More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0416 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0416  PfkB  100 
 
 		 320 aa  627  1e-179  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0735  PfkB domain-containing protein  57.83 
 
 		 317 aa  355  7.999999999999999e-97  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.263465  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2001  PfkB domain protein  58.5 
 
 		 321 aa  330  2e-89  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1580  ribokinase-like domain-containing protein  54.15 
 
 		 309 aa  301  1e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0863941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0491  PfkB  39.25 
 
 		 303 aa  172  6.999999999999999e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7068  PfkB  36.03 
 
 		 297 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1755  PfkB domain protein  37.33 
 
 		 304 aa  158  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3300  PfkB domain protein  36.81 
 
 		 314 aa  157  3e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.369715  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2385  PfkB domain-containing protein  35.69 
 
 		 297 aa  154  2e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.790997  normal  0.420761 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1627  PfkB domain protein  36.49 
 
 		 309 aa  154  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.100578  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2129  putative sugar kinase  35.12 
 
 		 298 aa  150  2e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.101939  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1498  PfkB domain protein  35.02 
 
 		 300 aa  150  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24440  sugar kinase, ribokinase  35.34 
 
 		 288 aa  139  8.999999999999999e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.480444  normal  0.238886 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6402  kinase, PfkB family  34.85 
 
 		 316 aa  136  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.223985  normal  0.0576873 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3558  PfkB domain protein  38.91 
 
 		 287 aa  130  3e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.321996  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1435  ribokinase-like domain-containing protein  36.88 
 
 		 293 aa  127  3e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000559808 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1470  ribokinase-like domain-containing protein  37.25 
 
 		 298 aa  127  4.0000000000000003e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1117  ribokinase-like domain-containing protein  33.82 
 
 		 305 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.145837 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0316  pfkB family carbohydrate kinase  27.88 
 
 		 330 aa  108  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.930013  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0041  ribokinase-like domain-containing protein  33.7 
 
 		 304 aa  107  3e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2148  PfkB domain-containing protein  33.67 
 
 		 312 aa  105  8e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.950763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0506  carbohydrate kinase-like  25.46 
 
 		 334 aa  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2854  ribokinase-like domain-containing protein  33.33 
 
 		 328 aa  105  1e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000011716  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3378  ribokinase-like domain-containing protein  29 
 
 		 330 aa  104  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.463525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05631  carbohydrate kinase  29.35 
 
 		 335 aa  104  2e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.577343 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3532  ribokinase-like domain-containing protein  31.27 
 
 		 337 aa  103  5e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321565  normal  0.851243 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4407  PfkB domain protein  27.89 
 
 		 330 aa  102  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1649  ribokinase-like domain-containing protein  31.56 
 
 		 308 aa  102  8e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0416676  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4087  PfkB domain protein  27.79 
 
 		 330 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1838  carbohydrate kinase  28.62 
 
 		 335 aa  101  2e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1260  PfkB domain protein  31.87 
 
 		 331 aa  100  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3284  ribokinase-like domain-containing protein  27.68 
 
 		 330 aa  100  5e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000189129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05621  carbohydrate kinase  23.99 
 
 		 333 aa  100  5e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05321  carbohydrate kinase  24.07 
 
 		 333 aa  97.8  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0559209  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1142  PfkB  30.35 
 
 		 310 aa  97.4  3e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0676537  normal  0.093061 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5186  PfkB domain protein  29.2 
 
 		 337 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.430634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18220  Fructokinase  26.91 
 
 		 320 aa  97.4  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.749798  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0389  PfkB  30.71 
 
 		 323 aa  97.4  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.211683  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1278  PfkB domain-containing protein  29.97 
 
 		 317 aa  96.7  4e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.399616 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5108  PfkB domain protein  28.61 
 
 		 337 aa  96.3  6e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.905931 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4645  ribokinase-like domain-containing protein  28.61 
 
 		 337 aa  96.3  6e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3778  PfkB domain protein  29.63 
 
 		 297 aa  95.1  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00891877  normal  0.801682 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0562  PfkB domain protein  32.21 
 
 		 328 aa  95.5  1e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05691  carbohydrate kinase  22.98 
 
 		 338 aa  95.1  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0990225  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0169  carbohydrate kinase  27.58 
 
 		 330 aa  95.1  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0162  carbohydrate kinase  27.58 
 
 		 330 aa  95.1  2e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.98466  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0954  PfkB domain protein  26.62 
 
 		 321 aa  94.7  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.102628  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0215  ribokinase-like domain-containing protein  30.96 
 
 		 333 aa  94  3e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.26013  normal  0.0979989 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01230  fructokinase  28.98 
 
 		 311 aa  93.6  4e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.826599  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1639  ribokinase-like domain-containing protein  33.21 
 
