More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2129 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2129  putative sugar kinase  100 
 
 		 298 aa  596  1e-169  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.101939  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3300  PfkB domain protein  80.47 
 
 		 314 aa  497  1e-139  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.369715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7068  PfkB  71.04 
 
 		 297 aa  429  1e-119  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2385  PfkB domain-containing protein  72.73 
 
 		 297 aa  419  1e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.790997  normal  0.420761 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1627  PfkB domain protein  67.68 
 
 		 309 aa  396  1e-109  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.100578  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1755  PfkB domain protein  47.97 
 
 		 304 aa  252  5.000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0491  PfkB  44.86 
 
 		 303 aa  211  9e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1470  ribokinase-like domain-containing protein  47.8 
 
 		 298 aa  207  2e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1435  ribokinase-like domain-containing protein  45.92 
 
 		 293 aa  201  9.999999999999999e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000559808 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1498  PfkB domain protein  43.2 
 
 		 300 aa  197  2.0000000000000003e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3778  PfkB domain protein  44.93 
 
 		 297 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00891877  normal  0.801682 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6402  kinase, PfkB family  38.28 
 
 		 316 aa  163  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.223985  normal  0.0576873 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24440  sugar kinase, ribokinase  40 
 
 		 288 aa  162  8.000000000000001e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.480444  normal  0.238886 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3558  PfkB domain protein  43.2 
 
 		 287 aa  155  7e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.321996  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0735  PfkB domain-containing protein  34.78 
 
 		 317 aa  153  4e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.263465  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2001  PfkB domain protein  34.78 
 
 		 321 aa  144  1e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2148  PfkB domain-containing protein  41.36 
 
 		 312 aa  145  1e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.950763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0416  PfkB  35.12 
 
 		 320 aa  136  3.0000000000000003e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1580  ribokinase-like domain-containing protein  30.77 
 
 		 309 aa  125  8.000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0863941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0041  ribokinase-like domain-containing protein  34.2 
 
 		 304 aa  107  3e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0562  PfkB domain protein  31.42 
 
 		 328 aa  102  6e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0151  PfkB  33.46 
 
 		 331 aa  95.1  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1117  ribokinase-like domain-containing protein  32.08 
 
 		 305 aa  94  3e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.145837 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0220  ribokinase  31.72 
 
 		 305 aa  92  9e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.328501  normal  0.180212 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2477  ribokinase-like domain-containing protein  32.97 
 
 		 307 aa  92  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1170  PfkB domain-containing protein  30.5 
 
 		 305 aa  90.1  4e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0154398  normal  0.362053 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0149  PfkB  30.15 
 
 		 407 aa  90.1  4e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.029935  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2905  aminoimidazole riboside kinase  31.99 
 
 		 306 aa  89.4  7e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00998461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4160  ribokinase  30.62 
 
 		 310 aa  89  9e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0954  PfkB domain protein  27.76 
 
 		 321 aa  88.2  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.102628  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3532  ribokinase-like domain-containing protein  29.5 
 
 		 337 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321565  normal  0.851243 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0576  putative ribokinase  31.35 
 
 		 312 aa  87.8  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.588326 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3592  PfkB domain protein  32.48 
 
 		 311 aa  87.8  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0720957  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2615  PfkB domain protein  30.18 
 
 		 305 aa  86.7  4e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0147  ribokinase-like domain-containing protein  32.45 
 
 		 318 aa  86.7  5e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.719935  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2458  ribokinase  30.82 
 
 		 302 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4645  ribokinase-like domain-containing protein  31.69 
 
 		 337 aa  86.3  6e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5108  PfkB domain protein  31.69 
 
 		 337 aa  86.3  6e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.905931 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3232  ribokinase  30.82 
 
 		 302 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.493529  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3488  ribokinase  30.49 
 
 		 302 aa  85.9  7e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232463  normal  0.188896 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0078  ribokinase-like domain-containing protein  32.95 
 
 		 302 aa  85.5  9e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2872  PfkB  30.34 
 
 		 332 aa  85.5  9e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.626247 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3284  ribokinase-like domain-containing protein  29.15 
 
 		 330 aa  85.5  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000189129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0316  pfkB family carbohydrate kinase  26.72 
 
 		 330 aa  84.3  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.930013  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3284  PfkB  24.16 
 
 		 336 aa  84  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.469583  normal  0.0441315 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5186  PfkB domain protein  31.07 
 
 		 337 aa  83.6  0.000000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.430634  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0351  aminoimidazole riboside kinase  32.63 
 
 		 307 aa  83.2  0.000000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.735787  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1307  PfkB domain protein  30.26 
 
 		 338 aa  83.6  0.000000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.887451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1260  PfkB domain protein  29.67 
 
 		 331 aa  83.2  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1649  ribokinase-like domain-containing protein  33.05 
 
 		 308 aa  83.2  0.000000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0416676  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1278  PfkB domain-containing protein  32.73 
 
