More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_5186 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_5186  PfkB domain protein  100 
 
 		 337 aa  673    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.430634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5108  PfkB domain protein  95.85 
 
 		 337 aa  654    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.905931 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4645  ribokinase-like domain-containing protein  95.85 
 
 		 337 aa  654    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3532  ribokinase-like domain-containing protein  78.93 
 
 		 337 aa  536  1e-151  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321565  normal  0.851243 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1639  ribokinase-like domain-containing protein  75.3 
 
 		 331 aa  491  9.999999999999999e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.487738  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1260  PfkB domain protein  74.4 
 
 		 331 aa  483  1e-135  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1165  PfkB domain protein  61.49 
 
 		 335 aa  404  1e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.188666 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0036  pfkB family carbohydrate kinase  60.12 
 
 		 333 aa  391  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564268  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2565  ribokinase-like domain-containing protein  60.12 
 
 		 333 aa  391  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.650274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0215  ribokinase-like domain-containing protein  60.66 
 
 		 333 aa  380  1e-104  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.26013  normal  0.0979989 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0461  PfkB domain protein  58.21 
 
 		 333 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0218  PfkB  58.91 
 
 		 333 aa  364  1e-99  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0457  PfkB  55.22 
 
 		 333 aa  361  9e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0010  PfkB  58.21 
 
 		 333 aa  360  2e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00317456  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0251  PfkB  57.01 
 
 		 333 aa  358  5e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0581  PfkB  56.72 
 
 		 333 aa  355  7.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.189374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0121  ribokinase-like domain-containing protein  58.07 
 
 		 328 aa  352  5.9999999999999994e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.02163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4021  PfkB  53.41 
 
 		 330 aa  351  1e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.737193  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1228  ribokinase-like domain-containing protein  54.43 
 
 		 337 aa  341  1e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0169  carbohydrate kinase  52.1 
 
 		 330 aa  340  2e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0162  carbohydrate kinase  52.1 
 
 		 330 aa  340  2e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.98466  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0178  ribokinase-like domain-containing protein  51.64 
 
 		 331 aa  336  3.9999999999999995e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.613115  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3378  ribokinase-like domain-containing protein  52.41 
 
 		 330 aa  332  8e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.463525  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4407  PfkB domain protein  51.05 
 
 		 330 aa  331  1e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0316  pfkB family carbohydrate kinase  50.15 
 
 		 330 aa  330  2e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.930013  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4087  PfkB domain protein  51.35 
 
 		 330 aa  328  6e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0149  PfkB  53.54 
 
 		 407 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.029935  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0690  carbohydrate kinase PfkB family  51.06 
 
 		 338 aa  315  9e-85  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07411  carbohydrate kinase  49.39 
 
 		 342 aa  306  3e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1838  carbohydrate kinase  44.41 
 
 		 335 aa  300  2e-80  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5046  ribokinase-like domain-containing protein  49.11 
 
 		 329 aa  299  4e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151131 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1307  PfkB domain protein  51.67 
 
 		 338 aa  297  1e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.887451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1668  carbohydrate kinase PfkB family  50.15 
 
 		 337 aa  296  2e-79  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2872  PfkB  49.54 
 
 		 332 aa  296  3e-79  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.626247 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05631  carbohydrate kinase  44.11 
 
 		 335 aa  296  3e-79  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.577343 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05061  carbohydrate kinase  42.77 
 
 		 348 aa  291  1e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0313242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0151  PfkB  50 
 
 		 331 aa  286  4e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2989  ribokinase-like domain-containing protein  47.72 
 
 		 338 aa  282  6.000000000000001e-75  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1030  pfkB family carbohydrate kinase  47.59 
 
 		 330 aa  278  8e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.577037  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2691  ribokinase-like domain-containing protein  47.59 
 
 		 330 aa  278  1e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.272607  normal  0.270933 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2022  ribokinase-like domain-containing protein  49.54 
 
 		 330 aa  271  1e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0198  ribokinase-like domain-containing protein  47.77 
 
 		 330 aa  268  1e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05691  carbohydrate kinase  38.02 
 
 		 338 aa  263  3e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0990225  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0506  carbohydrate kinase-like  39.21 
 
 		 334 aa  261  1e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05321  carbohydrate kinase  38.79 
 
 		 333 aa  257  2e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0559209  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05621  carbohydrate kinase  38.79 
 
 		 333 aa  256  3e-67  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1671  PfkB  42.52 
 
 		 331 aa  243  3e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.276087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2452  PfkB  41.06 
 
 		 330 aa  241  1e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.826037  normal  0.155331 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2872  ribokinase-like domain-containing protein  44.05 
 
 		 335 aa  225  9e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.417432 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3022  PfkB domain protein  42.41 
 
 		 333 aa  222  8e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.523599  normal  0.417909 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2568  ribokinase-like domain-containing protein  41.92 
 
