More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_1099 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_1099  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 
266 aa  530  1e-150  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00311315  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0668  regulatory proteins, IclR  60.58 
 
 
242 aa  305  7e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0128525  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1205  IclR family transcriptional regulator  57.59 
 
 
261 aa  293  3e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0230361  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1309  IclR family transcriptional regulator  58.5 
 
 
262 aa  292  3e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1936  transcriptional regulator, IclR family  59.92 
 
 
265 aa  292  4e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00885833 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1608  transcriptional regulator, IclR family  59.92 
 
 
265 aa  292  5e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0247666  normal  0.511449 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1610  transcription regulator protein  59.44 
 
 
266 aa  289  4e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2661  IclR family transcriptional regulator  57.65 
 
 
270 aa  286  3e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2606  IclR family transcriptional regulator  57.65 
 
 
270 aa  286  3e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.339666  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2739  IclR regulatory protein  57.65 
 
 
270 aa  286  3e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1869  IclR family transcriptional regulator  57.65 
 
 
270 aa  285  4e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.32806  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1495  IclR family transcriptional regulator  57.65 
 
 
270 aa  285  8e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.684109  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1714  IclR family transcriptional regulator  57.65 
 
 
270 aa  285  8e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.760018  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3097  IclR family transcriptional regulator  57.65 
 
 
270 aa  285  8e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.070392  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2223  IclR family transcriptional regulator  57.65 
 
 
270 aa  285  8e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1946  transcriptional regulator, IclR family  55.16 
 
 
270 aa  284  1e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1776  IclR family transcriptional regulator  55.16 
 
 
270 aa  284  1e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1546  IclR family transcriptional regulator  58.47 
 
 
268 aa  283  2e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0208849  normal  0.0159222 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1138  IclR family transcriptional regulator  57.25 
 
 
269 aa  283  2e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.211589  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5438  IclR family transcriptional regulator  56.59 
 
 
269 aa  282  5e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.442503  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2586  transcriptional regulator, IclR family  58.06 
 
 
268 aa  281  8e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00119641 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2132  IclR family transcriptional regulator  56.86 
 
 
269 aa  281  8e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0887225  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2149  IclR family transcriptional regulator  56.86 
 
 
269 aa  281  8e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0618427  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5945  IclR family transcriptional regulator  56.86 
 
 
269 aa  281  8e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2042  IclR family transcriptional regulator  56.86 
 
 
269 aa  280  1e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2169  IclR family transcriptional regulator  56.86 
 
 
269 aa  280  1e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2886  IclR family transcriptional regulator  57.72 
 
 
256 aa  280  2e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.187395 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1465  IclR family transcriptional regulator  56.47 
 
 
268 aa  279  4e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0393345  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3106  IclR family transcriptional regulator  54.22 
 
 
270 aa  274  1e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.184655 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2099  IclR family transcriptional regulator  56.97 
 
 
257 aa  272  5e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.734801  normal  0.3554 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2376  transcriptional regulator, IclR family  54.73 
 
 
281 aa  270  2e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.157038  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1723  regulatory proteins, IclR  53.66 
 
 
259 aa  270  2e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.270095  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3624  regulatory proteins, IclR  52.31 
 
 
286 aa  269  3e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0740  regulatory protein IclR  53.05 
 
 
277 aa  269  4e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4860  IclR family transcriptional regulator  53.52 
 
 
274 aa  268  6e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2324  IclR family transcriptional regulator  52.85 
 
 
259 aa  265  5e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0866935  normal  0.741427 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2347  IclR family transcriptional regulator  50.81 
 
 
263 aa  258  8e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0050  IclR family transcriptional regulator  48.37 
 
 
257 aa  230  2e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.676674 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1081  transcriptional regulator, IclR family  53.02 
 
 
259 aa  227  1e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.199562  normal  0.251697 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2031  IclR family transcriptional regulator  47.19 
 
 
273 aa  214  1e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4891  IclR family transcriptional regulator  40.08 
 
 
262 aa  185  8e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1365  transcriptional regulator, IclR family  41.11 
 
 
259 aa  155  7e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.490803  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1668  transcriptional regulator, IclR family  41.11 
 
 
259 aa  155  8e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.145248  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  35.34 
 
 
259 aa  149  4e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  31.85 
 
 
252 aa  147  1e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  38.1 
 
 
277 aa  145  8e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  34.09 
 
 
267 aa  145  8e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  2.86827e-13  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2617  IclR family transcriptional regulator  36.63 
 
