More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_51242 on replicon NC_011693
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011693  PHATRDRAFT_51242  predicted protein  100 
 
 
342 aa  701    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.215587  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50659  predicted protein  54.41 
 
 
347 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57331  adenosine kinase  45.99 
 
 
350 aa  285  8e-76  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.066494 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02272  adenosine kinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06390)  43.71 
 
 
352 aa  260  2e-68  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0154807  normal 
 
 
-
 
NC_006683  CNN02130  adenosine kinase, putative  38.57 
 
 
357 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.339104  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3284  PfkB  26.71 
 
 
336 aa  94.4  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.469583  normal  0.0441315 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05691  carbohydrate kinase  26.28 
 
 
338 aa  93.2  6e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0990225  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1228  ribokinase-like domain-containing protein  27.67 
 
 
337 aa  85.1  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05321  carbohydrate kinase  26.24 
 
 
333 aa  80.5  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0559209  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  28.63 
 
 
308 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0215  ribokinase-like domain-containing protein  27.81 
 
 
333 aa  80.5  0.00000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.26013  normal  0.0979989 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05621  carbohydrate kinase  25.66 
 
 
333 aa  80.5  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0169  carbohydrate kinase  28.02 
 
 
330 aa  79.7  0.00000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0162  carbohydrate kinase  28.02 
 
 
330 aa  79.7  0.00000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.98466  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  28.74 
 
 
308 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0819  cell division protein FtsA  28.95 
 
 
328 aa  78.2  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000392808  normal  0.759534 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0178  ribokinase-like domain-containing protein  27.24 
 
 
331 aa  76.6  0.0000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.613115  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1307  PfkB domain protein  25.37 
 
 
338 aa  76.6  0.0000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.887451  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2872  PfkB  25.6 
 
 
332 aa  76.6  0.0000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.626247 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0036  pfkB family carbohydrate kinase  26.89 
 
 
333 aa  76.3  0.0000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564268  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0316  pfkB family carbohydrate kinase  25.74 
 
 
330 aa  73.9  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.930013  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4407  PfkB domain protein  25.07 
 
 
330 aa  73.6  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3284  ribokinase-like domain-containing protein  26.37 
 
 
330 aa  72.8  0.000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000189129  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1084  PfkB domain protein  25.52 
 
 
327 aa  72.8  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0200  ribokinase  25.94 
 
 
313 aa  72.8  0.000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.933367 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1113  PfkB domain protein  25.52 
 
 
327 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.941643 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2022  ribokinase-like domain-containing protein  27.3 
 
 
330 aa  71.6  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1494  PfkB domain protein  26.57 
 
 
331 aa  71.6  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0243607  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0218  PfkB  24.6 
 
 
333 aa  71.6  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0506  carbohydrate kinase-like  24.41 
 
 
334 aa  71.6  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5046  ribokinase-like domain-containing protein  25.52 
 
 
329 aa  72  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.151131 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1165  PfkB domain protein  25 
 
 
335 aa  70.5  0.00000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.188666 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4640  ribokinase  26.95 
 
 
305 aa  70.5  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.162899  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0457  PfkB  25.68 
 
 
333 aa  70.1  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0251  PfkB  25.65 
 
 
333 aa  69.3  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214496  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4087  PfkB domain protein  24.42 
 
 
330 aa  68.9  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1260  PfkB domain protein  25.9 
 
 
331 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0562  PfkB domain protein  25.23 
 
 
328 aa  67.8  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1402  ribokinase  26.45 
 
 
318 aa  67.8  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0972031 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1639  ribokinase-like domain-containing protein  26.79 
 
 
331 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.487738  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1838  carbohydrate kinase  25.38 
 
 
335 aa  67  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0149  PfkB  25.45 
 
 
407 aa  67  0.0000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.029935  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07411  carbohydrate kinase  24.63 
 
 
342 aa  67  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0220  ribokinase  25.99 
 
 
305 aa  66.6  0.0000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.328501  normal  0.180212 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  27.18 
 
 
308 aa  66.6  0.0000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0581  PfkB  25.24 
 
 
333 aa  66.6  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.189374  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2452  PfkB  23.87 
 
 
330 aa  65.9  0.0000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.826037  normal  0.155331 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2565  ribokinase-like domain-containing protein  26.43 
 
