122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0798 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_0798  RecA-superfamily ATPase implicated in signal transduction-like protein  100 
 
 		 249 aa  499  1e-140  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0799  Sigma 54 interacting domain protein  28.97 
 
 		 242 aa  72.4  0.000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2353  putative circadian clock protein, KaiC  27.51 
 
 		 489 aa  70.1  0.00000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5577  non-specific serine/threonine protein kinase  26.26 
 
 		 500 aa  68.9  0.00000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.15364  normal  0.116511 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1332  non-specific serine/threonine protein kinase  28.42 
 
 		 502 aa  66.2  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723068 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2718  hypothetical protein  30.87 
 
 		 494 aa  65.9  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.150479  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2044  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.53 
 
 		 503 aa  65.9  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.174274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0671  putative circadian clock protein, KaiC  29.82 
 
 		 535 aa  65.1  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.492648 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5921  putative circadian clock protein, KaiC  29.47 
 
 		 502 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.3624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3136  putative circadian clock protein, KaiC  30.61 
 
 		 498 aa  64.7  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00540403  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0033  hypothetical protein  31.79 
 
 		 230 aa  63.9  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2268  Non-specific serine/threonine protein kinase  25.89 
 
 		 503 aa  64.3  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00960812  normal  0.0645307 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2451  KaiC  30.87 
 
 		 494 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.970563  hitchhiker  0.00417767 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2653  circadian clock protein KaiC  31.54 
 
 		 505 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.829711 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3229  non-specific serine/threonine protein kinase  28.67 
 
 		 494 aa  63.5  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2944  putative circadian clock protein, KaiC  31.54 
 
 		 496 aa  63.2  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00911179  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2453  putative circadian clock protein, KaiC  28.02 
 
 		 478 aa  63.2  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6530  putative circadian clock protein, KaiC  28.42 
 
 		 501 aa  62  0.000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.283837  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0048  putative circadian clock protein, KaiC  23.01 
 
 		 235 aa  62  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1138  putative circadian clock protein, KaiC  24.26 
 
 		 482 aa  61.6  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.860477  normal  0.0108343 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1062  KaiA binding  23.86 
 
 		 228 aa  62  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.38736  normal  0.180687 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2398  hypothetical protein  28.09 
 
 		 508 aa  60.1  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.381909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0547  hypothetical protein  32.24 
 
 		 242 aa  60.5  0.00000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000268994  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0561  hypothetical protein  32.24 
 
 		 242 aa  60.5  0.00000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00523047  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0039  putative circadian clock protein, KaiC  25.47 
 
 		 505 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0424208 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1030  Non-specific serine/threonine protein kinase  26.77 
 
 		 498 aa  60.1  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2890  KaiA binding protein  24.86 
 
 		 236 aa  58.9  0.00000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0444  KaiA binding protein  47.3 
 
 		 224 aa  58.2  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2260  KaiA binding  34.52 
 
 		 231 aa  57.8  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00780772 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1657  putative circadian clock protein, KaiC  28.86 
 
 		 501 aa  57.4  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1297  putative circadian clock protein, KaiC  25.56 
 
 		 492 aa  57  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.551481  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0135  putative circadian clock protein, KaiC  29.05 
 
 		 506 aa  56.2  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.034427 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0067  putative circadian clock protein, KaiC  26.79 
 
 		 532 aa  55.8  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.643949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4712  non-specific serine/threonine protein kinase  24.88 
 
 		 507 aa  55.8  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1513  KaiC  25.68 
 
 		 459 aa  55.5  0.0000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00132783  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0297  putative circadian clock protein, KaiC  46.88 
 
 		 320 aa  55.5  0.0000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000433674  normal  0.105078 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1702  putative circadian clock protein, KaiC  27.42 
 
 		 499 aa  55.5  0.0000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.197448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0524  putative circadian clock protein, KaiC  47.46 
 
 		 364 aa  53.9  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1389  putative circadian clock protein, KaiC  22.7 
 
 		 402 aa  54.3  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.201888  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0483  putative circadian clock protein, KaiC  25.14 
 
 		 362 aa  53.5  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1755  ATPase  45.45 
 
 		 247 aa  53.1  0.000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0741  circadian clock protein KaiC  26.64 
 
 		 562 aa  52.8  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1768  putative circadian clock protein, KaiC  45.45 
 
 		 280 aa  52.8  0.000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00173937 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3435  putative circadian clock protein, KaiC  22.9 
 
 		 492 aa  52.8  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0781  tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit C-like protein  37.08 
 
 		 238 aa  52.4  0.000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.207407  unclonable  0.000000000000156433 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2624  putative circadian clock protein, KaiC  30.26 
 
 		 280 aa  52.4  0.000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.209506  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0596  putative circadian clock protein, KaiC  42.65 
 
 		 281 aa  52.4  0.000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00351856  hitchhiker  0.0000057975 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5760  putative circadian clock protein, KaiC  25.7 
 
 		 496 aa  52.4  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5757  putative circadian clock protein, KaiC  26.46 
 
