More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2297 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_2297  AAA ATPase, central region  100 
 
 		 228 aa  473  1e-132  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.754524 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0869  AAA ATPase family protein  45.79 
 
 		 352 aa  194  9e-49  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000165138  normal  0.784704 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0853  AAA ATPase  44.56 
 
 		 305 aa  185  5e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4054  AAA ATPase, central region  48.31 
 
 		 299 aa  183  2.0000000000000003e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0357172 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0025  AAA ATPase central domain protein  51.11 
 
 		 443 aa  171  1e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0172  ATPase central domain-containing protein  44.04 
 
 		 387 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3168  ATPase central domain-containing protein  40.11 
 
 		 434 aa  130  1.0000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0578626  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0972  AAA family ATPase  34.29 
 
 		 743 aa  125  5e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1499  AAA ATPase central domain protein  36.57 
 
 		 744 aa  123  3e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4356  hypothetical protein  36.36 
 
 		 652 aa  122  6e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00948823  normal  0.0832553 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2258  AAA ATPase central domain protein  34.03 
 
 		 680 aa  122  6e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.226213  hitchhiker  0.00277333 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0659  AAA ATPase central domain protein  40.12 
 
 		 442 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0372478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3136  AAA ATPase, central region  37.36 
 
 		 478 aa  119  3e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0755  AAA ATPase central domain protein  34.66 
 
 		 725 aa  118  9e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1734  AAA ATPase central domain protein  34.29 
 
 		 697 aa  117  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.168086 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1049  elongation factor P  37.28 
 
 		 432 aa  117  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1822  ATPase central domain-containing protein  33.73 
 
 		 622 aa  115  5e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1879  AAA ATPase  34.29 
 
 		 787 aa  115  6e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1669  AAA ATPase central domain protein  35.64 
 
 		 450 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2559  AAA ATPase central domain protein  35.64 
 
 		 450 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.585202  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1943  AAA ATPase central domain protein  33.33 
 
 		 619 aa  113  3e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00697304  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1893  AAA ATPase central domain protein  37.14 
 
 		 698 aa  113  3e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00103439  normal  0.0680609 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0362  ATPase central domain-containing protein  35.88 
 
 		 448 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1952  AAA ATPase central domain protein  32.32 
 
 		 656 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.248161 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0827  AAA ATPase, central region  33.52 
 
 		 697 aa  109  3e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.934037  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2455  putative ATPase  35.59 
 
 		 441 aa  108  5e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0571186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4150  AAA ATPase central domain protein  33.71 
 
 		 665 aa  108  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2933  AAA ATPase central domain protein  35.71 
 
 		 689 aa  108  6e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1651  ATPase central domain-containing protein  32.54 
 
 		 653 aa  106  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0496762 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2830  ATPase central domain-containing protein  32 
 
 		 657 aa  107  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5393  AAA ATPase central domain protein  37.29 
 
 		 682 aa  106  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2524  AAA ATPase central domain protein  33.33 
 
 		 656 aa  106  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4397  AAA ATPase central domain protein  35.43 
 
 		 687 aa  105  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5978  AAA ATPase central domain protein  34.55 
 
 		 1085 aa  106  4e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0938  ATPase central domain-containing protein  35.43 
 
 		 671 aa  105  7e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0137  AAA ATPase central domain protein  34.2 
 
 		 577 aa  104  1e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3811  ATPase central domain-containing protein  36.21 
 
 		 788 aa  104  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.308842 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1500  AAA ATPase central domain protein  32.52 
 
 		 639 aa  103  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2996  AAA ATPase, central region  35.63 
 
 		 478 aa  103  3e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4120  AAA ATPase central domain protein  36.9 
 
 		 466 aa  102  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0052109  hitchhiker  0.000242019 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3602  AAA ATPase, central region  32.75 
 
 		 448 aa  101  8e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000057004 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2559  AAA ATPase  36.05 
 
 		 444 aa  100  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000494228 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3934  AAA ATPase central domain protein  33.33 
 
 		 450 aa  99.8  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.158027  normal  0.185322 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0859  AAA ATPase  31.46 
 
 		 634 aa  99.4  4e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1667  ATPase, AAA family protein  31.51 
 
 		 569 aa  99.4  4e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3054  ATPase central domain-containing protein  39.34 
 
 		 725 aa  98.6  7e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000821112 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2009  AAA ATPase central domain protein  32.12 
 
 		 1193 aa  97.8  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1833  AAA ATPase  30.33 
 
 		 578 aa  97.1  2e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.735306  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1753  ATPase central domain-containing protein  32.94 
 
 		 450 aa  95.9  4e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.215663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1020  AAA ATPase central domain protein  31.93 
 
 		 646 aa  94.4  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5257  AAA ATPase central domain protein  34.62 
 
 		 749 aa  93.6  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1774  cysteine synthase A  31.43 
 
