More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6402 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_6402  kinase, PfkB family  100 
 
 
316 aa  610  1e-173  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.223985  normal  0.0576873 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2148  PfkB domain-containing protein  66.33 
 
 
312 aa  315  5e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.950763  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0491  PfkB  43.56 
 
 
303 aa  186  3e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7068  PfkB  39.6 
 
 
297 aa  173  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1755  PfkB domain protein  42.52 
 
 
304 aa  173  3.9999999999999995e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1498  PfkB domain protein  41.45 
 
 
300 aa  172  5e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2385  PfkB domain-containing protein  39.6 
 
 
297 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.790997  normal  0.420761 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3300  PfkB domain protein  39.22 
 
 
314 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.369715  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2129  putative sugar kinase  38.28 
 
 
298 aa  163  3e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.101939  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1627  PfkB domain protein  38.36 
 
 
309 aa  160  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.100578  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24440  sugar kinase, ribokinase  41.76 
 
 
288 aa  159  8e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.480444  normal  0.238886 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3558  PfkB domain protein  43.54 
 
 
287 aa  150  3e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.321996  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0735  PfkB domain-containing protein  35.1 
 
 
317 aa  149  5e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.263465  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2001  PfkB domain protein  36.33 
 
 
321 aa  147  3e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1470  ribokinase-like domain-containing protein  39.87 
 
 
298 aa  145  1e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1435  ribokinase-like domain-containing protein  40.54 
 
 
293 aa  144  3e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000559808 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1580  ribokinase-like domain-containing protein  36.54 
 
 
309 aa  142  6e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0863941  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0416  PfkB  34.32 
 
 
320 aa  133  3.9999999999999996e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3778  PfkB domain protein  37.07 
 
 
297 aa  120  3e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00891877  normal  0.801682 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0457  ribokinase-like domain-containing protein  31.8 
 
 
313 aa  100  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3869  ribokinase  31.92 
 
 
299 aa  98.2  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559054 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1170  PfkB domain-containing protein  30.37 
 
 
305 aa  97.1  3e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0154398  normal  0.362053 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0059  ribokinase-like domain-containing protein  34.08 
 
 
319 aa  96.3  6e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2615  PfkB domain protein  31.2 
 
 
305 aa  94.7  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3217  PfkB domain protein  30.48 
 
 
312 aa  93.6  3e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0716  fructokinase  28.62 
 
 
313 aa  93.2  5e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0666  fructokinase  28.62 
 
 
313 aa  93.2  5e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0752  fructokinase  28.62 
 
 
313 aa  93.2  5e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2854  ribokinase-like domain-containing protein  30.5 
 
 
328 aa  91.7  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000011716  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05691  carbohydrate kinase  26.2 
 
 
338 aa  92.4  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0990225  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1486  ribokinase-like domain-containing protein  34.33 
 
 
315 aa  91.3  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2146  fructokinase protein  32.13 
 
 
318 aa  90.5  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00000404752  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26890  2-ketogluconate kinase  34.43 
 
 
314 aa  90.5  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00940196  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0494  PfkB domain protein  34.56 
 
 
360 aa  89.7  5e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.441156  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0808  fructokinase  28.83 
 
 
313 aa  89.4  7e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0041  ribokinase-like domain-containing protein  34.85 
 
 
304 aa  88.6  1e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  32.28 
 
 
302 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2764  PfkB domain protein  37.13 
 
 
289 aa  87.8  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.11778  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0915  fructokinase  28.47 
 
 
313 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1782  fructokinase  28.1 
 
 
315 aa  86.7  5e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0521883  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1011  ribokinase-like domain-containing protein  29.32 
 
 
398 aa  86.3  6e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1278  PfkB domain-containing protein  31.94 
 
 
317 aa  86.3  6e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.399616 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1124  ribokinase  31.2 
 
 
403 aa  86.3  7e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1510  fructokinase  27.6 
 
 
315 aa  85.9  7e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00409278  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0274  PfkB  32.84 
 
 
306 aa  85.9  8e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2905  aminoimidazole riboside kinase  29.41 
 
 
306 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00998461  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3280  ribokinase  34.33 
 
 
305 aa  84.7  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18220  Fructokinase  29.73 
 
 
320 aa  84.7  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.749798  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1117  ribokinase-like domain-containing protein  34.56 
 
 
305 aa  84.3  0.000000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.145837 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1154  ribokinase-like domain-containing protein  30.24 
 
