More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2854 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2854  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 		 328 aa  666    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000011716  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0055  ribokinase-like domain-containing protein  39.87 
 
 		 334 aa  206  6e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.747338  normal  0.368725 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1228  ribokinase-like domain-containing protein  39.56 
 
 		 337 aa  184  2.0000000000000003e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05631  carbohydrate kinase  37.58 
 
 		 335 aa  181  1e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.577343 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1838  carbohydrate kinase  37.26 
 
 		 335 aa  179  4.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0149  PfkB  38.59 
 
 		 407 aa  178  1e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.029935  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05321  carbohydrate kinase  33.55 
 
 		 333 aa  176  6e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0559209  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05691  carbohydrate kinase  34.08 
 
 		 338 aa  175  9e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0990225  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05061  carbohydrate kinase  34.46 
 
 		 348 aa  172  6.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0313242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05621  carbohydrate kinase  32.9 
 
 		 333 aa  171  2e-41  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0690  carbohydrate kinase PfkB family  35.48 
 
 		 338 aa  169  5e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0506  carbohydrate kinase-like  33.33 
 
 		 334 aa  167  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1668  carbohydrate kinase PfkB family  35.81 
 
 		 337 aa  159  5e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0316  pfkB family carbohydrate kinase  34.39 
 
 		 330 aa  159  6e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.930013  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07411  carbohydrate kinase  33.86 
 
 		 342 aa  159  7e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0121  ribokinase-like domain-containing protein  36.45 
 
 		 328 aa  156  6e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.02163  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0562  PfkB domain protein  35.48 
 
 		 328 aa  154  1e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5046  ribokinase-like domain-containing protein  35.96 
 
 		 329 aa  153  4e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151131 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0178  ribokinase-like domain-containing protein  33.33 
 
 		 331 aa  152  5e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.613115  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0169  carbohydrate kinase  33.66 
 
 		 330 aa  152  5.9999999999999996e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0162  carbohydrate kinase  33.66 
 
 		 330 aa  152  5.9999999999999996e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.98466  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3378  ribokinase-like domain-containing protein  35.62 
 
 		 330 aa  150  3e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.463525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2872  PfkB  34.19 
 
 		 332 aa  150  4e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.626247 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4407  PfkB domain protein  34.95 
 
 		 330 aa  150  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1165  PfkB domain protein  34.29 
 
 		 335 aa  149  7e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.188666 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0457  PfkB  33.76 
 
 		 333 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3532  ribokinase-like domain-containing protein  36.31 
 
 		 337 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321565  normal  0.851243 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0151  PfkB  36.31 
 
 		 331 aa  147  3e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4021  PfkB  33.76 
 
 		 330 aa  147  3e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.737193  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0251  PfkB  33.76 
 
 		 333 aa  146  5e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3284  ribokinase-like domain-containing protein  30.94 
 
 		 330 aa  144  2e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000189129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4087  PfkB domain protein  34.3 
 
 		 330 aa  144  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0010  PfkB  35.24 
 
 		 333 aa  143  4e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00317456  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2989  ribokinase-like domain-containing protein  35.78 
 
 		 338 aa  142  8e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0461  PfkB domain protein  34.08 
 
 		 333 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1307  PfkB domain protein  32.27 
 
 		 338 aa  141  1.9999999999999998e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.887451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0218  PfkB  34.18 
 
 		 333 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0215  ribokinase-like domain-containing protein  34.71 
 
 		 333 aa  139  6e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.26013  normal  0.0979989 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0581  PfkB  33.76 
 
 		 333 aa  139  6e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.189374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0036  pfkB family carbohydrate kinase  33.44 
 
 		 333 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564268  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5186  PfkB domain protein  34.29 
 
 		 337 aa  136  5e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.430634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2565  ribokinase-like domain-containing protein  33.01 
 
 		 333 aa  136  5e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.650274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2452  PfkB  32.2 
 
 		 330 aa  135  9e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.826037  normal  0.155331 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3022  PfkB domain protein  33.63 
 
 		 333 aa  135  9e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.523599  normal  0.417909 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5108  PfkB domain protein  34.6 
 
 		 337 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.905931 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3284  PfkB  29.29 
 
 		 336 aa  134  1.9999999999999998e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.469583  normal  0.0441315 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4645  ribokinase-like domain-containing protein  34.6 
 
 		 337 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2691  ribokinase-like domain-containing protein  33.44 
 
 		 330 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.272607  normal  0.270933 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1030  pfkB family carbohydrate kinase  33.12 
 
 		 330 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.577037  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1260  PfkB domain protein  35.48 
 
 		 331 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1494  PfkB domain protein  30.56 
 
 		 331 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0243607  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1639  ribokinase-like domain-containing protein  34.84 
 
