More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4087 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_4087  PfkB domain protein  100 
 
 		 330 aa  675    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4407  PfkB domain protein  96.36 
 
 		 330 aa  656    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0316  pfkB family carbohydrate kinase  79.39 
 
 		 330 aa  553  1e-156  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.930013  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3378  ribokinase-like domain-containing protein  76.67 
 
 		 330 aa  529  1e-149  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.463525  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0169  carbohydrate kinase  67.88 
 
 		 330 aa  461  1e-129  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0162  carbohydrate kinase  67.88 
 
 		 330 aa  461  1e-129  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.98466  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4021  PfkB  66.06 
 
 		 330 aa  453  1.0000000000000001e-126  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.737193  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0178  ribokinase-like domain-containing protein  66.77 
 
 		 331 aa  449  1e-125  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.613115  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1228  ribokinase-like domain-containing protein  56.7 
 
 		 337 aa  367  1e-100  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0457  PfkB  51.99 
 
 		 333 aa  349  4e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2565  ribokinase-like domain-containing protein  54.13 
 
 		 333 aa  341  1e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.650274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0251  PfkB  51.99 
 
 		 333 aa  339  2.9999999999999998e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1165  PfkB domain protein  51.68 
 
 		 335 aa  336  3.9999999999999995e-91  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.188666 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0036  pfkB family carbohydrate kinase  51.99 
 
 		 333 aa  332  4e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564268  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0121  ribokinase-like domain-containing protein  52.02 
 
 		 328 aa  332  6e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.02163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0461  PfkB domain protein  51.68 
 
 		 333 aa  331  8e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4645  ribokinase-like domain-containing protein  50.75 
 
 		 337 aa  330  3e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5108  PfkB domain protein  50.75 
 
 		 337 aa  330  3e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.905931 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0581  PfkB  51.68 
 
 		 333 aa  329  5.0000000000000004e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.189374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5186  PfkB domain protein  51.35 
 
 		 337 aa  328  6e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.430634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5046  ribokinase-like domain-containing protein  52.15 
 
 		 329 aa  327  1.0000000000000001e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151131 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07411  carbohydrate kinase  51.1 
 
 		 342 aa  327  1.0000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3532  ribokinase-like domain-containing protein  50.75 
 
 		 337 aa  324  2e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321565  normal  0.851243 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1260  PfkB domain protein  51.68 
 
 		 331 aa  323  3e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0010  PfkB  52.29 
 
 		 333 aa  320  1.9999999999999998e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00317456  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0218  PfkB  52.32 
 
 		 333 aa  319  5e-86  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1639  ribokinase-like domain-containing protein  50.46 
 
 		 331 aa  315  5e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.487738  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1668  carbohydrate kinase PfkB family  48.28 
 
 		 337 aa  308  6.999999999999999e-83  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0149  PfkB  47.87 
 
 		 407 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.029935  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0690  carbohydrate kinase PfkB family  47.83 
 
 		 338 aa  307  2.0000000000000002e-82  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05061  carbohydrate kinase  47.63 
 
 		 348 aa  306  3e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0313242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1307  PfkB domain protein  48.15 
 
 		 338 aa  303  2.0000000000000002e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.887451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2989  ribokinase-like domain-containing protein  50.15 
 
 		 338 aa  300  2e-80  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2872  PfkB  48.59 
 
 		 332 aa  296  4e-79  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.626247 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1838  carbohydrate kinase  44.48 
 
 		 335 aa  285  5e-76  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05631  carbohydrate kinase  44.48 
 
 		 335 aa  284  2.0000000000000002e-75  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.577343 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0215  ribokinase-like domain-containing protein  46.32 
 
 		 333 aa  281  7.000000000000001e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.26013  normal  0.0979989 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2022  ribokinase-like domain-containing protein  48.25 
 
 		 330 aa  281  1e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0151  PfkB  46.44 
 
 		 331 aa  279  6e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2691  ribokinase-like domain-containing protein  47.29 
 
 		 330 aa  276  4e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.272607  normal  0.270933 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1030  pfkB family carbohydrate kinase  46.99 
 
 		 330 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.577037  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0198  ribokinase-like domain-containing protein  48.19 
 
 		 330 aa  271  8.000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1671  PfkB  44.07 
 
 		 331 aa  265  5.999999999999999e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.276087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2452  PfkB  43.07 
 
 		 330 aa  263  4e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.826037  normal  0.155331 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05621  carbohydrate kinase  39.01 
 
 		 333 aa  260  2e-68  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05321  carbohydrate kinase  38.7 
 
 		 333 aa  259  4e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0559209  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0506  carbohydrate kinase-like  38.36 
 
 		 334 aa  256  4e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05691  carbohydrate kinase  37.58 
 
 		 338 aa  255  6e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0990225  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3022  PfkB domain protein  43.73 
 
