104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0031 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_0031  hypothetical protein  100 
 
 		 103 aa  197  3e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.841066  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2529  type VI secretion protein  68.42 
 
 		 162 aa  134  4e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1196  hypothetical protein  65.66 
 
 		 166 aa  133  7.000000000000001e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2807  type VI secretion protein, VC_A0107 family  63.16 
 
 		 167 aa  120  5e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3733  hypothetical protein  62.77 
 
 		 165 aa  119  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3255  type VI secretion protein, VC_A0107 family  60 
 
 		 167 aa  117  6e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1070  type VI secretion protein, VC_A0107 family  58.95 
 
 		 167 aa  115  3e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.533436  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0313  hypothetical protein  58.33 
 
 		 165 aa  113  8.999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3905  hypothetical protein  58.33 
 
 		 165 aa  113  8.999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0386  type VI secretion protein  58.33 
 
 		 165 aa  113  8.999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0045  hypothetical protein  61.62 
 
 		 169 aa  112  1.0000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1124  putative type VI secretion protein VasQ  54.55 
 
 		 164 aa  113  1.0000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0239  hypothetical protein  61.29 
 
 		 166 aa  110  5e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0241  hypothetical protein  61.29 
 
 		 166 aa  110  5e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0247  hypothetical protein  59.14 
 
 		 166 aa  108  3e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.788284 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05863  hypothetical protein  53.26 
 
 		 168 aa  107  8.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000441  uncharacterized protein ImpB  52.17 
 
 		 168 aa  106  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3224  type VI secretion protein  53.68 
 
 		 167 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2624  hypothetical protein  52.63 
 
 		 167 aa  104  4e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.799752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2127  hypothetical protein  52.63 
 
 		 167 aa  104  4e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4074  hypothetical protein  52.63 
 
 		 167 aa  103  8e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.0000649214  unclonable  0.000000799186 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1111  type VI secretion protein, family  56.84 
 
 		 167 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1231  type VI secretion protein  56.84 
 
 		 167 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.137782 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5433  hypothetical protein  55.43 
 
 		 168 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0278  hypothetical protein  48.45 
 
 		 162 aa  96.3  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0090  hypothetical protein  53.85 
 
 		 168 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3172  hypothetical protein  48.94 
 
 		 161 aa  95.1  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5595  hypothetical protein  54.95 
 
 		 167 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43040  hypothetical protein  53.85 
 
 		 168 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.138878 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0870  hypothetical protein  50 
 
 		 164 aa  92.8  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2123  hypothetical protein  50 
 
 		 164 aa  92.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2025  hypothetical protein  50 
 
 		 164 aa  92.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.393017  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3615  hypothetical protein  52.75 
 
 		 168 aa  92  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.668584  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0744  hypothetical protein  48.96 
 
 		 164 aa  90.1  9e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0196457  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0533  hypothetical protein  48.96 
 
 		 164 aa  90.1  9e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.56183  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0604  hypothetical protein  48.96 
 
 		 164 aa  90.1  9e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0715  hypothetical protein  48.96 
 
 		 164 aa  90.1  9e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.750715  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1672  hypothetical protein  48.96 
 
 		 164 aa  90.1  9e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.873681  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1181  type VI secretion protein  47.83 
 
 		 161 aa  89  2e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2543  hypothetical protein  47.37 
 
 		 166 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0150995  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0011  hypothetical protein  43.43 
 
 		 168 aa  84  7e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5266  hypothetical protein  40.21 
 
 		 168 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0625  hypothetical protein  42.86 
 
 		 171 aa  57.4  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0562318 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3649  type VI secretion protein  40.91 
 
 		 170 aa  57  0.00000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.629046 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2268  hypothetical protein  37.21 
 
 		 177 aa  53.9  0.0000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.923124  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2814  hypothetical protein  32.88 
 
 		 175 aa  51.2  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0777  hypothetical protein  36.25 
 
 		 166 aa  51.2  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3261  type VI secretion protein  38.96 
 
 		 167 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.30542  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01965  hypothetical protein  35.23 
 
 		 170 aa  50.4  0.000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.380992  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000020  uncharacterized protein ImpB  37.35 
 
 		 176 aa  50.4  0.000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.100303  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2916  hypothetical protein  34.83 
 
 		 165 aa  50.4  0.000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.318874 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0798  type VI secretion protein  35 
 
