More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0023 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_0023  geranylgeranyl reductase  100 
 
 		 398 aa  809    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0428  monooxygenase, FAD-binding  28.48 
 
 		 415 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00208516  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  28.79 
 
 		 424 aa  111  3e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5104  hypothetical protein  28.61 
 
 		 415 aa  110  5e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  28.4 
 
 		 425 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004059  FAD-binding protein inferred for ABFAE pathway  27.59 
 
 		 414 aa  108  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.371428  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  28.19 
 
 		 418 aa  108  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0369  geranylgeranyl reductase  26.83 
 
 		 408 aa  107  4e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0683691  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2696  geranylgeranyl reductase, plantal and  28.57 
 
 		 435 aa  107  5e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5052  geranylgeranyl reductase  27.33 
 
 		 434 aa  106  6e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3185  monooxygenase FAD-binding protein  26.02 
 
 		 375 aa  105  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.388588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4197  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:tryptophan halogenase  25.98 
 
 		 444 aa  103  4e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.107815 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03738  hydroxylase  26.44 
 
 		 461 aa  102  9e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4559  geranylgeranyl reductase  27.53 
 
 		 419 aa  102  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  28.53 
 
 		 423 aa  101  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1308  geranylgeranyl reductase  26.89 
 
 		 406 aa  100  4e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0428  FAD dependent oxidoreductase  27.59 
 
 		 410 aa  99.8  8e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.25324  normal  0.196339 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0578  geranylgeranyl reductase  26.99 
 
 		 395 aa  99.8  8e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3422  geranylgeranyl reductase  28.19 
 
 		 407 aa  97.8  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.351163 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6683  geranylgeranyl reductase  27.63 
 
 		 426 aa  97.4  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00871957  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1250  geranylgeranyl reductase  27.24 
 
 		 390 aa  97.1  5e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375977  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3957  tryptophan halogenase  23.62 
 
 		 444 aa  96.3  8e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1273  geranylgeranyl reductase  25.89 
 
 		 457 aa  94.7  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  28.48 
 
 		 376 aa  94.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3389  monooxygenase FAD-binding  28.16 
 
 		 392 aa  94  4e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2108  FAD dependent oxidoreductase  26.87 
 
 		 413 aa  93.6  5e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.478337  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1494  oxidoreductase, FAD-binding, putative  24.85 
 
 		 455 aa  92.8  9e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2031  tryptophan halogenase  26.13 
 
 		 413 aa  92  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0818162  normal  0.0655371 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1375  geranylgeranyl reductase  25.59 
 
 		 390 aa  92  2e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.545102  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4066  geranylgeranyl reductase  27.22 
 
 		 423 aa  91.7  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.449431  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0537  geranylgeranyl reductase  26.75 
 
 		 434 aa  91.7  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1407  geranylgeranyl reductase  26.54 
 
 		 398 aa  92  2e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.426262  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3702  monooxygenase FAD-binding  26.81 
 
 		 419 aa  91.7  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.378943  normal  0.20919 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4464  geranylgeranyl reductase  26.91 
 
 		 423 aa  91.3  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.152921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4779  monooxygenase FAD-binding  26.81 
 
 		 419 aa  91.7  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0718  geranylgeranyl reductase  27.41 
 
 		 387 aa  92  2e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1332  oxidoreductase, FAD-binding, putative  27.25 
 
 		 449 aa  91.3  3e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.401661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0808  geranylgeranyl reductase  32.08 
 
 		 378 aa  90.5  4e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000424296 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2934  monooxygenase, FAD-binding  27.71 
 
 		 402 aa  90.1  7e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0750661 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2763  oxidoreductase, FAD-binding, putative  25 
 
 		 445 aa  89.7  8e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1602  hypothetical protein  26.82 
 
 		 387 aa  89.7  9e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1307  geranylgeranyl reductase  25.97 
 
 		 391 aa  89  1e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.398981  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3109  monooxygenase FAD-binding  28.24 
 
 		 444 aa  88.6  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0931  tryptophan halogenase  24.35 
 
 		 439 aa  88.6  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0788  non-heme halogenase, putative  24.35 
 
 		 439 aa  88.6  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.702938  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0522  geranylgeranyl reductase  26.09 
 
 		 390 aa  87.8  3e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0266  geranylgeranyl reductase  27.79 
 
 		 445 aa  87.8  3e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.224418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1150  monooxygenase FAD-binding protein  25.73 
 
 		 397 aa  87.4  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.862466  normal  0.995827 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0468  geranylgeranyl reductase  26.67 
 
 		 431 aa  87.4  4e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0708  monooxygenase FAD-binding  27.27 
 
 		 416 aa  86.7  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1462  geranylgeranyl reductase  27.38 
 