 		 333 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.523599  normal  0.417909 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2872  ribokinase-like domain-containing protein  41.23 
 
 		 335 aa  232  6e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.417432 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0562  PfkB domain protein  39.62 
 
 		 328 aa  206  4e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2568  ribokinase-like domain-containing protein  39.39 
 
 		 333 aa  206  4e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3284  ribokinase-like domain-containing protein  34.17 
 
 		 330 aa  192  9e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000189129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1084  PfkB domain protein  34.06 
 
 		 327 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1113  PfkB domain protein  34.06 
 
 		 327 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.941643 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1494  PfkB domain protein  33.12 
 
 		 331 aa  176  4e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0243607  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0819  cell division protein FtsA  33.54 
 
 		 328 aa  167  2e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000392808  normal  0.759534 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2764  PfkB  36.25 
 
 		 370 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.040802  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3284  PfkB  30.58 
 
 		 336 aa  159  4e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.469583  normal  0.0441315 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2200  PfkB  31.89 
 
 		 339 aa  158  1e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000468276  decreased coverage  0.00888496 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1910  carbohydrate kinase  31.69 
 
 		 339 aa  155  8e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.0000000000000704659  hitchhiker  0.00127543 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0055  ribokinase-like domain-containing protein  31.76 
 
 		 334 aa  153  5e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.747338  normal  0.368725 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1845  ribokinase-like domain-containing protein  30.34 
 
 		 341 aa  146  4.0000000000000006e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000273033  unclonable  0.000000000472438 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0494  PfkB domain protein  33.23 
 
 		 360 aa  146  5e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.441156  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2854  ribokinase-like domain-containing protein  34.3 
 
 		 328 aa  144  3e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000011716  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0735  PfkB domain-containing protein  32.33 
 
 		 317 aa  105  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.263465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1117  ribokinase-like domain-containing protein  29.82 
 
 		 305 aa  100  3e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.145837 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0491  PfkB  28.26 
 
 		 303 aa  99.8  5e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0041  ribokinase-like domain-containing protein  31.85 
 
 		 304 aa  99  1e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7068  PfkB  29.96 
 
 		 297 aa  96.3  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1755  PfkB domain protein  29.06 
 
 		 304 aa  95.5  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2483  PfkB domain protein  28.16 
 
 		 302 aa  92.4  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0078  ribokinase-like domain-containing protein  31.72 
 
 		 302 aa  91.7  1e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1736  PfkB domain protein  27.22 
 
 		 304 aa  90.9  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_18364  predicted protein  33.04 
 
 		 273 aa  90.5  4e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.132458 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2001  PfkB domain protein  28.01 
 
 		 321 aa  85.9  8e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1498  PfkB domain protein  29.12 
 
 		 300 aa  84.7  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0660  ribokinase family sugar kinase  27.17 
 
 		 303 aa  85.1  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0298925  normal  0.606106 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0416  PfkB  27.16 
 
 		 320 aa  83.6  0.000000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01741  predicted kinase  24.68 
 
 		 315 aa  83.2  0.000000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1856  PfkB family kinase  24.37 
 
 		 315 aa  83.2  0.000000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0158072  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01729  hypothetical protein  24.68 
 
 		 315 aa  83.2  0.000000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3688  PfkB domain protein  24.84 
 
 		 317 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1860  ribokinase-like domain-containing protein  24.68 
 
 		 315 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.335723  decreased coverage  0.00000390561 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50659  predicted protein  25.75 
 
 		 347 aa  81.6  0.00000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1419  PfkB family kinase  24.37 
 
 		 315 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.997387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1649  ribokinase-like domain-containing protein  25.61 
 
 		 308 aa  82  0.00000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0416676  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1870  PfkB domain protein  24.37 
 
 		 315 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0114143  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2118  PfkB domain protein  29.6 
 
 		 307 aa  81.3  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1996  PfkB family kinase  24.37 
 
 		 315 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2496  kinase, pfkB family  24.13 
 
 		 310 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6402  kinase, PfkB family  28.96 
 
 		 316 aa  78.2  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.223985  normal  0.0576873 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02272  adenosine kinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06390)  27.19 
 
 		 352 aa  77  0.0000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0154807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1627  PfkB domain protein  27.19 
 
 		 309 aa  77  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.100578  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0970  carbohydrate kinase  26.71 
 
 		 314 aa  76.6  0.0000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01230  fructokinase  25.62 
 
 		 311 aa  77  0.0000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.826599  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0189  PfkB family carbohydrate kinase  25.96 
 
 		 339 aa  76.3  0.0000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0558  PfkB domain protein  26.67 
 
 		 295 aa  75.5  0.000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0949  PfkB  32.19 
 
 		 301 aa  75.1  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2057  PfkB family kinase  26.15 
 
 		 315 aa  74.7  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.124987  normal  0.010035 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>