More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1627 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_1627  PfkB domain protein  100 
 
 
309 aa  626  1e-178  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.100578  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7068  PfkB  73.74 
 
 
297 aa  455  1e-127  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2385  PfkB domain-containing protein  73.06 
 
 
297 aa  431  1e-120  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.790997  normal  0.420761 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2129  putative sugar kinase  67.68 
 
 
298 aa  408  1e-113  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.101939  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3300  PfkB domain protein  65.99 
 
 
314 aa  397  1e-109  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.369715  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1755  PfkB domain protein  47.8 
 
 
304 aa  246  4e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0491  PfkB  47.26 
 
 
303 aa  227  2e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1470  ribokinase-like domain-containing protein  49.15 
 
 
298 aa  211  2e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1435  ribokinase-like domain-containing protein  46.94 
 
 
293 aa  208  1e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000559808 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1498  PfkB domain protein  44.59 
 
 
300 aa  196  4.0000000000000005e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3778  PfkB domain protein  46.62 
 
 
297 aa  191  1e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00891877  normal  0.801682 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24440  sugar kinase, ribokinase  43.27 
 
 
288 aa  172  6.999999999999999e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.480444  normal  0.238886 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6402  kinase, PfkB family  38.31 
 
 
316 aa  167  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.223985  normal  0.0576873 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0735  PfkB domain-containing protein  36.45 
 
 
317 aa  166  5e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.263465  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3558  PfkB domain protein  44.22 
 
 
287 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.321996  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2148  PfkB domain-containing protein  42.03 
 
 
312 aa  151  1e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.950763  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0416  PfkB  36.49 
 
 
320 aa  150  3e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2001  PfkB domain protein  33.9 
 
 
321 aa  139  6e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1580  ribokinase-like domain-containing protein  32.25 
 
 
309 aa  133  3e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0863941  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0562  PfkB domain protein  30.15 
 
 
328 aa  108  1e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3532  ribokinase-like domain-containing protein  33.33 
 
 
337 aa  106  4e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321565  normal  0.851243 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0151  PfkB  35.36 
 
 
331 aa  104  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05691  carbohydrate kinase  28.68 
 
 
338 aa  103  5e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0990225  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2872  PfkB  29.17 
 
 
332 aa  102  6e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.626247 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5108  PfkB domain protein  31.52 
 
 
337 aa  100  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.905931 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4645  ribokinase-like domain-containing protein  31.52 
 
 
337 aa  100  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0149  PfkB  31.99 
 
 
407 aa  99.8  5e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.029935  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1307  PfkB domain protein  31.37 
 
 
338 aa  100  5e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.887451  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5186  PfkB domain protein  32.25 
 
 
337 aa  99.8  6e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.430634  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0041  ribokinase-like domain-containing protein  34.47 
 
 
304 aa  97.4  2e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1170  PfkB domain-containing protein  29.15 
 
 
305 aa  96.7  5e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0154398  normal  0.362053 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1165  PfkB domain protein  29.87 
 
 
335 aa  95.5  9e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.188666 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0316  pfkB family carbohydrate kinase  28.14 
 
 
330 aa  94.7  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.930013  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0200  ribokinase  29.11 
 
 
313 aa  94.7  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.933367 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1260  PfkB domain protein  32.47 
 
 
331 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1639  ribokinase-like domain-containing protein  32.84 
 
 
331 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.487738  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2565  ribokinase-like domain-containing protein  31.58 
 
 
333 aa  94  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.650274  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1228  ribokinase-like domain-containing protein  31.73 
 
 
337 aa  92.4  9e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2477  ribokinase-like domain-containing protein  28.76 
 
 
307 aa  92  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0121  ribokinase-like domain-containing protein  29.62 
 
 
328 aa  91.3  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.02163  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3284  ribokinase-like domain-containing protein  30.53 
 
 
330 aa  91.3  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000189129  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05621  carbohydrate kinase  26.97 
 
 
333 aa  90.5  3e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3378  ribokinase-like domain-containing protein  28.73 
 
 
330 aa  90.1  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.463525  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0220  ribokinase  32.04 
 
 
305 aa  89.4  7e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.328501  normal  0.180212 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2615  PfkB domain protein  30.17 
 
 
305 aa  89.4  8e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1278  PfkB domain-containing protein  33.82 
 
 
317 aa  89  9e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.399616 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05321  carbohydrate kinase  26.97 
 
 
333 aa  88.6  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0559209  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1088  PfkB domain protein  27.01 
 
 
315 aa  88.2  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.332998  normal  0.446333 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  31.82 
 
 
329 aa  87.4  3e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7361  ribokinase  29.58 
 
 
308 aa  87  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3232  ribokinase  31.58 
 
 
302 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.493529  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2200  PfkB  26.79 
 