 		 384 aa  86.7  6e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.36043  normal  0.122675 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1644  FAD dependent oxidoreductase  26.09 
 
 		 378 aa  86.3  8e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00782092 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0436  FAD dependent oxidoreductase  25.23 
 
 		 429 aa  86.3  8e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3477  dehydrogenase (flavoprotein)  25.56 
 
 		 356 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00015718  normal  0.0486362 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1615  dehydrogenase  27.22 
 
 		 405 aa  85.9  0.000000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3230  geranylgeranyl reductase  25.51 
 
 		 431 aa  85.5  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  28.28 
 
 		 413 aa  84.7  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03150  geranylgeranyl reductase family protein  32.56 
 
 		 424 aa  84.7  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.992088  normal  0.897834 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3184  tryptophan halogenase  27.33 
 
 		 441 aa  84.3  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153347  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  27.57 
 
 		 375 aa  84.7  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0342  tryptophan halogenase  25.96 
 
 		 422 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2237  tryptophan halogenase  24.47 
 
 		 444 aa  84.3  0.000000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1161  geranylgeranyl reductase  30.52 
 
 		 429 aa  84  0.000000000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3528  geranylgeranyl reductase  29.67 
 
 		 394 aa  84  0.000000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.673829 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1512  FAD dependent oxidoreductase  25.93 
 
 		 365 aa  84  0.000000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.193117  normal  0.45553 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1386  geranylgeranyl reductase  26.09 
 
 		 390 aa  84  0.000000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2269  geranylgeranyl reductase  29.45 
 
 		 398 aa  83.2  0.000000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3521  tryptophan halogenase  25.22 
 
 		 424 aa  82.8  0.000000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.956189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1066  geranylgeranyl reductase  26.1 
 
 		 382 aa  82.8  0.000000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000111291  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3616  tryptophan halogenase  25.77 
 
 		 415 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.190224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1062  geranylgeranyl reductase  29.19 
 
 		 385 aa  82.4  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3389  FAD-binding protein  24.32 
 
 		 424 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0330  monooxygenase FAD-binding  24.26 
 
 		 429 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2055  geranylgeranyl reductase  24.33 
 
 		 393 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3883  monooxygenase FAD-binding  26.36 
 
 		 409 aa  81.3  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.964641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4291  geranylgeranyl reductase  23.54 
 
 		 393 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.464527 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  26.56 
 
 		 384 aa  80.9  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0340  monooxygenase, FAD-binding  25.94 
 
 		 435 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1134  geranylgeranyl reductase  25.65 
 
 		 389 aa  81.3  0.00000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.719323  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4378  FAD-binding protein  24.92 
 
 		 436 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4091  tryptophan halogenase  25.46 
 
 		 415 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3806  FAD dependent oxidoreductase  23.1 
 
 		 375 aa  80.9  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.749975  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10918  putative oxidoreductase  23.29 
 
 		 374 aa  80.5  0.00000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.183929  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0973  geranylgeranyl reductase  26.07 
 
 		 430 aa  80.5  0.00000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0340  monooxygenase FAD-binding  24.26 
 
 		 429 aa  80.5  0.00000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.131128 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3686  monooxygenase, FAD-binding protein  26.25 
 
 		 435 aa  80.5  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1193  geranylgeranyl reductase  28.83 
 
 		 362 aa  79.7  0.00000000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0917874  hitchhiker  0.0000705466 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0337  monooxygenase FAD-binding  24.26 
 
 		 429 aa  79.7  0.00000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0648  geranylgeranyl reductase  26.76 
 
 		 430 aa  79.7  0.00000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626765  normal  0.0232794 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2717  geranylgeranyl reductase  24.16 
 
 		 443 aa  79.3  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.593407 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0530  tryptophan halogenase  25.91 
 
 		 491 aa  79.3  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.680136  normal  0.208224 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0332  monooxygenase FAD-binding  24.26 
 
 		 429 aa  79  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4161  putative tryptophan halogenase  25.98 
 
 		 470 aa  79.3  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.326464 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0331  monooxygenase, FAD-binding  25.62 
 
 		 435 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4606  tryptophan halogenase  25.15 
 
 		 420 aa  79  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.577017 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4387  tryptophan halogenase  25.15 
 
 		 409 aa  78.2  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000478087  normal  0.336171 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2824  geranylgeranyl reductase  28.39 
 
 		 379 aa  78.2  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1825  FAD dependent oxidoreductase  25.5 
 
 		 455 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.133963  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00759  putative oxidoreductase protein  27.44 
 
 		 419 aa  77.8  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.134999  normal  0.0681702 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3777  geranylgeranyl reductase  24.34 
 
 		 368 aa  78.2  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.218559 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>