More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0198 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0198  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 		 330 aa  671    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1030  pfkB family carbohydrate kinase  87.88 
 
 		 330 aa  565  1e-160  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.577037  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2691  ribokinase-like domain-containing protein  87.88 
 
 		 330 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.272607  normal  0.270933 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0036  pfkB family carbohydrate kinase  51.68 
 
 		 333 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564268  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1228  ribokinase-like domain-containing protein  50.46 
 
 		 337 aa  311  1e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0457  PfkB  50.15 
 
 		 333 aa  306  3e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0251  PfkB  51.99 
 
 		 333 aa  305  8.000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2989  ribokinase-like domain-containing protein  51.21 
 
 		 338 aa  303  2.0000000000000002e-81  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0010  PfkB  52.29 
 
 		 333 aa  301  7.000000000000001e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00317456  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0218  PfkB  53.42 
 
 		 333 aa  300  2e-80  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1639  ribokinase-like domain-containing protein  51.08 
 
 		 331 aa  300  3e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.487738  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0461  PfkB domain protein  51.68 
 
 		 333 aa  298  1e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07411  carbohydrate kinase  47.09 
 
 		 342 aa  297  2e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0316  pfkB family carbohydrate kinase  49.23 
 
 		 330 aa  296  3e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.930013  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4407  PfkB domain protein  49.1 
 
 		 330 aa  296  4e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0151  PfkB  49.39 
 
 		 331 aa  296  5e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2872  PfkB  50.78 
 
 		 332 aa  295  5e-79  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.626247 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0581  PfkB  52.6 
 
 		 333 aa  294  2e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.189374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1260  PfkB domain protein  50.46 
 
 		 331 aa  293  2e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0169  carbohydrate kinase  46.99 
 
 		 330 aa  292  6e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1307  PfkB domain protein  47.81 
 
 		 338 aa  292  6e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.887451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0162  carbohydrate kinase  46.99 
 
 		 330 aa  292  6e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.98466  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5186  PfkB domain protein  47.77 
 
 		 337 aa  291  1e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.430634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0178  ribokinase-like domain-containing protein  47.69 
 
 		 331 aa  291  1e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.613115  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0121  ribokinase-like domain-containing protein  49.06 
 
 		 328 aa  290  2e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.02163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4087  PfkB domain protein  48.19 
 
 		 330 aa  290  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0149  PfkB  48.73 
 
 		 407 aa  288  1e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.029935  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0215  ribokinase-like domain-containing protein  49.7 
 
 		 333 aa  287  1e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.26013  normal  0.0979989 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3532  ribokinase-like domain-containing protein  49.7 
 
 		 337 aa  286  2e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321565  normal  0.851243 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5108  PfkB domain protein  46.59 
 
 		 337 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.905931 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4645  ribokinase-like domain-containing protein  46.59 
 
 		 337 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1165  PfkB domain protein  47.09 
 
 		 335 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.188666 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3378  ribokinase-like domain-containing protein  46.08 
 
 		 330 aa  281  8.000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.463525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2452  PfkB  44.38 
 
 		 330 aa  281  1e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.826037  normal  0.155331 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4021  PfkB  44.58 
 
 		 330 aa  281  1e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.737193  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2565  ribokinase-like domain-containing protein  48.63 
 
 		 333 aa  281  1e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.650274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5046  ribokinase-like domain-containing protein  46.93 
 
 		 329 aa  280  2e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151131 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1671  PfkB  44.07 
 
 		 331 aa  279  5e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.276087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1838  carbohydrate kinase  42.41 
 
 		 335 aa  278  1e-73  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05061  carbohydrate kinase  41.28 
 
 		 348 aa  277  2e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0313242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05631  carbohydrate kinase  42.41 
 
 		 335 aa  277  2e-73  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.577343 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0690  carbohydrate kinase PfkB family  46.27 
 
 		 338 aa  276  3e-73  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1668  carbohydrate kinase PfkB family  46.27 
 
 		 337 aa  274  1.0000000000000001e-72  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3022  PfkB domain protein  46.18 
 
 		 333 aa  272  6e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.523599  normal  0.417909 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2872  ribokinase-like domain-containing protein  44.94 
 
 		 335 aa  270  2e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.417432 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05691  carbohydrate kinase  34.86 
 
 		 338 aa  245  6.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0990225  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0506  carbohydrate kinase-like  36.22 
 
 		 334 aa  244  1.9999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05321  carbohydrate kinase  35.69 
 
 		 333 aa  243  3e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0559209  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05621  carbohydrate kinase  35.69 
 
 		 333 aa  243  3e-63  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2022  ribokinase-like domain-containing protein  43.99 
 
 		 330 aa  226  3e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2568  ribokinase-like domain-containing protein  43.56 
 