 		 580 aa  93.6  2e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0393214  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1819  ATPase central domain-containing protein  26.84 
 
 		 662 aa  93.2  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.760352  normal  0.277502 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0165  AAA ATPase, central region  41.48 
 
 		 672 aa  89  5e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5237  AAA ATPase central domain protein  33.57 
 
 		 459 aa  88.2  9e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.368199  hitchhiker  0.00000000902621 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0165  putative ATPase protein  39.68 
 
 		 772 aa  87  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1549  ATPase, AAA family protein  31.69 
 
 		 570 aa  86.7  3e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.974713  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1133  AAA ATPase, central region  40 
 
 		 445 aa  86.7  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0401  ATPase, AAA family protein  31.18 
 
 		 570 aa  85.1  8e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0150  AAA ATPase central domain protein  37.76 
 
 		 775 aa  84.7  9e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.172395  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0426  ATPase, AAA family protein  31.35 
 
 		 570 aa  84.7  0.000000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1579  ATPase, AAA family protein  31.35 
 
 		 570 aa  84.3  0.000000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1961  putative ATPase protein  38.46 
 
 		 771 aa  84.3  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.242778  normal  0.909939 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1791  AAA ATPase central domain protein  38.17 
 
 		 773 aa  84  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.615211 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2115  AAA ATPase central domain protein  38.17 
 
 		 773 aa  84  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00930684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0747  AAA ATPase central domain protein  30.53 
 
 		 335 aa  84  0.000000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.425262  normal  0.978944 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2275  AAA ATPase, central region  38.93 
 
 		 771 aa  83.2  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0746104  hitchhiker  0.00641076 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0166  AAA ATPase, central region  37.21 
 
 		 789 aa  82.4  0.000000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0086  ATPase  27.78 
 
 		 335 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.244566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3852  AAA ATPase central domain protein  29.41 
 
 		 335 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3321  AAA family ATPase  34.25 
 
 		 326 aa  81.6  0.000000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.81305  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2234  AAA ATPase, central region  37.69 
 
 		 766 aa  81.6  0.000000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.218503  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01000  endopeptidase, putative  38.81 
 
 		 407 aa  81.6  0.00000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.174287  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3267  ATPase central domain-containing protein  36.43 
 
 		 795 aa  80.9  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.115516 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03020  endopeptidase, putative  35.9 
 
 		 438 aa  80.1  0.00000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0528314  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1677  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  36.25 
 
 		 736 aa  79.7  0.00000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1561  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.33 
 
 		 808 aa  79.3  0.00000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_75017  protease subunit component  37.24 
 
 		 446 aa  79.7  0.00000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0564069 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02917  hypothetical protein similar to 26S proteasome regulatory subunit (Broad)  37.59 
 
 		 443 aa  79  0.00000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.137848 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0097  ATPase central domain-containing protein  29.63 
 
 		 338 aa  79  0.00000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.622643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0112  ATPase central domain-containing protein  33.57 
 
 		 789 aa  78.6  0.00000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.181464 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3668  AAA ATPase central domain protein  37.6 
 
 		 134 aa  78.6  0.00000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_66830  26S proteasome regulatory subunit  36.42 
 
 		 410 aa  77.8  0.0000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.0000427133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1124  beta-lactamase domain-containing protein  34.83 
 
 		 810 aa  78.2  0.0000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35070  predicted protein  34.68 
 
 		 417 aa  77.8  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0746786  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02904  proteasome regulatory particle subunit Rpt3, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G11390)  36.36 
 
 		 422 aa  77  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.211289 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03930  endopeptidase, putative  38.46 
 
 		 414 aa  77  0.0000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0534334  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3109  putative ATPase  31.64 
 
 		 366 aa  77.4  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.351146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1864  AAA ATPase central domain protein  28.65 
 
 		 678 aa  77  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5232  AAA ATPase, central region  37.4 
 
 		 688 aa  76.6  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.000000286955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0449  AAA ATPase, central region  32.75 
 
 		 335 aa  76.3  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0920  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  37.74 
 
 		 723 aa  76.3  0.0000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2822  AAA ATPase central domain protein  35.23 
 
 		 239 aa  76.3  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11735  predicted protein  36.31 
 
 		 389 aa  76.3  0.0000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2659  AAA ATPase central domain protein  31.07 
 
 		 322 aa  75.9  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000788626  hitchhiker  0.00386241 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4244  AAA ATPase, central region  33.08 
 
 		 686 aa  75.9  0.0000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000108013 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03550  endopeptidase, putative  35.14 
 
 		 450 aa  75.5  0.0000000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.502719  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0908  cell division control protein 48  37.33 
 
 		 754 aa  75.5  0.0000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.247323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0817  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  38.36 
 
 		 801 aa  75.1  0.0000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.251181 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1548  AAA ATPase, central region  35.88 
 
 		 688 aa  74.7  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000910509  normal  0.627937 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>