More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3778 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_3778  PfkB domain protein  100 
 
 
297 aa  561  1.0000000000000001e-159  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00891877  normal  0.801682 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1498  PfkB domain protein  52.76 
 
 
300 aa  235  7e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7068  PfkB  46.44 
 
 
297 aa  210  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1627  PfkB domain protein  48.47 
 
 
309 aa  206  5e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.100578  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2129  putative sugar kinase  46.28 
 
 
298 aa  202  8e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.101939  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24440  sugar kinase, ribokinase  52.81 
 
 
288 aa  200  1.9999999999999998e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.480444  normal  0.238886 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0491  PfkB  45.92 
 
 
303 aa  191  9e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2385  PfkB domain-containing protein  45.42 
 
 
297 aa  191  1e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.790997  normal  0.420761 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3300  PfkB domain protein  43.05 
 
 
314 aa  185  8e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.369715  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1755  PfkB domain protein  44.59 
 
 
304 aa  179  7e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1435  ribokinase-like domain-containing protein  46.8 
 
 
293 aa  171  1e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000559808 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1470  ribokinase-like domain-containing protein  46.31 
 
 
298 aa  169  6e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6402  kinase, PfkB family  38.44 
 
 
316 aa  138  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.223985  normal  0.0576873 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3558  PfkB domain protein  43.1 
 
 
287 aa  136  5e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.321996  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0735  PfkB domain-containing protein  29.39 
 
 
317 aa  115  7.999999999999999e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.263465  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1142  PfkB  37.25 
 
 
310 aa  115  8.999999999999998e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0676537  normal  0.093061 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2148  PfkB domain-containing protein  37.37 
 
 
312 aa  108  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.950763  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0416  PfkB  32.55 
 
 
320 aa  107  2e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1580  ribokinase-like domain-containing protein  33 
 
 
309 aa  107  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0863941  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1170  PfkB domain-containing protein  32.99 
 
 
305 aa  105  7e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0154398  normal  0.362053 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2615  PfkB domain protein  34.11 
 
 
305 aa  105  9e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0752  ribokinase-like domain-containing protein  36.11 
 
 
310 aa  102  8e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5186  PfkB domain protein  34.63 
 
 
337 aa  96.3  6e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.430634  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4645  ribokinase-like domain-containing protein  34.3 
 
 
337 aa  95.5  9e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5108  PfkB domain protein  34.3 
 
 
337 aa  95.5  9e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.905931 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2477  ribokinase-like domain-containing protein  32.89 
 
 
307 aa  94.7  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2001  PfkB domain protein  29.19 
 
 
321 aa  94.4  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0041  ribokinase-like domain-containing protein  32.72 
 
 
304 aa  93.2  5e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1307  PfkB domain protein  31.16 
 
 
338 aa  90.9  3e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.887451  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0149  PfkB  33.59 
 
 
407 aa  90.5  3e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.029935  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1706  PfkB domain protein  31.44 
 
 
319 aa  90.1  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0185  ribokinase  30.83 
 
 
291 aa  89.4  6e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000069064  normal  0.0609987 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3532  ribokinase-like domain-containing protein  34.77 
 
 
337 aa  89  8e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321565  normal  0.851243 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1639  ribokinase-like domain-containing protein  34.67 
 
 
331 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.487738  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3350  hypothetical protein  32.51 
 
 
315 aa  87.4  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.373497 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1117  ribokinase-like domain-containing protein  29.96 
 
 
305 aa  87  3e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.145837 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2458  ribokinase  29.8 
 
 
302 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0690  carbohydrate kinase PfkB family  30.4 
 
 
338 aa  84.7  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3232  ribokinase  30.03 
 
 
302 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.493529  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0121  ribokinase-like domain-containing protein  35.06 
 
 
328 aa  82.4  0.000000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.02163  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1260  PfkB domain protein  33.21 
 
 
331 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2565  ribokinase-like domain-containing protein  30.71 
 
 
333 aa  81.6  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.650274  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2297  ribokinase  30.07 
 
 
309 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0434925  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3022  PfkB domain protein  34.21 
 
 
333 aa  81.3  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.523599  normal  0.417909 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0494  PfkB domain protein  30.43 
 
 
360 aa  80.5  0.00000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.441156  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3488  ribokinase  29.47 
 
 
302 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232463  normal  0.188896 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3378  ribokinase-like domain-containing protein  30.48 
 
 
330 aa  79.7  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.463525  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0506  carbohydrate kinase-like  26.55 
 
 
334 aa  79.7  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2294  ribokinase-like domain-containing protein  28.93 
 
 
317 aa  79.7  0.00000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  28.66 
 
