More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_0093 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_0093  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  100 
 
 
222 aa  452  1e-126  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.169395 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1140  HhH-GPD family protein  76.58 
 
 
222 aa  373  1e-102  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  2.77091e-10 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0101  HhH-GPD family protein  73.15 
 
 
218 aa  338  3e-92  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0066  HhH-GPD family protein  69.34 
 
 
219 aa  322  3e-87  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1887  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  44.29 
 
 
230 aa  179  4e-44  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00394166  normal  0.954448 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0393  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  37.93 
 
 
240 aa  147  1e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0160174  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2110  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  35.41 
 
 
230 aa  145  6e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1090  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  37.14 
 
 
236 aa  140  2e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.311677  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0141  HhH-GPD family protein  37.2 
 
 
236 aa  137  2e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0911  HhH-GPD family protein  40.11 
 
 
219 aa  130  2e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.581755  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2692  endonuclease III  41.49 
 
 
214 aa  119  4e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.841587  normal  0.269141 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2873  endonuclease III  39.8 
 
 
222 aa  119  5e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.407783 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1031  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  40.96 
 
 
214 aa  117  2e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.474778  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1930  endonuclease III  37.13 
 
 
216 aa  116  3e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.491388  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1461  endonuclease III  39.58 
 
 
216 aa  115  4e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1523  HhH-GPD family protein  30.3 
 
 
216 aa  114  8e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.951977  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0190  endonuclease III  35.55 
 
 
224 aa  114  1e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0197  endonuclease III  40.11 
 
 
214 aa  114  1e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1891  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  40.64 
 
 
233 aa  113  2e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1022  endonuclease III  38.1 
 
 
219 aa  113  2e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0438  endonuclease III  35.68 
 
 
203 aa  113  3e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0343367  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1270  endonuclease III  36.92 
 
 
215 aa  112  4e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0205  endonuclease III  35.29 
 
 
239 aa  111  7e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0490975  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2523  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  35.29 
 
 
219 aa  111  7e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.181892 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0436  endonuclease III  37.23 
 
 
220 aa  111  7e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.22324  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2870  HhH-GPD family protein  34.52 
 
 
232 aa  110  1e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0804  endonuclease III  38.42 
 
 
219 aa  110  1e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.61713 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2109  endonuclease III  36.04 
 
 
223 aa  110  1e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.171881  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0437  endonuclease III  37.69 
 
 
246 aa  110  2e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.186096 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2331  endonuclease III  36.6 
 
 
211 aa  110  2e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0547  HhH-GPD family protein  33.51 
 
 
220 aa  110  2e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3568  endonuclease III  38.54 
 
 
214 aa  110  2e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2572  putative endonuclease  32.68 
 
 
232 aa  110  2e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0904  HhH-GPD family protein  36.5 
 
 
221 aa  110  2e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00777346  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1074  endonuclease III  39.47 
 
 
235 aa  109  3e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0468  endonuclease III  38.25 
 
 
210 aa  109  3e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1489  endonuclease III  34.8 
 
 
217 aa  109  3e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.220134  normal  0.323214 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25390  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase /endonuclease III  36.68 
 
 
244 aa  109  3e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0533  HhH-GPD family protein  32.97 
 
 
220 aa  109  4e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.208461  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1540  endonuclease III  37.37 
 
 
219 aa  108  5e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0880  endonuclease III  36.04 
 
 
231 aa  108  5e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  6.30803e-09  hitchhiker  6.62064e-07 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1511  endonuclease III  37.37 
 
 
219 aa  108  5e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1676  endonuclease III  35.2 
 
 
215 aa  108  6e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1195  putative EndoIII-related endonuclease  34.67 
 
 
228 aa  108  7e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.643643  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2604  endonuclease III  34.22 
 
 
227 aa  108  8e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.324373  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1456  endonuclease III  35.2 
 
 
215 aa  108  9e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1714  endonuclease III  35.2 
 
 
215 aa  108  9e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.147583  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1428  endonuclease III  35.2 
 
 
215 aa  108  9e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0645154  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1570  endonuclease III  35.2 
 