 		 317 aa  82.8  0.000000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.399616 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18020  sugar kinase, ribokinase  32.05 
 
 		 306 aa  82.8  0.000000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.503416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  29.64 
 
 		 302 aa  82.4  0.000000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1706  PfkB domain protein  28.32 
 
 		 319 aa  82  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3378  ribokinase-like domain-containing protein  27.48 
 
 		 330 aa  81.6  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.463525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2276  PfkB domain protein  31.07 
 
 		 307 aa  82  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.303585  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1228  ribokinase-like domain-containing protein  29.09 
 
 		 337 aa  81.6  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05691  carbohydrate kinase  23.74 
 
 		 338 aa  80.9  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0990225  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0121  ribokinase-like domain-containing protein  28.26 
 
 		 328 aa  80.9  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.02163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0395  aminoimidazole riboside kinase  30.26 
 
 		 311 aa  80.1  0.00000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0581877  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0036  pfkB family carbohydrate kinase  28.73 
 
 		 333 aa  80.1  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564268  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0215  ribokinase-like domain-containing protein  28.25 
 
 		 333 aa  80.1  0.00000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.26013  normal  0.0979989 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0070  ribokinase-like domain-containing protein  35.09 
 
 		 305 aa  80.1  0.00000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.60231  normal  0.104072 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1639  ribokinase-like domain-containing protein  29.96 
 
 		 331 aa  80.1  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.487738  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1728  PfkB  31.25 
 
 		 645 aa  79.7  0.00000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.371371  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05621  carbohydrate kinase  23.74 
 
 		 333 aa  79.7  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5056  PfkB domain protein  33.07 
 
 		 320 aa  79.7  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1030  PfkB domain protein  31.07 
 
 		 329 aa  79.7  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.185699  normal  0.340834 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0506  carbohydrate kinase-like  24.54 
 
 		 334 aa  79.3  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0200  ribokinase  28.66 
 
 		 313 aa  79.3  0.00000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.933367 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2854  ribokinase-like domain-containing protein  30.43 
 
 		 328 aa  79.7  0.00000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000011716  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0494  PfkB domain protein  29.26 
 
 		 360 aa  79  0.0000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.441156  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0218  PfkB  28.46 
 
 		 333 aa  78.2  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3755  PfkB domain protein  33.33 
 
 		 307 aa  79  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0212856  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2029  PfkB domain-containing protein  27.88 
 
 		 323 aa  78.6  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.159361  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2019  aminoimidazole riboside kinase  28.78 
 
 		 298 aa  79  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0270358  normal  0.162694 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0971  aminoimidazole riboside kinase  27.59 
 
 		 308 aa  78.2  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00309121  normal  0.0346902 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2146  fructokinase protein  29.61 
 
 		 318 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00000404752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1165  PfkB domain protein  27.95 
 
 		 335 aa  78.2  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.188666 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2565  ribokinase-like domain-containing protein  28.14 
 
 		 333 aa  77.8  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.650274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3217  PfkB domain protein  27.42 
 
 		 312 aa  78.2  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4404  ribokinase-like domain-containing protein  28.71 
 
 		 322 aa  77.8  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  normal  0.135313 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0259  ribokinase  29.93 
 
 		 295 aa  77  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00211116  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05321  carbohydrate kinase  24.54 
 
 		 333 aa  77.4  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0559209  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  27.4 
 
 		 322 aa  77.4  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  31.6 
 
 		 329 aa  77  0.0000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2234  PfkB domain protein  28.41 
 
 		 319 aa  76.6  0.0000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1142  PfkB  30.18 
 
 		 310 aa  76.3  0.0000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0676537  normal  0.093061 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2014  PfkB domain protein  28.81 
 
 		 324 aa  76.3  0.0000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3414  PfkB domain protein  29.32 
 
 		 317 aa  76.3  0.0000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0389  PfkB  28.83 
 
 		 323 aa  75.9  0.0000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.211683  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0660  ribokinase family sugar kinase  27.53 
 
 		 303 aa  75.9  0.0000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0298925  normal  0.606106 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0059  ribokinase-like domain-containing protein  30.67 
 
 		 319 aa  75.5  0.0000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1088  PfkB domain protein  25.93 
 
 		 315 aa  75.5  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.332998  normal  0.446333 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  29.18 
 
 		 306 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2461  ribokinase-like domain-containing protein  32.79 
 
 		 316 aa  75.1  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4394  ribokinase-like domain-containing protein  30.71 
 
 		 319 aa  75.5  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0284996  normal  0.833034 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0077  PfkB  28.52 
 
 		 299 aa  75.1  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.273667  normal  0.451983 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0558  PfkB domain protein  30.1 
 
 		 295 aa  75.5  0.000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0369  ribokinase-like domain-containing protein  28.74 
 
 		 322 aa  75.5  0.000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>