More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0215 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_0215  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 		 333 aa  671    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.26013  normal  0.0979989 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1165  PfkB domain protein  68.67 
 
 		 335 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.188666 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0218  PfkB  65.65 
 
 		 333 aa  419  1e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0036  pfkB family carbohydrate kinase  60.73 
 
 		 333 aa  417  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564268  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1260  PfkB domain protein  62.95 
 
 		 331 aa  412  1e-114  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1639  ribokinase-like domain-containing protein  62.05 
 
 		 331 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.487738  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2565  ribokinase-like domain-containing protein  62.24 
 
 		 333 aa  407  1.0000000000000001e-112  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.650274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0010  PfkB  64.05 
 
 		 333 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00317456  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5186  PfkB domain protein  60.66 
 
 		 337 aa  398  9.999999999999999e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.430634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0457  PfkB  60.12 
 
 		 333 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0251  PfkB  61.03 
 
 		 333 aa  396  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4645  ribokinase-like domain-containing protein  60.06 
 
 		 337 aa  397  1e-109  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5108  PfkB domain protein  60.06 
 
 		 337 aa  397  1e-109  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.905931 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3532  ribokinase-like domain-containing protein  60.53 
 
 		 337 aa  394  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321565  normal  0.851243 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0461  PfkB domain protein  61.33 
 
 		 333 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0581  PfkB  62.24 
 
 		 333 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.189374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0162  carbohydrate kinase  54.43 
 
 		 330 aa  356  3.9999999999999996e-97  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.98466  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0169  carbohydrate kinase  54.43 
 
 		 330 aa  356  3.9999999999999996e-97  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0149  PfkB  55.8 
 
 		 407 aa  347  2e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.029935  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0178  ribokinase-like domain-containing protein  53.05 
 
 		 331 aa  347  2e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.613115  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1228  ribokinase-like domain-containing protein  53.66 
 
 		 337 aa  342  4e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4021  PfkB  50.15 
 
 		 330 aa  329  4e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.737193  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0121  ribokinase-like domain-containing protein  53.07 
 
 		 328 aa  329  4e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.02163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07411  carbohydrate kinase  51.23 
 
 		 342 aa  321  9.999999999999999e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2872  PfkB  50.16 
 
 		 332 aa  311  1e-83  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.626247 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0316  pfkB family carbohydrate kinase  46.93 
 
 		 330 aa  308  9e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.930013  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2989  ribokinase-like domain-containing protein  50.15 
 
 		 338 aa  306  5.0000000000000004e-82  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3378  ribokinase-like domain-containing protein  49.23 
 
 		 330 aa  301  1e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.463525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5046  ribokinase-like domain-containing protein  50.77 
 
 		 329 aa  301  1e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151131 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4407  PfkB domain protein  46.63 
 
 		 330 aa  297  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4087  PfkB domain protein  46.32 
 
 		 330 aa  295  7e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05631  carbohydrate kinase  46.11 
 
 		 335 aa  294  1e-78  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.577343 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1838  carbohydrate kinase  45.48 
 
 		 335 aa  293  4e-78  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0690  carbohydrate kinase PfkB family  48.31 
 
 		 338 aa  291  1e-77  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0151  PfkB  49.24 
 
 		 331 aa  287  2e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05061  carbohydrate kinase  45 
 
 		 348 aa  286  2.9999999999999996e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0313242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1030  pfkB family carbohydrate kinase  48.93 
 
 		 330 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.577037  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2691  ribokinase-like domain-containing protein  48.93 
 
 		 330 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.272607  normal  0.270933 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1307  PfkB domain protein  49.23 
 
 		 338 aa  283  3.0000000000000004e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.887451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1668  carbohydrate kinase PfkB family  49.22 
 
 		 337 aa  283  4.0000000000000003e-75  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0198  ribokinase-like domain-containing protein  49.7 
 
 		 330 aa  281  9e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2022  ribokinase-like domain-containing protein  50.63 
 
 		 330 aa  275  1.0000000000000001e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05691  carbohydrate kinase  40.49 
 
 		 338 aa  272  6e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0990225  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0506  carbohydrate kinase-like  41.18 
 
 		 334 aa  271  1e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05621  carbohydrate kinase  40.06 
 
 		 333 aa  261  2e-68  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05321  carbohydrate kinase  40.37 
 
 		 333 aa  259  6e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0559209  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2452  PfkB  42.3 
 
 		 330 aa  251  1e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.826037  normal  0.155331 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1671  PfkB  39.7 
 
 		 331 aa  227  2e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.276087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2568  ribokinase-like domain-containing protein  43.12 
 
 		 333 aa  220  1.9999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3022  PfkB domain protein  42.54 
 
 		 333 aa  220  3e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.523599  normal  0.417909 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2872  ribokinase-like domain-containing protein  37.57 
 
