More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0322 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0322  putative signal transduction protein  100 
 
 		 403 aa  819    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0920  diguanylate phosphodiesterase  44.75 
 
 		 416 aa  327  3e-88  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.135015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2312  diguanylate phosphodiesterase  45.48 
 
 		 423 aa  320  3e-86  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0122  diguanylate phosphodiesterase  37.12 
 
 		 400 aa  294  1e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000715595  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1998  diguanylate phosphodiesterase  37.44 
 
 		 404 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3594  diguanylate phosphodiesterase  37.66 
 
 		 402 aa  272  9e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00249356  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1888  diguanylate phosphodiesterase  34.74 
 
 		 400 aa  268  1e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.61283  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0127  hypothetical protein  38.06 
 
 		 402 aa  266  7e-70  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3129  diguanylate phosphodiesterase  38.89 
 
 		 415 aa  262  6.999999999999999e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0828  diguanylate phosphodiesterase  40.45 
 
 		 413 aa  257  2e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.81779  normal  0.35188 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0339  signal transduction protein  34.64 
 
 		 409 aa  251  2e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0012225  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03533  EAL domain protein  32.1 
 
 		 408 aa  241  2e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0111496  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1442  hypothetical protein  33.25 
 
 		 404 aa  239  6.999999999999999e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000750338  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003840  predicted signal transduction protein  34.16 
 
 		 404 aa  239  6.999999999999999e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000123266  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3234  diguanylate phosphodiesterase  33.08 
 
 		 408 aa  237  2e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.114779 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2417  diguanylate phosphodiesterase  37.5 
 
 		 411 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000004717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1938  diguanylate phosphodiesterase  35.87 
 
 		 422 aa  232  8.000000000000001e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.509602  normal  0.818289 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0413  diguanylate phosphodiesterase  30.02 
 
 		 397 aa  230  4e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000029399  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3130  diguanylate phosphodiesterase  35.82 
 
 		 413 aa  228  1e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1720  diguanylate phosphodiesterase  34.49 
 
 		 412 aa  227  2e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1073  diguanylate phosphodiesterase  38.19 
 
 		 428 aa  227  2e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0860  diguanylate phosphodiesterase  31.36 
 
 		 397 aa  226  7e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4244  diguanylate phosphodiesterase  37.28 
 
 		 428 aa  226  8e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3464  EAL domain-containing protein  32.16 
 
 		 406 aa  226  8e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.126352  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3736  diguanylate phosphodiesterase  32.83 
 
 		 406 aa  224  2e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000203381 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1729  diguanylate phosphodiesterase  34.24 
 
 		 419 aa  224  3e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3785  diguanylate phosphodiesterase  36.96 
 
 		 444 aa  224  3e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.942548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1462  diguanylate phosphodiesterase  32.84 
 
 		 405 aa  220  3e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1937  putative signaling protein  32.49 
 
 		 400 aa  220  3e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2615  diguanylate phosphodiesterase  34.89 
 
 		 411 aa  219  5e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1149  EAL domain-containing protein  35.94 
 
 		 411 aa  218  1e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2981  diguanylate phosphodiesterase  32.35 
 
 		 412 aa  218  1e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0150403  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1352  hypothetical protein  32.33 
 
 		 411 aa  217  2.9999999999999998e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1598  diguanylate phosphodiesterase  34.89 
 
 		 411 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0347  diguanylate phosphodiesterase  36.1 
 
 		 400 aa  215  9.999999999999999e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.145586  normal  0.218991 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2451  diguanylate phosphodiesterase  34.57 
 
 		 423 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.694346  normal  0.603659 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2930  putative signaling protein  35.28 
 
 		 406 aa  214  2.9999999999999995e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2383  hypothetical protein  32.43 
 
 		 408 aa  213  3.9999999999999995e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2343  diguanylate phosphodiesterase  32.83 
 
 		 431 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00856181  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2780  diguanylate phosphodiesterase  36.22 
 
 		 411 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.948032  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03534  diguanylate phosphodiesterase  30.85 
 
 		 411 aa  212  1e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0852439  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1652  diguanylate phosphodiesterase  31.23 
 
 		 406 aa  211  1e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3300  EAL  35.04 
 
 		 417 aa  211  2e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002124  predicted signal transduction protein  32.44 
 
 		 407 aa  210  3e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00298  signal transduction protein  32.16 
 
 		 407 aa  210  4e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1612  diguanylate phosphodiesterase  33.67 
 
 		 410 aa  209  7e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0416985  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2098  diguanylate phosphodiesterase  30.17 
 
 		 405 aa  208  1e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3947  diguanylate phosphodiesterase  31.84 
 
 		 413 aa  208  1e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.103414  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1965  diguanylate phosphodiesterase  32.59 
 
 		 413 aa  205  1e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.616321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2937  diguanylate phosphodiesterase  36.84 
 
