More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_05061 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009976  P9211_05061  carbohydrate kinase  100 
 
 
348 aa  714    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0313242  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07411  carbohydrate kinase  63.41 
 
 
342 aa  426  1e-118  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0690  carbohydrate kinase PfkB family  60.62 
 
 
338 aa  398  9.999999999999999e-111  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1838  carbohydrate kinase  58.46 
 
 
335 aa  389  1e-107  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05631  carbohydrate kinase  57.54 
 
 
335 aa  382  1e-105  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.577343 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1668  carbohydrate kinase PfkB family  61.11 
 
 
337 aa  379  1e-104  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05691  carbohydrate kinase  51.49 
 
 
338 aa  357  1.9999999999999998e-97  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0990225  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0506  carbohydrate kinase-like  49.38 
 
 
334 aa  340  2e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0149  PfkB  49.85 
 
 
407 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.029935  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05621  carbohydrate kinase  50 
 
 
333 aa  337  9.999999999999999e-92  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05321  carbohydrate kinase  47.89 
 
 
333 aa  337  1.9999999999999998e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0559209  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1228  ribokinase-like domain-containing protein  47.88 
 
 
337 aa  324  2e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2565  ribokinase-like domain-containing protein  48.3 
 
 
333 aa  315  6e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.650274  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0316  pfkB family carbohydrate kinase  46.54 
 
 
330 aa  310  2e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.930013  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2989  ribokinase-like domain-containing protein  45.99 
 
 
338 aa  310  2e-83  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4407  PfkB domain protein  47.95 
 
 
330 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0162  carbohydrate kinase  46.52 
 
 
330 aa  307  1.0000000000000001e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.98466  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0169  carbohydrate kinase  46.52 
 
 
330 aa  307  1.0000000000000001e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4087  PfkB domain protein  47.63 
 
 
330 aa  306  3e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5046  ribokinase-like domain-containing protein  47.8 
 
 
329 aa  306  3e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.151131 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0121  ribokinase-like domain-containing protein  47.81 
 
 
328 aa  306  3e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.02163  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4021  PfkB  45.28 
 
 
330 aa  305  5.0000000000000004e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.737193  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0178  ribokinase-like domain-containing protein  47.32 
 
 
331 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.613115  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2872  PfkB  48.42 
 
 
332 aa  301  8.000000000000001e-81  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.626247 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0036  pfkB family carbohydrate kinase  43.96 
 
 
333 aa  300  3e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564268  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3378  ribokinase-like domain-containing protein  46.52 
 
 
330 aa  297  2e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.463525  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3532  ribokinase-like domain-containing protein  43.56 
 
 
337 aa  296  3e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321565  normal  0.851243 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5108  PfkB domain protein  42.77 
 
 
337 aa  293  2e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.905931 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4645  ribokinase-like domain-containing protein  42.77 
 
 
337 aa  293  2e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1165  PfkB domain protein  45.57 
 
 
335 aa  292  7e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.188666 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5186  PfkB domain protein  42.77 
 
 
337 aa  291  1e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.430634  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0461  PfkB domain protein  43.69 
 
 
333 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1639  ribokinase-like domain-containing protein  41.85 
 
 
331 aa  281  1e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.487738  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1260  PfkB domain protein  43.3 
 
 
331 aa  280  2e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0251  PfkB  43.38 
 
 
333 aa  279  4e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214496  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0151  PfkB  45.06 
 
 
331 aa  277  2e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0457  PfkB  41.61 
 
 
333 aa  276  3e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0215  ribokinase-like domain-containing protein  45 
 
 
333 aa  275  7e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.26013  normal  0.0979989 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1030  pfkB family carbohydrate kinase  42.81 
 
 
330 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.577037  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2691  ribokinase-like domain-containing protein  42.81 
 
 
330 aa  272  6e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.272607  normal  0.270933 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0010  PfkB  43.26 
 
 
333 aa  271  1e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00317456  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0218  PfkB  43.57 
 
 
333 aa  269  5.9999999999999995e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0581  PfkB  41.85 
 
 
333 aa  267  2e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.189374  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0198  ribokinase-like domain-containing protein  41.28 
 
 
330 aa  257  2e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2022  ribokinase-like domain-containing protein  43.73 
 
 
330 aa  257  2e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1307  PfkB domain protein  43.67 
 
 
338 aa  257  2e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.887451  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2452  PfkB  38.46 
 
 
330 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.826037  normal  0.155331 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1671  PfkB  39.51 
 
 
331 aa  252  6e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.276087  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3022  PfkB domain protein  39.87 
 
 
333 aa  227  3e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.523599  normal  0.417909 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2568  ribokinase-like domain-containing protein  38.23 
 
 
333 aa  223  3e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2872  ribokinase-like domain-containing protein  37.27 
 
