More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4324 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_4324  ABC transporter related  100 
 
 
368 aa  738    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0269619  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0496  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding protein  53.28 
 
 
359 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0754513  normal  0.366469 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1587  ABC transporter related protein  41.5 
 
 
367 aa  287  2e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3716  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  49.35 
 
 
355 aa  287  2e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.841303  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2580  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.48 
 
 
372 aa  286  4e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1716  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48.39 
 
 
355 aa  283  3.0000000000000004e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198407  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0570  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.35 
 
 
365 aa  283  5.000000000000001e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.124586  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3796  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48.42 
 
 
360 aa  282  8.000000000000001e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.327654  normal  0.344897 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0301  putative spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  48.71 
 
 
355 aa  281  1e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00163011  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6033  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.65 
 
 
349 aa  280  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1196  ABC transporter related  49.2 
 
 
374 aa  281  2e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0565539  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3863  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.56 
 
 
359 aa  279  5e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1284  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.66 
 
 
383 aa  279  6e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0341676  normal  0.481379 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3644  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  49.22 
 
 
376 aa  278  9e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.84314  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003481  spermidine putrescine transport ATP-binding protein PotA  48.94 
 
 
371 aa  278  1e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000145818  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3396  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.15 
 
 
382 aa  278  2e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3930  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.47 
 
 
382 aa  277  2e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.40128  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7452  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.77 
 
 
374 aa  277  2e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.252559 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2912  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  45.43 
 
 
377 aa  277  2e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0327  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  48.39 
 
 
355 aa  276  3e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.100504  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1580  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  47 
 
 
372 aa  276  3e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.203005  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0028  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.59 
 
 
378 aa  277  3e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0855838  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02289  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  49.12 
 
 
426 aa  276  4e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1613  sperimidine/putrescine ABC transporter ATP-binding protein  49.18 
 
 
365 aa  276  4e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0308  ABC transporter related  44.81 
 
 
356 aa  276  5e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1639  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  47.78 
 
 
372 aa  276  5e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1930  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.62 
 
 
380 aa  275  7e-73  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00576419  hitchhiker  0.0000000435694 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2418  sperimidine/putrescine ABC transporter ATP-binding protein  44.11 
 
 
363 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1039  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  48.41 
 
 
377 aa  273  3e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000251214  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2140  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  46.77 
 
 
378 aa  273  4.0000000000000004e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0391853 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4439  ABC transporter related  45.05 
 
 
348 aa  273  4.0000000000000004e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1305  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  49.29 
 
 
378 aa  273  4.0000000000000004e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0889  ABC transporter related  45.33 
 
 
368 aa  272  5.000000000000001e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0784  ABC transporter related  45.15 
 
 
362 aa  273  5.000000000000001e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.294286  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1327  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  49.29 
 
 
378 aa  273  5.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.657677  normal  0.141247 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1958  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  49.29 
 
 
378 aa  273  5.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1343  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  49.29 
 
 
378 aa  273  5.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.416806 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0280  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  44.79 
 
 
384 aa  272  6e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1935  spermidine/putrescine transport ATP-binding protein pota  45.05 
 
 
352 aa  272  6e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.672597  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0023  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48.33 
 
 
447 aa  272  8.000000000000001e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.222017  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1804  ABC-type spermidine/putrescine transport systems ATPase components-like protein  47.22 
 
 
527 aa  271  2e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5898  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48.23 
 
 
371 aa  271  2e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2223  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  44.73 
 
 
349 aa  270  2e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1157  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  53.88 
 
 
372 aa  271  2e-71  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.602801  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6582  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.88 
 
 
360 aa  271  2e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.34057 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2951  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  49.3 
 
 
352 aa  270  2.9999999999999997e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2521  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.15 
 
 
378 aa  269  5e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0234665  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0758  ABC transporter related  45.07 
 
 
365 aa  269  5e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1567  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  46.15 
 
 
378 aa  269  5e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000366035 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0341  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  49.82 
 
 
373 aa  269  5e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2408  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  51.23 
 
