More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3874 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_3874  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 510 aa  1031    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0918503 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0804  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  48.51 
 
 		 516 aa  478  1e-133  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.48042 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2927  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  48.02 
 
 		 509 aa  477  1e-133  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.686689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3597  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  48.77 
 
 		 543 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1871  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  47.98 
 
 		 524 aa  464  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.394568  normal  0.852293 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5528  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  46.64 
 
 		 509 aa  461  9.999999999999999e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3839  AMP-dependent synthetase and ligase  48.69 
 
 		 508 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1967  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  45.05 
 
 		 514 aa  450  1e-125  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.595404  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3215  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  47.9 
 
 		 500 aa  445  1.0000000000000001e-124  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3057  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  47.8 
 
 		 499 aa  444  1e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.847241  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0423  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  44.62 
 
 		 509 aa  427  1e-118  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4093  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  46.28 
 
 		 497 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0327517  normal  0.151728 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3166  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  45.51 
 
 		 501 aa  407  1.0000000000000001e-112  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.130976  hitchhiker  0.0000354644 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3980  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  46.28 
 
 		 497 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.310048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0282  AMP-dependent synthetase and ligase  46.57 
 
 		 492 aa  399  9.999999999999999e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.376129  normal  0.234171 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6480  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  43.35 
 
 		 513 aa  396  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1368  AMP-dependent synthetase and ligase  39.96 
 
 		 515 aa  365  1e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.663143  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2714  AMP-dependent synthetase and ligase  41.31 
 
 		 546 aa  345  8e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0166  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40 
 
 		 506 aa  344  2e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0177  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.8 
 
 		 506 aa  342  1e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.761031  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0186  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.8 
 
 		 506 aa  342  1e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0230763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2695  AMP-dependent synthetase and ligase  42 
 
 		 516 aa  341  2e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0218  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.38 
 
 		 516 aa  339  5.9999999999999996e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0925378 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1502  acyl-CoA synthetase  38.73 
 
 		 515 aa  339  8e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1525  acyl-CoA synthetase  38.73 
 
 		 515 aa  339  8e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1502  acyl-CoA synthetase  38.65 
 
 		 515 aa  337  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0449  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.16 
 
 		 516 aa  336  7e-91  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.93416 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2641  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.77 
 
 		 516 aa  335  1e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.517138  normal  0.152736 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01193  acyl-CoA synthase  38.32 
 
 		 544 aa  333  5e-90  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0176178  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0912  AMP-dependent synthetase and ligase  39.38 
 
 		 515 aa  332  1e-89  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.881726 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10216  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.86 
 
 		 537 aa  330  3e-89  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2838  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.22 
 
 		 515 aa  330  5.0000000000000004e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.153198 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4161  acyl-CoA synthetase  38.34 
 
 		 517 aa  328  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7124  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.45 
 
 		 512 aa  318  2e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.100628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.8 
 
 		 513 aa  316  7e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1681  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.76 
 
 		 514 aa  316  8e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6823  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase I  38.4 
 
 		 492 aa  315  9.999999999999999e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1465  acyl-CoA synthetase  39.92 
 
 		 487 aa  314  1.9999999999999998e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.845905  normal  0.967698 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1902  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.02 
 
 		 518 aa  315  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.889055  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1905  AMP-dependent synthetase and ligase  37.24 
 
 		 512 aa  313  4.999999999999999e-84  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.97218  normal  0.26016 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3612  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.63 
 
 		 514 aa  311  2e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2707  AMP-dependent synthetase and ligase  38.11 
 
 		 519 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0621527  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3605  acyl-CoA synthetase  37.23 
 
 		 514 aa  310  4e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.133038  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3161  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.06 
 
 		 516 aa  308  1.0000000000000001e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1763  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.27 
 
 		 512 aa  308  2.0000000000000002e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0681  acyl-CoA synthetase  36.42 
 
 		 520 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.457647 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4700  acyl-CoA synthetase  36.19 
 
 		 516 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2397  AMP-dependent synthetase and ligase  37.43 
 
 		 516 aa  305  1.0000000000000001e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.264456  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5310  acyl-CoA synthetase  36.12 
 
 		 516 aa  305  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4410  acyl-CoA synthetase  36 
 
 		 516 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.648302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5158  putative o-succinylbenzoate-CoA ligase  36.77 
 
 		 527 aa  302  9e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.20469 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0848  AMP-dependent synthetase and ligase  34.03 
 
 		 517 aa  298  1e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3266  AMP-dependent synthetase and ligase  37.33 
 
