More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3284 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_3284  PfkB  100 
 
 		 336 aa  692    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.469583  normal  0.0441315 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0562  PfkB domain protein  40.32 
 
 		 328 aa  243  3.9999999999999997e-63  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3284  ribokinase-like domain-containing protein  38.11 
 
 		 330 aa  216  2.9999999999999998e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000189129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0149  PfkB  37.43 
 
 		 407 aa  210  3e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.029935  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05621  carbohydrate kinase  35.76 
 
 		 333 aa  209  8e-53  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05321  carbohydrate kinase  35.44 
 
 		 333 aa  206  4e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0559209  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0506  carbohydrate kinase-like  35.03 
 
 		 334 aa  206  6e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05691  carbohydrate kinase  33.54 
 
 		 338 aa  205  7e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0990225  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1228  ribokinase-like domain-containing protein  37.03 
 
 		 337 aa  205  8e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05631  carbohydrate kinase  35.62 
 
 		 335 aa  204  1e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.577343 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1838  carbohydrate kinase  35.31 
 
 		 335 aa  204  2e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0036  pfkB family carbohydrate kinase  36.67 
 
 		 333 aa  201  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564268  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1084  PfkB domain protein  36.39 
 
 		 327 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07411  carbohydrate kinase  35.95 
 
 		 342 aa  201  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0251  PfkB  37.31 
 
 		 333 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1113  PfkB domain protein  36.39 
 
 		 327 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.941643 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2764  PfkB  35.46 
 
 		 370 aa  198  7.999999999999999e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.040802  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0457  PfkB  36.45 
 
 		 333 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1494  PfkB domain protein  35.76 
 
 		 331 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0243607  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0010  PfkB  36.06 
 
 		 333 aa  193  4e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00317456  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0690  carbohydrate kinase PfkB family  36.17 
 
 		 338 aa  192  7e-48  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0819  cell division protein FtsA  36.79 
 
 		 328 aa  191  2e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000392808  normal  0.759534 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0218  PfkB  36.09 
 
 		 333 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05061  carbohydrate kinase  33.54 
 
 		 348 aa  186  6e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0313242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0215  ribokinase-like domain-containing protein  35.78 
 
 		 333 aa  185  9e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.26013  normal  0.0979989 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0581  PfkB  37.09 
 
 		 333 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.189374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0178  ribokinase-like domain-containing protein  34.6 
 
 		 331 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.613115  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1165  PfkB domain protein  33.44 
 
 		 335 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.188666 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1639  ribokinase-like domain-containing protein  36.22 
 
 		 331 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.487738  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0121  ribokinase-like domain-containing protein  35.02 
 
 		 328 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.02163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4645  ribokinase-like domain-containing protein  34.57 
 
 		 337 aa  182  8.000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5108  PfkB domain protein  34.57 
 
 		 337 aa  182  8.000000000000001e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.905931 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0461  PfkB domain protein  36.8 
 
 		 333 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2565  ribokinase-like domain-containing protein  32.83 
 
 		 333 aa  181  1e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.650274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5186  PfkB domain protein  34.26 
 
 		 337 aa  181  2e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.430634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1260  PfkB domain protein  35.4 
 
 		 331 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1845  ribokinase-like domain-containing protein  33.73 
 
 		 341 aa  178  1e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000273033  unclonable  0.000000000472438 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4021  PfkB  32.42 
 
 		 330 aa  178  1e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.737193  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0169  carbohydrate kinase  33.02 
 
 		 330 aa  176  6e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0162  carbohydrate kinase  33.02 
 
 		 330 aa  176  6e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.98466  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1668  carbohydrate kinase PfkB family  35.95 
 
 		 337 aa  175  8e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3532  ribokinase-like domain-containing protein  34.36 
 
 		 337 aa  171  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321565  normal  0.851243 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2872  PfkB  32.42 
 
 		 332 aa  169  8e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.626247 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0316  pfkB family carbohydrate kinase  31.96 
 
 		 330 aa  167  2.9999999999999998e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.930013  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1030  pfkB family carbohydrate kinase  32.7 
 
 		 330 aa  166  4e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.577037  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2691  ribokinase-like domain-containing protein  32.7 
 
 		 330 aa  166  5e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.272607  normal  0.270933 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1910  carbohydrate kinase  31.07 
 
 		 339 aa  165  9e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.0000000000000704659  hitchhiker  0.00127543 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0151  PfkB  32 
 
 		 331 aa  164  2.0000000000000002e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5046  ribokinase-like domain-containing protein  32.61 
 
 		 329 aa  163  4.0000000000000004e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151131 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4407  PfkB domain protein  31.5 
 