 
339 aa  85.9  8e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000468276  decreased coverage  0.00888496 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0036  pfkB family carbohydrate kinase  30.71 
 
 
333 aa  85.5  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564268  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2458  ribokinase  31.68 
 
 
302 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2905  aminoimidazole riboside kinase  31.8 
 
 
306 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00998461  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0506  carbohydrate kinase-like  26.52 
 
 
334 aa  85.5  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5056  PfkB domain protein  33.85 
 
 
320 aa  84.7  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2704  PfkB domain protein  31.38 
 
 
317 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1142  PfkB  29.24 
 
 
310 aa  84.3  0.000000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0676537  normal  0.093061 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2019  aminoimidazole riboside kinase  28.88 
 
 
298 aa  83.2  0.000000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0270358  normal  0.162694 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2234  PfkB domain protein  28.83 
 
 
319 aa  83.2  0.000000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3488  ribokinase  31.48 
 
 
302 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232463  normal  0.188896 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05631  carbohydrate kinase  28.46 
 
 
335 aa  82.8  0.000000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.577343 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2461  ribokinase-like domain-containing protein  32.61 
 
 
316 aa  82.8  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281644  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3592  PfkB domain protein  33.19 
 
 
311 aa  82.4  0.000000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0720957  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1838  carbohydrate kinase  28.08 
 
 
335 aa  82.4  0.000000000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1117  ribokinase-like domain-containing protein  30.83 
 
 
305 aa  82.4  0.000000000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.145837 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2278  PfkB domain protein  30.03 
 
 
327 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.741137  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0147  ribokinase-like domain-containing protein  30.13 
 
 
318 aa  81.6  0.00000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.719935  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4087  PfkB domain protein  28.14 
 
 
330 aa  80.9  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0215  ribokinase-like domain-containing protein  30.6 
 
 
333 aa  80.9  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.26013  normal  0.0979989 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1980  sugar (2-ketogluconate) kinase  30.48 
 
 
327 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0210202 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2022  ribokinase-like domain-containing protein  32.06 
 
 
330 aa  81.3  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1845  ribokinase-like domain-containing protein  26.12 
 
 
341 aa  80.9  0.00000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000273033  unclonable  0.000000000472438 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2146  fructokinase protein  28.67 
 
 
318 aa  80.5  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00000404752  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  30.94 
 
 
302 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0059  ribokinase-like domain-containing protein  28.86 
 
 
319 aa  80.5  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0055  ribokinase-like domain-containing protein  28.94 
 
 
334 aa  80.1  0.00000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.747338  normal  0.368725 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1980  ribokinase  28.85 
 
 
302 aa  80.1  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3284  PfkB  26.3 
 
 
336 aa  80.5  0.00000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.469583  normal  0.0441315 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4013  ribokinase-like domain-containing protein  30.63 
 
 
315 aa  79.7  0.00000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2568  ribokinase-like domain-containing protein  32.69 
 
 
333 aa  79.7  0.00000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3378  PfkB domain protein  30.84 
 
 
316 aa  79.3  0.00000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0607501 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3696  ribokinase-like domain-containing protein  31.33 
 
 
301 aa  79.3  0.00000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.657474  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1094  ribokinase-like domain-containing protein  31.77 
 
 
296 aa  79.3  0.00000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.495819  normal  0.168418 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0078  ribokinase-like domain-containing protein  32.08 
 
 
302 aa  79.3  0.00000000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2283  ribokinase  28.08 
 
 
310 aa  79  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.269259 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1706  PfkB domain protein  26.37 
 
 
319 aa  79  0.00000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1910  carbohydrate kinase  26.81 
 
 
339 aa  78.6  0.0000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.0000000000000704659  hitchhiker  0.00127543 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03203  Sugar kinase, ribokinase family protein  28.12 
 
 
327 aa  79  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00908389  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0218  PfkB  30.58 
 
 
333 aa  78.6  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0351  aminoimidazole riboside kinase  28.41 
 
 
307 aa  78.6  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.735787  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0494  PfkB domain protein  28.18 
 
 
360 aa  77.8  0.0000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.441156  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2380  ribokinase-like domain-containing protein  30.84 
 
 
316 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3707  ribokinase-like domain-containing protein  26.76 
 
 
319 aa  77.8  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.973516 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4407  PfkB domain protein  27 
 
 
330 aa  77.8  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2067  ribokinase-like domain-containing protein  32.03 
 
 
324 aa  77.4  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0314864  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3559  ribokinase-like domain-containing protein  28.43 
 
 
340 aa  77.8  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0010  PfkB  30.47 
 
 
333 aa  76.6  0.0000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00317456  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1084  PfkB domain protein  26.15 
 
 
327 aa  77  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>