More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3300 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3300  PfkB domain protein  100 
 
 		 314 aa  629  1e-179  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.369715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2129  putative sugar kinase  80.47 
 
 		 298 aa  497  1e-139  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.101939  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7068  PfkB  69.36 
 
 		 297 aa  418  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2385  PfkB domain-containing protein  70.71 
 
 		 297 aa  409  1e-113  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.790997  normal  0.420761 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1627  PfkB domain protein  65.99 
 
 		 309 aa  383  1e-105  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.100578  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1755  PfkB domain protein  46.44 
 
 		 304 aa  238  1e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1470  ribokinase-like domain-containing protein  46 
 
 		 298 aa  204  2e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0491  PfkB  43.2 
 
 		 303 aa  201  9.999999999999999e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1435  ribokinase-like domain-containing protein  44.26 
 
 		 293 aa  194  1e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000559808 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1498  PfkB domain protein  40.13 
 
 		 300 aa  179  5.999999999999999e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24440  sugar kinase, ribokinase  42.39 
 
 		 288 aa  174  1.9999999999999998e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.480444  normal  0.238886 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6402  kinase, PfkB family  39.22 
 
 		 316 aa  164  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.223985  normal  0.0576873 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3778  PfkB domain protein  41.36 
 
 		 297 aa  161  1e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00891877  normal  0.801682 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0735  PfkB domain-containing protein  34.45 
 
 		 317 aa  153  4e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.263465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3558  PfkB domain protein  41.5 
 
 		 287 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.321996  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2148  PfkB domain-containing protein  41.41 
 
 		 312 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.950763  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2001  PfkB domain protein  35.59 
 
 		 321 aa  147  2.0000000000000003e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0416  PfkB  36.81 
 
 		 320 aa  142  9e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1580  ribokinase-like domain-containing protein  32.43 
 
 		 309 aa  127  3e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0863941  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0562  PfkB domain protein  31.32 
 
 		 328 aa  101  1e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0041  ribokinase-like domain-containing protein  32.7 
 
 		 304 aa  98.6  1e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3284  PfkB  25.56 
 
 		 336 aa  94  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.469583  normal  0.0441315 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3284  ribokinase-like domain-containing protein  28.74 
 
 		 330 aa  89.4  7e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000189129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1170  PfkB domain-containing protein  28.08 
 
 		 305 aa  87  4e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0154398  normal  0.362053 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2067  ribokinase-like domain-containing protein  33.21 
 
 		 324 aa  87  4e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0314864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1278  PfkB domain-containing protein  31.27 
 
 		 317 aa  86.7  5e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.399616 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1165  PfkB domain protein  28.48 
 
 		 335 aa  85.9  8e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.188666 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5056  PfkB domain protein  30.79 
 
 		 320 aa  85.9  9e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2905  aminoimidazole riboside kinase  29.04 
 
 		 306 aa  84  0.000000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00998461  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2615  PfkB domain protein  28.57 
 
 		 305 aa  83.2  0.000000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1706  PfkB domain protein  27.49 
 
 		 319 aa  80.9  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2461  ribokinase-like domain-containing protein  33.46 
 
 		 316 aa  80.9  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0954  PfkB domain protein  25.31 
 
 		 321 aa  80.9  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.102628  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0151  PfkB  31.06 
 
 		 331 aa  80.5  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0162  ribokinase  24.83 
 
 		 309 aa  79.7  0.00000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1094  ribokinase-like domain-containing protein  31.06 
 
 		 296 aa  79  0.00000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.495819  normal  0.168418 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0025  ribokinase-like domain-containing protein  21.02 
 
 		 307 aa  79  0.00000000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.112625  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0220  ribokinase  28.16 
 
 		 305 aa  78.6  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.328501  normal  0.180212 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3592  PfkB domain protein  31.54 
 
 		 311 aa  78.6  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0720957  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0147  ribokinase-like domain-containing protein  30.37 
 
 		 318 aa  78.2  0.0000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.719935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0149  PfkB  27.07 
 
 		 407 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.029935  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1142  PfkB  30.36 
 
 		 310 aa  78.2  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0676537  normal  0.093061 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2872  PfkB  28.14 
 
 		 332 aa  78.2  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.626247 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1117  ribokinase-like domain-containing protein  29.55 
 
 		 305 aa  77.8  0.0000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.145837 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0200  ribokinase  28.16 
 
 		 313 aa  77  0.0000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.933367 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0075  PfkB domain protein  26.84 
 
 		 355 aa  77  0.0000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000000523624  normal  0.570334 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0971  aminoimidazole riboside kinase  26.05 
 
 		 308 aa  76.3  0.0000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00309121  normal  0.0346902 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0351  aminoimidazole riboside kinase  30.54 
 
 		 307 aa  76.3  0.0000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.735787  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2014  PfkB domain protein  28.41 
 
 		 324 aa  76.3  0.0000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2458  ribokinase  28.76 
 
