More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1362 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_1362  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 479 aa  968    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1324  FAD dependent oxidoreductase  98.54 
 
 		 479 aa  961    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00260762  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0697  FAD dependent oxidoreductase  63.9 
 
 		 480 aa  620  1e-176  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0620  FAD dependent oxidoreductase  59.41 
 
 		 478 aa  572  1.0000000000000001e-162  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0283  FAD dependent oxidoreductase  49.89 
 
 		 475 aa  459  9.999999999999999e-129  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0930  FAD dependent oxidoreductase  46.93 
 
 		 479 aa  415  1e-114  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0776869  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1021  FAD dependent oxidoreductase  45.32 
 
 		 500 aa  401  9.999999999999999e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1552  FAD dependent oxidoreductase  43.22 
 
 		 494 aa  394  1e-108  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.374477  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1532  FAD dependent oxidoreductase  44.76 
 
 		 493 aa  391  1e-107  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1628  FAD dependent oxidoreductase  42.56 
 
 		 478 aa  389  1e-107  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.855011  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2643  oxidoreductase, FAD-dependent  43.27 
 
 		 489 aa  387  1e-106  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.292986  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0021  FAD dependent oxidoreductase  45.04 
 
 		 484 aa  387  1e-106  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0147629  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2875  FAD-dependent oxidoreductase  44.23 
 
 		 476 aa  385  1e-106  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0411  oxidoreductase, FAD-binding  43.76 
 
 		 473 aa  382  1e-105  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0546468  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2558  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  44.03 
 
 		 476 aa  382  1e-105  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0320  FAD dependent oxidoreductase  42.15 
 
 		 485 aa  369  1e-101  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08100  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  40.95 
 
 		 503 aa  363  4e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.242125  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1244  FAD dependent oxidoreductase  40.59 
 
 		 479 aa  358  9.999999999999999e-98  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1490  FAD dependent oxidoreductase  41.84 
 
 		 473 aa  358  9.999999999999999e-98  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0683  FAD dependent oxidoreductase  39.87 
 
 		 496 aa  335  7.999999999999999e-91  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.302039  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06270  predicted dehydrogenase  37.7 
 
 		 511 aa  320  3e-86  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0293  FAD dependent oxidoreductase  38.75 
 
 		 491 aa  317  4e-85  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000524606  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1237  FAD dependent oxidoreductase  37.93 
 
 		 965 aa  312  1e-83  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.18893  normal  0.393596 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0134  oxidoreductase, FAD-dependent  34.22 
 
 		 508 aa  280  6e-74  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00168414  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7847  oxidoreductase, FAD-binding protein  37.34 
 
 		 472 aa  264  3e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3394  FAD dependent oxidoreductase  32.85 
 
 		 576 aa  261  3e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.513559  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1678  FAD dependent oxidoreductase  34.07 
 
 		 464 aa  252  1e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2649  FAD dependent oxidoreductase  32.82 
 
 		 465 aa  235  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3534  FAD dependent oxidoreductase  32.47 
 
 		 473 aa  235  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0951864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3607  FAD dependent oxidoreductase  32.47 
 
 		 473 aa  235  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3539  FAD dependent oxidoreductase  32.47 
 
 		 470 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.229098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3930  FAD dependent oxidoreductase  32.67 
 
 		 461 aa  233  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.130124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0012  FAD-dependent oxidoreductase  30.13 
 
 		 464 aa  224  4e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0012  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  30.27 
 
 		 464 aa  223  8e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1375  FAD dependent oxidoreductase  32.72 
 
 		 461 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.575431  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45170  putative oxidoreductase  31.43 
 
 		 396 aa  199  7.999999999999999e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.381756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0219  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, putative  33.6 
 
 		 387 aa  197  3e-49  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2696  FAD dependent oxidoreductase  30.09 
 
 		 465 aa  193  6e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0111401  hitchhiker  0.00176531 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_38067  predicted protein  46.33 
 
 		 698 aa  156  1e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00714206  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0217  oxidoreductase, FAD-binding family protein  30.98 
 
 		 373 aa  150  5e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.655071  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3297  oxidoreductase, FAD-binding family protein  30.41 
 
 		 373 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0434  oxidoreductase, FAD-binding family protein  30.33 
 
 		 373 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0953783  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2964  oxidoreductase, FAD-binding family protein  30.41 
 
 		 373 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2124  oxidoreductase, FAD-binding family protein  30.41 
 
 		 373 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.646813  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0239  FAD-dependent oxidoreductase  30.41 
 
 		 373 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.202342  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0251  FAD-dependent oxidoreductase  30.33 
 
 		 373 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.627616  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3382  oxidoreductase, FAD-binding family protein  30.41 
 
 		 373 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0106  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  29.97 
 
 		 368 aa  140  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2706  FAD dependent oxidoreductase  27.87 
 