 		 331 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.487738  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1845  ribokinase-like domain-containing protein  31.21 
 
 		 341 aa  126  6e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000273033  unclonable  0.000000000472438 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_18364  predicted protein  37.34 
 
 		 273 aa  125  8.000000000000001e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.132458 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1084  PfkB domain protein  29.55 
 
 		 327 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0819  cell division protein FtsA  31.6 
 
 		 328 aa  123  5e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000392808  normal  0.759534 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1113  PfkB domain protein  29.55 
 
 		 327 aa  123  5e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.941643 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0198  ribokinase-like domain-containing protein  32.5 
 
 		 330 aa  122  7e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2764  PfkB  29.66 
 
 		 370 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.040802  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2022  ribokinase-like domain-containing protein  34.47 
 
 		 330 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1671  PfkB  28.66 
 
 		 331 aa  115  1.0000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.276087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0494  PfkB domain protein  31.11 
 
 		 360 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.441156  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2568  ribokinase-like domain-containing protein  31.85 
 
 		 333 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1910  carbohydrate kinase  28.66 
 
 		 339 aa  114  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.0000000000000704659  hitchhiker  0.00127543 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2200  PfkB  28.57 
 
 		 339 aa  110  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000468276  decreased coverage  0.00888496 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2872  ribokinase-like domain-containing protein  30.49 
 
 		 335 aa  109  5e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.417432 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1580  ribokinase-like domain-containing protein  31.7 
 
 		 309 aa  106  6e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0863941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0735  PfkB domain-containing protein  33.33 
 
 		 317 aa  101  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.263465  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2001  PfkB domain protein  30.3 
 
 		 321 aa  97.8  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1755  PfkB domain protein  32.71 
 
 		 304 aa  94.7  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6402  kinase, PfkB family  30.5 
 
 		 316 aa  91.7  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.223985  normal  0.0576873 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0416  PfkB  31.46 
 
 		 320 aa  89.7  5e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1142  PfkB  29.29 
 
 		 310 aa  88.2  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0676537  normal  0.093061 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7068  PfkB  31.35 
 
 		 297 aa  87.4  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3227  inosine kinase  29.3 
 
 		 432 aa  86.3  6e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00215137  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2385  PfkB domain-containing protein  30.28 
 
 		 297 aa  85.5  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.790997  normal  0.420761 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5895  sugar kinase, putative  27.38 
 
 		 304 aa  84  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.760771  normal  0.0122717 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2615  PfkB domain protein  27.78 
 
 		 305 aa  79.7  0.00000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2129  putative sugar kinase  30.43 
 
 		 298 aa  79.7  0.00000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.101939  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0491  PfkB  27.48 
 
 		 303 aa  79.3  0.00000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0041  ribokinase-like domain-containing protein  28.09 
 
 		 304 aa  78.2  0.0000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1117  ribokinase-like domain-containing protein  29.66 
 
 		 305 aa  77.4  0.0000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.145837 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2477  ribokinase-like domain-containing protein  39.29 
 
 		 307 aa  77  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1366  ribokinase-like domain-containing protein  27.27 
 
 		 320 aa  77  0.0000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0275  PfkB domain-containing protein  28.46 
 
 		 312 aa  77  0.0000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1498  PfkB domain protein  30.68 
 
 		 300 aa  76.3  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0147  ribokinase-like domain-containing protein  29.92 
 
 		 318 aa  76.3  0.0000000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.719935  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02272  adenosine kinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06390)  29.94 
 
 		 352 aa  75.9  0.0000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0154807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1799  inosine kinase  27.03 
 
 		 434 aa  75.9  0.0000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00398478  hitchhiker  0.000000265344 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0005  ribokinase, putative  29.41 
 
 		 313 aa  75.5  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0831175  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1201  ribokinase-like domain-containing protein  27.27 
 
 		 298 aa  75.1  0.000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1541  inosine kinase  27.97 
 
 		 434 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.209586  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2148  PfkB domain-containing protein  34.38 
 
 		 312 aa  75.5  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.950763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2132  PfkB domain protein  29.35 
 
 		 344 aa  73.9  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1416  ribokinase-like domain-containing protein  26.52 
 
 		 302 aa  73.9  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0752  ribokinase-like domain-containing protein  30.35 
 
 		 310 aa  74.3  0.000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1649  ribokinase-like domain-containing protein  30.3 
 
 		 308 aa  73.6  0.000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0416676  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24440  sugar kinase, ribokinase  27.8 
 
 		 288 aa  73.6  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.480444  normal  0.238886 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1220  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  26.14 
 
 		 302 aa  73.6  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.515057  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1626  PfkB domain protein  29.41 
 
 		 319 aa  73.6  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.124685  normal  0.814532 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>