119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_0337 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_0337  DNA-binding protein  100 
 
 		 135 aa  275  2e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2814  transcriptional regulator, XRE family  76.19 
 
 		 128 aa  202  9e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2847  ans operon repressor protein  43.86 
 
 		 125 aa  52.8  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3459  transcriptional regulator  45 
 
 		 145 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3465  XRE family transcriptional regulator  45 
 
 		 142 aa  53.1  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0355  hypothetical protein  30.95 
 
 		 89 aa  53.1  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2917  transcriptional regulator AnsR  43.86 
 
 		 125 aa  52.8  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.41229  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2885  ans operon repressor protein  43.86 
 
 		 125 aa  52.8  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0484001  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3138  transcriptional regulator AnsR  43.86 
 
 		 125 aa  52.8  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3160  transcriptional regulator AnsR  43.86 
 
 		 125 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.980504  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3137  transcriptional regulator AnsR  43.86 
 
 		 125 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0650  transcriptional regulator, XRE family  35.96 
 
 		 110 aa  51.2  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3117  transcriptional regulator AnsR  42.11 
 
 		 125 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2120  transcriptional regulator AnsR  42.11 
 
 		 125 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2142  XRE family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 175 aa  50.4  0.000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0916  XRE family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 115 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0702  XRE family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 137 aa  49.7  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000217339  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0278  XRE family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 128 aa  49.3  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000672654  normal  0.646275 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0218  Cro/CI family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 158 aa  48.5  0.00003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.631577  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2248  transcriptional regulator, XRE family  41.27 
 
 		 505 aa  48.5  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.99928  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7699  putative transcriptional regulator  35.05 
 
 		 112 aa  48.5  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.829097  normal  0.153836 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20950  putative prophage repressor  38.33 
 
 		 200 aa  48.5  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000578065  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0465  transcriptional regulator, XRE family  34.04 
 
 		 163 aa  48.5  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00289124  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4178  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 130 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.886419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2460  XRE family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 142 aa  47.8  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0113682  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2252  transcriptional repressor DicA  32.71 
 
 		 131 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000218001  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0726  putative phage repressor  32.43 
 
 		 225 aa  47.8  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.255707  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1027  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 321 aa  47.4  0.00007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1733  XRE family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 133 aa  47  0.00009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3608  XRE family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 130 aa  47  0.00009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0510  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 114 aa  47  0.00009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000759518  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2429  transcriptional regulator, XRE family  29.52 
 
 		 127 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00159098 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4829  XRE family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 123 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.584136  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1543  XRE family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 359 aa  46.2  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3337  XRE family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 123 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.98805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3288  transcriptional regulator, XRE family  35.21 
 
 		 135 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0656  transcriptional regulator, XRE family  39.68 
 
 		 71 aa  47  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2672  transcriptional regulator, XRE family  38.16 
 
 		 118 aa  46.2  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000679525  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1249  Cro/CI family transcriptional regulator  40 
 
 		 74 aa  45.8  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2791  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 139 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0416  prophage LambdaBa04, DNA-binding protein  35.29 
 
 		 114 aa  45.4  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0428  prophage lambdaba04, DNA-binding protein  35.29 
 
 		 114 aa  45.4  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.663163  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6072  putative transcriptional regulator Cro/CI family  41.82 
 
 		 233 aa  45.4  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.406393 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0697  transcriptional regulator, XRE family  37.14 
 
 		 151 aa  45.1  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3135  transcriptional regulator, XRE family  32.89 
 
 		 137 aa  45.1  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.317529  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0281  XRE family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 78 aa  45.1  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0335018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1673  ABC transporter related  36.36 
 
 		 293 aa  45.1  0.0004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000539653  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1292  transcriptional regulator, XRE family  36.23 
 
 		 110 aa  45.1  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.020008  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2015  Cro/CI family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 99 aa  44.7  0.0005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00850971  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0686  helix-turn-helix domain protein  32.86 
 
