More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aasi_1239 on replicon NC_010830
Organism: Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010830  Aasi_1239  hypothetical protein  100 
 
 		 299 aa  609  1e-173  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.968724 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2702  site-specific recombinase  61.87 
 
 		 299 aa  377  1e-103  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2436  tyrosine recombinase XerD  59.26 
 
 		 305 aa  358  7e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.578966 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2797  tyrosine recombinase XerD  57.24 
 
 		 298 aa  354  1e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650693  normal  0.205647 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5470  tyrosine recombinase XerD  54.36 
 
 		 316 aa  342  5.999999999999999e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.602612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0124  phage integrase family protein  51.34 
 
 		 298 aa  334  1e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.776243  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2175  tyrosine recombinase XerD  54.92 
 
 		 299 aa  330  2e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11988  putative tyrosine recombinase  51.68 
 
 		 298 aa  319  3.9999999999999996e-86  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0381  tyrosine recombinase XerD  47.65 
 
 		 303 aa  297  1e-79  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1732  integrase/recombinase XerD  47.6 
 
 		 308 aa  278  8e-74  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1827  tyrosine recombinase XerD  41.67 
 
 		 306 aa  256  4e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1819  integrase/recombinase XerD  44.95 
 
 		 295 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.530175  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0607  recombinase  42.52 
 
 		 296 aa  253  2.0000000000000002e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.89 
 
 		 296 aa  251  1e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1427  tyrosine recombinase XerD subunit  44.48 
 
 		 295 aa  251  1e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.89 
 
 		 296 aa  250  2e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.89 
 
 		 296 aa  250  2e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.89 
 
 		 296 aa  250  2e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.89 
 
 		 296 aa  250  2e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.89 
 
 		 296 aa  250  2e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.89 
 
 		 296 aa  250  2e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.89 
 
 		 296 aa  250  2e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.41 
 
 		 299 aa  250  2e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.89 
 
 		 296 aa  250  2e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.55 
 
 		 296 aa  248  7e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.55 
 
 		 296 aa  247  2e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0927  tyrosine recombinase XerD  41.14 
 
 		 304 aa  246  3e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1320  tyrosine recombinase XerD  42.86 
 
 		 302 aa  244  9.999999999999999e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.75 
 
 		 298 aa  243  3e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1060  tyrosine recombinase XerD  41.3 
 
 		 295 aa  239  5e-62  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17947  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0817  tyrosine recombinase XerD  40.8 
 
 		 305 aa  238  1e-61  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.763193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  40.74 
 
 		 295 aa  237  2e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  42.23 
 
 		 294 aa  237  2e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  40.54 
 
 		 297 aa  236  3e-61  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2378  tyrosine recombinase XerD  41.44 
 
 		 296 aa  235  5.0000000000000005e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.336575 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1501  tyrosine recombinase XerD subunit  41.98 
 
 		 295 aa  234  1.0000000000000001e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2332  tyrosine recombinase XerD  43.1 
 
 		 292 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1878  tyrosine recombinase XerD  42.41 
 
 		 292 aa  233  3e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1554  tyrosine recombinase XerD  40.54 
 
 		 295 aa  233  4.0000000000000004e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1585  tyrosine recombinase XerD  40.54 
 
 		 295 aa  233  4.0000000000000004e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2052  tyrosine recombinase XerD  38.51 
 
 		 296 aa  232  5e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1769  tyrosine recombinase XerD  40.33 
 
 		 304 aa  232  5e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.151783  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2169  tyrosine recombinase XerD  42.42 
 
 		 298 aa  230  2e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1687  tyrosine recombinase XerD subunit  42.09 
 
 		 314 aa  230  3e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2117  tyrosine recombinase XerD  41.75 
 
 		 298 aa  229  5e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815623  normal  0.0464222 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2383  tyrosine recombinase XerD  42.21 
 
 		 295 aa  228  9e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0590  tyrosine recombinase XerD  39.33 
 
 		 306 aa  227  1e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  40.55 
 
 		 295 aa  228  1e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1003  tyrosine recombinase XerD subunit  39.8 
 
 		 302 aa  228  1e-58  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.497558  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1674  tyrosine recombinase XerD  40.34 
 
 		 297 aa  228  1e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0517708  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1099  tyrosine recombinase XerD  39.26 
 
 		 296 aa  226  3e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1432  tyrosine recombinase XerD  41.58 
 
