More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0749 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_0749  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  100 
 
 		 327 aa  640    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.641602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2878  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  97.55 
 
 		 327 aa  626  1e-178  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0715794 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7741  conjugal transfer protein trbB  91.44 
 
 		 327 aa  585  1e-166  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.685768 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2324  type II secretion system protein E  85.93 
 
 		 327 aa  555  1e-157  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3004  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  86.11 
 
 		 342 aa  553  1e-156  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.803505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0509  type II secretion system protein E  85.41 
 
 		 329 aa  550  1e-155  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.77324  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3827  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  86.6 
 
 		 321 aa  543  1e-153  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3086  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  85.02 
 
 		 343 aa  543  1e-153  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0699  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  84.74 
 
 		 326 aa  541  1e-153  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4000  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  84.52 
 
 		 328 aa  538  9.999999999999999e-153  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3851  type II secretion system protein E  82.77 
 
 		 327 aa  539  9.999999999999999e-153  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.296178  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3541  type II secretion system protein E  86.12 
 
 		 322 aa  534  1e-151  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0478777  normal  0.532138 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3541  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  83.85 
 
 		 327 aa  533  1e-150  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1194  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  83.85 
 
 		 327 aa  533  1e-150  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.442732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3901  type II secretion system protein E  85.94 
 
 		 322 aa  526  1e-148  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.23127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3212  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  85.3 
 
 		 332 aa  527  1e-148  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0166332  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0808  type II secretion system protein E  83.44 
 
 		 326 aa  524  1e-147  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1484  type II secretion system protein E  83.38 
 
 		 332 aa  520  1e-146  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.307277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0595  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  79.88 
 
 		 328 aa  517  1.0000000000000001e-145  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0156  type II secretion system protein E  82.97 
 
 		 334 aa  517  1.0000000000000001e-145  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7440  conjugal transfer protein trbB  83.55 
 
 		 305 aa  513  1e-144  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3364  conjugal transfer protein trbB  80.95 
 
 		 326 aa  511  1e-144  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.538744 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3194  type II secretion system protein E  82.22 
 
 		 334 aa  511  1e-144  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.653362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1013  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  80.83 
 
 		 322 aa  505  9.999999999999999e-143  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1500  conjugal transfer protein trbB  79.75 
 
 		 327 aa  503  1e-141  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0966  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  77.09 
 
 		 334 aa  492  9.999999999999999e-139  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2824  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  82.37 
 
 		 329 aa  494  9.999999999999999e-139  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3691  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  77.61 
 
 		 328 aa  490  1e-137  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0318  type II secretion system protein E  78.15 
 
 		 327 aa  483  1e-135  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0504933  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2614  type II secretion system protein E  79.69 
 
 		 327 aa  479  1e-134  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2485  type II secretion system protein E  78.93 
 
 		 327 aa  456  1e-127  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.3274 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2268  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  69.71 
 
 		 325 aa  415  9.999999999999999e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0161  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  69.38 
 
 		 323 aa  410  1e-113  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.654674 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1835  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  65.92 
 
 		 325 aa  405  1.0000000000000001e-112  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2027  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  61.46 
 
 		 333 aa  374  1e-103  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4195  type II secretion system protein E  63.88 
 
 		 343 aa  363  2e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2911  type II secretion system protein E  64.95 
 
 		 344 aa  358  6e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1550  type II secretion system protein E  61.78 
 
 		 358 aa  355  6.999999999999999e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00260971  normal  0.700306 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0438  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  63.04 
 
 		 353 aa  354  1e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3506  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  63.37 
 
 		 344 aa  354  1e-96  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.19636  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2699  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  63.12 
 
 		 344 aa  353  2e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.183128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1341  type II secretion system protein E  64.07 
 
 		 354 aa  353  2.9999999999999997e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.120888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2004  type II secretion system protein E  62.71 
 
 		 348 aa  352  4e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35720  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  61.84 
 
 		 350 aa  352  4e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.469898  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2645  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  63.21 
 
 		 345 aa  352  5.9999999999999994e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1282  type II secretion system protein E  62.05 
 
 		 356 aa  351  8.999999999999999e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0726  type II secretion system protein E  62.05 
 
 		 349 aa  350  2e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.687032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30940  putative conjugal transfer protein  63.27 
 
 		 356 aa  349  3e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000128533  unclonable  3.72388e-22 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3706  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  63.39 
 
 		 350 aa  349  4e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.557258  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1895  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  62.05 
 
 		 356 aa  348  7e-95  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2350  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  61.13 
 
