More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4135 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_4135  PfkB  100 
 
 		 306 aa  623  1e-177  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0867142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2923  carbohydrate kinase, PfkB  59.67 
 
 		 308 aa  331  9e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.123757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15170  sugar kinase, ribokinase  46.1 
 
 		 316 aa  243  3e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.295543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18020  sugar kinase, ribokinase  47.85 
 
 		 306 aa  242  7e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.503416  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3478  PfkB domain protein  45.83 
 
 		 327 aa  229  3e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06080  sugar kinase, ribokinase  42.38 
 
 		 303 aa  202  7e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2287  PfkB domain protein  41.1 
 
 		 313 aa  196  3e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08200  sugar kinase, ribokinase  41.27 
 
 		 322 aa  195  1e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.650554 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0290  kinase, PfkB family  31.16 
 
 		 374 aa  149  5e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2236  PfkB family kinase  30.23 
 
 		 321 aa  110  3e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3080  kinase, PfkB family  30.92 
 
 		 321 aa  109  5e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0595039 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2488  PfkB family kinase  30.59 
 
 		 321 aa  106  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1089  ribokinase family sugar kinase  29.63 
 
 		 338 aa  106  5e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0219735  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2331  kinase PfkB family  30.59 
 
 		 321 aa  106  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.194167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2380  kinase, PfkB family  30.84 
 
 		 321 aa  106  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.511168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2376  kinase, PfkB family  30.59 
 
 		 321 aa  105  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.15593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0963  PfkB family kinase  30.23 
 
 		 321 aa  105  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.964628 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2287  kinase, PfkB family  30.52 
 
 		 321 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2389  PfkB family kinase  30.23 
 
 		 321 aa  103  3e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1557  PfkB domain protein  29.9 
 
 		 321 aa  102  6e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.232611  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02028  predicted kinase  29.9 
 
 		 321 aa  102  7e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01992  hypothetical protein  29.9 
 
 		 321 aa  102  7e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1117  ribokinase-like domain-containing protein  30.26 
 
 		 305 aa  101  2e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.145837 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1001  PfkB domain protein  30.03 
 
 		 325 aa  99  8e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3309  PfkB domain protein  28.39 
 
 		 325 aa  99  9e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1011  ribokinase-like domain-containing protein  29.39 
 
 		 398 aa  97.1  3e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0159  ribokinase-like domain-containing protein  25.6 
 
 		 295 aa  96.7  4e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000338  ribokinase  30.52 
 
 		 305 aa  94.7  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  32.36 
 
 		 308 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3608  PfkB domain protein  31 
 
 		 312 aa  94  3e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0518  ribokinase  30.29 
 
 		 307 aa  94  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0007  ribokinase  31.19 
 
 		 306 aa  94  3e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.328015  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1137  kinase, PfkB family  28.9 
 
 		 316 aa  93.2  5e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.231812  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0615  PfkB  29.81 
 
 		 317 aa  92.8  7e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3407  ribokinase  30.38 
 
 		 424 aa  92.4  7e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1124  ribokinase  27.69 
 
 		 403 aa  91.7  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  31.7 
 
 		 308 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2283  ribokinase  28.9 
 
 		 310 aa  91.3  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.269259 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2526  ribokinase  28.99 
 
 		 301 aa  90.5  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0616  ribokinase-like domain-containing protein  26.79 
 
 		 315 aa  90.5  3e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00109848  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2216  ribokinase, putative  24.48 
 
 		 312 aa  90.1  4e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.442783  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0041  ribokinase-like domain-containing protein  29.1 
 
 		 304 aa  90.1  5e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0078  ribokinase-like domain-containing protein  28.67 
 
 		 302 aa  90.1  5e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4897  ribokinase  29.97 
 
 		 318 aa  89.7  6e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00647815  hitchhiker  0.000000886041 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1980  ribokinase  29.77 
 
 		 302 aa  89.7  6e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4209  ribokinase  28.44 
 
 		 308 aa  88.2  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.847437  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0008  ribokinase  28.44 
 
 		 308 aa  87.8  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000914124  normal  0.985734 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0008  ribokinase  28.44 
 
 		 308 aa  87.8  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0252287  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1470  ribokinase family sugar kinase  23.61 
 