 		 321 aa  226  3e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0895087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  40.21 
 
 		 302 aa  226  4e-58  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2692  tyrosine recombinase XerD  42.81 
 
 		 295 aa  226  4e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.457784  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2739  integrase/recombinase XerD  42.35 
 
 		 321 aa  225  5.0000000000000005e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3396  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.98 
 
 		 298 aa  224  9e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1025  tyrosine recombinase XerD subunit  37 
 
 		 302 aa  224  1e-57  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1118  tyrosine recombinase XerD  39.33 
 
 		 304 aa  224  1e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1622  tyrosine recombinase XerD  41.7 
 
 		 310 aa  224  1e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1142  tyrosine recombinase XerD  41.26 
 
 		 295 aa  224  1e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0396  tyrosine recombinase XerD  40.54 
 
 		 309 aa  224  2e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1347  tyrosine recombinase XerD  43.21 
 
 		 306 aa  223  2e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.816733  normal  0.74121 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2255  tyrosine recombinase XerD  41.64 
 
 		 305 aa  223  2e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000204462  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1971  tyrosine recombinase XerD subunit  40.27 
 
 		 309 aa  224  2e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000860406  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0842  hypothetical protein  40 
 
 		 290 aa  223  2e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0748  tyrosine recombinase XerD  40.34 
 
 		 303 aa  223  3e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.50433  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3714  tyrosine recombinase XerD  38.36 
 
 		 301 aa  223  4e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1025  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.64 
 
 		 298 aa  222  6e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.899371  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0727  tyrosine recombinase XerD  38.98 
 
 		 304 aa  221  8e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.689003 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3450  tyrosine recombinase XerD  41.07 
 
 		 322 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03409  tyrosine recombinase  42.16 
 
 		 308 aa  221  1.9999999999999999e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1521  tyrosine recombinase XerD  37.79 
 
 		 346 aa  220  1.9999999999999999e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.531713  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_998  integrase/recombinase  37 
 
 		 302 aa  219  3e-56  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1215  tyrosine recombinase XerD  36 
 
 		 302 aa  219  3.9999999999999997e-56  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1457  tyrosine recombinase XerD  42.32 
 
 		 292 aa  219  3.9999999999999997e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0432704  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1241  tyrosine recombinase XerD  37.54 
 
 		 311 aa  219  3.9999999999999997e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.657845  normal  0.578091 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39510  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.3 
 
 		 298 aa  219  3.9999999999999997e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4151  site-specific tyrosine recombinase XerD  39.93 
 
 		 298 aa  219  5e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.596099 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5431  tyrosine recombinase XerD  40.47 
 
 		 299 aa  219  5e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.060431  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2127  tyrosine recombinase XerD  38.59 
 
 		 308 aa  219  6e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16040  site-specific tyrosine recombinase XerD  40.27 
 
 		 298 aa  218  1e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0678  tyrosine recombinase XerD  39.52 
 
 		 294 aa  217  1e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0265142 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02726  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.5 
 
 		 298 aa  217  2e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.292633  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0798  tyrosine recombinase XerD  41.5 
 
 		 298 aa  217  2e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.966972  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3027  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.5 
 
 		 298 aa  217  2e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02689  hypothetical protein  41.5 
 
 		 298 aa  217  2e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.364794  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3314  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.5 
 
 		 298 aa  217  2e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25380  tyrosine recombinase XerD subunit  38.8 
 
 		 311 aa  217  2e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.732719 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3220  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.5 
 
 		 298 aa  217  2e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4185  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.5 
 
 		 298 aa  217  2e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0770  tyrosine recombinase XerD  39.73 
 
 		 303 aa  217  2e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0646575 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3053  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.5 
 
 		 298 aa  216  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1468  site-specific tyrosine recombinase XerD  39.93 
 
 		 298 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.208903 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1478  integrase/recombinase XerD  39.93 
 
 		 298 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0755097  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3200  site-specific tyrosine recombinase XerD  42.18 
 
 		 298 aa  216  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.550002  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3380  site-specific tyrosine recombinase XerD  42.18 
 
 		 298 aa  216  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3275  site-specific tyrosine recombinase XerD  42.18 
 
 		 298 aa  216  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4253  site-specific tyrosine recombinase XerD  39.93 
 
 		 298 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0815  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.5 
 
 		 298 aa  216  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.624778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3278  site-specific tyrosine recombinase XerD  42.18 
 
 		 298 aa  216  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>