 
302 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1165  PfkB domain protein  31 
 
 
335 aa  79.3  0.00000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.188666 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2764  PfkB domain protein  34.27 
 
 
289 aa  79  0.00000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.11778  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0147  ribokinase-like domain-containing protein  29.45 
 
 
318 aa  78.6  0.0000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.719935  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0869  ribokinase-like domain-containing protein  21.93 
 
 
290 aa  78.6  0.0000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3738  carbohydrate kinase  31.69 
 
 
315 aa  79  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0822309  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1010  ribokinase-like domain-containing protein  30.69 
 
 
290 aa  78.6  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3470  ribokinase  31.69 
 
 
315 aa  79  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.973567  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1278  PfkB domain-containing protein  32.64 
 
 
317 aa  78.6  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.399616 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1838  carbohydrate kinase  26.55 
 
 
335 aa  78.2  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1668  carbohydrate kinase PfkB family  31.72 
 
 
337 aa  77.8  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000598  fructokinase  31.11 
 
 
337 aa  77.8  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00217717  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05631  carbohydrate kinase  26.55 
 
 
335 aa  77.8  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.577343 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0660  ribokinase family sugar kinase  30.38 
 
 
303 aa  77.4  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0298925  normal  0.606106 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1603  ribokinase  23.28 
 
 
310 aa  77  0.0000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000677641  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2905  aminoimidazole riboside kinase  29.86 
 
 
306 aa  77  0.0000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00998461  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1084  PfkB domain protein  27.03 
 
 
327 aa  76.6  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07411  carbohydrate kinase  28.74 
 
 
342 aa  76.6  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2019  aminoimidazole riboside kinase  32.89 
 
 
298 aa  76.3  0.0000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0270358  normal  0.162694 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2872  PfkB  30.5 
 
 
332 aa  76.3  0.0000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.626247 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0289  ribokinase-like domain-containing protein  27.2 
 
 
315 aa  75.5  0.0000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4160  ribokinase  30.49 
 
 
310 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22680  PfkB domain protein  26 
 
 
314 aa  75.5  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.531518  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1113  PfkB domain protein  26.64 
 
 
327 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.941643 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05621  carbohydrate kinase  26.28 
 
 
333 aa  75.5  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05321  carbohydrate kinase  25.93 
 
 
333 aa  75.1  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0559209  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0078  ribokinase-like domain-containing protein  30.57 
 
 
302 aa  75.5  0.000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0169  carbohydrate kinase  29.22 
 
 
330 aa  74.7  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2838  ribokinase  29.96 
 
 
314 aa  74.3  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.760591  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0162  carbohydrate kinase  29.22 
 
 
330 aa  74.7  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.98466  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3869  ribokinase  28.69 
 
 
299 aa  73.9  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559054 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0151  PfkB  32.1 
 
 
331 aa  73.9  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0200  ribokinase  27.24 
 
 
313 aa  73.6  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.933367 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1884  ribokinase  22.95 
 
 
310 aa  73.9  0.000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0118065  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4692  PfkB domain protein  35.45 
 
 
307 aa  73.6  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.099486  normal  0.349994 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1220  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  25.42 
 
 
302 aa  73.9  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.515057  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0492  ribokinase-like domain-containing protein  25.42 
 
 
302 aa  73.9  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0070  ribokinase-like domain-containing protein  32.14 
 
 
305 aa  73.6  0.000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.60231  normal  0.104072 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39540  sugar kinase, ribokinase  34.75 
 
 
296 aa  73.6  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.893162 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0576  putative ribokinase  30.82 
 
 
312 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.588326 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0954  PfkB domain protein  27.38 
 
 
321 aa  73.6  0.000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.102628  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0316  pfkB family carbohydrate kinase  28.63 
 
 
330 aa  73.6  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.930013  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2022  ribokinase-like domain-containing protein  31.82 
 
 
330 aa  72.8  0.000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3563  PfkB domain protein  33.33 
 
 
300 aa  72.8  0.000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.247861  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0077  PfkB  27.99 
 
 
299 aa  72.4  0.000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.273667  normal  0.451983 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2764  PfkB  27.44 
 
 
370 aa  72.4  0.000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.040802  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1649  ribokinase-like domain-containing protein  29.21 
 
 
308 aa  72.4  0.000000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0416676  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01440  sugar kinase, ribokinase  34.66 
 
 
315 aa  72  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3592  PfkB domain protein  31.48 
 
 
311 aa  72  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0720957  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0873  ribokinase-like domain-containing protein  31.19 
 
 
315 aa  72  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.763397  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1228  ribokinase-like domain-containing protein  30.66 
 
 
337 aa  71.6  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>