 
319 aa  84  0.000000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5928  ribokinase family sugar kinase  31.95 
 
 
318 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0055  ribokinase-like domain-containing protein  31.54 
 
 
334 aa  83.6  0.000000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.747338  normal  0.368725 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1976  putative ribokinase  34.53 
 
 
305 aa  83.2  0.000000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.191043  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2556  PfkB domain protein  35.63 
 
 
316 aa  83.6  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0308577  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1419  PfkB family kinase  27.76 
 
 
315 aa  83.2  0.000000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.997387  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2621  ribokinase-like domain-containing protein  33.08 
 
 
318 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.712892  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01741  predicted kinase  27.76 
 
 
315 aa  82.8  0.000000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2652  PfkB domain protein  35.63 
 
 
316 aa  82.8  0.000000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01729  hypothetical protein  27.76 
 
 
315 aa  82.8  0.000000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2283  ribokinase  31.9 
 
 
310 aa  82.8  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.269259 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3284  PfkB  25.44 
 
 
336 aa  82.4  0.000000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.469583  normal  0.0441315 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2461  ribokinase-like domain-containing protein  36.21 
 
 
316 aa  82.4  0.000000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281644  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1987  PfkB  33.08 
 
 
318 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.903006  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2597  ribokinase-like domain-containing protein  33.08 
 
 
318 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0700  ribokinase-like domain-containing protein  32.71 
 
 
319 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.503063 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1870  PfkB domain protein  27.76 
 
 
315 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0114143  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22680  PfkB domain protein  29.12 
 
 
314 aa  82  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.531518  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5186  PfkB domain protein  29.41 
 
 
337 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.430634  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39540  sugar kinase, ribokinase  33.33 
 
 
296 aa  81.6  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.893162 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1996  PfkB family kinase  27.76 
 
 
315 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3765  ribokinase  34.33 
 
 
304 aa  81.6  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0637373 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1860  ribokinase-like domain-containing protein  27.76 
 
 
315 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.335723  decreased coverage  0.00000390561 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0660  ribokinase family sugar kinase  30.87 
 
 
303 aa  81.3  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0298925  normal  0.606106 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  29.74 
 
 
308 aa  81.6  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7361  ribokinase  33.95 
 
 
308 aa  81.3  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1856  PfkB family kinase  27.76 
 
 
315 aa  80.9  0.00000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0158072  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2979  putative 2-ketogluconate kinase  33.95 
 
 
316 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.441094  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1838  carbohydrate kinase  27.37 
 
 
335 aa  79.7  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0007  ribokinase  29.37 
 
 
306 aa  79.7  0.00000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.328015  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1304  carbohydrate kinase, PfkB  35.25 
 
 
316 aa  79.7  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3538  PfkB domain protein  27 
 
 
310 aa  79.7  0.00000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000797657  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2057  PfkB family kinase  27.53 
 
 
315 aa  79.3  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.124987  normal  0.010035 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1654  ribokinase-like domain-containing protein  31.27 
 
 
330 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.290792  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05631  carbohydrate kinase  27.61 
 
 
335 aa  79  0.00000000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.577343 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0987  ribokinase  29.81 
 
 
293 aa  78.6  0.0000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.135221  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2645  ribokinase-like domain-containing protein  30.45 
 
 
319 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1980  ribokinase  31.27 
 
 
302 aa  78.6  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0447  ribokinase-like domain-containing protein  27.31 
 
 
301 aa  78.6  0.0000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2496  kinase, pfkB family  28.63 
 
 
310 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4087  PfkB domain protein  28.96 
 
 
330 aa  78.2  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1980  sugar (2-ketogluconate) kinase  32.35 
 
 
327 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0210202 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4645  ribokinase-like domain-containing protein  30.63 
 
 
337 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5108  PfkB domain protein  30.63 
 
 
337 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.905931 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4291  PfkB domain protein  32.99 
 
 
342 aa  77.8  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.672218 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3414  PfkB domain protein  31.62 
 
 
317 aa  77.4  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2278  PfkB domain protein  30.99 
 
 
327 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.741137  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4407  PfkB domain protein  28.74 
 
 
330 aa  77.4  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0615  PfkB  29 
 
 
317 aa  77.4  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1228  ribokinase-like domain-containing protein  29.82 
 
 
337 aa  77.4  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  30.8 
 
 
305 aa  77.4  0.0000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>