More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3154 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_3154  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 145 aa  289  8e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.759591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4356  UspA domain-containing protein  77.24 
 
 		 145 aa  233  6e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244024  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1929  UspA domain-containing protein  82.88 
 
 		 146 aa  229  9e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1732  UspA domain protein  82.88 
 
 		 146 aa  229  9e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0644  UspA domain-containing protein  78.62 
 
 		 145 aa  204  3e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.577691 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3459  hypothetical protein  62.07 
 
 		 145 aa  185  2e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.450632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1272  UspA domain-containing protein  59.31 
 
 		 145 aa  176  1e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2198  hypothetical protein  62.76 
 
 		 145 aa  167  5e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.76051  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3655  UspA domain protein  57.64 
 
 		 147 aa  149  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.850888  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2088  UspA domain-containing protein  46.58 
 
 		 153 aa  120  7e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0358891 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5358  universal stress protein  40.28 
 
 		 144 aa  102  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.974267  normal  0.233102 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3368  hypothetical protein  44.97 
 
 		 146 aa  102  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2081  UspA domain-containing protein  39.58 
 
 		 144 aa  100  6e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1951  UspA domain-containing protein  39.58 
 
 		 144 aa  100  6e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.348575 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1587  universal stress protein  39.58 
 
 		 144 aa  99.8  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.240234  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2089  universal stress protein  39.58 
 
 		 144 aa  99.8  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000150804  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2614  universal stress protein family protein  39.58 
 
 		 144 aa  99.8  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.586253  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1362  universal stress family protein  39.58 
 
 		 144 aa  99.8  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2525  universal stress family protein  39.58 
 
 		 144 aa  99.8  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245766  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1997  universal stress protein  39.58 
 
 		 144 aa  99.8  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0827286  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3223  universal stress protein  39.58 
 
 		 144 aa  99.8  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2471  universal stress family protein  39.58 
 
 		 144 aa  99.8  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1228  UspA domain-containing protein  38.89 
 
 		 144 aa  97.4  5e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.156365 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  40.28 
 
 		 145 aa  97.4  6e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2524  UspA domain-containing protein  38.19 
 
 		 149 aa  97.1  7e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1369  UspA domain-containing protein  38.89 
 
 		 144 aa  97.1  8e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.981582 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1299  UspA domain protein  38.89 
 
 		 144 aa  96.7  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0196706  normal  0.273134 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1650  universal stress protein  38.89 
 
 		 144 aa  96.3  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.629264  normal  0.0236614 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1233  UspA domain protein  38.89 
 
 		 144 aa  96.7  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.997743  normal  0.558302 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2487  UspA domain protein  38.19 
 
 		 144 aa  94.7  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0465125  hitchhiker  0.000264577 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1359  hypothetical protein  38.19 
 
 		 168 aa  94.4  5e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1117  UspA domain-containing protein  36.91 
 
 		 156 aa  94  6e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.656052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  39.16 
 
 		 145 aa  93.6  9e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0997  UspA domain protein  39.07 
 
 		 147 aa  93.2  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1081  UspA domain-containing protein  39.07 
 
 		 147 aa  93.2  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0952859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2637  hypothetical protein  36.11 
 
 		 144 aa  93.2  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.163827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7012  UspA domain-containing protein  36.91 
 
 		 156 aa  92.4  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305575  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  38.19 
 
 		 145 aa  91.7  3e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2068  UspA domain-containing protein  40.28 
 
 		 144 aa  91.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.960208  normal  0.914393 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3338  UspA domain-containing protein  36.11 
 
 		 144 aa  91.7  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6028  hypothetical protein  40.28 
 
 		 144 aa  91.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.999121  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2049  UspA domain-containing protein  40.28 
 
 		 144 aa  91.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.765605  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1954  hypothetical protein  36.81 
 
 		 144 aa  91.3  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  38.19 
 
 		 145 aa  91.3  4e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  39.19 
 
 		 155 aa  90.5  6e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0991  hypothetical protein  36.05 
 
 		 147 aa  90.1  8e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  35.66 
 
 		 148 aa  90.1  8e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5818  UspA domain-containing protein  38.26 
 
 		 153 aa  90.1  9e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0832063 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0267  universal stress protein  38.26 
 
 		 145 aa  90.1  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.793437  normal  0.0161119 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  36.73 
 
