More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_2477 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009667  Oant_2477  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 		 307 aa  613  9.999999999999999e-175  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4394  ribokinase-like domain-containing protein  31.69 
 
 		 319 aa  125  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0284996  normal  0.833034 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0660  ribokinase family sugar kinase  33 
 
 		 303 aa  120  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0298925  normal  0.606106 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1498  PfkB domain protein  35.09 
 
 		 300 aa  110  4.0000000000000004e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3857  PfkB domain protein  33.33 
 
 		 373 aa  107  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1706  PfkB domain protein  27.88 
 
 		 319 aa  106  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24440  sugar kinase, ribokinase  33.84 
 
 		 288 aa  100  3e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.480444  normal  0.238886 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2607  PfkB domain protein  32.41 
 
 		 363 aa  100  4e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000945109 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2897  ribokinase-like domain-containing protein  32.31 
 
 		 387 aa  96.3  6e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7068  PfkB  32.44 
 
 		 297 aa  95.1  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0147  ribokinase-like domain-containing protein  31.16 
 
 		 318 aa  92.8  6e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.719935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2129  putative sugar kinase  32.97 
 
 		 298 aa  92  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.101939  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2589  PfkB domain protein  30.56 
 
 		 387 aa  90.1  5e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1627  PfkB domain protein  28.76 
 
 		 309 aa  90.1  5e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.100578  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2294  ribokinase-like domain-containing protein  28.85 
 
 		 317 aa  89.4  7e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2767  putative carbohydrate kinase  29.33 
 
 		 385 aa  88.6  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.634409  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00870  sugar kinase, ribokinase  30.18 
 
 		 445 aa  85.5  9e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.454231  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22680  PfkB domain protein  24.92 
 
 		 314 aa  84.7  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.531518  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1649  ribokinase-like domain-containing protein  29.07 
 
 		 308 aa  84.3  0.000000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0416676  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0491  PfkB  30.29 
 
 		 303 aa  84.3  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2057  PfkB family kinase  28.11 
 
 		 315 aa  83.6  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.124987  normal  0.010035 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0873  ribokinase-like domain-containing protein  31.39 
 
 		 315 aa  82.8  0.000000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.763397  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01741  predicted kinase  27.71 
 
 		 315 aa  82  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3558  PfkB domain protein  30.77 
 
 		 287 aa  82  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.321996  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01729  hypothetical protein  27.71 
 
 		 315 aa  82  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0041  ribokinase-like domain-containing protein  31.52 
 
 		 304 aa  82  0.00000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4692  PfkB domain protein  33.33 
 
 		 307 aa  82  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.099486  normal  0.349994 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1870  PfkB domain protein  27.71 
 
 		 315 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0114143  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3378  PfkB domain protein  33.6 
 
 		 316 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0607501 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0169  ribokinase-like domain-containing protein  30.16 
 
 		 312 aa  80.9  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1419  PfkB family kinase  27.71 
 
 		 315 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.997387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1856  PfkB family kinase  27.71 
 
 		 315 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0158072  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1996  PfkB family kinase  27.71 
 
 		 315 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1117  ribokinase-like domain-containing protein  28.57 
 
 		 305 aa  81.3  0.00000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.145837 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1654  ribokinase-like domain-containing protein  37.02 
 
 		 330 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.290792  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1860  ribokinase-like domain-containing protein  27.31 
 
 		 315 aa  79.7  0.00000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.335723  decreased coverage  0.00000390561 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1654  ribokinase-like domain-containing protein  37.57 
 
 		 330 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.909879 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1976  putative ribokinase  39.22 
 
 		 305 aa  79.3  0.00000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.191043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1746  ribokinase-like domain-containing protein  31.58 
 
 		 330 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.931195 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26890  2-ketogluconate kinase  32.55 
 
 		 314 aa  79  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00940196  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0501  PfkB domain protein  30 
 
 		 320 aa  79  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.501412  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2380  ribokinase-like domain-containing protein  32.81 
 
 		 316 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5029  ribokinase family sugar kinase  38.12 
 
 		 330 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.351369 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1626  PfkB domain protein  32.22 
 
 		 319 aa  78.2  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.124685  normal  0.814532 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6346  PfkB  31.12 
 
 		 330 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1580  ribokinase-like domain-containing protein  27.76 
 
 		 309 aa  77.8  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0863941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1733  ribokinase-like domain-containing protein  31.12 
 
 		 330 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1520  PfkB domain protein  29.58 
 
 		 371 aa  77.4  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.395402  normal  0.0514354 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4766  ribokinase-like domain-containing protein  30.92 
 
 		 313 aa  77.4  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.417619 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3217  PfkB domain protein  26.37 
 
 		 312 aa  76.6  0.0000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2854  ribokinase-like domain-containing protein  39.29 
 