 		 166 aa  50.4  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.153288  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2600  type VI secretion protein  35 
 
 		 166 aa  50.4  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02045  EvpA  41.56 
 
 		 166 aa  49.7  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.792135  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3100  hypothetical protein  37.21 
 
 		 191 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.310088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2177  hypothetical protein  36.78 
 
 		 170 aa  49.3  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000024001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2622  hypothetical protein  37.21 
 
 		 179 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0726  hypothetical protein  35 
 
 		 166 aa  49.3  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2511  hypothetical protein  35 
 
 		 166 aa  49.3  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0176  hypothetical protein  35 
 
 		 166 aa  49.3  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.026937  hitchhiker  0.000000135076 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2978  hypothetical protein  35 
 
 		 166 aa  49.3  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000439438 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1783  hypothetical protein  37.5 
 
 		 165 aa  48.5  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.309687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2764  type VI secretion protein  37.21 
 
 		 179 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0599499  normal  0.364663 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2360  type VI secretion protein, VC_A0107 family  51.92 
 
 		 183 aa  48.5  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.109575 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2510  type VI secretion protein  36.05 
 
 		 177 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.203105  normal  0.816356 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2369  hypothetical protein  36.36 
 
 		 166 aa  47.8  0.00006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2443  hypothetical protein  34.57 
 
 		 180 aa  47.4  0.00007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.485859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4953  hypothetical protein  36.05 
 
 		 177 aa  47.4  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1171  putative type VI secretion protein VasQ-1  34.48 
 
 		 169 aa  47.4  0.00008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.242549  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2964  EvpA  36.25 
 
 		 172 aa  46.2  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4913  type VI secretion protein, VC_A0107 family  31.82 
 
 		 182 aa  46.2  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000468167  normal  0.0151327 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3477  hypothetical protein  35.44 
 
 		 176 aa  45.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.772504  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3559  hypothetical protein  36.25 
 
 		 171 aa  45.4  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00132458  normal  0.648001 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2639  hypothetical protein  36.25 
 
 		 171 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00139416  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0467  hypothetical protein  36.25 
 
 		 171 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00157357  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3121  hypothetical protein  35.44 
 
 		 176 aa  45.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.241786  normal  0.0428701 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0445  type VI secretion protein  36.25 
 
 		 171 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.493585  normal  0.482575 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1733  hypothetical protein  42.19 
 
 		 182 aa  44.7  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.541869  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0381  hypothetical protein  35 
 
 		 171 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00433333  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3436  hypothetical protein  37.7 
 
 		 186 aa  44.3  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00868528  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0763  hypothetical protein  37.7 
 
 		 186 aa  44.3  0.0006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.184659  normal  0.121475 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3565  type VI secretion protein  37.7 
 
 		 186 aa  44.3  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0402  type VI secretion protein  35 
 
 		 171 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.0000194603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3645  EvpA  31.82 
 
 		 172 aa  43.9  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0328511  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3635  hypothetical protein  31.82 
 
 		 172 aa  43.9  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0300878  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3660  hypothetical protein  31.82 
 
 		 172 aa  43.9  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.471211  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3123  hypothetical protein  33.33 
 
 		 166 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.489353  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2930  type VI secretion protein  36.25 
 
 		 171 aa  43.9  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00592536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1901  hypothetical protein  36.49 
 
 		 183 aa  43.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3025  hypothetical protein  53.19 
 
 		 167 aa  43.5  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0474697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3073  hypothetical protein  36.14 
 
 		 168 aa  43.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.747125  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00266  hypothetical protein  39.34 
 
 		 150 aa  43.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6051  hypothetical protein  32.61 
 
 		 171 aa  43.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3041  type VI secretion protein, VC_A0107 family  35.53 
 
 		 178 aa  42.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0161  hypothetical protein  27 
 
 		 200 aa  41.6  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.535252  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1683  type VI secretion protein, VC_A0107 family  37.1 
 
 		 179 aa  41.2  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0225402 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1207  type VI secretion protein, VC_A0107 family  42.25 
 
 		 176 aa  41.6  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3043  type VI secretion protein, VC_A0107 family  36.99 
 
 		 176 aa  41.2  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0438  hypothetical protein  35.14 
 
 		 141 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.874563  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2074  hypothetical protein  35.14 
 
 		 182 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.385689  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>