 
 		 529 aa  79.7  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.579616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3146  hypothetical protein  29.17 
 
 		 507 aa  78.2  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.41691  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3381  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  24.73 
 
 		 499 aa  73.9  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.130693  normal  0.720575 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3766  hypothetical protein  27.99 
 
 		 486 aa  73.6  0.000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2295  hypothetical protein  31.15 
 
 		 472 aa  68.9  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3997  hypothetical protein  28.85 
 
 		 499 aa  69.3  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2492  DNA-directed DNA polymerase  26.87 
 
 		 409 aa  67.8  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2530  nucleotidyltransferase/DNA polymerase  26.76 
 
 		 548 aa  67  0.0000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.397333 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2379  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase-like protein  29.68 
 
 		 469 aa  66.6  0.0000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.286987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0176  hypothetical protein  28.06 
 
 		 433 aa  66.2  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.876193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0055  hypothetical protein  27.48 
 
 		 536 aa  66.6  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.845742 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0108  putative DNA repair enzyme  25.83 
 
 		 534 aa  65.5  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0727599 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1120  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase-like protein  26.61 
 
 		 515 aa  65.1  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.881049 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13710  DNA polymerase IV involved in DNA repair  36.1 
 
 		 431 aa  64.7  0.000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3231  putative DNA repair enzyme  28.85 
 
 		 552 aa  64.7  0.000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1332  hypothetical protein  31.03 
 
 		 472 aa  64.3  0.000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3022  hypothetical protein  27.78 
 
 		 471 aa  64.3  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.302557 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3073  DNA-directed DNA polymerase  27.06 
 
 		 414 aa  63.5  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.523448  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1458  putative DNA repair enzyme  26.15 
 
 		 534 aa  63.5  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4919  DNA-directed DNA polymerase  23.93 
 
 		 416 aa  62.8  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.17095 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3264  hypothetical protein  25.85 
 
 		 477 aa  62.8  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4497  hypothetical protein  29.25 
 
 		 472 aa  62.4  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0330891 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5604  hypothetical protein  30.48 
 
 		 503 aa  61.6  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000770787 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5158  putative nucleotidyltransferase protein  29.2 
 
 		 474 aa  61.6  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.777825 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1362  DNA-directed DNA polymerase  24.72 
 
 		 393 aa  61.2  0.00000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1756  UMUC domain protein DNA-repair protein  25.37 
 
 		 409 aa  61.2  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000481583  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5202  hypothetical protein  31.97 
 
 		 474 aa  61.2  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.45217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13630  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  32.53 
 
 		 458 aa  60.8  0.00000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.106068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3293  nucleotidyltransferase/DNA polymerase involved in DNA repair-like protein  27.06 
 
 		 522 aa  60.8  0.00000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.247641  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4046  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase-like protein  23 
 
 		 495 aa  60.5  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4462  hypothetical protein  26.5 
 
 		 525 aa  60.5  0.00000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.234838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3150  hypothetical protein  27.92 
 
 		 471 aa  60.1  0.00000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5156  hypothetical protein  30.5 
 
 		 472 aa  59.7  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.249554  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2332  DNA-directed DNA polymerase  26.04 
 
 		 353 aa  59.7  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.353166  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5394  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  23.72 
 
 		 503 aa  58.5  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.280036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4251  hypothetical protein  33.68 
 
 		 395 aa  58.5  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.240238  normal  0.380401 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2779  hypothetical protein  28.94 
 
 		 545 aa  58.2  0.0000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.989391 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2399  cytosolic protein  27.16 
 
 		 500 aa  58.2  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.843761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3129  damage-inducible protein DinP  27.31 
 
 		 399 aa  57.4  0.0000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3469  hypothetical protein  27.63 
 
 		 480 aa  57  0.0000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1616  ImpB/MucB/SamB family protein  24.66 
 
 		 409 aa  55.8  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1654  DNA polymerase IV  29.03 
 
 		 407 aa  55.8  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.263851  normal  0.0394567 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5725  hypothetical protein  31.03 
 
 		 468 aa  55.8  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2667  hypothetical protein  28.17 
 
 		 462 aa  55.8  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2344  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  24.44 
 
 		 499 aa  55.8  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0116755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0080  hypothetical protein  23.39 
 
 		 489 aa  55.8  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2794  hypothetical protein  26.55 
 
 		 487 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.42838  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2256  hypothetical protein  31.25 
 
 		 501 aa  55.1  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4575  hypothetical protein  31.25 
 
 		 500 aa  55.5  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.782674  normal  0.448511 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1830  hypothetical protein  30.9 
 
 		 449 aa  54.7  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1122  DNA polymerase IV  31.19 
 
 		 413 aa  54.7  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.36327  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1323  DNA-directed DNA polymerase  24.09 
 
 		 416 aa  53.9  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.308192  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1203  DNA polymerase IV  27.71 
 
 		 354 aa  53.9  0.000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.46761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4215  DNA polymerase IV  27.71 
 
 		 354 aa  53.9  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.154299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2522  hypothetical protein  25.79 
 
 		 476 aa  53.9  0.000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0740789  normal  0.855778 
 
 
-
 
NC_004310  BR0070  hypothetical protein  26.8 
 
 		 483 aa  53.5  0.000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2856  DNA-directed DNA polymerase  28.73 
 
 		 406 aa  53.5  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107741  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4587  DNA polymerase IV  29.36 
 
 		 349 aa  53.5  0.000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.099232  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2165  hypothetical protein  29.79 
 
 		 492 aa  53.5  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.255686  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1941  hypothetical protein  28 
 
 		 479 aa  53.1  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0469275 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2507  DNA-directed DNA polymerase  22.81 
 
 		 358 aa  53.1  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1232  DNA polymerase IV  27.71 
 
 		 354 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.46587  normal  0.838167 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4012  DNA polymerase IV  28.11 
 
 		 354 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.333158  normal  0.93726 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2368  DNA-directed DNA polymerase  35.4 
 
 		 445 aa  52  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0144  DNA-directed DNA polymerase  20.15 
 
 		 354 aa  52  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2337  hypothetical protein  27.15 
 
 		 539 aa  52.4  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.30742  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3213  DNA-directed DNA polymerase  31.58 
 
 		 407 aa  52.4  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0704877  normal  0.021461 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1469  DNA-directed DNA polymerase  27.05 
 
 		 368 aa  51.6  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52310  DNA polymerase IV  28.64 
 
 		 349 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.88026 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13520  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  23.44 
 
 		 433 aa  51.6  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2801  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase-like protein  27.62 
 
 		 452 aa  51.2  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.236313 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3808  hypothetical protein  26.32 
 
 		 465 aa  51.2  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1444  DNA polymerase IV  26.54 
 
 		 466 aa  51.6  0.00004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.754501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3159  DNA-directed DNA polymerase  22.71 
 
 		 431 aa  51.6  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.382923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5890  DNA-directed DNA polymerase  30.04 
 
 		 409 aa  51.2  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.315723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5112  DNA-directed DNA polymerase  31.66 
 
 		 420 aa  51.2  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360047  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1072  hypothetical protein  26.53 
 
 		 488 aa  51.6  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.289779 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37100  DNA polymerase IV  28 
 
 		 353 aa  51.2  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>