More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1030 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1030  NLP/P60 family secreted protein  100 
 
 		 340 aa  691    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427961  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  48.33 
 
 		 333 aa  276  5e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3145  NLP/P60 protein  57.63 
 
 		 349 aa  274  2.0000000000000002e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.120353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  48.17 
 
 		 331 aa  237  2e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3144  NLP/P60 protein  44.55 
 
 		 334 aa  231  2e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0327841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3070  NLP/P60 protein  38.02 
 
 		 306 aa  200  3e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00281193  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1303  NLP/P60 protein  36.69 
 
 		 319 aa  178  1e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0103745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2686  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  35.15 
 
 		 330 aa  170  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377535  normal  0.257604 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  30.37 
 
 		 340 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3124  NLP/P60 protein  32.73 
 
 		 327 aa  145  1e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0606455  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6766  NLP/P60 protein  32.42 
 
 		 350 aa  142  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2683  NLP/P60 protein  31.56 
 
 		 348 aa  140  3e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468332  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1820  NLP/P60 protein  29.61 
 
 		 330 aa  135  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3420  NLP/P60 protein  30.91 
 
 		 342 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1380  NLP/P60 protein  31.11 
 
 		 343 aa  134  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2692  NLP/P60 protein  43.79 
 
 		 162 aa  133  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0060  NLP/P60 protein  29.97 
 
 		 337 aa  132  6.999999999999999e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1508  NLP/P60 protein  29.5 
 
 		 348 aa  129  5.0000000000000004e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3958  NLP/P60 protein  31.75 
 
 		 323 aa  129  5.0000000000000004e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.068937  normal  0.125379 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0971  NLP/P60 protein  30.81 
 
 		 345 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.230256 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8562  NLP/P60 protein  29.8 
 
 		 373 aa  128  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0614213  hitchhiker  0.0073147 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3453  NLP/P60 protein  27.59 
 
 		 394 aa  125  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3579  NLP/P60 protein  28.06 
 
 		 323 aa  125  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10740  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  30.33 
 
 		 332 aa  123  5e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4909  NLP/P60 protein  32 
 
 		 335 aa  122  8e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9152  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  29.23 
 
 		 321 aa  121  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2283  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  45.8 
 
 		 222 aa  120  3e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6095  NLP/P60 protein  28.07 
 
 		 366 aa  120  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0570  NLP/P60 protein  48.76 
 
 		 160 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0055  NLP/P60 protein  29.65 
 
 		 337 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.275537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4013  NLP/P60 protein  49.58 
 
 		 236 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0480  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  43.4 
 
 		 390 aa  117  3e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3049  NLP/P60 protein  27.91 
 
 		 347 aa  116  6e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8043  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  47.01 
 
 		 210 aa  115  8.999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.433259  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0148  NLP/P60 protein  50.42 
 
 		 392 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  44.06 
 
 		 257 aa  113  6e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  42.42 
 
 		 265 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6205  NLP/P60 protein  44.8 
 
 		 417 aa  111  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6731  NLP/P60 protein  47.37 
 
 		 308 aa  107  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00865661  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5385  NLP/P60 protein  27.07 
 
 		 363 aa  108  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.418529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8534  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  37.04 
 
 		 438 aa  106  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0174309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0243  NLP/P60 protein  27.33 
 
 		 323 aa  106  6e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5879  NLP/P60 protein  27.21 
 
 		 333 aa  106  6e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.884921  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0694  NLP/P60 protein  43.55 
 
 		 453 aa  105  8e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.427421 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9181  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  34.13 
 
 		 531 aa  105  9e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5880  NLP/P60 protein  27.39 
 
 		 315 aa  105  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.791829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  44.53 
 
 		 329 aa  104  3e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0586  NLP/P60 protein  44.63 
 
 		 432 aa  104  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  31.25 
 
 		 391 aa  103  4e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0385  NLP/P60 protein  28.36 
 
 		 360 aa  103  4e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2959  NLP/P60 protein  25.81 
 
 		 378 aa  103  4e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.454421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0423  NLP/P60  43.33 
 
 		 459 aa  103  5e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0573  NLP/P60 protein  47.01 
 
 		 388 aa  103  6e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.774962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3235  NLP/P60 protein  27.46 
 