 		 481 aa  52  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.36007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3030  Non-specific serine/threonine protein kinase  27.89 
 
 		 497 aa  52.4  0.000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.470915  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2609  hypothetical protein  29.25 
 
 		 505 aa  51.6  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0466  Non-specific serine/threonine protein kinase  45 
 
 		 463 aa  51.6  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1727  putative circadian clock protein, KaiC  44.12 
 
 		 276 aa  51.2  0.00001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.806508 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5730  Non-specific serine/threonine protein kinase  41.67 
 
 		 480 aa  51.2  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3032  putative circadian clock protein, KaiC  25 
 
 		 483 aa  50.8  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0689  putative circadian clock protein, KaiC  44.64 
 
 		 467 aa  50.4  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.95223  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6620  putative circadian clock protein, KaiC  28.97 
 
 		 497 aa  50.8  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2779  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.38 
 
 		 504 aa  50.4  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5592  hypothetical protein  25.83 
 
 		 480 aa  50.8  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2554  putative circadian clock protein, KaiC  27.27 
 
 		 242 aa  50.4  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.445302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1860  KaiA binding  21.59 
 
 		 228 aa  50.4  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1678  hypothetical protein  26.9 
 
 		 283 aa  50.4  0.00003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.844314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1520  putative circadian clock protein, KaiC  41.18 
 
 		 281 aa  50.1  0.00003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.554824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1600  hypothetical protein  26.21 
 
 		 293 aa  50.4  0.00003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0751504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0483  hypothetical protein  36.36 
 
 		 286 aa  49.7  0.00005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.751724  hitchhiker  0.00130673 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1661  putative circadian clock protein, KaiC  20.88 
 
 		 344 aa  49.3  0.00006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.321518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0019  non-specific serine/threonine protein kinase  24.53 
 
 		 520 aa  49.3  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0020  putative circadian clock protein, KaiC  24.53 
 
 		 520 aa  49.3  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2689  putative circadian clock protein, KaiC  40.35 
 
 		 234 aa  48.9  0.00008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1170  putative circadian clock protein, KaiC  43.64 
 
 		 237 aa  48.5  0.00009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0984322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3984  circadian clock protein KaiC  24.8 
 
 		 570 aa  48.5  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.612648  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3181  putative circadian clock protein, KaiC  36.14 
 
 		 494 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2095  KaiC  37.33 
 
 		 243 aa  47.4  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0517  hypothetical protein  26.49 
 
 		 281 aa  47.4  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0112529  normal  0.0461896 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1102  non-specific serine/threonine protein kinase  26.21 
 
 		 489 aa  47.8  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0716  putative circadian clock protein, KaiC  24.61 
 
 		 266 aa  47.8  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0711817  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0484  hypothetical protein  25 
 
 		 491 aa  47  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.424786  normal  0.883095 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4008  circadian clock protein KaiC  25.3 
 
 		 559 aa  47  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.376445  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0550  putative circadian clock protein, KaiC  42.11 
 
 		 289 aa  47  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0009  circadian clock protein KaiC  25.82 
 
 		 563 aa  47  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.310441  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6728  putative circadian clock protein, KaiC  35.21 
 
 		 474 aa  46.6  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2228  putative circadian clock protein, KaiC  21.86 
 
 		 484 aa  46.2  0.0004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3311  circadian clock protein KaiC  26.23 
 
 		 570 aa  46.6  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.140965 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1663  circadian clock protein KaiC  23.05 
 
 		 574 aa  46.2  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0010  putative circadian clock protein, KaiC  30.92 
 
 		 257 aa  45.8  0.0006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0174  Non-specific serine/threonine protein kinase  39.62 
 
 		 461 aa  45.8  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1884  putative circadian clock protein, KaiC  24.5 
 
 		 569 aa  45.8  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.780487  normal  0.628661 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1116  circadian clock protein KaiC  21.31 
 
 		 550 aa  45.4  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1328  KaiC  24.3 
 
 		 482 aa  45.4  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0758  KaiC  36.67 
 
 		 301 aa  45.1  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.28576  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1808  circadian clock protein KaiC  29.14 
 
 		 454 aa  44.7  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1788  hypothetical protein  26.57 
 
 		 285 aa  44.7  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00651163 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0226  putative circadian clock protein, KaiC  36.67 
 
 		 267 aa  45.1  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.728159  normal  0.358869 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2366  putative circadian clock protein, KaiC  29.61 
 
 		 258 aa  44.7  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.160155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6554  circadian clock protein KaiC  24.12 
 
 		 584 aa  45.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.242881 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_2003  putative circadian clock protein, KaiC  30.26 
 
 		 258 aa  44.7  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3006  circadian clock protein KaiC  31.94 
 
 		 506 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0945  putative circadian clock protein, KaiC  25.95 
 
 		 241 aa  44.7  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.553729  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4148  circadian clock protein KaiC  27.33 
 
 		 510 aa  44.3  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0860299 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3983  circadian clock protein KaiC  31.58 
 
 		 507 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0301115  normal  0.0187293 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>