 		 333 aa  216  4e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0562  PfkB domain protein  38.49 
 
 		 328 aa  214  1.9999999999999998e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1084  PfkB domain protein  36.56 
 
 		 327 aa  207  3e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1113  PfkB domain protein  36.56 
 
 		 327 aa  206  5e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.941643 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1494  PfkB domain protein  37.74 
 
 		 331 aa  206  6e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0243607  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0819  cell division protein FtsA  39.01 
 
 		 328 aa  203  4e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000392808  normal  0.759534 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3284  ribokinase-like domain-containing protein  35.85 
 
 		 330 aa  198  7.999999999999999e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000189129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2764  PfkB  37.77 
 
 		 370 aa  192  5e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.040802  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3284  PfkB  32.7 
 
 		 336 aa  170  2e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.469583  normal  0.0441315 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2200  PfkB  31.25 
 
 		 339 aa  161  1e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000468276  decreased coverage  0.00888496 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1845  ribokinase-like domain-containing protein  32.01 
 
 		 341 aa  156  4e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000273033  unclonable  0.000000000472438 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1910  carbohydrate kinase  30.65 
 
 		 339 aa  155  1e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.0000000000000704659  hitchhiker  0.00127543 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0494  PfkB domain protein  32.1 
 
 		 360 aa  144  1e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.441156  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2854  ribokinase-like domain-containing protein  32.81 
 
 		 328 aa  142  6e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000011716  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0055  ribokinase-like domain-containing protein  31.03 
 
 		 334 aa  125  7e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.747338  normal  0.368725 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0491  PfkB  30.75 
 
 		 303 aa  90.1  5e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0735  PfkB domain-containing protein  30.51 
 
 		 317 aa  87  4e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.263465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_18364  predicted protein  31.06 
 
 		 273 aa  85.1  0.000000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.132458 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7068  PfkB  30.65 
 
 		 297 aa  84  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0902  PfkB domain protein  29.71 
 
 		 309 aa  83.6  0.000000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1755  PfkB domain protein  29.47 
 
 		 304 aa  79  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2001  PfkB domain protein  28.61 
 
 		 321 aa  78.2  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2647  aminoimidazole riboside kinase  28.19 
 
 		 304 aa  77  0.0000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1649  ribokinase-like domain-containing protein  27.59 
 
 		 308 aa  77  0.0000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0416676  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1736  PfkB domain protein  30 
 
 		 304 aa  76.3  0.0000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2019  aminoimidazole riboside kinase  29.44 
 
 		 298 aa  75.9  0.0000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0270358  normal  0.162694 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2905  aminoimidazole riboside kinase  27.76 
 
 		 306 aa  75.9  0.0000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00998461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3592  aminoimidazole riboside kinase  27.8 
 
 		 304 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000158875 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2461  ribokinase-like domain-containing protein  28.99 
 
 		 316 aa  75.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0077  PfkB  28 
 
 		 299 aa  75.5  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.273667  normal  0.451983 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000598  fructokinase  27.85 
 
 		 337 aa  73.9  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00217717  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3227  inosine kinase  25.29 
 
 		 432 aa  74.3  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00215137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0389  PfkB  26.46 
 
 		 323 aa  73.9  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.211683  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1117  ribokinase-like domain-containing protein  26.44 
 
 		 305 aa  73.9  0.000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.145837 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2923  carbohydrate kinase, PfkB  27.43 
 
 		 308 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.123757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0949  PfkB  28.52 
 
 		 301 aa  72.4  0.000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0416  PfkB  28.83 
 
 		 320 aa  72.4  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1498  PfkB domain protein  30.23 
 
 		 300 aa  70.9  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2483  PfkB domain protein  28.08 
 
 		 302 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1847  inosine-guanosine kinase  26.17 
 
 		 434 aa  70.5  0.00000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.324608  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2129  putative sugar kinase  30.22 
 
 		 298 aa  70.5  0.00000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.101939  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5056  PfkB domain protein  29.46 
 
 		 320 aa  70.1  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0967  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  23.79 
 
 		 300 aa  70.1  0.00000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0230959  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2903  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  25.19 
 
 		 299 aa  69.3  0.00000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.859362  hitchhiker  0.00094244 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0041  ribokinase-like domain-containing protein  28.22 
 
 		 304 aa  69.7  0.00000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0082  myo-inositol catabolism protein IolC  25.47 
 
 		 338 aa  69.3  0.00000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2287  PfkB domain protein  30.13 
 
 		 313 aa  69.3  0.00000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1627  PfkB domain protein  30.65 
 
 		 309 aa  68.9  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.100578  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1580  ribokinase-like domain-containing protein  29.14 
 
 		 309 aa  68.6  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0863941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0971  aminoimidazole riboside kinase  27 
 
 		 308 aa  67.8  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00309121  normal  0.0346902 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>