More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0942 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_0942  signal transduction protein  100 
 
 		 307 aa  600  1e-170  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1119  signal transduction protein  37.76 
 
 		 295 aa  219  6e-56  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.700202 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2115  signal transduction protein  36.9 
 
 		 300 aa  196  4.0000000000000005e-49  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.548765 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1085  putative signal transduction protein with CBS domains  33.1 
 
 		 300 aa  179  4.999999999999999e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.971141  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1742  signal transduction protein  35.96 
 
 		 286 aa  160  4e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.12379 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0565  signal transduction protein  35.44 
 
 		 286 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.632057  hitchhiker  0.00109381 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1735  signal transduction protein  34.14 
 
 		 286 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.281156  decreased coverage  0.000421461 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1555  signal transduction protein  34.63 
 
 		 286 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2165  hypothetical protein  27.97 
 
 		 291 aa  129  6e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.758559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2102  signal transduction protein  29.86 
 
 		 292 aa  127  2.0000000000000002e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2936  signal transduction protein  31.74 
 
 		 292 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000290592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0054  putative signal transduction protein with CBS domains  30.9 
 
 		 292 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1886  hypothetical protein  29.33 
 
 		 291 aa  125  1e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1922  signal transduction protein  30.69 
 
 		 293 aa  123  4e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0754  signal transduction protein  27.97 
 
 		 302 aa  122  7e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.284841  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1049  signal transduction protein  29.11 
 
 		 303 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1625  signal transduction protein  29.27 
 
 		 303 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0897  signal transduction protein  28.77 
 
 		 303 aa  108  1e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1067  signal transduction protein  26.74 
 
 		 303 aa  107  2e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1153  signal transduction protein  29.72 
 
 		 288 aa  107  2e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0640  hypothetical protein  26.51 
 
 		 292 aa  105  8e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2269  Protein of unknown function DUF293  31.48 
 
 		 177 aa  82.8  0.000000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4532  transcriptional regulator, TrmB  29.82 
 
 		 177 aa  81.6  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0304  Protein of unknown function DUF293  30.12 
 
 		 177 aa  79.7  0.00000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.480647  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1169  Protein of unknown function DUF293  29.41 
 
 		 176 aa  78.6  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.896672  normal  0.435827 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2734  Protein of unknown function DUF293  33.13 
 
 		 177 aa  77  0.0000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.645133 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2771  transcriptional regulator, TrmB  32.08 
 
 		 177 aa  76.6  0.0000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.129306  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0936  Protein of unknown function DUF293  33.95 
 
 		 177 aa  77  0.0000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0850424  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1203  CBS domain-containing protein  37.59 
 
 		 873 aa  69.3  0.00000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.452152  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2105  Protein of unknown function DUF293  30.63 
 
 		 178 aa  68.6  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0300972  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1201  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  30.33 
 
 		 370 aa  67.4  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1929  CBS domain containing protein  36.97 
 
 		 875 aa  64.3  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3672  Protein of unknown function DUF293  28.93 
 
 		 173 aa  64.7  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.829255  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0213  CBS domain-containing protein  32.39 
 
 		 863 aa  64.7  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1004  CBS domain-containing protein  30.2 
 
 		 149 aa  63.9  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024412  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0657  signal transduction protein  30.6 
 
 		 309 aa  63.9  0.000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00784458  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2294  CBS domain containing protein  37.82 
 
 		 875 aa  63.9  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2016  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 		 144 aa  63.9  0.000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1913  putative sigma54 specific transcriptional regulator  32.8 
 
 		 710 aa  63.2  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0899132  normal  0.0546689 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2087  Polynucleotide adenylyltransferase region  30.23 
 
 		 877 aa  63.2  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.625204 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0304  signal transduction protein  40.57 
 
 		 261 aa  62.8  0.000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.123702  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1497  CBS domain containing protein  30.52 
 
 		 845 aa  62.8  0.000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1420  polyA polymerase family protein  34.04 
 
 		 880 aa  62.4  0.000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0185526  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0838  signal transduction protein  28.75 
 
 		 279 aa  62.4  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.545659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0019  hypothetical protein  37.19 
 
 		 503 aa  62  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0215  CBS domain-containing protein  32.39 
 
 		 863 aa  62  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6427  CBS domain-containing protein  34.25 
 
 		 361 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0798  homoserine O-acetyltransferase  35.71 
 
 		 488 aa  61.2  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  33.85 
 
 		 256 aa  60.8  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0684  polynucleotide adenylyltransferase region  31.15 
 
 		 877 aa  60.8  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0765  CBS  33.08 
 
