More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1838 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1838  carbohydrate kinase  100 
 
 		 335 aa  676    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05631  carbohydrate kinase  97.01 
 
 		 335 aa  657    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.577343 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07411  carbohydrate kinase  58.95 
 
 		 342 aa  399  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05061  carbohydrate kinase  58.46 
 
 		 348 aa  389  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0313242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0690  carbohydrate kinase PfkB family  56.84 
 
 		 338 aa  387  1e-106  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05691  carbohydrate kinase  52.01 
 
 		 338 aa  363  3e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0990225  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1668  carbohydrate kinase PfkB family  57.85 
 
 		 337 aa  359  3e-98  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0506  carbohydrate kinase-like  51.25 
 
 		 334 aa  343  2e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05321  carbohydrate kinase  51.25 
 
 		 333 aa  343  2e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0559209  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05621  carbohydrate kinase  51.25 
 
 		 333 aa  342  5e-93  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0149  PfkB  49.54 
 
 		 407 aa  329  4e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.029935  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1228  ribokinase-like domain-containing protein  48.1 
 
 		 337 aa  323  2e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0121  ribokinase-like domain-containing protein  48.43 
 
 		 328 aa  315  6e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.02163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2565  ribokinase-like domain-containing protein  45.68 
 
 		 333 aa  311  9e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.650274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5186  PfkB domain protein  44.41 
 
 		 337 aa  300  2e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.430634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5108  PfkB domain protein  44.41 
 
 		 337 aa  300  3e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.905931 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4645  ribokinase-like domain-containing protein  44.41 
 
 		 337 aa  300  3e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3378  ribokinase-like domain-containing protein  47.13 
 
 		 330 aa  298  1e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.463525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0036  pfkB family carbohydrate kinase  44.72 
 
 		 333 aa  296  3e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564268  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1165  PfkB domain protein  46.08 
 
 		 335 aa  296  3e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.188666 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3532  ribokinase-like domain-containing protein  43.98 
 
 		 337 aa  296  4e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321565  normal  0.851243 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0316  pfkB family carbohydrate kinase  44.09 
 
 		 330 aa  293  3e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.930013  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0169  carbohydrate kinase  44.83 
 
 		 330 aa  292  4e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0162  carbohydrate kinase  44.83 
 
 		 330 aa  292  4e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.98466  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0178  ribokinase-like domain-containing protein  45.62 
 
 		 331 aa  292  7e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.613115  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1260  PfkB domain protein  45 
 
 		 331 aa  289  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1639  ribokinase-like domain-containing protein  44.27 
 
 		 331 aa  288  1e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.487738  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5046  ribokinase-like domain-containing protein  45.91 
 
 		 329 aa  287  2e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151131 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4021  PfkB  45.45 
 
 		 330 aa  286  2.9999999999999996e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.737193  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2989  ribokinase-like domain-containing protein  45.51 
 
 		 338 aa  286  4e-76  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4087  PfkB domain protein  44.48 
 
 		 330 aa  285  5e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2872  PfkB  44.95 
 
 		 332 aa  284  1.0000000000000001e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.626247 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4407  PfkB domain protein  43.22 
 
 		 330 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0215  ribokinase-like domain-containing protein  45.48 
 
 		 333 aa  280  2e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.26013  normal  0.0979989 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0010  PfkB  43.29 
 
 		 333 aa  280  2e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00317456  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0457  PfkB  42.11 
 
 		 333 aa  280  4e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1307  PfkB domain protein  43.56 
 
 		 338 aa  277  2e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.887451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0251  PfkB  42.68 
 
 		 333 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0218  PfkB  42.51 
 
 		 333 aa  274  2.0000000000000002e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0461  PfkB domain protein  42.38 
 
 		 333 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0151  PfkB  45.06 
 
 		 331 aa  268  7e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2452  PfkB  42.01 
 
 		 330 aa  261  1e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.826037  normal  0.155331 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0581  PfkB  40.85 
 
 		 333 aa  261  2e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.189374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1030  pfkB family carbohydrate kinase  41.72 
 
 		 330 aa  257  2e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.577037  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2691  ribokinase-like domain-containing protein  41.72 
 
 		 330 aa  256  3e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.272607  normal  0.270933 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0198  ribokinase-like domain-containing protein  42.41 
 
 		 330 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3022  PfkB domain protein  40.87 
 
 		 333 aa  252  8.000000000000001e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.523599  normal  0.417909 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1671  PfkB  39.14 
 
 		 331 aa  248  1e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.276087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2022  ribokinase-like domain-containing protein  45.45 
 
 		 330 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2872  ribokinase-like domain-containing protein  38.82 
 
 		 335 aa  215  8e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.417432 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3284  ribokinase-like domain-containing protein  37.11 
 
