More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_24440 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_24440  sugar kinase, ribokinase  100 
 
 		 288 aa  566  1e-160  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.480444  normal  0.238886 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1498  PfkB domain protein  65.73 
 
 		 300 aa  349  2e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7068  PfkB  45.39 
 
 		 297 aa  212  5.999999999999999e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1435  ribokinase-like domain-containing protein  48.63 
 
 		 293 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000559808 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1755  PfkB domain protein  43.05 
 
 		 304 aa  199  3.9999999999999996e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3778  PfkB domain protein  50.87 
 
 		 297 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00891877  normal  0.801682 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3300  PfkB domain protein  42.32 
 
 		 314 aa  194  1e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.369715  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2385  PfkB domain-containing protein  44.71 
 
 		 297 aa  192  4e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.790997  normal  0.420761 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0491  PfkB  42.07 
 
 		 303 aa  192  8e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1470  ribokinase-like domain-containing protein  47.1 
 
 		 298 aa  190  2e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1627  PfkB domain protein  43.69 
 
 		 309 aa  187  2e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.100578  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2129  putative sugar kinase  40.27 
 
 		 298 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.101939  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6402  kinase, PfkB family  42.03 
 
 		 316 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.223985  normal  0.0576873 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3558  PfkB domain protein  46.58 
 
 		 287 aa  165  9e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.321996  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0416  PfkB  35.59 
 
 		 320 aa  144  2e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0735  PfkB domain-containing protein  30.38 
 
 		 317 aa  142  7e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.263465  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2001  PfkB domain protein  32.19 
 
 		 321 aa  137  3.0000000000000003e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1580  ribokinase-like domain-containing protein  32.54 
 
 		 309 aa  129  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0863941  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2148  PfkB domain-containing protein  37.24 
 
 		 312 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.950763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1278  PfkB domain-containing protein  36.29 
 
 		 317 aa  113  3e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.399616 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  32.78 
 
 		 302 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1142  PfkB  33.67 
 
 		 310 aa  106  5e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0676537  normal  0.093061 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0041  ribokinase-like domain-containing protein  31.86 
 
 		 304 aa  106  5e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5186  PfkB domain protein  32.41 
 
 		 337 aa  106  6e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.430634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0149  PfkB  33.08 
 
 		 407 aa  105  7e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.029935  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0461  PfkB domain protein  34.44 
 
 		 333 aa  105  7e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0457  PfkB  33.68 
 
 		 333 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0752  ribokinase-like domain-containing protein  37.5 
 
 		 310 aa  102  5e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2477  ribokinase-like domain-containing protein  33.84 
 
 		 307 aa  102  8e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0581  PfkB  34.07 
 
 		 333 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.189374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4766  ribokinase-like domain-containing protein  31.08 
 
 		 313 aa  100  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.417619 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0562  PfkB domain protein  30.38 
 
 		 328 aa  101  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1260  PfkB domain protein  32.93 
 
 		 331 aa  99.4  6e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0289  ribokinase-like domain-containing protein  30.14 
 
 		 315 aa  99  9e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3563  PfkB domain protein  34.96 
 
 		 300 aa  98.2  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.247861  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5108  PfkB domain protein  33.94 
 
 		 337 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.905931 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4645  ribokinase-like domain-containing protein  33.94 
 
 		 337 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0036  pfkB family carbohydrate kinase  32.47 
 
 		 333 aa  98.6  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564268  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2909  ribokinase  35.35 
 
 		 302 aa  97.4  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0179509 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2565  ribokinase-like domain-containing protein  30.79 
 
 		 333 aa  97.4  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.650274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0147  ribokinase-like domain-containing protein  31.03 
 
 		 318 aa  97.1  3e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.719935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1639  ribokinase-like domain-containing protein  33.33 
 
 		 331 aa  96.7  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.487738  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3232  ribokinase  32.33 
 
 		 302 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.493529  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1706  PfkB domain protein  30.74 
 
 		 319 aa  95.9  7e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0010  PfkB  33.33 
 
 		 333 aa  95.9  7e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00317456  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3532  ribokinase-like domain-containing protein  30.89 
 
 		 337 aa  95.9  7e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321565  normal  0.851243 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2764  PfkB domain protein  35.52 
 
 		 289 aa  95.5  8e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.11778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0251  PfkB  32.59 
 
 		 333 aa  95.1  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18220  Fructokinase  29 
 
 		 320 aa  92.8  5e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.749798  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1285  ribokinase  29.43 
 