 
335 aa  213  3.9999999999999995e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.417432 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3284  ribokinase-like domain-containing protein  36 
 
 
330 aa  194  2e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000189129  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3284  PfkB  33.54 
 
 
336 aa  186  6e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.469583  normal  0.0441315 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1084  PfkB domain protein  35.28 
 
 
327 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2200  PfkB  33.64 
 
 
339 aa  184  2.0000000000000003e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000468276  decreased coverage  0.00888496 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1113  PfkB domain protein  35.28 
 
 
327 aa  184  3e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.941643 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0562  PfkB domain protein  37.77 
 
 
328 aa  183  3e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1910  carbohydrate kinase  33.02 
 
 
339 aa  181  2e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.0000000000000704659  hitchhiker  0.00127543 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1845  ribokinase-like domain-containing protein  33.85 
 
 
341 aa  177  2e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000273033  unclonable  0.000000000472438 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2854  ribokinase-like domain-containing protein  34.46 
 
 
328 aa  172  6.999999999999999e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000011716  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0819  cell division protein FtsA  32.38 
 
 
328 aa  168  1e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000392808  normal  0.759534 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1494  PfkB domain protein  32.19 
 
 
331 aa  165  9e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0243607  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2764  PfkB  32.74 
 
 
370 aa  162  6e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.040802  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0494  PfkB domain protein  31.87 
 
 
360 aa  161  1e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.441156  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0055  ribokinase-like domain-containing protein  29.84 
 
 
334 aa  142  7e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.747338  normal  0.368725 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0735  PfkB domain-containing protein  29.2 
 
 
317 aa  103  5e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.263465  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1117  ribokinase-like domain-containing protein  30.65 
 
 
305 aa  95.1  1e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.145837 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0491  PfkB  28.52 
 
 
303 aa  87.4  4e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1649  ribokinase-like domain-containing protein  27.8 
 
 
308 aa  86.7  6e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0416676  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02272  adenosine kinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06390)  26.76 
 
 
352 aa  84  0.000000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0154807  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1736  PfkB domain protein  24.56 
 
 
304 aa  83.6  0.000000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7068  PfkB  28.03 
 
 
297 aa  83.6  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2615  PfkB domain protein  22.59 
 
 
305 aa  83.6  0.000000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0082  myo-inositol catabolism protein IolC  26.2 
 
 
338 aa  82.8  0.000000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0646  ribokinase-like domain-containing protein  24.82 
 
 
328 aa  82  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_18364  predicted protein  28.8 
 
 
273 aa  82  0.00000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.132458 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0902  PfkB domain protein  26.02 
 
 
309 aa  82.4  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2483  PfkB domain protein  24.58 
 
 
302 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1755  PfkB domain protein  25.55 
 
 
304 aa  80.9  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0041  ribokinase-like domain-containing protein  26.04 
 
 
304 aa  80.5  0.00000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1201  ribokinase-like domain-containing protein  27.74 
 
 
298 aa  80.5  0.00000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1278  PfkB domain-containing protein  25.88 
 
 
317 aa  79.7  0.00000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.399616 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0078  ribokinase-like domain-containing protein  29.62 
 
 
302 aa  79.7  0.00000000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0967  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  29.84 
 
 
300 aa  79  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0230959  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_618  sugar kinase ribokinase  25.55 
 
 
328 aa  79  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50659  predicted protein  25 
 
 
347 aa  77.8  0.0000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0660  ribokinase family sugar kinase  26.97 
 
 
303 aa  76.6  0.0000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0298925  normal  0.606106 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05942  inosine-guanosine kinase  25.75 
 
 
434 aa  76.6  0.0000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2659  inosine kinase  27.24 
 
 
434 aa  76.3  0.0000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0486522  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1802  Inosine kinase  27.24 
 
 
434 aa  76.3  0.0000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0521986  hitchhiker  0.0000108014 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2544  inosine kinase  27.24 
 
 
434 aa  76.3  0.0000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.247957  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2582  inosine kinase  27.24 
 
 
434 aa  76.3  0.0000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00525217  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5895  sugar kinase, putative  28.4 
 
 
304 aa  76.3  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.760771  normal  0.0122717 
 
 
-
 
NC_002936  DET0711  carbohydrate kinase  23.78 
 
 
328 aa  75.9  0.0000000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2845  inosine kinase  26.85 
 
 
434 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000469104  decreased coverage  0.00000000256797 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1530  inosine kinase  27.63 
 
 
442 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00064994  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2903  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  27.76 
 
 
299 aa  75.1  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.859362  hitchhiker  0.00094244 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2295  inosine kinase  28.02 
 
 
434 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000546869  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4464  aminoimidazole riboside kinase  24.27 
 
 
319 aa  75.1  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.680577  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1541  inosine kinase  27.24 
 
 
434 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.209586  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>