 
333 aa  65.5  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.650274  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2764  PfkB  26.71 
 
 
370 aa  65.5  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.040802  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2057  PfkB family kinase  24.29 
 
 
315 aa  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.124987  normal  0.010035 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05631  carbohydrate kinase  25.3 
 
 
335 aa  65.5  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.577343 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0494  PfkB domain protein  24.02 
 
 
360 aa  65.1  0.000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.441156  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4749  ribokinase  24.17 
 
 
309 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1233  ribokinase  26.97 
 
 
309 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.567948  normal  0.0906963 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3217  PfkB domain protein  24.91 
 
 
312 aa  65.1  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  29.09 
 
 
305 aa  64.7  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1507  ribokinase  22.85 
 
 
308 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3532  ribokinase-like domain-containing protein  25.86 
 
 
337 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321565  normal  0.851243 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0010  PfkB  23.96 
 
 
333 aa  63.9  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00317456  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1383  ribokinase  26.23 
 
 
309 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1845  ribokinase-like domain-containing protein  24.41 
 
 
341 aa  63.5  0.000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000273033  unclonable  0.000000000472438 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2568  ribokinase-like domain-containing protein  26.37 
 
 
333 aa  63.5  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2001  PfkB domain protein  28.72 
 
 
321 aa  63.2  0.000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4021  PfkB  24.26 
 
 
330 aa  62.8  0.000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.737193  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0053  PfkB domain protein  27.66 
 
 
299 aa  62.8  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0373513 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  26.48 
 
 
306 aa  62  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1856  PfkB family kinase  24.37 
 
 
315 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0158072  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1526  ribokinase  22.52 
 
 
308 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395922  normal  0.909431 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0518  ribokinase  26.8 
 
 
307 aa  62  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1130  ribokinase  25.41 
 
 
311 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0225  ribokinase  28.09 
 
 
317 aa  61.6  0.00000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1343  ribokinase  26.14 
 
 
309 aa  62  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5108  PfkB domain protein  25 
 
 
337 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.905931 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1610  ribokinase  25.41 
 
 
311 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.231434  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1860  ribokinase-like domain-containing protein  23.97 
 
 
315 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.335723  decreased coverage  0.00000390561 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4645  ribokinase-like domain-containing protein  25 
 
 
337 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1419  PfkB family kinase  23.66 
 
 
315 aa  61.2  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.997387  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0576  putative ribokinase  26.8 
 
 
312 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.588326 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01741  predicted kinase  23.66 
 
 
315 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1870  PfkB domain protein  23.66 
 
 
315 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0114143  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1996  PfkB family kinase  23.66 
 
 
315 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01729  hypothetical protein  23.66 
 
 
315 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6187  ribokinase  27.6 
 
 
299 aa  60.5  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.313469  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1587  ribokinase  25.41 
 
 
311 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.338475  normal  0.646425 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4160  ribokinase  26.47 
 
 
310 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5186  PfkB domain protein  25 
 
 
337 aa  60.5  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.430634  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2200  PfkB  23.38 
 
 
339 aa  60.5  0.00000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000468276  decreased coverage  0.00888496 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0461  PfkB domain protein  23.62 
 
 
333 aa  60.1  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1910  carbohydrate kinase  23.86 
 
 
339 aa  59.3  0.00000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.0000000000000704659  hitchhiker  0.00127543 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1627  ribokinase  24.09 
 
 
310 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  26.07 
 
 
302 aa  59.3  0.00000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1011  ribokinase-like domain-containing protein  26.17 
 
 
398 aa  58.9  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0949  PfkB  27.27 
 
 
301 aa  58.9  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1603  ribokinase  26.05 
 
 
310 aa  58.9  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000677641  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2837  ribokinase  26.33 
 
 
302 aa  58.5  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2385  PfkB domain-containing protein  23.81 
 
 
297 aa  58.5  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.790997  normal  0.420761 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1124  ribokinase  27.89 
 
 
403 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3488  ribokinase  24.35 
 
 
302 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232463  normal  0.188896 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3132  ribokinase-like domain-containing protein  27.31 
 
 
308 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00509823 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2132  PfkB domain protein  26.64 
 
 
344 aa  57.8  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>