 		 335 aa  206  4e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.417432 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3284  PfkB  35.78 
 
 		 336 aa  197  2.0000000000000003e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.469583  normal  0.0441315 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1084  PfkB domain protein  36.31 
 
 		 327 aa  183  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1113  PfkB domain protein  36.31 
 
 		 327 aa  182  6e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.941643 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3284  ribokinase-like domain-containing protein  35.33 
 
 		 330 aa  178  1e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000189129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1494  PfkB domain protein  36.04 
 
 		 331 aa  176  5e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0243607  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0562  PfkB domain protein  34.39 
 
 		 328 aa  171  1e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0819  cell division protein FtsA  34.91 
 
 		 328 aa  171  2e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000392808  normal  0.759534 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2764  PfkB  35.22 
 
 		 370 aa  166  5e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.040802  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0494  PfkB domain protein  33.75 
 
 		 360 aa  151  1e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.441156  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2200  PfkB  31.99 
 
 		 339 aa  147  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000468276  decreased coverage  0.00888496 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2854  ribokinase-like domain-containing protein  34.71 
 
 		 328 aa  145  1e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000011716  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1910  carbohydrate kinase  31.14 
 
 		 339 aa  144  2e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.0000000000000704659  hitchhiker  0.00127543 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1845  ribokinase-like domain-containing protein  31.19 
 
 		 341 aa  140  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000273033  unclonable  0.000000000472438 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0055  ribokinase-like domain-containing protein  31.86 
 
 		 334 aa  134  1.9999999999999998e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.747338  normal  0.368725 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0735  PfkB domain-containing protein  31.58 
 
 		 317 aa  108  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.263465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1498  PfkB domain protein  32.65 
 
 		 300 aa  100  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7068  PfkB  30.97 
 
 		 297 aa  95.9  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1117  ribokinase-like domain-containing protein  31.82 
 
 		 305 aa  95.1  2e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.145837 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50659  predicted protein  26.55 
 
 		 347 aa  90.9  2e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1755  PfkB domain protein  28 
 
 		 304 aa  86.7  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_18364  predicted protein  29.22 
 
 		 273 aa  86.7  5e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.132458 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24440  sugar kinase, ribokinase  32.35 
 
 		 288 aa  85.9  9e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.480444  normal  0.238886 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2385  PfkB domain-containing protein  30.22 
 
 		 297 aa  84.7  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.790997  normal  0.420761 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0416  PfkB  29.02 
 
 		 320 aa  83.2  0.000000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2129  putative sugar kinase  29.52 
 
 		 298 aa  82.4  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.101939  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0070  ribokinase-like domain-containing protein  31.82 
 
 		 305 aa  82.4  0.00000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.60231  normal  0.104072 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0491  PfkB  31.32 
 
 		 303 aa  82.4  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1736  PfkB domain protein  28.11 
 
 		 304 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1649  ribokinase-like domain-containing protein  30.53 
 
 		 308 aa  80.5  0.00000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0416676  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_51242  predicted protein  27.81 
 
 		 342 aa  79.7  0.00000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.215587  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1627  PfkB domain protein  30.6 
 
 		 309 aa  79.7  0.00000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.100578  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0041  ribokinase-like domain-containing protein  29.59 
 
 		 304 aa  79.3  0.00000000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2615  PfkB domain protein  27.2 
 
 		 305 aa  78.2  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2001  PfkB domain protein  28.1 
 
 		 321 aa  78.2  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2287  PfkB domain protein  30.74 
 
 		 313 aa  77.8  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3300  PfkB domain protein  27.72 
 
 		 314 aa  77  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.369715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1580  ribokinase-like domain-containing protein  30.82 
 
 		 309 aa  76.3  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0863941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2483  PfkB domain protein  28.11 
 
 		 302 aa  75.9  0.0000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1170  PfkB domain-containing protein  26.44 
 
 		 305 aa  75.1  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0154398  normal  0.362053 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0902  PfkB domain protein  29.32 
 
 		 309 aa  75.9  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2413  PfkB domain protein  26.37 
 
 		 642 aa  74.7  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5895  sugar kinase, putative  28.3 
 
 		 304 aa  73.6  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.760771  normal  0.0122717 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  29.04 
 
 		 329 aa  72.4  0.000000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6402  kinase, PfkB family  28.72 
 
 		 316 aa  72  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.223985  normal  0.0576873 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0329  ribokinase-like domain-containing protein  27.27 
 
 		 308 aa  72.4  0.00000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.810022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1317  inosine kinase  32.16 
 
 		 434 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.110891  normal  0.220477 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0078  ribokinase-like domain-containing protein  30 
 
 		 302 aa  71.6  0.00000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1626  PfkB domain protein  29.85 
 
 		 319 aa  70.9  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.124685  normal  0.814532 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4640  ribokinase  32.03 
 
 		 305 aa  70.5  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.162899  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>