 
276 aa  144  1e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2527  transcriptional regulator, IclR family  36.84 
 
 
265 aa  144  2e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00648168  normal  0.235147 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0115  transcriptional regulator, IclR family  36.11 
 
 
279 aa  143  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.587027  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  33.2 
 
 
254 aa  142  5e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0457  transcriptional regulator IclR  33.83 
 
 
295 aa  141  1e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  34.26 
 
 
268 aa  140  3e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4531  IclR family transcriptional regulator  33.59 
 
 
283 aa  138  7e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.924227  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  31.23 
 
 
256 aa  137  1e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3853  IclR family transcriptional regulator  35.63 
 
 
263 aa  138  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  hitchhiker  0.00959131 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  34.08 
 
 
272 aa  136  3e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  31.76 
 
 
280 aa  135  5e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2257  IclR family transcriptional regulator  35.46 
 
 
259 aa  134  1e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.115222 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  31.62 
 
 
261 aa  134  2e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0779  transcriptional regulator IclR  33.96 
 
 
278 aa  132  4e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0882  IclR family transcriptional regulator  29.15 
 
 
246 aa  132  6e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0859  transcriptional regulator IclR-like protein  29.15 
 
 
246 aa  132  6e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  30.52 
 
 
255 aa  132  7e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4307  transcriptional regulator IclR  31.76 
 
 
273 aa  131  1e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0456166 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  32.66 
 
 
252 aa  130  2e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5403  transcriptional regulator, IclR family  35.71 
 
 
290 aa  129  5e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.681342  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3122  IclR family transcriptional regulator  32.51 
 
 
250 aa  128  9e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.255406  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2811  IclR family transcriptional regulator  32.1 
 
 
250 aa  127  2e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.667309  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3121  transcriptional regulator, IclR family  32.1 
 
 
250 aa  127  2e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  3.51533e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9117  IclR family transciptional regulator  38.02 
 
 
252 aa  126  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  33.07 
 
 
252 aa  126  4e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0569  transcriptional regulator, IclR family  28.23 
 
 
251 aa  126  4e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1318  IclR family transcriptional regulator  33.07 
 
 
275 aa  125  6e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.486749  normal  0.878274 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2240  regulatory protein, IclR  34.9 
 
 
262 aa  124  2e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  31.13 
 
 
260 aa  123  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  34.69 
 
 
267 aa  124  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2875  IclR family transcriptional regulator  32.1 
 
 
250 aa  124  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102982  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3103  transcriptional regulator, IclR family  31.69 
 
 
250 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  32.13 
 
 
262 aa  124  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2850  IclR family transcriptional regulator  31.69 
 
 
250 aa  124  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.526346  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3089  transcriptional regulator, IclR family  31.28 
 
 
250 aa  124  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0440  DNA-binding transcriptional repressor AllR  30.89 
 
 
271 aa  123  3e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0717823  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0549  DNA-binding transcriptional repressor AllR  30.89 
 
 
256 aa  122  4e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0543  DNA-binding transcriptional repressor AllR  30.89 
 
 
271 aa  122  4e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3116  DNA-binding transcriptional repressor AllR  30.89 
 
 
271 aa  122  4e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.129581 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0580  DNA-binding transcriptional repressor AllR  30.89 
 
 
271 aa  122  4e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3106  transcriptional regulator, IclR family  30.89 
 
 
271 aa  122  4e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00456  DNA-binding transcriptional repressor  30.89 
 
 
271 aa  122  4e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.832726  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00461  hypothetical protein  30.89 
 
 
271 aa  122  4e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0607  DNA-binding transcriptional repressor AllR  30.89 
 
 
256 aa  122  4e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3960  transcriptional regulator, IclR family  33.2 
 
 
255 aa  122  5e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3098  IclR family transcriptional regulator  31.28 
 
 
250 aa  122  6e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0903257  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2883  IclR family transcriptional regulator  31.28 
 
 
250 aa  122  6e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0306717  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0565  DNA-binding transcriptional repressor AllR  30.92 
 
 
272 aa  121  1e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.988218 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0570  DNA-binding transcriptional repressor AllR  30.92 
 
 
272 aa  121  1e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0563  DNA-binding transcriptional repressor AllR  30.92 
 
 
272 aa  121  1e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0886  transcriptional regulator  30.26 
 
 
280 aa  121  1e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.574379  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0624  DNA-binding transcriptional repressor AllR  30.92 
 
 
272 aa  121  1e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.10241  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2889  regulatory proteins, IclR  36.43 
 
 
299 aa  121  1e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.457395  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>