 		 291 aa  87.8  2e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0475498  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3718  ribokinase  34.01 
 
 		 318 aa  87.4  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06142  ribokinase  29.55 
 
 		 305 aa  87.4  3e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0635  ribokinase-like domain-containing protein  26.79 
 
 		 315 aa  86.7  5e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.377528  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  30.32 
 
 		 305 aa  86.3  6e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0735  PfkB domain-containing protein  26.82 
 
 		 317 aa  85.9  9e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.263465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1534  ribokinase-like domain-containing protein  27.6 
 
 		 297 aa  85.1  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.260714 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4124  ribokinase  27.51 
 
 		 403 aa  85.5  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1622  PfkB domain protein  26.6 
 
 		 297 aa  85.5  0.000000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2471  ribokinase  33.11 
 
 		 297 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0416  PfkB  26.3 
 
 		 320 aa  84  0.000000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4749  ribokinase  32.33 
 
 		 309 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2001  PfkB domain protein  27.27 
 
 		 321 aa  82.8  0.000000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1987  PfkB  26.71 
 
 		 318 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.903006  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2597  ribokinase-like domain-containing protein  26.71 
 
 		 318 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4641  ribokinase  27.21 
 
 		 298 aa  82.4  0.000000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.184783  unclonable  5.38833e-26 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  27.8 
 
 		 308 aa  82.4  0.000000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3225  ribokinase  26.11 
 
 		 311 aa  81.6  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5928  ribokinase family sugar kinase  27.04 
 
 		 318 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3538  PfkB domain protein  27.45 
 
 		 310 aa  82  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000797657  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3290  PfkB domain protein  28.2 
 
 		 320 aa  82  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3284  PfkB  27.2 
 
 		 336 aa  82  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.469583  normal  0.0441315 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0697  ribokinase  27.21 
 
 		 298 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0813613  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1789  ribokinase  27.04 
 
 		 297 aa  82  0.00000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000225274  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2458  ribokinase  30.03 
 
 		 302 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0005  ribokinase, putative  28.34 
 
 		 313 aa  81.3  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0831175  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4524  ribokinase  27.85 
 
 		 308 aa  81.3  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00216955  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3196  ribokinase  29.21 
 
 		 316 aa  81.3  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.20247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4160  ribokinase  30.84 
 
 		 310 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2621  ribokinase-like domain-containing protein  26.38 
 
 		 318 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.712892  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2146  fructokinase protein  27.99 
 
 		 318 aa  80.5  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00000404752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3332  ribokinase  28.99 
 
 		 297 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0869  ribokinase-like domain-containing protein  25.26 
 
 		 290 aa  80.9  0.00000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2909  ribokinase  30.27 
 
 		 302 aa  80.5  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0179509 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0147  ribokinase-like domain-containing protein  27.03 
 
 		 318 aa  80.5  0.00000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.719935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1507  ribokinase  31.33 
 
 		 308 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  29.76 
 
 		 306 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2689  ribokinase  25.95 
 
 		 345 aa  80.1  0.00000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2121  PfkB  26.45 
 
 		 307 aa  79.7  0.00000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.987568  normal  0.281407 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2764  PfkB  28.14 
 
 		 370 aa  79.7  0.00000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.040802  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7448  cyclic nucleotide-binding protein  27.12 
 
 		 314 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0819  cell division protein FtsA  25.83 
 
 		 328 aa  79.7  0.00000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000392808  normal  0.759534 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0579  ribokinase  26.5 
 
 		 298 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4200  ribokinase  29.71 
 
 		 326 aa  79.7  0.00000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0354  ribokinase  29.51 
 
 		 308 aa  79.3  0.00000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  28.52 
 
 		 302 aa  79.3  0.00000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5194  ribokinase  29.84 
 
 		 328 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0135726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1526  ribokinase  31.33 
 
 		 308 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395922  normal  0.909431 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22680  PfkB domain protein  26.87 
 
 		 314 aa  79.3  0.00000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.531518  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3869  ribokinase  29 
 
 		 299 aa  79  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559054 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1130  ribokinase  31.67 
 
 		 311 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3505  PfkB  27.56 
 
 		 298 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>