 		 364 aa  138  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0337061  normal  0.0586265 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3780  FAD dependent oxidoreductase  28.17 
 
 		 403 aa  136  7.000000000000001e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0708  FAD dependent oxidoreductase  30.6 
 
 		 362 aa  135  1.9999999999999998e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.440314  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2220  hydroxyglutarate oxidase  28.67 
 
 		 427 aa  134  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.531505  normal  0.0413594 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3043  FAD dependent oxidoreductase  29.46 
 
 		 369 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0034  hydroxyglutarate oxidase  29.29 
 
 		 408 aa  133  6.999999999999999e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1888  hydroxyglutarate oxidase  27.63 
 
 		 427 aa  132  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.452346 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2365  FAD dependent oxidoreductase  27.95 
 
 		 409 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000683607  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2959  FAD dependent oxidoreductase  29.12 
 
 		 369 aa  131  3e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.4255 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4334  putative FAD dependent oxidoreductase  28.61 
 
 		 368 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3093  FAD dependent oxidoreductase  29.12 
 
 		 369 aa  130  6e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3277  FAD dependent oxidoreductase  29.19 
 
 		 396 aa  129  9.000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.289099  normal  0.220627 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6395  FAD dependent oxidoreductase  28.88 
 
 		 366 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.704477 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3067  FAD dependent oxidoreductase  29.04 
 
 		 369 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.41507 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2614  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  30.96 
 
 		 396 aa  129  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2434  FAD dependent oxidoreductase  29.04 
 
 		 369 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0628  putative FAD dependent oxidoreductase  28.23 
 
 		 374 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.323528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3048  FAD dependent oxidoreductase  29.04 
 
 		 369 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0387  FAD dependent oxidoreductase  28.53 
 
 		 368 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2799  FAD dependent oxidoreductase  30.19 
 
 		 380 aa  128  3e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.444037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1640  FAD dependent oxidoreductase  28.07 
 
 		 366 aa  128  3e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21030  hydroxyglutarate oxidase  28.39 
 
 		 398 aa  128  3e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00231927  normal  0.19129 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2590  FAD dependent oxidoreductase  26.7 
 
 		 400 aa  125  1e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0530  FAD dependent oxidoreductase  26.6 
 
 		 375 aa  124  3e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_41947  predicted protein  26.36 
 
 		 383 aa  124  4e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.856013  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2152  FAD dependent oxidoreductase  26.72 
 
 		 367 aa  123  6e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.841388  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1107  hydroxyglutarate oxidase  27.64 
 
 		 404 aa  123  7e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1081  FAD dependent oxidoreductase  28.73 
 
 		 367 aa  123  7e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0868948  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2833  FAD dependent oxidoreductase  28.42 
 
 		 364 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.774679  normal  0.0535368 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1916  FAD dependent oxidoreductase  28.46 
 
 		 371 aa  122  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0872909 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_50137  predicted protein  24.51 
 
 		 437 aa  121  3e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.563801  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3531  FAD dependent oxidoreductase  27.79 
 
 		 406 aa  120  6e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.36327  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1140  FAD dependent oxidoreductase  28.84 
 
 		 368 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0603157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1090  FAD dependent oxidoreductase  26.47 
 
 		 378 aa  118  3e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.151516  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1021  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  25 
 
 		 552 aa  118  3e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4590  FAD dependent oxidoreductase  26.68 
 
 		 394 aa  117  6e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2451  FAD dependent oxidoreductase  26.92 
 
 		 367 aa  117  6e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2610  FAD dependent oxidoreductase  27.7 
 
 		 364 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270535  normal  0.198369 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2156  FAD dependent oxidoreductase  27.49 
 
 		 399 aa  116  7.999999999999999e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0724716  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3133  FAD dependent oxidoreductase  27.82 
 
 		 407 aa  116  1.0000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.270891  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0430  FAD dependent oxidoreductase  27.76 
 
 		 370 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2624  FAD dependent oxidoreductase  30.03 
 
 		 442 aa  115  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0036  hydroxyglutarate oxidase  31.14 
 
 		 397 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.925555  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3777  FAD dependent oxidoreductase  30.89 
 
 		 371 aa  114  3e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.986155 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1646  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  27.7 
 
 		 371 aa  114  4.0000000000000004e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.515375  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4036  hydroxyglutarate oxidase  26.43 
 
 		 403 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.534482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14181  dehydrogenase  26.49 
 
 		 400 aa  114  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1005  FAD dependent oxidoreductase  25.74 
 
 		 368 aa  114  5e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.179288 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0823  FAD dependent oxidoreductase  25.26 
 
 		 371 aa  114  5e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6841  NAD binding site FAD dependent oxidoreductase  27.91 
 
 		 367 aa  113  6e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1660  dehydrogenase  25.32 
 
 		 625 aa  113  8.000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1941  FAD dependent oxidoreductase  29.85 
 
 		 412 aa  113  9e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>