More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_1487 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_1487  DNA mismatch repair protein MutL  100 
 
 
622 aa  1253    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.101291  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2420  DNA mismatch repair protein  36.11 
 
 
649 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.323655  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3802  DNA mismatch repair protein  35.94 
 
 
647 aa  394  1e-108  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.618994  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3617  DNA mismatch repair protein  36.09 
 
 
626 aa  393  1e-108  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.552847  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3904  DNA mismatch repair protein  36.09 
 
 
626 aa  393  1e-108  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.595251  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3867  DNA mismatch repair protein  35.79 
 
 
647 aa  394  1e-108  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2128  DNA mismatch repair protein  38.31 
 
 
639 aa  395  1e-108  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000120986  normal  0.021871 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3815  DNA mismatch repair protein  35.94 
 
 
647 aa  395  1e-108  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3780  DNA mismatch repair protein  35.79 
 
 
647 aa  392  1e-108  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0217989 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3539  DNA mismatch repair protein  36.21 
 
 
644 aa  394  1e-108  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2098  DNA mismatch repair protein  34.48 
 
 
659 aa  391  1e-107  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3527  DNA mismatch repair protein  35.64 
 
 
647 aa  390  1e-107  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0526  DNA mismatch repair protein  35 
 
 
668 aa  391  1e-107  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0072  DNA mismatch repair protein  35.55 
 
 
647 aa  391  1e-107  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3509  DNA mismatch repair protein  35.9 
 
 
647 aa  387  1e-106  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1203  DNA mismatch repair protein  38.29 
 
 
619 aa  387  1e-106  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.288753  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2517  DNA mismatch repair protein  35.45 
 
 
656 aa  386  1e-106  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1432  DNA mismatch repair protein  35.79 
 
 
647 aa  389  1e-106  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.980701 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1696  DNA mismatch repair protein MutL  34.38 
 
 
665 aa  384  1e-105  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.930861  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1359  DNA mismatch repair protein  33.38 
 
 
674 aa  385  1e-105  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.52416  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2096  DNA mismatch repair protein  39.22 
 
 
630 aa  385  1e-105  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1382  DNA mismatch repair protein  34.13 
 
 
669 aa  382  1e-104  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0932721  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11660  DNA mismatch repair protein MutL  32.16 
 
 
644 aa  380  1e-104  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1172  DNA mismatch repair protein  33.23 
 
 
674 aa  381  1e-104  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0864  DNA mismatch repair protein  33.65 
 
 
645 aa  375  1e-102  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.23826  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1703  DNA mismatch repair protein MutL  37.62 
 
 
603 aa  370  1e-101  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2001  DNA mismatch repair protein  38.72 
 
 
606 aa  369  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0369313  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1114  DNA mismatch repair protein MutL  39.37 
 
 
620 aa  365  1e-100  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000422632  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3219  DNA mismatch repair protein MutL  37.6 
 
 
647 aa  369  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.428383  normal  0.251683 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1575  DNA mismatch repair protein MutL  33.91 
 
 
648 aa  367  1e-100  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1884  DNA mismatch repair protein  35.92 
 
 
640 aa  363  4e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2053  DNA mismatch repair protein  38 
 
 
622 aa  362  1e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00117239  hitchhiker  0.0000000712721 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0554  DNA mismatch repair protein MutL  38.9 
 
 
565 aa  358  9.999999999999999e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1304  DNA mismatch repair protein  38.12 
 
 
628 aa  357  3.9999999999999996e-97  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0761454  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1612  DNA mismatch repair protein  34.63 
 
 
614 aa  353  4e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.235254  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0494  DNA mismatch repair protein MutL  38.15 
 
 
626 aa  352  1e-95  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.220055  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1951  DNA mismatch repair protein  40.22 
 
 
585 aa  351  2e-95  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.448925  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1936  DNA mismatch repair protein MutL  37.48 
 
 
612 aa  347  3e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000687656 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1499  DNA mismatch repair protein MutL  31.18 
 
 
589 aa  347  5e-94  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2088  DNA mismatch repair protein  38.12 
 
 
601 aa  345  1e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.02775 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0800  DNA mismatch repair protein MutL  34.62 
 
 
586 aa  345  1e-93  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2223  DNA mismatch repair protein  39.68 
 
 
607 aa  344  2.9999999999999997e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.38556  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1770  DNA mismatch repair protein  36.31 
 
 
602 aa  343  5e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00259733  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1144  DNA mismatch repair protein MutL  36.98 
 
 
616 aa  343  5e-93  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.513301  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2634  DNA mismatch repair protein  36.26 
 
 
641 aa  343  7e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00330895  unclonable  0.0000000000120627 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2999  DNA mismatch repair protein MutL  35.93 
 
 
631 aa  343  7e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0978  DNA mismatch repair protein  35.31 
 
 
647 aa  343  8e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0100042  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0633  DNA mismatch repair protein  37.25 
 
 
623 aa  342  1e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.211888 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0413  DNA mismatch repair protein  34.42 
 
 
630 aa  341  2.9999999999999998e-92  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2771  DNA mismatch repair protein  36.99 
 
 
629 aa  340  4e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0570  DNA mismatch repair protein  37.15 
 