 		 446 aa  102  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.177919  hitchhiker  0.000140663 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4866  NLP/P60 protein  28.37 
 
 		 350 aa  101  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5001  NLP/P60 protein  47.37 
 
 		 204 aa  100  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.132684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7290  NLP/P60 protein  46.15 
 
 		 329 aa  100  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0724969  normal  0.129694 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0190  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  39.84 
 
 		 235 aa  100  4e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2593  NLP/P60 protein  34.12 
 
 		 476 aa  99.4  8e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3298  NLP/P60 protein  41.38 
 
 		 372 aa  99.4  9e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.382335  normal  0.154902 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0869  LysM domain/NLP/P60 family protein  33.63 
 
 		 342 aa  99  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1435  NLP/P60  35.16 
 
 		 361 aa  99  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0418485  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3287  NLP/P60  41.38 
 
 		 372 aa  99  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1453  NLP/P60 protein  35.16 
 
 		 361 aa  99  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3349  NLP/P60 protein  41.38 
 
 		 372 aa  99  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0832432  normal  0.0310886 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3713  NLP/P60 protein  25.81 
 
 		 348 aa  99  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.761513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0888  NLP/P60 protein  40.5 
 
 		 363 aa  99  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2096  NLP/P60 protein  29.18 
 
 		 375 aa  98.2  2e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.685486  normal  0.535161 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3552  NLP/P60 protein  39.66 
 
 		 378 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2808  NLP/P60 protein  27.67 
 
 		 348 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4570  NLP/P60 protein  43.27 
 
 		 363 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12218  hypothetical protein  44.9 
 
 		 393 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.327955  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  42.24 
 
 		 452 aa  96.7  5e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5661  NLP/P60 protein  25.51 
 
 		 348 aa  96.7  5e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5350  NLP/P60 protein  25.51 
 
 		 348 aa  96.7  5e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0889  NLP/P60 protein  38.58 
 
 		 337 aa  95.5  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1169  NLP/P60:peptidoglycan-binding LysM  40.54 
 
 		 341 aa  94.7  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000154936  normal  0.0379935 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32150  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  40.91 
 
 		 475 aa  94.7  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0191937  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  44.34 
 
 		 232 aa  94.4  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1561  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  39.23 
 
 		 337 aa  94.4  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.308616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4528  NLP/P60 protein  42.72 
 
 		 370 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4077  NLP/P60 protein  43.59 
 
 		 308 aa  94.7  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0063374  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4506  NLP/P60 protein  39.86 
 
 		 501 aa  94.4  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.918319  normal  0.0864721 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1783  NLP/P60 protein  46.22 
 
 		 317 aa  94.4  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114987  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3076  NLP/P60 protein  34.17 
 
 		 231 aa  93.6  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2700  NLP/P60 protein  42.74 
 
 		 188 aa  94  4e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000637216  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5530  NLP/P60 protein  42.25 
 
 		 491 aa  94  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.479781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2110  NLP/P60 protein  43.24 
 
 		 491 aa  93.6  5e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0361918  normal  0.848147 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1368  NLP/P60 protein  38.74 
 
 		 346 aa  93.2  5e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00025517  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0896  NLP/P60 protein  41.96 
 
 		 342 aa  93.2  6e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000013444  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8469  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  39.5 
 
 		 362 aa  93.2  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3237  NLP/P60 protein  45.36 
 
 		 380 aa  93.2  6e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00058739  hitchhiker  0.000426733 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2144  NLP/P60 protein  45.13 
 
 		 374 aa  92.8  7e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1371  cell wall-associated hydrolase/invasion-associated protein  44.86 
 
 		 273 aa  92.8  8e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3365  NLP/P60 protein  41.96 
 
 		 342 aa  92  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2736  NLP/P60 protein  39.29 
 
 		 307 aa  92  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3054  NLP/P60 protein  39.02 
 
 		 381 aa  92  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0610428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3043  NLP/P60 protein  35.82 
 
 		 274 aa  92  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.166608  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2074  NLP/P60 protein  42.74 
 
 		 295 aa  91.3  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.591046  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1696  NLP/P60  45 
 
 		 302 aa  91.3  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.033206  normal  0.040245 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>