More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_4376 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_4376  phosphoesterase DHHA1  100 
 
 
406 aa  758    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.267763  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4220  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  94.15 
 
 
408 aa  639    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.147338  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4353  phosphoesterase DHHA1  98.03 
 
 
406 aa  743    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.437465  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4370  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  68.41 
 
 
401 aa  403  1e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0256503 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3568  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  42.33 
 
 
408 aa  245  9.999999999999999e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.437121  normal  0.758255 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4632  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  40.15 
 
 
387 aa  230  3e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3415  alanyl-tRNA synthetase family protein  32.32 
 
 
411 aa  207  2e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3376  alanine--tRNA ligase (alanyl-tRNA synthetase)  32.32 
 
 
411 aa  207  2e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3326  alanine--tRNA ligase (alanyl-tRNA synthetase)  32.32 
 
 
411 aa  207  2e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3684  alanyl-tRNA synthetase family protein  32.32 
 
 
411 aa  207  2e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3635  alanyl-tRNA synthetase family protein  32.58 
 
 
400 aa  208  2e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.9277 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3643  alanyl-tRNA synthetase family protein  32.51 
 
 
400 aa  206  8e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2431  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  36.25 
 
 
389 aa  205  1e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4033  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  35.82 
 
 
403 aa  205  1e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.22843  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3310  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  32.66 
 
 
411 aa  204  3e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.463207  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3652  alanyl-tRNA synthetase family protein  31.84 
 
 
400 aa  204  3e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3732  alanyl-tRNA synthetase family protein  31.59 
 
 
400 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.499023  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2272  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  30.73 
 
 
414 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1585  alanyl-tRNA synthetase family protein  30.3 
 
 
400 aa  194  2e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0223949 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2333  phage tail protein I  31.4 
 
 
404 aa  176  7e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0714  DHH domain-containing protein  30.41 
 
 
400 aa  168  1e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.148713  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0705  DHH domain-containing protein  30.41 
 
 
400 aa  167  2e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0730  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  33.59 
 
 
398 aa  164  3e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00140336 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0209  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  34.29 
 
 
390 aa  154  2e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.468608 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1908  alanyl-tRNA synthetase  34.46 
 
 
926 aa  152  1e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0033  alanyl-tRNA synthetase  33.25 
 
 
925 aa  150  3e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1124  alanyl-tRNA synthetase  32.94 
 
 
924 aa  143  6e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.118182  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0719  alanyl-tRNA synthetase  36.95 
 
 
926 aa  140  4.999999999999999e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.507157  normal  0.398718 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1287  alanyl-tRNA synthetase  29.9 
 
 
913 aa  139  6e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.460274  normal  0.758822 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1021  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  34.12 
 
 
373 aa  139  7e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000117981  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1361  alanyl-tRNA synthetase  31.12 
 
 
923 aa  137  4e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0657  alanyl-tRNA synthetase  32.61 
 
 
913 aa  137  4e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.459969  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1929  alanyl-tRNA synthetase  33.74 
 
 
926 aa  137  4e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1099  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  33.77 
 
 
373 aa  136  7.000000000000001e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.239872  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1384  alanyl-tRNA synthetase  27.57 
 
 
892 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1513  alanyl-tRNA synthetase  34.63 
 
 
915 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0039  alanyl-tRNA synthetase  29.23 
 
 
916 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0776  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  28.69 
 
 
373 aa  130  4.0000000000000003e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0618  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  39.13 
 
 
265 aa  129  8.000000000000001e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.920461  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1395  alanyl-tRNA synthetase  28.06 
 
 
892 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2186  alanyl-tRNA synthetase  28.03 
 
 
923 aa  125  1e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1447  alanyl-tRNA synthetase  28.92 
 
 
882 aa  125  1e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1898  alanyl-tRNA synthetase  33.81 
 
 
899 aa  124  2e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0295948  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0917  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  30.89 
 
 
363 aa  124  3e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1267  alanyl-tRNA synthetase  31.82 
 
 
914 aa  124  4e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.837647  normal  0.239203 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1760  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  23.49 
 
 
383 aa  123  7e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000600128  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1993  alanyl-tRNA synthetase  34.68 
 
 
896 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1241  alanyl-tRNA synthetase  27.81 
 
 
892 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.243126  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0513  alanyl-tRNA synthetase  27.55 
 
 
892 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1887  alanyl-tRNA synthetase  29.1 
 
 
872 aa  120  3.9999999999999996e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0744  alanyl-tRNA synthetase  31.3 
 
 
888 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.453512  normal  0.711122 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4881  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  35.89 
 