 
648 aa  340  5e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.963062 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3282  DNA mismatch repair protein  34.5 
 
 
650 aa  340  5.9999999999999996e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3164  DNA mismatch repair protein MutL  38.33 
 
 
615 aa  339  7e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2133  DNA mismatch repair protein  39.36 
 
 
607 aa  337  3.9999999999999995e-91  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0963  DNA mismatch repair protein MutL  36.52 
 
 
608 aa  337  3.9999999999999995e-91  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00410  DNA mismatch repair protein  36.38 
 
 
625 aa  337  5e-91  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1040  DNA mismatch repair protein MutL  36.76 
 
 
632 aa  337  5e-91  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.619157 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0481  DNA mismatch repair protein MutL  32.54 
 
 
623 aa  337  5.999999999999999e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.324517  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0293  DNA mismatch repair protein  37.4 
 
 
602 aa  336  7e-91  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1078  DNA mismatch repair protein MutL  32.16 
 
 
572 aa  336  7e-91  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0521  DNA mismatch repair protein  36.42 
 
 
635 aa  336  7.999999999999999e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0525121  normal  0.511532 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4944  DNA mismatch repair protein MutL  37.21 
 
 
645 aa  335  1e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3054  DNA mismatch repair protein  37.09 
 
 
643 aa  335  1e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0230443  normal  0.222547 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1715  DNA mismatch repair protein  39.46 
 
 
608 aa  335  2e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.233899  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3466  DNA mismatch repair protein MutL  36.5 
 
 
622 aa  335  2e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.52693  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3225  DNA mismatch repair protein MutL  36.77 
 
 
599 aa  334  3e-90  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.142793  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1692  DNA mismatch repair protein  36.35 
 
 
611 aa  333  4e-90  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2962  DNA mismatch repair protein  36.29 
 
 
608 aa  333  7.000000000000001e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000126227  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4896  DNA mismatch repair protein  37.81 
 
 
632 aa  332  1e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4948  DNA mismatch repair protein  37.56 
 
 
632 aa  332  1e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.167425  normal  0.037125 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0100  DNA mismatch repair protein MutL  36.55 
 
 
605 aa  332  1e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4772  DNA mismatch repair protein  37.66 
 
 
633 aa  330  3e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209994  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_978  DNA mismatch repair protein, MutL/HexB family  35.1 
 
 
566 aa  331  3e-89  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2669  DNA mismatch repair protein  34.87 
 
 
630 aa  330  5.0000000000000004e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.680786  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0571  DNA mismatch repair protein MutL  37.35 
 
 
636 aa  330  6e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.707368  hitchhiker  0.00000000963067 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07520  DNA mismatch repair protein  37.04 
 
 
641 aa  329  8e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0441  DNA mismatch repair protein  36.97 
 
 
620 aa  329  8e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1041  DNA mismatch repair protein MutL  30.56 
 
 
606 aa  329  1.0000000000000001e-88  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1217  DNA mismatch repair protein  37.2 
 
 
612 aa  328  2.0000000000000001e-88  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.469734  normal  0.0661873 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3811  DNA mismatch repair protein MutL  32.97 
 
 
629 aa  328  2.0000000000000001e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.248482 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2701  DNA mismatch repair protein MutL  32.76 
 
 
626 aa  327  3e-88  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00383046  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1924  DNA mismatch repair protein MutL  36.14 
 
 
560 aa  327  3e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2713  DNA mismatch repair protein  37.09 
 
 
606 aa  327  4.0000000000000003e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1494  DNA mismatch repair protein MutL  32.16 
 
 
692 aa  327  4.0000000000000003e-88  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1981  DNA mismatch repair protein  34.76 
 
 
626 aa  327  5e-88  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.201794  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5675  DNA mismatch repair protein  36.2 
 
 
633 aa  327  6e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65350  DNA mismatch repair protein  36.2 
 
 
633 aa  326  9e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1195  MutL/HexB family DNA mismatch repair protein  35.3 
 
 
566 aa  325  1e-87  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0321912  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0145  DNA mismatch repair protein  32.45 
 
 
644 aa  325  1e-87  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4687  DNA mismatch repair protein  37.01 
 
 
633 aa  325  2e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427145  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4548  DNA mismatch repair protein MutL  36.7 
 
 
605 aa  325  2e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2836  DNA mismatch repair protein  35.88 
 
 
647 aa  323  4e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0267  DNA mismatch repair protein MutL  33.01 
 
 
622 aa  323  5e-87  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000997696 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0993  DNA mismatch repair protein  36.82 
 
 
589 aa  322  9.000000000000001e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.139394  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0023  DNA mismatch repair protein MutL  30.82 
 
 
621 aa  322  9.999999999999999e-87  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000493473  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4062  DNA mismatch repair protein  36.77 
 
 
643 aa  322  9.999999999999999e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1466  DNA mismatch repair protein MutL  36.52 
 
 
635 aa  321  3e-86  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.643627  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1275  DNA mismatch repair protein  36.79 
 
 
644 aa  320  3.9999999999999996e-86  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0149  DNA mismatch repair protein MutL  34.13 
 
 
605 aa  320  5e-86  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2563  DNA mismatch repair protein  34.18 
 
 
636 aa  319  7.999999999999999e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>