 		 511 aa  298  2e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1481  AMP-dependent synthetase and ligase  37.45 
 
 		 525 aa  296  7e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0104  AMP-dependent synthetase and ligase  39.02 
 
 		 524 aa  295  1e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.256556 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6739  AMP-dependent synthetase and ligase  36.79 
 
 		 532 aa  293  7e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0799452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3089  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.11 
 
 		 522 aa  291  2e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.196285  normal  0.363977 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0015  acyl-CoA synthetase  37.55 
 
 		 511 aa  291  2e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.323665 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3984  AMP-dependent synthetase and ligase  35.52 
 
 		 521 aa  291  2e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.446284  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1124  AMP-dependent synthetase and ligase  37.45 
 
 		 509 aa  291  2e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.719867  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2787  AMP-dependent synthetase and ligase  38.96 
 
 		 518 aa  289  9e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.296837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3399  AMP-dependent synthetase and ligase  38.29 
 
 		 522 aa  288  1e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0221  AMP-dependent synthetase and ligase  37.72 
 
 		 510 aa  288  2e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1347  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.85 
 
 		 512 aa  288  2e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5032  acyl-CoA synthetase  38.7 
 
 		 501 aa  288  2e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.672582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2738  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.5 
 
 		 522 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4649  acyl-CoA synthetase  38.31 
 
 		 501 aa  284  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4737  acyl-CoA synthetase  38.31 
 
 		 501 aa  284  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.987006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0121  AMP-dependent synthetase and ligase  38.42 
 
 		 522 aa  283  5.000000000000001e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0696  AMP-dependent synthetase and ligase  38.43 
 
 		 521 aa  282  1e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3855  AMP-dependent synthetase and ligase  37.18 
 
 		 523 aa  277  4e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.713722 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0570  AMP-dependent synthetase and ligase  34.6 
 
 		 525 aa  267  2.9999999999999995e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.356446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2936  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.67 
 
 		 536 aa  261  2e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.098527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6056  AMP-dependent synthetase and ligase  35.02 
 
 		 515 aa  258  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3694  AMP-dependent synthetase and ligase  34.37 
 
 		 532 aa  256  7e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.178139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13440  acyl-CoA synthetase  35.7 
 
 		 539 aa  255  1.0000000000000001e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3600  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.08 
 
 		 525 aa  254  3e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.887287  normal  0.975846 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4225  acyl-CoA synthetase  34.21 
 
 		 530 aa  253  5.000000000000001e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3758  acyl-CoA synthetase  34.13 
 
 		 548 aa  252  1e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.102214  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3831  acyl-CoA synthetase  34.13 
 
 		 548 aa  252  1e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.948087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3770  acyl-CoA synthetase  33.93 
 
 		 548 aa  251  3e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1868  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.08 
 
 		 525 aa  249  1e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.205754 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4678  AMP-dependent synthetase and ligase  36.21 
 
 		 539 aa  247  3e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3975  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.86 
 
 		 530 aa  247  4e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.251646  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5140  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.2 
 
 		 525 aa  247  4.9999999999999997e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.24744  normal  0.25513 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3158  AMP-dependent synthetase and ligase  33.73 
 
 		 515 aa  246  8e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2924  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.25 
 
 		 526 aa  245  9.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.42655 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1666  AMP-dependent synthetase and ligase  32.23 
 
 		 518 aa  245  9.999999999999999e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.144653  normal  0.373713 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4826  AMP-dependent synthetase and ligase  36.26 
 
 		 520 aa  244  3e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0178748  normal  0.551416 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3247  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 		 497 aa  243  5e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.640388 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10274  acyl-CoA synthetase  32.99 
 
 		 560 aa  243  5e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0406036 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1964  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.79 
 
 		 525 aa  243  7e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.132088  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0223  AMP-dependent synthetase and ligase  34.27 
 
 		 491 aa  242  1e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.803967  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0233  AMP-dependent synthetase and ligase  34.27 
 
 		 491 aa  242  1e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.318189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0213  AMP-dependent synthetase and ligase  34.27 
 
 		 491 aa  241  2e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.65945 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2427  acyl-CoA synthetase  33.12 
 
 		 535 aa  241  2e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.206901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  33.94 
 
 		 520 aa  241  2.9999999999999997e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3514  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.53 
 
 		 525 aa  240  5e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.270509  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11456  acyl-CoA synthetase  34.56 
 
 		 535 aa  240  5e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0248769 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1034  AMP-dependent synthetase and ligase  32.52 
 
 		 495 aa  239  9e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>