 		 330 aa  161  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2200  PfkB  30.96 
 
 		 339 aa  161  1e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000468276  decreased coverage  0.00888496 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1307  PfkB domain protein  28.88 
 
 		 338 aa  160  3e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.887451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0198  ribokinase-like domain-containing protein  32.7 
 
 		 330 aa  159  4e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1671  PfkB  30.28 
 
 		 331 aa  159  4e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.276087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4087  PfkB domain protein  30.58 
 
 		 330 aa  159  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2989  ribokinase-like domain-containing protein  30 
 
 		 338 aa  159  9e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2022  ribokinase-like domain-containing protein  30.41 
 
 		 330 aa  157  3e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2452  PfkB  29.11 
 
 		 330 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.826037  normal  0.155331 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3378  ribokinase-like domain-containing protein  30.28 
 
 		 330 aa  152  8e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.463525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2568  ribokinase-like domain-containing protein  32.08 
 
 		 333 aa  149  5e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2872  ribokinase-like domain-containing protein  27.76 
 
 		 335 aa  137  3.0000000000000003e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.417432 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2854  ribokinase-like domain-containing protein  29.29 
 
 		 328 aa  134  3e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000011716  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3022  PfkB domain protein  27.73 
 
 		 333 aa  126  5e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.523599  normal  0.417909 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0494  PfkB domain protein  27.22 
 
 		 360 aa  125  2e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.441156  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0055  ribokinase-like domain-containing protein  28.4 
 
 		 334 aa  122  9.999999999999999e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.747338  normal  0.368725 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0491  PfkB  26.69 
 
 		 303 aa  97.8  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06080  sugar kinase, ribokinase  28.63 
 
 		 303 aa  94.7  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3300  PfkB domain protein  25.56 
 
 		 314 aa  94  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.369715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50659  predicted protein  25 
 
 		 347 aa  90.9  3e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7068  PfkB  26.62 
 
 		 297 aa  89  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0735  PfkB domain-containing protein  25.97 
 
 		 317 aa  87.8  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.263465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2496  kinase, pfkB family  27.33 
 
 		 310 aa  87.4  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01741  predicted kinase  27.41 
 
 		 315 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01729  hypothetical protein  27.41 
 
 		 315 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  25.63 
 
 		 322 aa  84.3  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_51242  predicted protein  26.71 
 
 		 342 aa  84.3  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.215587  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3407  ribokinase  28.79 
 
 		 424 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2057  PfkB family kinase  28.17 
 
 		 315 aa  84  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.124987  normal  0.010035 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2129  putative sugar kinase  24.16 
 
 		 298 aa  84  0.000000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.101939  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1419  PfkB family kinase  27.1 
 
 		 315 aa  82.8  0.000000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.997387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6402  kinase, PfkB family  25.44 
 
 		 316 aa  82.4  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.223985  normal  0.0576873 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1860  ribokinase-like domain-containing protein  27.41 
 
 		 315 aa  82.4  0.000000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.335723  decreased coverage  0.00000390561 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1870  PfkB domain protein  27.1 
 
 		 315 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0114143  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1996  PfkB family kinase  27.1 
 
 		 315 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1755  PfkB domain protein  27.27 
 
 		 304 aa  81.6  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2019  aminoimidazole riboside kinase  27.35 
 
 		 298 aa  80.5  0.00000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0270358  normal  0.162694 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3217  PfkB domain protein  28.46 
 
 		 312 aa  80.5  0.00000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1580  ribokinase-like domain-containing protein  26.5 
 
 		 309 aa  80.5  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0863941  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2283  ribokinase  27.17 
 
 		 310 aa  79.3  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.269259 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1856  PfkB family kinase  26.79 
 
 		 315 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0158072  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24440  sugar kinase, ribokinase  25.86 
 
 		 288 aa  78.6  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.480444  normal  0.238886 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0041  ribokinase-like domain-containing protein  29.12 
 
 		 304 aa  79  0.0000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1498  PfkB domain protein  26.59 
 
 		 300 aa  77.8  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2923  carbohydrate kinase, PfkB  27.97 
 
 		 308 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.123757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1884  ribokinase  25.17 
 
 		 310 aa  77  0.0000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0118065  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0954  PfkB domain protein  25.42 
 
 		 321 aa  75.9  0.0000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.102628  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02272  adenosine kinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06390)  26.39 
 
 		 352 aa  75.9  0.0000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0154807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18220  Fructokinase  25.38 
 
 		 320 aa  75.9  0.0000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.749798  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1103  PfkB  25.19 
 
 		 300 aa  75.5  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00948504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18020  sugar kinase, ribokinase  25.66 
 
 		 306 aa  74.7  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.503416  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>