 		 224 aa  60.1  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1308  putative signal transduction protein with CBS domains  26.06 
 
 		 161 aa  60.5  0.00000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0311  hypothetical protein  34.75 
 
 		 500 aa  60.5  0.00000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0172  homoserine O-acetyltransferase  30.83 
 
 		 492 aa  60.5  0.00000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0604  hypothetical protein  27.2 
 
 		 513 aa  60.5  0.00000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.940155 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3428  Polynucleotide adenylyltransferase region  32.76 
 
 		 873 aa  60.1  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000799776  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1302  CBS domain containing protein  34.85 
 
 		 769 aa  60.1  0.00000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1552  CBS domain-containing protein  33.04 
 
 		 378 aa  59.7  0.00000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.651546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1421  polynucleotide adenylyltransferase region  31.94 
 
 		 909 aa  59.3  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1654  CBS domain containing protein  27.65 
 
 		 890 aa  59.7  0.00000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.873652 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0219  hypothetical protein  27.2 
 
 		 513 aa  59.3  0.00000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.434471  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0911  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  28.35 
 
 		 290 aa  58.9  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1297  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  31.15 
 
 		 888 aa  58.9  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.795106  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2847  polynucleotide adenylyltransferase region  32.26 
 
 		 874 aa  58.9  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1873  hypothetical protein  31.72 
 
 		 229 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.994541 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3135  CBS domain-containing protein  26.47 
 
 		 141 aa  58.9  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0694667  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0451  hypothetical protein  32.65 
 
 		 502 aa  58.9  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2755  CBS domain-containing protein  33.06 
 
 		 896 aa  58.2  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.1635  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2466  polynucleotide adenylyltransferase region  32.26 
 
 		 872 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.779181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1131  polynucleotide adenylyltransferase region  30.6 
 
 		 907 aa  57.8  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00727527  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0978  hypothetical protein  30.4 
 
 		 364 aa  57.8  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1731  peptidase M50  26.19 
 
 		 366 aa  57.4  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0628  signal transduction protein  33.07 
 
 		 307 aa  57  0.0000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1972  CBS  35.19 
 
 		 898 aa  57  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.03578  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2063  protein of unknown function UPF0074  29.41 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2388  Polynucleotide adenylyltransferase region  33.9 
 
 		 903 aa  56.2  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.991166 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2925  CBS domain-containing protein  27.69 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00660702  normal  0.275882 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3742  Polynucleotide adenylyltransferase region  34.85 
 
 		 903 aa  56.6  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1508  peptidase M50  33.06 
 
 		 412 aa  56.2  0.0000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1761  CBS domain-containing protein  27.56 
 
 		 315 aa  56.2  0.0000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000282472  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0669  hypothetical protein  28.32 
 
 		 513 aa  55.8  0.0000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0805  CBS domain-containing protein  26.12 
 
 		 172 aa  55.5  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1314  hypothetical protein  25.6 
 
 		 513 aa  55.5  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1708  phosphoesterase, RecJ-like  31.62 
 
 		 904 aa  55.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.833662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2794  chloride channel protein EriC  31.75 
 
 		 608 aa  55.5  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000831422  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3792  Polynucleotide adenylyltransferase region  34.85 
 
 		 903 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1487  sigma-L-dependent transcriptional regulator  31.97 
 
 		 696 aa  55.5  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0750  CBS domain containing protein  34.96 
 
 		 867 aa  55.1  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.596795  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  29.75 
 
 		 230 aa  55.5  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2229  CBS domain-containing protein  29.91 
 
 		 313 aa  54.7  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6174  CBS domain containing membrane protein  32.89 
 
 		 246 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1695  CBS domain-containing protein  28.39 
 
 		 885 aa  54.7  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0345  signal transduction protein  26.36 
 
 		 411 aa  54.3  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0545  homoserine O-acetyltransferase  31.86 
 
 		 487 aa  54.7  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.419548  normal  0.193935 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0914  putative signal transduction protein with CBS domains  31.5 
 
 		 131 aa  53.9  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0000312526  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2437  signal transduction protein  40 
 
 		 166 aa  54.3  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.188385 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0771  signal-transduction protein  30.48 
 
 		 164 aa  54.3  0.000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.411579  normal  0.0544722 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0677  signal transduction protein  26.96 
 
 		 399 aa  53.9  0.000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6307  putative signal transduction protein with CBS domains  30.56 
 
 		 229 aa  53.9  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1763  putative PAS/PAC sensor protein  31.15 
 
 		 698 aa  53.5  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>