 
215 aa  108  9e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1641  endonuclease III  35.2 
 
 
215 aa  108  9e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00426336 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1429  endonuclease III  35.2 
 
 
215 aa  108  9e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.965291  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0118  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  36.73 
 
 
258 aa  107  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2824  endonuclease III  38.71 
 
 
250 aa  107  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.105195 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0353  HhH-GPD family protein  36.1 
 
 
222 aa  107  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.822084 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1299  endonuclease III  35.75 
 
 
213 aa  107  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  8.04758e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0980  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  38.34 
 
 
232 aa  107  2e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  9.05623e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0829  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  34.2 
 
 
231 aa  107  2e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.141999  normal  0.027211 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1407  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  31.48 
 
 
220 aa  107  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3156  HhH-GPD family protein  36.73 
 
 
223 aa  106  2e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0734145 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0851  endonuclease III  33.99 
 
 
231 aa  106  3e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0762  HhH-GPD family protein  35.44 
 
 
236 aa  106  3e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3238  endonuclease III  39.78 
 
 
213 aa  106  3e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.27706  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1794  base excision repair protein, HhH-GPD family  34.47 
 
 
223 aa  106  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1471  HhH-GPD family protein  34.47 
 
 
223 aa  106  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.598554  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3567  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  37.06 
 
 
268 aa  105  4e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3842  endonuclease III  37.7 
 
 
254 aa  105  5e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.561189  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3375  endonuclease III  38.69 
 
 
236 aa  105  5e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3166  endonuclease III  36.32 
 
 
291 aa  105  5e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0244001 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3737  endonuclease III  37.84 
 
 
226 aa  105  7e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2682  endonuclease III  37.77 
 
 
220 aa  105  7e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3170  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  37.63 
 
 
216 aa  105  7e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.999623  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2306  endonuclease III  37.77 
 
 
220 aa  105  7e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1388  endonuclease III  31.68 
 
 
210 aa  104  9e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.212617  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2517  endonuclease III  37.63 
 
 
216 aa  104  9e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2676  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  37.95 
 
 
214 aa  104  9e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0091  endonuclease III  40.31 
 
 
237 aa  104  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0510  endonuclease III  36.04 
 
 
223 aa  104  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1187  endonuclease III, DNA repair  33.51 
 
 
214 aa  104  1e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00300969  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2009  HhH-GPD family protein  35.5 
 
 
217 aa  103  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.483803  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8862  endonuclease III  34.85 
 
 
251 aa  104  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0153  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  37.97 
 
 
237 aa  104  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3057  endonuclease III  35.29 
 
 
208 aa  104  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1603  endonuclease III  34.87 
 
 
215 aa  104  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2402  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  34.45 
 
 
222 aa  103  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  1.42862e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1562  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  38.17 
 
 
226 aa  103  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.888667 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1273  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  31.71 
 
 
215 aa  103  2e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2765  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  34.03 
 
 
219 aa  103  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.361393  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3888  endonuclease III/Nth  39.36 
 
 
212 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.324947 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2465  endonuclease III  35.61 
 
 
220 aa  103  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.341333 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2655  endonuclease III  36.9 
 
 
212 aa  102  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3934  endonuclease III  37.37 
 
 
234 aa  103  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.386422  hitchhiker  0.00986962 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1669  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  37.77 
 
 
240 aa  102  3e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.544383  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1172  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  32.31 
 
 
218 aa  103  3e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0261583  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1009  endonuclease III/Nth  35.91 
 
 
217 aa  102  3e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.544458  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2021  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  40.31 
 
 
229 aa  102  4e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18220  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase /endonuclease III  38.07 
 
 
268 aa  102  4e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.331491  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1638  endonuclease III  35.24 
 
 
228 aa  102  4e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.104677  normal  0.333144 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2899  endonuclease III  36.92 
 
 
213 aa  102  4e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.786495  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1435  DNA-3-methyladenine glycosylase III  32.82 
 
 
221 aa  102  4e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.115204  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1735  endonuclease III  39.2 
 
 
215 aa  102  4e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.61574  normal  0.277364 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>