 		 307 aa  92.8  5e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000150833  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2458  ribokinase  31.89 
 
 		 302 aa  92.4  7e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3488  ribokinase  31.58 
 
 		 302 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232463  normal  0.188896 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0200  ribokinase  30.13 
 
 		 313 aa  92  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.933367 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0218  PfkB  32.6 
 
 		 333 aa  91.3  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1117  ribokinase-like domain-containing protein  30.51 
 
 		 305 aa  90.9  2e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.145837 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2461  ribokinase-like domain-containing protein  36.32 
 
 		 316 aa  91.3  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1170  PfkB domain-containing protein  30.17 
 
 		 305 aa  90.5  3e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0154398  normal  0.362053 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0121  ribokinase-like domain-containing protein  32.85 
 
 		 328 aa  90.5  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.02163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1838  carbohydrate kinase  27.97 
 
 		 335 aa  90.1  4e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4464  aminoimidazole riboside kinase  30.41 
 
 		 319 aa  89.7  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.680577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05631  carbohydrate kinase  28.35 
 
 		 335 aa  89.7  5e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.577343 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4074  ribokinase  26.6 
 
 		 306 aa  89.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.532803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4124  ribokinase  26.6 
 
 		 306 aa  89.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4003  ribokinase  26.6 
 
 		 306 aa  89.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4182  ribokinase  26.6 
 
 		 306 aa  89.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2615  PfkB domain protein  30.72 
 
 		 305 aa  89.4  6e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1165  PfkB domain protein  29.47 
 
 		 335 aa  89.4  6e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.188666 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4019  ribokinase  26.6 
 
 		 306 aa  89.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4283  aminoimidazole riboside kinase  30.77 
 
 		 319 aa  89.4  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3284  ribokinase-like domain-containing protein  27.59 
 
 		 330 aa  89.4  7e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000189129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0274  PfkB  32.06 
 
 		 306 aa  89  9e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1603  ribokinase  27.06 
 
 		 310 aa  89  9e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000677641  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3350  hypothetical protein  33.48 
 
 		 315 aa  89  9e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.373497 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1884  ribokinase  27.06 
 
 		 310 aa  88.6  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0118065  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0151  PfkB  33.08 
 
 		 331 aa  87.8  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1507  ribokinase  32 
 
 		 308 aa  87.8  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1307  PfkB domain protein  32.34 
 
 		 338 aa  87.4  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.887451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  29.9 
 
 		 306 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2276  PfkB domain protein  33.88 
 
 		 307 aa  87.4  3e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.303585  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2837  ribokinase  30.54 
 
 		 302 aa  87  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3998  ribokinase-like domain-containing protein  35.59 
 
 		 308 aa  87  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0662614  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0600  aminoimidazole riboside kinase  30.6 
 
 		 323 aa  87  3e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0215  ribokinase-like domain-containing protein  32.35 
 
 		 333 aa  86.7  4e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.26013  normal  0.0979989 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0819  cell division protein FtsA  28.14 
 
 		 328 aa  86.3  5e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000392808  normal  0.759534 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2014  PfkB domain protein  33.58 
 
 		 324 aa  86.3  5e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1526  ribokinase  32 
 
 		 308 aa  86.3  6e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395922  normal  0.909431 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0494  PfkB domain protein  30.47 
 
 		 360 aa  85.9  7e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.441156  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0354  ribokinase  30.77 
 
 		 308 aa  85.9  8e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4013  ribokinase-like domain-containing protein  33.45 
 
 		 315 aa  85.5  9e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2989  ribokinase-like domain-containing protein  33.21 
 
 		 338 aa  85.1  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1649  ribokinase-like domain-containing protein  31.47 
 
 		 308 aa  85.1  0.000000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0416676  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2100  ribokinase  27.87 
 
 		 307 aa  84.3  0.000000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  27.55 
 
 		 322 aa  84  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2019  aminoimidazole riboside kinase  31.77 
 
 		 298 aa  84  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0270358  normal  0.162694 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0162  ribokinase  28.28 
 
 		 309 aa  83.6  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4749  ribokinase  32 
 
 		 309 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4397  aminoimidazole riboside kinase  30.09 
 
 		 319 aa  84  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4312  aminoimidazole riboside kinase  30.45 
 
 		 319 aa  83.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1088  PfkB domain protein  28.62 
 
 		 315 aa  83.6  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.332998  normal  0.446333 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0316  pfkB family carbohydrate kinase  29.78 
 
 		 330 aa  83.2  0.000000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.930013  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>