 		 351 aa  348  9e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.526616 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2584  conjugal transfer protein TrbB  61.06 
 
 		 355 aa  346  3e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2351  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  58.93 
 
 		 325 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5330  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  54.05 
 
 		 320 aa  308  1.0000000000000001e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.548363 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5159  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  51.11 
 
 		 318 aa  291  8e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5376  conjugal transfer protein TrbB  49.18 
 
 		 325 aa  270  2.9999999999999997e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.873553  normal  0.169831 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9269  conjugal transfer protein TrbB  47.3 
 
 		 323 aa  265  5.999999999999999e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5482  conjugal transfer protein TrbB  47.4 
 
 		 321 aa  265  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8334  conjugal transfer protein TrbB  47.65 
 
 		 323 aa  259  5.0000000000000005e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.222514  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4569  conjugal transfer protein TrbB  47.6 
 
 		 329 aa  259  5.0000000000000005e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0047  conjugal transfer ATPase TrbB  46.25 
 
 		 366 aa  256  3e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.435739  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4690  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  44.67 
 
 		 310 aa  251  1e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0688  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  47.81 
 
 		 309 aa  248  8e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2497  type II secretion system protein E  46.73 
 
 		 321 aa  248  1e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0892  type II secretion system protein E  41.37 
 
 		 319 aa  245  6e-64  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1720  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  48.16 
 
 		 329 aa  242  6e-63  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00147948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2265  conjugal transfer ATPase TrbB  44.59 
 
 		 320 aa  239  4e-62  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000000182151  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6502  conjugal transfer ATPase TrbB  45.75 
 
 		 320 aa  238  8e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000848029  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6635  conjugal transfer ATPase TrbB  45.75 
 
 		 320 aa  238  8e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000001277  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1334  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  45.36 
 
 		 322 aa  238  1e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0908976 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1183  type II secretion system protein E  40.61 
 
 		 319 aa  237  2e-61  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2346  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  43.51 
 
 		 325 aa  236  6e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0244  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  44.67 
 
 		 322 aa  235  1.0000000000000001e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1634  P-type conjugative transfer protein TrbB  45.02 
 
 		 322 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0899884  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9661  conjugal transfer protein TrbB  46.36 
 
 		 320 aa  233  5e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4274  conjugal transfer ATPase TrbB  43.14 
 
 		 321 aa  224  1e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  1.39641e-17  normal  0.780952 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1622  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  38.67 
 
 		 346 aa  201  9.999999999999999e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2555  type II secretion system protein E  37.41 
 
 		 464 aa  164  2.0000000000000002e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174933  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1498  type II secretion system protein E  34.22 
 
 		 468 aa  162  6e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2639  type II secretion system protein E  39.53 
 
 		 491 aa  162  1e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2817  type II secretion system protein E  35.15 
 
 		 349 aa  161  2e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.501575 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2366  putative pilus assembly protein  35.67 
 
 		 441 aa  160  4e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.108206  normal  0.102588 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4437  type II secretion system protein E  37.04 
 
 		 349 aa  159  9e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7195  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  35.55 
 
 		 455 aa  158  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.141277  normal  0.285879 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4170  type II secretion system protein E  36.53 
 
 		 343 aa  157  3e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0804  type II secretion system protein E  32.78 
 
 		 473 aa  156  4e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0799  type II secretion system protein E  35.55 
 
 		 452 aa  156  4e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2019  type II secretion system protein E  34.77 
 
 		 442 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.547771  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3656  type II/IV secretion system protein, ATPase domain-containing protein  36.5 
 
 		 438 aa  155  6e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5411  type II secretion system protein E  37.09 
 
 		 440 aa  155  7e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0593921  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6298  type II secretion system protein E  34.88 
 
 		 455 aa  155  9e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1752  Flp pilus assembly ATPase CpaF  31.89 
 
 		 451 aa  155  1e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4617  type II secretion system protein E  34.21 
 
 		 460 aa  154  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.511137 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0670  type II secretion system protein E  33.94 
 
 		 466 aa  154  2e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.811515  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6002  type II secretion system protein E  34.55 
 
 		 455 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.661496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  35.31 
 
 		 444 aa  154  2e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0644  FHA domain-containing protein  34.67 
 
 		 569 aa  154  2e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.61095 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4447  type II secretion system protein E  36.45 
 
 		 438 aa  154  2.9999999999999998e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0655  type II secretion system protein  33.67 
 
 		 479 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.181528 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0748  FHA domain-containing protein  34 
 
 		 572 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>