 		 152 aa  89.4  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1173  UspA domain-containing protein  40.4 
 
 		 147 aa  89  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.761945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0788  UspA domain-containing protein  35.76 
 
 		 147 aa  88.6  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.523142 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1284  UspA domain protein  40.82 
 
 		 147 aa  89  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0432  UspA domain protein  38.19 
 
 		 144 aa  88.6  3e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1334  hypothetical protein  35.37 
 
 		 154 aa  87.4  6e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0586772  normal  0.952223 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1387  hypothetical protein  36.11 
 
 		 144 aa  87.4  6e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00373989  normal  0.527764 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1112  hypothetical protein  38.51 
 
 		 144 aa  87.4  7e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.619921  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1926  hypothetical protein  38.1 
 
 		 147 aa  87  7e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0463  UspA domain-containing protein  40.82 
 
 		 146 aa  87  8e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2059  UspA domain protein  35.62 
 
 		 156 aa  86.3  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.3944  hitchhiker  0.00218931 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  39.04 
 
 		 144 aa  86.3  1e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4869  UspA domain protein  38 
 
 		 151 aa  85.5  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0991837 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3792  UspA domain protein  38 
 
 		 151 aa  85.5  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4308  hypothetical protein  34.01 
 
 		 147 aa  85.5  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00896563  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2815  UspA domain protein  38.41 
 
 		 147 aa  85.5  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0183337  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1676  hypothetical protein  38.19 
 
 		 143 aa  85.1  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.631803 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1311  UspA domain protein  35.33 
 
 		 187 aa  84.7  4e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.519886  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  37.5 
 
 		 143 aa  84.3  5e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0442  universal stress protein  36.36 
 
 		 200 aa  84  6e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  39.19 
 
 		 153 aa  84  6e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1016  UspA domain-containing protein  36.91 
 
 		 149 aa  83.6  7e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.597353  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6968  UspA domain protein  40.28 
 
 		 147 aa  83.2  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483791  normal  0.0402006 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1888  putative universal stress protein  35.14 
 
 		 184 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.803254  normal  0.974311 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0228  UspA domain protein  41.78 
 
 		 144 aa  82.8  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.115538 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1519  UspA domain-containing protein  38.78 
 
 		 148 aa  82.8  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0716802  normal  0.348047 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3176  UspA domain protein  36.05 
 
 		 291 aa  82.4  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  35.57 
 
 		 157 aa  82.4  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4434  UspA domain-containing protein  35.81 
 
 		 158 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.947422 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2772  UspA domain-containing protein  41.22 
 
 		 147 aa  82.8  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5567  UspA domain protein  36 
 
 		 152 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0848  hypothetical protein  36.55 
 
 		 142 aa  82.4  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1859  putative universal stress protein  34.67 
 
 		 157 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  37.24 
 
 		 148 aa  82  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4273  UspA domain protein  36.49 
 
 		 155 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.664066 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  36.55 
 
 		 180 aa  81.3  0.000000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  33.33 
 
 		 150 aa  81.6  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2230  UspA domain-containing protein  37.93 
 
 		 171 aa  81.3  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0395018 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0904  hypothetical protein  32.19 
 
 		 157 aa  81.3  0.000000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381712  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05426  hypothetical protein  33.11 
 
 		 146 aa  81.3  0.000000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0607  putative universal stress-related protein  37.16 
 
 		 155 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.135512 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1409  UspA domain protein  37.06 
 
 		 140 aa  80.9  0.000000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.554815 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  33.33 
 
 		 150 aa  80.5  0.000000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3150  UspA domain-containing protein  34.67 
 
 		 155 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5009  UspA domain-containing protein  34.67 
 
 		 156 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4660  putative universal stress protein (Usp)  34.87 
 
 		 144 aa  80.5  0.000000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.969367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5580  UspA domain protein  35.37 
 
 		 168 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.88885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4213  UspA domain protein  33.56 
 
 		 146 aa  80.1  0.000000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.501381  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4323  UspA domain protein  33.56 
 
 		 146 aa  80.1  0.000000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.729204  normal  0.0224521 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3813  UspA domain-containing protein  36.24 
 
 		 156 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.175974  normal  0.56362 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  33.57 
 
 		 164 aa  79  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>