 
345 aa  269  5e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.65462  normal  0.048511 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1289  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  46.15 
 
 
378 aa  269  5e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5470  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.88 
 
 
364 aa  269  5e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.867721  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7192  putative ABC transporter ATP-binding protein  48.65 
 
 
361 aa  269  5e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.27359  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2000  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  46.15 
 
 
378 aa  269  5e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.767612 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01124  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  46.15 
 
 
378 aa  269  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.900215  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1246  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  46.15 
 
 
378 aa  269  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.457204  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01132  hypothetical protein  46.15 
 
 
378 aa  269  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.815293  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1304  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  46.15 
 
 
378 aa  269  5.9999999999999995e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2477  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  46.15 
 
 
378 aa  269  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0899476  normal  0.634641 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0916  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  50.52 
 
 
387 aa  269  7e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0838  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  49.84 
 
 
370 aa  267  2e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1009  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.62 
 
 
382 aa  267  2e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.193299 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1537  ABC transporter related  47.99 
 
 
355 aa  267  2.9999999999999995e-70  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0442847  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3947  ABC transporter related  43.9 
 
 
366 aa  266  2.9999999999999995e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0174728  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1881  polyamine transport protein PotG  42.82 
 
 
381 aa  266  5e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1061  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  46.28 
 
 
382 aa  266  5e-70  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000354755  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1896  ABC transporter related  45.28 
 
 
359 aa  265  7e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0892333  normal  0.42443 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1478  ABC transporter, ATP-binding protein  52.72 
 
 
343 aa  265  7e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00879269  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2606  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.77 
 
 
388 aa  265  8.999999999999999e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.115233  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6149  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.75 
 
 
360 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6838  putrescine ABC transporter ATP-binding protein  48.23 
 
 
393 aa  265  1e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.840617  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2303  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  46.5 
 
 
381 aa  265  1e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0982  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  48.42 
 
 
363 aa  265  1e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3229  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.13 
 
 
408 aa  265  1e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2567  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  47 
 
 
388 aa  265  1e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.571516  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17640  polyamine transport protein PotA  45.54 
 
 
363 aa  265  1e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2612  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47 
 
 
388 aa  265  1e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3637  ABC transporter related  44.15 
 
 
347 aa  264  2e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.671698  normal  0.50975 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1592  ABC transporter related  48.39 
 
 
356 aa  264  2e-69  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.911818  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1586  ABC transporter related  46.98 
 
 
355 aa  263  2e-69  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1034  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  42.66 
 
 
359 aa  264  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.330861  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5048  ABC transporter related  49.16 
 
 
353 aa  264  2e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1836  ABC transporter, atp_binding subunit  43.1 
 
 
364 aa  263  3e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.382756 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3396  ABC opine/polyamine transporter, ATPase subunit  44.2 
 
 
372 aa  263  3e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04840  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  48.47 
 
 
363 aa  263  3e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4728  ABC transporter related  50.52 
 
 
360 aa  263  3e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.871256  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3635  ABC transporter related  50.52 
 
 
360 aa  263  3e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.340284 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3954  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  48.08 
 
 
381 aa  263  4e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.320364  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2023  ABC transporter related  45.21 
 
 
366 aa  263  4.999999999999999e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.264561 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2805  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.71 
 
 
381 aa  263  4.999999999999999e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.593662 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1148  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  44.41 
 
 
364 aa  262  6e-69  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0750  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.37 
 
 
352 aa  262  6e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000146357  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3041  ABC transporter related  44.2 
 
 
372 aa  262  6e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.383047  normal  0.901224 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0449  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.86 
 
 
366 aa  262  6e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6630  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.6 
 
 
363 aa  262  8.999999999999999e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00510446  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1534  polyamine transport protein PotA  45.22 
 
 
359 aa  261  1e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5428  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.06 
 
 
368 aa  261  1e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.48813  normal  0.102518 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0335  ABC transporter related  50.41 
 
 
329 aa  261  1e-68  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0307284  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0981  ABC transporter related  46.89 
 
 
353 aa  261  1e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>