 		 411 aa  205  1e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.64133  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1814  diguanylate phosphodiesterase  30.37 
 
 		 405 aa  204  2e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.877922  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2174  diguanylate phosphodiesterase  33.51 
 
 		 408 aa  204  3e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.120475  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1332  diguanylate phosphodiesterase  32.69 
 
 		 424 aa  202  6e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1693  EAL domain protein  31.3 
 
 		 410 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1316  diguanylate phosphodiesterase  31.13 
 
 		 419 aa  189  8e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2912  diguanylate phosphodiesterase  32.92 
 
 		 447 aa  186  7e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.776236 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0906  diguanylate phosphodiesterase  31.37 
 
 		 423 aa  181  2e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.3977  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0991  diguanylate phosphodiesterase  31.37 
 
 		 423 aa  181  2e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1776  diguanylate phosphodiesterase  35.62 
 
 		 448 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.265098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0010  diguanylate phosphodiesterase  31.68 
 
 		 487 aa  180  4e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0508854 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5115  diguanylate phosphodiesterase  32.84 
 
 		 429 aa  179  4.999999999999999e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.959026 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1571  diguanylate phosphodiesterase  32.68 
 
 		 445 aa  179  9e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.256124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1852  diguanylate phosphodiesterase  32.89 
 
 		 412 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.12834  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2840  diguanylate phosphodiesterase  30.87 
 
 		 403 aa  173  3.9999999999999995e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0990  diguanylate phosphodiesterase  31.6 
 
 		 431 aa  171  3e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0905  diguanylate phosphodiesterase  31.6 
 
 		 431 aa  170  4e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5114  diguanylate phosphodiesterase  29.41 
 
 		 464 aa  167  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488167 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1990  diguanylate phosphodiesterase  31.27 
 
 		 414 aa  167  2e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.973618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1719  diguanylate phosphodiesterase  32.44 
 
 		 448 aa  165  1.0000000000000001e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.189633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1315  diguanylate phosphodiesterase  33.42 
 
 		 449 aa  162  7e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2159  signal transduction protein  28.99 
 
 		 480 aa  146  8.000000000000001e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.140137  normal  0.149553 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1268  diguanylate phosphodiesterase  30.53 
 
 		 407 aa  144  3e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.15473  normal  0.0747469 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1497  putative signal transduction protein  29.8 
 
 		 414 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1476  putative signal transduction protein  23.04 
 
 		 403 aa  140  6e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000542008  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0573  hypothetical protein  25.13 
 
 		 379 aa  137  4e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2882  putative signal transduction protein  27.2 
 
 		 397 aa  136  7.000000000000001e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.567941  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0592  hypothetical protein  25.38 
 
 		 379 aa  135  9.999999999999999e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2907  signal transduction protein  27.94 
 
 		 439 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0386149  normal  0.411691 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1384  putative signal transduction protein  27.32 
 
 		 463 aa  132  9e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0056  signal transduction protein  28.05 
 
 		 444 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.680301  normal  0.542378 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1779  diguanylate phosphodiesterase  30.43 
 
 		 450 aa  123  5e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4213  EAL  31.08 
 
 		 402 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3084  putative signal transduction protein  24.72 
 
 		 419 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1568  diguanylate phosphodiesterase  26.68 
 
 		 460 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2915  diguanylate phosphodiesterase  27.67 
 
 		 458 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.555808 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31360  predicted signal transduction protein containing EAL and modified HD-GYP domains  26.91 
 
 		 418 aa  104  4e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.041924 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2212  putative signal transduction protein  25.8 
 
 		 394 aa  102  9e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.566783 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4155  putative signal transduction protein  25.12 
 
 		 438 aa  100  5e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.78127  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2226  diguanylate phosphodiesterase  36.41 
 
 		 242 aa  98.6  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0863855  hitchhiker  0.00537893 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2227  diguanylate phosphodiesterase  40 
 
 		 207 aa  94.7  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.118815  hitchhiker  0.00585618 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1201  putative signal transduction protein  25.93 
 
 		 406 aa  88.6  2e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2723  putative signal transduction protein  32.73 
 
 		 399 aa  88.6  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000022717 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3725  putative signal transduction protein  28.22 
 
 		 378 aa  87  5e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3062  signal transduction protein  31.1 
 
 		 403 aa  85.5  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0202013  normal  0.558987 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2044  putative signal transduction protein  27.24 
 
 		 398 aa  79  0.0000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0842  signal transduction protein  32.65 
 
 		 389 aa  74.7  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0117523 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0622  putative signal transduction protein  27.57 
 
 		 430 aa  70.9  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3112  putative signal transduction protein  27.27 
 
 		 413 aa  67.8  0.0000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3839  putative signal transduction protein  27.45 
 
 		 403 aa  67.4  0.0000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4432  putative signal transduction protein  28.21 
 
 		 409 aa  63.2  0.000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>