 		 330 aa  212  5.999999999999999e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000189129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1084  PfkB domain protein  37.15 
 
 		 327 aa  212  9e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1113  PfkB domain protein  37.15 
 
 		 327 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.941643 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3284  PfkB  35.31 
 
 		 336 aa  204  2e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.469583  normal  0.0441315 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2568  ribokinase-like domain-containing protein  37.58 
 
 		 333 aa  203  3e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0562  PfkB domain protein  34.19 
 
 		 328 aa  196  3e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1494  PfkB domain protein  34.94 
 
 		 331 aa  194  2e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0243607  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0819  cell division protein FtsA  33.86 
 
 		 328 aa  182  5.0000000000000004e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000392808  normal  0.759534 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2764  PfkB  33.13 
 
 		 370 aa  182  6e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.040802  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2854  ribokinase-like domain-containing protein  37.26 
 
 		 328 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000011716  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0494  PfkB domain protein  31.03 
 
 		 360 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.441156  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1845  ribokinase-like domain-containing protein  32.09 
 
 		 341 aa  162  6e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000273033  unclonable  0.000000000472438 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2200  PfkB  31.06 
 
 		 339 aa  153  4e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000468276  decreased coverage  0.00888496 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0055  ribokinase-like domain-containing protein  32.17 
 
 		 334 aa  153  5e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.747338  normal  0.368725 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1910  carbohydrate kinase  30.56 
 
 		 339 aa  150  3e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.0000000000000704659  hitchhiker  0.00127543 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0735  PfkB domain-containing protein  30.22 
 
 		 317 aa  106  5e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.263465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1117  ribokinase-like domain-containing protein  30.65 
 
 		 305 aa  104  2e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.145837 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1736  PfkB domain protein  24.7 
 
 		 304 aa  98.2  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1755  PfkB domain protein  27.47 
 
 		 304 aa  95.9  8e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7068  PfkB  28.46 
 
 		 297 aa  95.5  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0491  PfkB  30.48 
 
 		 303 aa  94  4e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2483  PfkB domain protein  25.68 
 
 		 302 aa  92.8  8e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0041  ribokinase-like domain-containing protein  28.19 
 
 		 304 aa  90.9  3e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0078  ribokinase-like domain-containing protein  29.39 
 
 		 302 aa  88.6  1e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2014  PfkB domain protein  29.34 
 
 		 324 aa  88.6  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0416  PfkB  27.44 
 
 		 320 aa  86.7  5e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24440  sugar kinase, ribokinase  27.97 
 
 		 288 aa  86.3  6e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.480444  normal  0.238886 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0070  ribokinase-like domain-containing protein  28.74 
 
 		 305 aa  86.3  6e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.60231  normal  0.104072 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2615  PfkB domain protein  23.48 
 
 		 305 aa  85.9  8e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1510  fructokinase  28.69 
 
 		 315 aa  84.3  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00409278  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1782  fructokinase  29.1 
 
 		 315 aa  84.3  0.000000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0521883  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0902  PfkB domain protein  24.64 
 
 		 309 aa  84  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2385  PfkB domain-containing protein  27.1 
 
 		 297 aa  83.6  0.000000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.790997  normal  0.420761 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2001  PfkB domain protein  29.82 
 
 		 321 aa  83.6  0.000000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2845  inosine kinase  27.17 
 
 		 434 aa  83.2  0.000000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000469104  decreased coverage  0.00000000256797 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_18364  predicted protein  28.57 
 
 		 273 aa  82.8  0.000000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.132458 
 
 
-
 
NC_006683  CNN02130  adenosine kinase, putative  25.93 
 
 		 357 aa  82.8  0.000000000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.339104  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1278  PfkB domain-containing protein  24.92 
 
 		 317 aa  81.6  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.399616 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6402  kinase, PfkB family  27.37 
 
 		 316 aa  79.7  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.223985  normal  0.0576873 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1088  PfkB domain protein  26.67 
 
 		 315 aa  79.7  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.332998  normal  0.446333 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0949  PfkB  30.74 
 
 		 301 aa  79.3  0.00000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  28.85 
 
 		 322 aa  78.6  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4464  aminoimidazole riboside kinase  28.63 
 
 		 319 aa  79  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.680577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1431  inosine kinase  26.22 
 
 		 434 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000183569  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2228  inosine kinase  26.94 
 
 		 434 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0216466  hitchhiker  0.00128428 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4283  aminoimidazole riboside kinase  28.23 
 
 		 319 aa  77.8  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  29 
 
 		 305 aa  77  0.0000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0389  PfkB  28.21 
 
 		 323 aa  77  0.0000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.211683  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1627  PfkB domain protein  28.08 
 
 		 309 aa  76.6  0.0000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.100578  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50659  predicted protein  22.65 
 
 		 347 aa  75.1  0.000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>