 		 331 aa  93.2  5e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.487738  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18020  sugar kinase, ribokinase  31.46 
 
 		 306 aa  92.4  8e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.503416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0178  ribokinase-like domain-containing protein  26.63 
 
 		 331 aa  92.4  9e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.613115  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1307  PfkB domain protein  29.75 
 
 		 338 aa  92.4  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.887451  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0351  aminoimidazole riboside kinase  31.62 
 
 		 307 aa  91.7  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.735787  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0354  ribokinase  32.06 
 
 		 308 aa  91.7  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1088  PfkB domain protein  28.15 
 
 		 315 aa  90.1  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.332998  normal  0.446333 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2461  ribokinase-like domain-containing protein  33.11 
 
 		 316 aa  89.7  6e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0457  PfkB  28.92 
 
 		 333 aa  89.7  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3755  PfkB domain protein  32.14 
 
 		 307 aa  89.4  8e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0212856  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0716  fructokinase  26.81 
 
 		 313 aa  89  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0666  fructokinase  26.81 
 
 		 313 aa  89  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0055  ribokinase-like domain-containing protein  32.48 
 
 		 334 aa  89  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.747338  normal  0.368725 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0752  fructokinase  26.81 
 
 		 313 aa  89  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2764  PfkB  29.9 
 
 		 370 aa  88.6  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.040802  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4203  aminoimidazole riboside kinase  30.77 
 
 		 309 aa  88.6  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.831759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1011  ribokinase-like domain-containing protein  28.35 
 
 		 398 aa  88.6  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0070  ribokinase-like domain-containing protein  31.72 
 
 		 305 aa  89  1e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.60231  normal  0.104072 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0752  ribokinase-like domain-containing protein  33.45 
 
 		 310 aa  88.6  1e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2905  aminoimidazole riboside kinase  31.35 
 
 		 306 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00998461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0078  ribokinase-like domain-containing protein  30.37 
 
 		 302 aa  88.2  2e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1084  PfkB domain protein  27.38 
 
 		 327 aa  87.4  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0395  aminoimidazole riboside kinase  31.23 
 
 		 311 aa  87.4  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0581877  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1165  PfkB domain protein  27.76 
 
 		 335 aa  87.4  3e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.188666 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1489  ribokinase-like domain-containing protein  33.08 
 
 		 308 aa  87  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.538606  normal  0.0997526 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4135  PfkB  26.94 
 
 		 306 aa  87  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0867142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1849  PfkB domain protein  31.62 
 
 		 316 aa  86.3  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0541004  normal  0.0446674 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2276  PfkB domain protein  32.36 
 
 		 307 aa  86.3  7e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.303585  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1113  PfkB domain protein  27 
 
 		 327 aa  85.9  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.941643 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4124  ribokinase  29.43 
 
 		 403 aa  85.9  9e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0218  PfkB  29.69 
 
 		 333 aa  85.1  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0151  PfkB  30.82 
 
 		 331 aa  85.5  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0251  PfkB  30.68 
 
 		 333 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2647  aminoimidazole riboside kinase  29.43 
 
 		 304 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1612  ribokinase family sugar kinase  27.6 
 
 		 340 aa  85.1  0.000000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0874983  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2452  PfkB  27.52 
 
 		 330 aa  84.7  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.826037  normal  0.155331 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5056  PfkB domain protein  32.3 
 
 		 320 aa  84.3  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3592  aminoimidazole riboside kinase  29.43 
 
 		 304 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000158875 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1721  ribokinase-like domain-containing protein  33.46 
 
 		 308 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2477  ribokinase-like domain-containing protein  28.46 
 
 		 307 aa  84.7  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05061  carbohydrate kinase  23.81 
 
 		 348 aa  84.3  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0313242  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2270  PfkB domain protein  35.38 
 
 		 387 aa  84.3  0.000000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0793911 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0220  ribokinase  29.77 
 
 		 305 aa  84.3  0.000000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.328501  normal  0.180212 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5081  ribokinase family sugar kinase  32.31 
 
 		 308 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.89362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0010  PfkB  29.69 
 
 		 333 aa  83.2  0.000000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00317456  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  28.52 
 
 		 323 aa  83.2  0.000000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2615  PfkB domain protein  27.05 
 
 		 305 aa  83.6  0.000000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0873  ribokinase-like domain-containing protein  31.46 
 
 		 315 aa  83.2  0.000000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.763397  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1622  PfkB domain protein  21.85 
 
 		 297 aa  83.2  0.000000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1884  ribokinase  25.57 
 
 		 310 aa  83.2  0.000000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0118065  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0025  ribokinase-like domain-containing protein  22.99 
 
 		 307 aa  82.8  0.000000000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.112625  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>