 		 328 aa  77  0.0000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000011716  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5122  PfkB domain protein  31.21 
 
 		 347 aa  76.6  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0283  PfkB domain protein  28.82 
 
 		 292 aa  76.6  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.686629  normal  0.98072 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2566  ribokinase-like domain-containing protein  32.06 
 
 		 316 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.255946  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2496  kinase, pfkB family  26.8 
 
 		 310 aa  76.3  0.0000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0749  ribokinase  26.32 
 
 		 306 aa  76.3  0.0000000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000720941  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3563  PfkB domain protein  31.6 
 
 		 300 aa  76.3  0.0000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.247861  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2615  PfkB domain protein  27.61 
 
 		 305 aa  75.9  0.0000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2278  PfkB domain protein  30.97 
 
 		 327 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.741137  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2385  PfkB domain-containing protein  30.58 
 
 		 297 aa  75.5  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.790997  normal  0.420761 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3300  PfkB domain protein  29.25 
 
 		 314 aa  75.5  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.369715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3778  PfkB domain protein  31.54 
 
 		 297 aa  75.1  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00891877  normal  0.801682 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1170  PfkB domain-containing protein  27.81 
 
 		 305 aa  75.1  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0154398  normal  0.362053 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1526  ribokinase-like domain-containing protein  30.9 
 
 		 328 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.198304  normal  0.764115 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1980  sugar (2-ketogluconate) kinase  31.52 
 
 		 327 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0210202 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0735  PfkB domain-containing protein  26.69 
 
 		 317 aa  74.7  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.263465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0059  ribokinase-like domain-containing protein  29.45 
 
 		 319 aa  73.9  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0416  PfkB  26.59 
 
 		 320 aa  73.6  0.000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3290  PfkB domain protein  27.12 
 
 		 320 aa  73.6  0.000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1406  ribokinase-like domain-containing protein  23.89 
 
 		 302 aa  72.8  0.000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3998  ribokinase-like domain-containing protein  29.01 
 
 		 308 aa  72.8  0.000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0662614  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1884  ribokinase  27.39 
 
 		 310 aa  72.4  0.000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0118065  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1201  ribokinase-like domain-containing protein  24.82 
 
 		 298 aa  72.4  0.000000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0518  ribokinase  26.41 
 
 		 307 aa  72.4  0.000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2979  putative 2-ketogluconate kinase  32.75 
 
 		 316 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.441094  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0275  PfkB domain-containing protein  28.92 
 
 		 312 aa  71.6  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0756  PfkB domain protein  29.31 
 
 		 329 aa  72  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0819977  normal  0.156556 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1603  ribokinase  25.91 
 
 		 310 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000677641  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3386  ribokinase-like domain-containing protein  29.64 
 
 		 298 aa  71.6  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.139536 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  26.59 
 
 		 308 aa  70.9  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0289  ribokinase-like domain-containing protein  29.76 
 
 		 315 aa  70.5  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0274  PfkB  29.01 
 
 		 306 aa  70.5  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0457  ribokinase-like domain-containing protein  26.42 
 
 		 313 aa  70.5  0.00000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35340  putative 2-ketogluconate kinase  32.13 
 
 		 316 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00857937  normal  0.115887 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0690  PfkB domain protein  38.26 
 
 		 329 aa  70.9  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.107436  normal  0.316336 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2909  ribokinase  27.81 
 
 		 302 aa  70.5  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0179509 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1622  PfkB domain protein  22.67 
 
 		 297 aa  69.7  0.00000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2067  ribokinase-like domain-containing protein  29.73 
 
 		 324 aa  70.1  0.00000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0314864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4209  ribokinase  26.64 
 
 		 308 aa  69.7  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.847437  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3225  ribokinase  26.45 
 
 		 311 aa  69.7  0.00000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1124  ribokinase  24.92 
 
 		 403 aa  69.7  0.00000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0008  ribokinase  26.64 
 
 		 308 aa  69.3  0.00000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0252287  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0008  ribokinase  26.64 
 
 		 308 aa  69.3  0.00000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000914124  normal  0.985734 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5895  sugar kinase, putative  35.71 
 
 		 304 aa  68.9  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.760771  normal  0.0122717 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0007  ribokinase  26.59 
 
 		 306 aa  68.9  0.00000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.328015  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1470  ribokinase-like domain-containing protein  28.33 
 
 		 298 aa  68.9  0.00000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3280  2-keto-3-deoxygluconate kinase  23.42 
 
 		 312 aa  68.9  0.00000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.3989  normal  0.0530742 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2001  PfkB domain protein  28.09 
 
 		 321 aa  68.9  0.00000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0253  ribokinase  25.59 
 
 		 304 aa  68.6  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2096  putative 2-keto-gluconokinase  36.09 
 
 		 329 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>