 
239 aa  119  9.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1113  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  27.97 
 
 
369 aa  118  1.9999999999999998e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.466733  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2228  alanyl-tRNA synthetase  31.23 
 
 
892 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53118  Alanyl-tRNA synthetase (Alanine--tRNA ligase) (AlaRS)  33.69 
 
 
430 aa  117  3e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.523739  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0797  alanyl-tRNA synthetase  31.14 
 
 
884 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1345  Alanyl-tRNA synthetase, class IIc-like protein  40.4 
 
 
249 aa  117  5e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0814  alanyl-tRNA synthetase  31.04 
 
 
893 aa  116  6.9999999999999995e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1644  alanyl-tRNA synthetase  30.81 
 
 
881 aa  116  7.999999999999999e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.859756  normal  0.0937796 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1380  alanyl-tRNA synthetase  28.81 
 
 
913 aa  116  7.999999999999999e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.573615  normal  0.044569 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1324  alanyl-tRNA synthetase  32.74 
 
 
874 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0621  alanyl-tRNA synthetase  24.94 
 
 
910 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1387  alanyl-tRNA synthetase  32.48 
 
 
874 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.371658 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1201  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  35.34 
 
 
399 aa  115  2.0000000000000002e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.703964 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0900  alanyl-tRNA synthetase  35.01 
 
 
892 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0927  alanyl-tRNA synthetase  31.79 
 
 
897 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.540325  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1409  alanyl-tRNA synthetase  31.79 
 
 
897 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.412076  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1286  alanyl-tRNA synthetase  32.48 
 
 
874 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0368  alanyl-tRNA synthetase  26.94 
 
 
889 aa  113  7.000000000000001e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4553  alanyl-tRNA synthetase  32.23 
 
 
897 aa  113  8.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.468521  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2824  alanyl-tRNA synthetase  30.95 
 
 
874 aa  113  8.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0756598 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0919  alanyl-tRNA synthetase  32.69 
 
 
892 aa  112  8.000000000000001e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.213328 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0831  alanyl-tRNA synthetase  29.7 
 
 
884 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.168627  normal  0.137566 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1331  alanyl-tRNA synthetase  24.04 
 
 
883 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.255644  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0962  alanyl-tRNA synthetase  31.47 
 
 
878 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0357  alanyl-tRNA synthetase  30.2 
 
 
872 aa  112  2.0000000000000002e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.160702  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0850  alanyl-tRNA synthetase  30.26 
 
 
874 aa  109  7.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1613  alanyl-tRNA synthetase  30.89 
 
 
874 aa  108  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.894889  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4471  alanyl-tRNA synthetase  28.68 
 
 
880 aa  108  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00256411  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0728  alanyl-tRNA synthetase  28.68 
 
 
880 aa  108  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00762442  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1311  alanyl-tRNA synthetase  31.03 
 
 
874 aa  108  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.290938  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4508  alanyl-tRNA synthetase  28.43 
 
 
880 aa  108  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4132  alanyl-tRNA synthetase  28.68 
 
 
880 aa  107  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0533  alanyl-tRNA synthetase  29.23 
 
 
884 aa  107  3e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000106893  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4521  alanyl-tRNA synthetase  28.68 
 
 
880 aa  107  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00304935  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0493  alanyl-tRNA synthetase  29.7 
 
 
872 aa  107  3e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4468  alanyl-tRNA synthetase  28.68 
 
 
880 aa  107  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000190216 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1313  alanyl-tRNA synthetase  27.7 
 
 
900 aa  107  4e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2320  alanyl-tRNA synthetase  30.91 
 
 
900 aa  107  5e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.871367  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0127  alanyl-tRNA synthetase  26.45 
 
 
877 aa  106  6e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0445567  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0418  alanyl-tRNA synthetase  22.95 
 
 
865 aa  106  8e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1975  alanyl-tRNA synthetase  32.66 
 
 
890 aa  105  1e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.235306  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1670  alanyl-tRNA synthetase  31.19 
 
 
872 aa  105  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.503814 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4284  alanyl-tRNA synthetase  28.43 
 
 
880 aa  104  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4616  alanyl-tRNA synthetase  28.43 
 
 
880 aa  104  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00215408  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2571  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  36.07 
 
 
236 aa  104  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.613801  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1489  alanyl-tRNA synthetase  25.51 
 
 
877 aa  105  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000163922  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4121  alanyl-tRNA synthetase  28.43 
 
 
880 aa  104  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000164484  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0553  alanyl-tRNA synthetase  32.23 
 
 
886 aa  104  3e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4712  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  33.22 
 
 
403 aa  104  3e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0289109  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>