 		 349 aa  44.7  0.0005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0820462  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4788  transcriptional regulator, XRE family  26.53 
 
 		 114 aa  44.3  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000000200631  normal  0.763075 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0513  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 70 aa  44.3  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.041665  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0163  transcriptional regulator, XRE family  34.85 
 
 		 141 aa  43.9  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.953205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4781  transcriptional regulator, XRE family  26.53 
 
 		 113 aa  43.9  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00061071  normal  0.699893 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0051  putative transcriptional regulator  26.8 
 
 		 138 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3371  putative phage repressor  32.22 
 
 		 229 aa  43.9  0.0008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000119805  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3495  putative phage repressor  32.22 
 
 		 229 aa  43.9  0.0008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000058003  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3618  XRE family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 123 aa  43.9  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1892  XRE family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 120 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0278  XRE family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 145 aa  43.1  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0540  XRE family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 120 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0413  helix-turn-helix domain-containing protein  33.85 
 
 		 132 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0675  XRE family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 120 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00325967 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0591  XRE family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 113 aa  43.5  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07480  helix-turn-helix domain protein  38.33 
 
 		 301 aa  43.5  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.961759  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0162  transcriptional regulator  37.1 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0762  XRE family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 132 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1232  XRE family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 126 aa  42.7  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.236768  normal  0.265611 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1909  XRE family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 123 aa  42.4  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00600  putative transcriptional regulator  26.67 
 
 		 127 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.1953  normal  0.198014 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0918  XRE family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 229 aa  42.7  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000791351  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2421  helix-turn-helix domain-containing protein  35.48 
 
 		 132 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.195917  normal  0.223738 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2020  putative phage repressor  33.33 
 
 		 233 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0868068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1628  XRE family transcriptional regulator  25 
 
 		 133 aa  42.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3762  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 135 aa  42.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.117326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2958  transcriptional regulator HTH family  31.68 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2436  transcriptional regulator, XRE family  30.39 
 
 		 104 aa  42.7  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2636  transcriptional regulator, XRE family  34.92 
 
 		 496 aa  42.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2567  XRE family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 106 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.59456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1603  adenine deaminase  34.67 
 
 		 347 aa  42  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000000366307  hitchhiker  0.000640003 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19180  predicted transcriptional regulator  34.43 
 
 		 141 aa  41.6  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.433834  normal  0.0717748 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00980  predicted transcriptional regulator  36.07 
 
 		 459 aa  42  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.224409  normal  0.709118 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2780  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 152 aa  42  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0182016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2431  transcriptional regulator, XRE family  36.92 
 
 		 125 aa  42  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000620136 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4971  helix-turn-helix domain protein  31 
 
 		 111 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1621  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 146 aa  41.2  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4073  XRE family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 141 aa  41.6  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2433  transcriptional regulator, XRE family  33.78 
 
 		 132 aa  41.2  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000213647 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1967  XRE family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 268 aa  41.6  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000016802  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0767  putative phage repressor  33.33 
 
 		 233 aa  41.2  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.420477  normal  0.277646 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2146  transcriptional regulator, XRE family  30.3 
 
 		 206 aa  41.6  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0483341  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3652  helix-turn-helix domain-containing protein  32.79 
 
 		 262 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0250948  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06250  predicted transcriptional regulator  33.33 
 
 		 256 aa  41.2  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3616  putative phage repressor  33.33 
 
 		 233 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0874136  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0495  XRE family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 100 aa  41.2  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00400235  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0169  XRE family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 141 aa  41.2  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3663  helix-turn-helix domain protein  32.79 
 
 		 262 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0164225  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4795  transcriptional regulator, XRE family  33.85 
 
 		 134 aa  41.2  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0939257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1578  helix-turn-helix domain protein  32.79 
 
 		 262 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00571888  normal  0.126267 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1468  transcriptional regulator, XRE family  31.4 
 
 		 182 aa  41.2  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0100935  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>