 		 333 aa  213  4.9999999999999996e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3284  ribokinase-like domain-containing protein  35.31 
 
 		 330 aa  188  1e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000189129  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0562  PfkB domain protein  34.56 
 
 		 328 aa  184  2.0000000000000003e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3284  PfkB  34.26 
 
 		 336 aa  181  2e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.469583  normal  0.0441315 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1494  PfkB domain protein  34.47 
 
 		 331 aa  172  5.999999999999999e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0243607  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1113  PfkB domain protein  33.86 
 
 		 327 aa  172  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.941643 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1084  PfkB domain protein  33.65 
 
 		 327 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0494  PfkB domain protein  37.73 
 
 		 360 aa  160  4e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.441156  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0819  cell division protein FtsA  33.12 
 
 		 328 aa  160  4e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000392808  normal  0.759534 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2764  PfkB  33.94 
 
 		 370 aa  154  2e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.040802  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0055  ribokinase-like domain-containing protein  33.33 
 
 		 334 aa  139  6e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.747338  normal  0.368725 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2854  ribokinase-like domain-containing protein  34.29 
 
 		 328 aa  136  5e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000011716  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1845  ribokinase-like domain-containing protein  28.35 
 
 		 341 aa  127  4.0000000000000003e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000273033  unclonable  0.000000000472438 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2200  PfkB  27.74 
 
 		 339 aa  114  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000468276  decreased coverage  0.00888496 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0735  PfkB domain-containing protein  32.62 
 
 		 317 aa  110  3e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.263465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1910  carbohydrate kinase  27.96 
 
 		 339 aa  110  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.0000000000000704659  hitchhiker  0.00127543 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7068  PfkB  35.04 
 
 		 297 aa  107  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1117  ribokinase-like domain-containing protein  34.59 
 
 		 305 aa  106  7e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.145837 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24440  sugar kinase, ribokinase  36.07 
 
 		 288 aa  103  4e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.480444  normal  0.238886 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0491  PfkB  31.25 
 
 		 303 aa  100  4e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1498  PfkB domain protein  35.04 
 
 		 300 aa  97.1  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1755  PfkB domain protein  34.26 
 
 		 304 aa  96.7  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_18364  predicted protein  30.86 
 
 		 273 aa  93.2  6e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.132458 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1627  PfkB domain protein  32.25 
 
 		 309 aa  90.5  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.100578  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0902  PfkB domain protein  32.84 
 
 		 309 aa  89  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0041  ribokinase-like domain-containing protein  32.36 
 
 		 304 aa  88.6  1e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2001  PfkB domain protein  31.36 
 
 		 321 aa  87.8  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0416  PfkB  28.91 
 
 		 320 aa  85.5  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2385  PfkB domain-containing protein  31.05 
 
 		 297 aa  85.1  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.790997  normal  0.420761 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1580  ribokinase-like domain-containing protein  29.62 
 
 		 309 aa  83.6  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0863941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2129  putative sugar kinase  31.07 
 
 		 298 aa  83.6  0.000000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.101939  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0949  PfkB  34.73 
 
 		 301 aa  83.6  0.000000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39540  sugar kinase, ribokinase  32.11 
 
 		 296 aa  82.8  0.000000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.893162 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2014  PfkB domain protein  31.39 
 
 		 324 aa  82.4  0.000000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6402  kinase, PfkB family  29.41 
 
 		 316 aa  82  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.223985  normal  0.0576873 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0078  ribokinase-like domain-containing protein  32.35 
 
 		 302 aa  82.4  0.00000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2461  ribokinase-like domain-containing protein  31.95 
 
 		 316 aa  80.1  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1278  PfkB domain-containing protein  28.48 
 
 		 317 aa  79.3  0.00000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.399616 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1728  PfkB  27.87 
 
 		 645 aa  78.2  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.371371  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0070  ribokinase-like domain-containing protein  33.83 
 
 		 305 aa  78.6  0.0000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.60231  normal  0.104072 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0077  PfkB  29.04 
 
 		 299 aa  77  0.0000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.273667  normal  0.451983 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2132  PfkB domain protein  33.12 
 
 		 344 aa  76.6  0.0000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0982  PfkB domain protein  25.65 
 
 		 644 aa  76.6  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1135  PfkB domain protein  25.97 
 
 		 644 aa  75.9  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.488845 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4591  ribokinase  33.45 
 
 		 295 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4112  ribokinase  30.45 
 
 		 309 aa  75.1  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4218  ribokinase  30.45 
 
 		 309 aa  74.7  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.980767 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4277  ribokinase  30.45 
 
 		 309 aa  74.7  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.136431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4168  ribokinase  30.45 
 
 		 309 aa  74.7  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0354  ribokinase  27.84 
 
 		 308 aa  74.7  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>