 		 302 aa  75.9  0.0000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0036  pfkB family carbohydrate kinase  27.92 
 
 		 333 aa  75.9  0.0000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564268  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05691  carbohydrate kinase  22.26 
 
 		 338 aa  75.9  0.0000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0990225  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4013  ribokinase-like domain-containing protein  27.57 
 
 		 315 aa  75.5  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4645  ribokinase-like domain-containing protein  28.83 
 
 		 337 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0600  aminoimidazole riboside kinase  28.47 
 
 		 323 aa  75.1  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1030  PfkB domain protein  28.42 
 
 		 329 aa  75.1  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.185699  normal  0.340834 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3414  PfkB domain protein  29.41 
 
 		 317 aa  75.5  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5108  PfkB domain protein  28.83 
 
 		 337 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.905931 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2477  ribokinase-like domain-containing protein  29.25 
 
 		 307 aa  75.5  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  30.19 
 
 		 329 aa  75.1  0.000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0752  ribokinase-like domain-containing protein  32.4 
 
 		 310 aa  75.1  0.000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1088  PfkB domain protein  26.16 
 
 		 315 aa  75.5  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.332998  normal  0.446333 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2566  ribokinase-like domain-containing protein  33.9 
 
 		 316 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.255946  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1980  ribokinase  28.81 
 
 		 302 aa  74.7  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0215  ribokinase-like domain-containing protein  27.72 
 
 		 333 aa  74.3  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.26013  normal  0.0979989 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0078  ribokinase-like domain-containing protein  31.06 
 
 		 302 aa  74.7  0.000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05621  carbohydrate kinase  22.38 
 
 		 333 aa  74.7  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2565  ribokinase-like domain-containing protein  27.48 
 
 		 333 aa  74.3  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.650274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1980  sugar (2-ketogluconate) kinase  29.74 
 
 		 327 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0210202 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7727  ribokinase-like domain-containing protein  32.76 
 
 		 314 aa  73.9  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0316  pfkB family carbohydrate kinase  25.48 
 
 		 330 aa  73.6  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.930013  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1307  PfkB domain protein  27.99 
 
 		 338 aa  73.6  0.000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.887451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0059  ribokinase-like domain-containing protein  27.94 
 
 		 319 aa  73.6  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3217  PfkB domain protein  25 
 
 		 312 aa  73.6  0.000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3696  ribokinase-like domain-containing protein  29.77 
 
 		 301 aa  73.2  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.657474  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1639  ribokinase-like domain-containing protein  30.53 
 
 		 331 aa  73.2  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.487738  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3559  ribokinase-like domain-containing protein  29.21 
 
 		 340 aa  73.2  0.000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3232  ribokinase  28.43 
 
 		 302 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.493529  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_004310  BR0169  carbohydrate kinase  25.66 
 
 		 330 aa  73.2  0.000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0395  aminoimidazole riboside kinase  28.83 
 
 		 311 aa  73.2  0.000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0581877  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0162  carbohydrate kinase  25.66 
 
 		 330 aa  73.2  0.000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.98466  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1845  ribokinase-like domain-containing protein  24.73 
 
 		 341 aa  72.8  0.000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000273033  unclonable  0.000000000472438 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1260  PfkB domain protein  29.86 
 
 		 331 aa  72.8  0.000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26890  2-ketogluconate kinase  29.04 
 
 		 314 aa  72.8  0.000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00940196  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5186  PfkB domain protein  29.5 
 
 		 337 aa  72.8  0.000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.430634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2019  aminoimidazole riboside kinase  27.11 
 
 		 298 aa  72.4  0.000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0270358  normal  0.162694 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000598  fructokinase  27.62 
 
 		 337 aa  72.4  0.000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00217717  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2278  PfkB domain protein  28.89 
 
 		 327 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.741137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05321  carbohydrate kinase  22.38 
 
 		 333 aa  72.4  0.000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0559209  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1649  ribokinase-like domain-containing protein  29.87 
 
 		 308 aa  72.4  0.000000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0416676  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1728  PfkB  28.3 
 
 		 645 aa  72  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.371371  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0354  ribokinase  29.13 
 
 		 308 aa  72  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0808  fructokinase  26.07 
 
 		 313 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1312  ribokinase  29.03 
 
 		 299 aa  70.9  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29260  sugar kinase, ribokinase  32.95 
 
 		 311 aa  71.2  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.466231 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3455  ribokinase-like domain-containing protein  28.62 
 
 		 326 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84523  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0915  fructokinase  26.07 
 
 		 313 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0070  ribokinase-like domain-containing protein  31.54 
 
 		 305 aa  71.6  0.00000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.60231  normal  0.104072 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3505  PfkB  25.89 
 
 		 298 aa  71.6  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3532  ribokinase-like domain-containing protein  28.26 
 
 		 337 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321565  normal  0.851243 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>